More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_0300 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009253  Dred_0300  transposase  100 
 
 
529 aa  1094    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2004  transposase  29.74 
 
 
494 aa  176  7e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2198  transposase  29.74 
 
 
494 aa  176  7e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2294  transposase  29.74 
 
 
494 aa  176  7e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2831  transposase  29.74 
 
 
494 aa  176  7e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1016  IstA2  27.35 
 
 
499 aa  169  9e-41  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.133303 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1175  IstA2  27.35 
 
 
499 aa  169  9e-41  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0070794  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1501  IstA2  27.35 
 
 
499 aa  169  9e-41  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0307163  hitchhiker  0.000409094 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0130  transposase  28.15 
 
 
502 aa  162  1e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.295597  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0739  integrase catalytic subunit  28.47 
 
 
510 aa  162  1e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.281393  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0831  integrase catalytic subunit  28.47 
 
 
510 aa  162  1e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1214  integrase catalytic subunit  28.47 
 
 
510 aa  162  1e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3099  integrase catalytic subunit  28.47 
 
 
510 aa  162  1e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.277104  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3173  Integrase catalytic region  29.51 
 
 
496 aa  156  8e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1070  Integrase catalytic region  29.27 
 
 
496 aa  155  1e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.47791  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2408  Integrase catalytic region  29.27 
 
 
496 aa  155  1e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3264  transposase  27.35 
 
 
509 aa  154  5e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.354242  normal  0.73638 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2113  Integrase catalytic region  27.4 
 
 
503 aa  154  5e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0683  transposase  28.93 
 
 
504 aa  153  7e-36  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0155  transposase IstA for insertion sequence IS1326  27.59 
 
 
507 aa  153  8e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.791462  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0318  integrase catalytic subunit  27.13 
 
 
499 aa  152  1e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0789  integrase catalytic subunit  27.13 
 
 
499 aa  152  1e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.972954  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3914  integrase catalytic subunit  27.13 
 
 
499 aa  152  1e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.639879  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3052  integrase catalytic subunit  28.5 
 
 
504 aa  151  2e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.96491 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0901  integrase catalytic subunit  27.71 
 
 
499 aa  150  5e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0261682  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3714  integrase catalytic subunit  27.71 
 
 
499 aa  150  5e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.16715  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1227  Integrase catalytic region  29.06 
 
 
497 aa  150  7e-35  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5321  ISPsy20, transposase IstA  27.95 
 
 
501 aa  149  9e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3017  transposase  30.79 
 
 
565 aa  149  1.0000000000000001e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3226  transposase  30.79 
 
 
565 aa  149  1.0000000000000001e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1871  transposase  30.79 
 
 
565 aa  149  1.0000000000000001e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.333339  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4458  transposase  28.21 
 
 
442 aa  149  1.0000000000000001e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000107543  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0221  transposase  30.79 
 
 
565 aa  149  1.0000000000000001e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.113746  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3390  integrase catalytic subunit  27.08 
 
 
501 aa  148  2.0000000000000003e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0417622 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3483  integrase catalytic subunit  27.08 
 
 
501 aa  148  2.0000000000000003e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.202546 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5130  integrase catalytic subunit  27.08 
 
 
501 aa  148  2.0000000000000003e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.819554  normal 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5140  integrase catalytic subunit  27.08 
 
 
501 aa  148  2.0000000000000003e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.920886  normal  0.438385 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0908  integrase catalytic subunit  27.08 
 
 
501 aa  148  2.0000000000000003e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.530345  normal  0.680535 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2463  integrase catalytic subunit  27.08 
 
 
501 aa  148  2.0000000000000003e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.587911  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3053  integrase catalytic subunit  27.08 
 
 
501 aa  148  2.0000000000000003e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00502865 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2884  Integrase catalytic region  28.86 
 
 
503 aa  148  3e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.53685e-20 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3044  IS21 family transposase  26.44 
 
 
505 aa  147  3e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3403  IS21 family transposase  26.44 
 
 
505 aa  147  3e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1639  IS21 family transposase  26.44 
 
 
505 aa  147  3e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2412  Integrase catalytic region  28.54 
 
 
503 aa  148  3e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.305963 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0683  IS21 family transposase  26.44 
 
 
505 aa  147  3e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4066  Integrase catalytic region  28.86 
 
 
503 aa  148  3e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3045  integrase catalytic subunit  26.78 
 
 
499 aa  146  7.0000000000000006e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3056  integrase catalytic subunit  26.78 
 
 
499 aa  146  7.0000000000000006e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.278904 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0906  Integrase catalytic region  27.97 
 
 
504 aa  146  8.000000000000001e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3489  Integrase catalytic region  27.97 
 
 
504 aa  146  8.000000000000001e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0016  Integrase catalytic region  27.97 
 
 
504 aa  146  8.000000000000001e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0423553  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1294  Integrase catalytic region  27.97 
 
 
504 aa  146  8.000000000000001e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1436  Integrase catalytic region  27.97 
 
 
504 aa  146  8.000000000000001e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2179  Integrase catalytic region  27.97 
 
 
504 aa  146  8.000000000000001e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2255  Integrase catalytic region  27.97 
 
 
504 aa  146  8.000000000000001e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2848  Integrase catalytic region  27.97 
 
 
504 aa  146  8.000000000000001e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0886  Integrase catalytic region  27.97 
 
 
504 aa  146  8.000000000000001e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.106081  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6519  integrase catalytic region  27.97 
 
 
499 aa  146  9e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.126482 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2875  integrase catalytic subunit  26.34 
 
 
506 aa  145  2e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00853486  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1039  Integrase catalytic region  25.97 
 
 
496 aa  144  4e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0651609  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0823  hypothetical protein  26.54 
 
 
504 aa  141  1.9999999999999998e-32  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1995  hypothetical protein  26.54 
 
 
504 aa  141  1.9999999999999998e-32  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3235  integrase catalytic subunit  28.77 
 
 
508 aa  141  1.9999999999999998e-32  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2866  Integrase catalytic region  29.17 
 
 
503 aa  141  1.9999999999999998e-32  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00185303  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1780  transposase  29.23 
 
 
558 aa  140  6e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.466747  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3923  integrase catalytic subunit  26.1 
 
 
499 aa  139  1e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0433  integrase catalytic subunit  29.57 
 
 
504 aa  139  1e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.230494  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0850  integrase catalytic subunit  29.57 
 
 
504 aa  139  1e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.314158  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0566  integrase catalytic region  25.33 
 
 
501 aa  139  2e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.478269  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0554  integrase catalytic region  25.33 
 
 
501 aa  139  2e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4982  integrase catalytic subunit  27.75 
 
 
423 aa  136  9e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4688  Integrase catalytic region  25.49 
 
 
508 aa  133  7.999999999999999e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0483  integrase catalytic subunit  26.44 
 
 
508 aa  132  2.0000000000000002e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3365  integrase catalytic subunit  26.44 
 
 
508 aa  132  2.0000000000000002e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0417  integrase catalytic subunit  23.85 
 
 
509 aa  132  2.0000000000000002e-29  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.328365  normal  0.377294 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1251  integrase catalytic subunit  23.85 
 
 
509 aa  132  2.0000000000000002e-29  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.539956  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0069  Integrase catalytic region  23.99 
 
 
502 aa  131  3e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.83421 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1042  Integrase catalytic region  25.78 
 
 
508 aa  130  5.0000000000000004e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.861303  normal  0.109435 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4173  integrase catalytic region  25.67 
 
 
502 aa  130  5.0000000000000004e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5400  integrase catalytic region  25.67 
 
 
502 aa  130  5.0000000000000004e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2255  integrase catalytic region  25.67 
 
 
502 aa  130  5.0000000000000004e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.659658  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2556  integrase catalytic subunit  26.93 
 
 
501 aa  130  8.000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2899  integrase catalytic subunit  26.93 
 
 
501 aa  130  8.000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4866  integrase catalytic subunit  26.93 
 
 
501 aa  130  8.000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4956  integrase catalytic subunit  26.93 
 
 
501 aa  130  8.000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0004  integrase catalytic subunit  26.93 
 
 
501 aa  130  8.000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3204  integrase catalytic subunit  26.93 
 
 
501 aa  130  8.000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3299  integrase catalytic subunit  26.93 
 
 
501 aa  130  8.000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0070  transposase  26.28 
 
 
503 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.177477 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4455  putative transposase  26.28 
 
 
503 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0648  Integrase catalytic region  24.57 
 
 
488 aa  127  4.0000000000000003e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.509934 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1464  putative transposase  28.03 
 
 
497 aa  127  4.0000000000000003e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2997  putative transposase  28.03 
 
 
497 aa  127  4.0000000000000003e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3304  putative transposase  28.03 
 
 
497 aa  127  4.0000000000000003e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.299203 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2677  Integrase catalytic region  24.78 
 
 
507 aa  127  7e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.696745 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0675  Integrase catalytic region  24.78 
 
 
507 aa  127  7e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.275744  hitchhiker  0.000336572 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0315  Integrase catalytic region  24.78 
 
 
507 aa  127  7e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.165744  normal  0.0795408 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1791  Integrase catalytic region  24.78 
 
 
507 aa  127  7e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.459924  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1288  transposase (25)  25.35 
 
 
501 aa  123  7e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.540829  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>