More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_0706 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010816  BLD_0706  transposase  100 
 
 
309 aa  637    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.642121  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0028  transposase  99.03 
 
 
309 aa  630  1e-180  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.355464  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0314  transposase  99.03 
 
 
309 aa  630  1e-180  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.00173653  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1802  transposase  100 
 
 
464 aa  604  9.999999999999999e-173  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.716345  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1659  transposase  98.97 
 
 
323 aa  597  1e-170  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03390  transposase  51.21 
 
 
494 aa  270  2e-71  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.309069  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1657  transposase  41.81 
 
 
493 aa  227  1e-58  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1643  transposase  41.81 
 
 
493 aa  227  1e-58  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.432337  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2749  hypothetical protein  38.49 
 
 
501 aa  210  2e-53  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.596289  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2200  hypothetical protein  40 
 
 
334 aa  208  8e-53  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0024  transposase (25)  40 
 
 
501 aa  207  1e-52  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0619695  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0485  transposase (25)  40 
 
 
501 aa  207  1e-52  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1288  transposase (25)  40 
 
 
501 aa  207  1e-52  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.540829  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2218  transposase (25)  40 
 
 
501 aa  207  1e-52  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1799  transposase  41.92 
 
 
507 aa  206  3e-52  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.161181  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0823  hypothetical protein  42.19 
 
 
504 aa  207  3e-52  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1995  hypothetical protein  42.19 
 
 
504 aa  207  3e-52  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1412  transposase  41.58 
 
 
507 aa  206  5e-52  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0995  transposase  41.92 
 
 
500 aa  204  1e-51  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2738  Integrase catalytic region  36.18 
 
 
501 aa  183  3e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3067  hypothetical protein  35.86 
 
 
501 aa  173  3.9999999999999995e-42  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0704  integrase catalytic region  36.64 
 
 
498 aa  149  8e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.275152  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4983  transposase  34.64 
 
 
497 aa  139  3.9999999999999997e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.712907  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4458  transposase  34.66 
 
 
442 aa  139  4.999999999999999e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000107543  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4958  transposase  34.64 
 
 
502 aa  139  4.999999999999999e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2004  transposase  33.7 
 
 
494 aa  137  2e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2198  transposase  33.7 
 
 
494 aa  137  2e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2294  transposase  33.7 
 
 
494 aa  137  2e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2831  transposase  33.7 
 
 
494 aa  137  2e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3264  transposase  38.96 
 
 
509 aa  135  9e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.354242  normal  0.73638 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1871  transposase  39.57 
 
 
565 aa  134  3e-30  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.333339  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0221  transposase  39.57 
 
 
565 aa  134  3e-30  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.113746  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3017  transposase  39.57 
 
 
565 aa  134  3e-30  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1780  transposase  37.63 
 
 
558 aa  133  3e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.466747  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3226  transposase  39.57 
 
 
565 aa  134  3e-30  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0683  transposase  30.08 
 
 
504 aa  132  7.999999999999999e-30  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1175  IstA2  30.38 
 
 
499 aa  127  4.0000000000000003e-28  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0070794  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1016  IstA2  30.38 
 
 
499 aa  127  4.0000000000000003e-28  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.133303 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1501  IstA2  30.38 
 
 
499 aa  127  4.0000000000000003e-28  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0307163  hitchhiker  0.000409094 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0458  transposase  39.08 
 
 
584 aa  124  3e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5335  IstA2  34.31 
 
 
534 aa  115  6.9999999999999995e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3045  IstA2  34.31 
 
 
534 aa  115  6.9999999999999995e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000242102  hitchhiker  0.00242323 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2079  IstA2  34.31 
 
 
534 aa  115  6.9999999999999995e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0246359  hitchhiker  0.00457727 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1227  Integrase catalytic region  32.73 
 
 
497 aa  114  2.0000000000000002e-24  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2954  hypothetical protein  40.76 
 
 
160 aa  113  4.0000000000000004e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0300  transposase  29.64 
 
 
529 aa  105  8e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6519  integrase catalytic region  30.19 
 
 
499 aa  103  5e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.126482 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2875  integrase catalytic subunit  31.27 
 
 
506 aa  101  2e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00853486  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1791  Integrase catalytic region  32.07 
 
 
507 aa  100  3e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.459924  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0417  integrase catalytic subunit  30.14 
 
 
509 aa  100  3e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.328365  normal  0.377294 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1251  integrase catalytic subunit  30.14 
 
 
509 aa  100  3e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.539956  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0315  Integrase catalytic region  32.07 
 
 
507 aa  100  3e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.165744  normal  0.0795408 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0675  Integrase catalytic region  32.07 
 
 
507 aa  100  3e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.275744  hitchhiker  0.000336572 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2677  Integrase catalytic region  32.07 
 
 
507 aa  100  3e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.696745 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5139  hypothetical protein  35.71 
 
 
468 aa  99.4  7e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.235994  normal  0.315254 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0648  Integrase catalytic region  32.19 
 
 
488 aa  97.4  2e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.509934 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0069  Integrase catalytic region  30.77 
 
 
502 aa  97.4  3e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.83421 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2884  Integrase catalytic region  31.33 
 
 
503 aa  96.3  5e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.53685e-20 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4066  Integrase catalytic region  31.33 
 
 
503 aa  96.3  5e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2412  Integrase catalytic region  31.33 
 
 
503 aa  96.3  5e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.305963 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5400  integrase catalytic region  31.66 
 
 
502 aa  95.9  7e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2255  integrase catalytic region  31.66 
 
 
502 aa  95.9  7e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.659658  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0339  hypothetical protein  36.09 
 
 
387 aa  95.9  7e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4173  integrase catalytic region  31.66 
 
 
502 aa  95.9  7e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3923  integrase catalytic subunit  28.48 
 
 
499 aa  93.6  4e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0041  Integrase catalytic region  29.02 
 
 
501 aa  92.8  6e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.456904  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0901  integrase catalytic subunit  29.32 
 
 
499 aa  90.9  3e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0261682  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3714  integrase catalytic subunit  29.32 
 
 
499 aa  90.9  3e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.16715  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1971  integrase catalytic subunit  30.4 
 
 
373 aa  90.1  4e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0139673  normal  0.752349 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2463  integrase catalytic subunit  31.25 
 
 
501 aa  89.7  6e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.587911  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3390  integrase catalytic subunit  31.25 
 
 
501 aa  89.7  6e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0417622 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0908  integrase catalytic subunit  31.25 
 
 
501 aa  89.7  6e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.530345  normal  0.680535 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3053  integrase catalytic subunit  31.25 
 
 
501 aa  89.7  6e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00502865 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3483  integrase catalytic subunit  31.25 
 
 
501 aa  89.7  6e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.202546 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5130  integrase catalytic subunit  31.25 
 
 
501 aa  89.7  6e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.819554  normal 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5140  integrase catalytic subunit  31.25 
 
 
501 aa  89.7  6e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.920886  normal  0.438385 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2866  Integrase catalytic region  30.4 
 
 
503 aa  89.4  7e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00185303  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0318  integrase catalytic subunit  29.32 
 
 
499 aa  89.4  8e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0789  integrase catalytic subunit  29.32 
 
 
499 aa  89.4  8e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.972954  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3914  integrase catalytic subunit  29.32 
 
 
499 aa  89.4  8e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.639879  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0886  Integrase catalytic region  28.03 
 
 
504 aa  88.6  1e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.106081  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2848  Integrase catalytic region  28.03 
 
 
504 aa  88.6  1e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2179  Integrase catalytic region  28.03 
 
 
504 aa  88.6  1e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1294  Integrase catalytic region  28.03 
 
 
504 aa  88.6  1e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3489  Integrase catalytic region  28.03 
 
 
504 aa  88.6  1e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0016  Integrase catalytic region  28.03 
 
 
504 aa  88.6  1e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0423553  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2255  Integrase catalytic region  28.03 
 
 
504 aa  88.6  1e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1436  Integrase catalytic region  28.03 
 
 
504 aa  88.6  1e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0906  Integrase catalytic region  28.03 
 
 
504 aa  88.6  1e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3045  integrase catalytic subunit  30.43 
 
 
499 aa  88.6  1e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3056  integrase catalytic subunit  30.43 
 
 
499 aa  88.6  1e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.278904 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3668  IstA2  31.85 
 
 
564 aa  88.6  1e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0182144  normal  0.155285 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0433  integrase catalytic subunit  31.1 
 
 
504 aa  87.8  2e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.230494  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0850  integrase catalytic subunit  31.1 
 
 
504 aa  87.8  2e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.314158  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0130  transposase  30.77 
 
 
502 aa  88.2  2e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.295597  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1039  Integrase catalytic region  27.48 
 
 
496 aa  88.2  2e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0651609  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1070  Integrase catalytic region  28.68 
 
 
496 aa  87  3e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.47791  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2408  Integrase catalytic region  28.68 
 
 
496 aa  87  3e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3235  integrase catalytic subunit  27.71 
 
 
508 aa  87  3e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0018  integrase catalytic region  29.04 
 
 
510 aa  87  4e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>