More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_2738 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013411  GYMC61_2738  Integrase catalytic region  100 
 
 		 501 aa  1033    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3067  hypothetical protein  77.11 
 
 		 501 aa  815    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0339  hypothetical protein  74.77 
 
 		 387 aa  517  1.0000000000000001e-145  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0024  transposase (25)  39.23 
 
 		 501 aa  261  2e-68  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0619695  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0485  transposase (25)  39.23 
 
 		 501 aa  261  2e-68  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1288  transposase (25)  39.23 
 
 		 501 aa  261  2e-68  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.540829  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2218  transposase (25)  39.23 
 
 		 501 aa  261  2e-68  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2749  hypothetical protein  35.68 
 
 		 501 aa  249  1e-64  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.596289  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2200  hypothetical protein  44.05 
 
 		 334 aa  244  1.9999999999999999e-63  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0823  hypothetical protein  34.16 
 
 		 504 aa  230  5e-59  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1995  hypothetical protein  34.16 
 
 		 504 aa  230  5e-59  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1799  transposase  33.18 
 
 		 507 aa  207  4e-52  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.161181  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1412  transposase  32.3 
 
 		 507 aa  202  9e-51  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1802  transposase  33.33 
 
 		 464 aa  200  6e-50  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.716345  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0995  transposase  32.7 
 
 		 500 aa  199  7.999999999999999e-50  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1659  transposase  35.51 
 
 		 323 aa  187  3e-46  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0706  transposase  36.18 
 
 		 309 aa  183  6e-45  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.642121  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0028  transposase  36.13 
 
 		 309 aa  179  9e-44  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.355464  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0314  transposase  36.13 
 
 		 309 aa  179  9e-44  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.00173653  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1657  transposase  33.33 
 
 		 493 aa  172  2e-41  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1643  transposase  33.33 
 
 		 493 aa  172  2e-41  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.432337  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1016  IstA2  31.66 
 
 		 499 aa  157  3e-37  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.133303 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1175  IstA2  31.66 
 
 		 499 aa  157  3e-37  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0070794  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1501  IstA2  31.66 
 
 		 499 aa  157  3e-37  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0307163  hitchhiker  0.000409094 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03390  transposase  33.53 
 
 		 494 aa  152  1e-35  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.309069  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2004  transposase  30.64 
 
 		 494 aa  152  1e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2198  transposase  30.64 
 
 		 494 aa  152  1e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2294  transposase  30.64 
 
 		 494 aa  152  1e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2831  transposase  30.64 
 
 		 494 aa  152  1e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3264  transposase  32.72 
 
 		 509 aa  145  2e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.354242  normal  0.73638 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4458  transposase  34.8 
 
 		 442 aa  144  5e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000107543  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3226  transposase  31.82 
 
 		 565 aa  137  3.0000000000000003e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1871  transposase  31.82 
 
 		 565 aa  137  3.0000000000000003e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.333339  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0221  transposase  31.82 
 
 		 565 aa  137  3.0000000000000003e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.113746  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3017  transposase  31.82 
 
 		 565 aa  137  3.0000000000000003e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4983  transposase  35.69 
 
 		 497 aa  137  6.0000000000000005e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.712907  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4958  transposase  35.29 
 
 		 502 aa  135  1.9999999999999998e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1227  Integrase catalytic region  32.24 
 
 		 497 aa  134  3e-30  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1780  transposase  32.61 
 
 		 558 aa  132  1.0000000000000001e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.466747  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2079  IstA2  31.48 
 
 		 534 aa  129  1.0000000000000001e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0246359  hitchhiker  0.00457727 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5335  IstA2  31.48 
 
 		 534 aa  129  1.0000000000000001e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3045  IstA2  31.48 
 
 		 534 aa  129  1.0000000000000001e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000242102  hitchhiker  0.00242323 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0704  integrase catalytic region  34.65 
 
 		 498 aa  127  3e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.275152  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0155  transposase IstA for insertion sequence IS1326  27.62 
 
 		 507 aa  127  6e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.791462  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0417  integrase catalytic subunit  27.92 
 
 		 509 aa  121  3e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.328365  normal  0.377294 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1251  integrase catalytic subunit  27.92 
 
 		 509 aa  121  3e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.539956  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0683  transposase  27.07 
 
 		 504 aa  120  7e-26  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2954  hypothetical protein  44.37 
 
 		 160 aa  119  9.999999999999999e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2408  Integrase catalytic region  29.09 
 
 		 496 aa  115  2.0000000000000002e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1070  Integrase catalytic region  29.09 
 
 		 496 aa  115  2.0000000000000002e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.47791  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3173  Integrase catalytic region  29.09 
 
 		 496 aa  115  2.0000000000000002e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4688  Integrase catalytic region  27.67 
 
 		 508 aa  114  3e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0483  integrase catalytic subunit  27.21 
 
 		 508 aa  114  4.0000000000000004e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3365  integrase catalytic subunit  27.21 
 
 		 508 aa  114  4.0000000000000004e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1042  Integrase catalytic region  27.43 
 
 		 508 aa  114  6e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.861303  normal  0.109435 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3403  IS21 family transposase  28.4 
 
 		 505 aa  113  8.000000000000001e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1639  IS21 family transposase  28.4 
 
 		 505 aa  113  8.000000000000001e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0683  IS21 family transposase  28.4 
 
 		 505 aa  113  8.000000000000001e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3044  IS21 family transposase  28.4 
 
 		 505 aa  113  8.000000000000001e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2884  Integrase catalytic region  27.23 
 
 		 503 aa  111  3e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.53685e-20 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4066  Integrase catalytic region  27.23 
 
 		 503 aa  111  3e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3235  integrase catalytic subunit  25.3 
 
 		 508 aa  111  3e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2412  Integrase catalytic region  27.23 
 
 		 503 aa  111  3e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.305963 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1971  integrase catalytic subunit  28.31 
 
 		 373 aa  110  4.0000000000000004e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0139673  normal  0.752349 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2677  Integrase catalytic region  26.67 
 
 		 507 aa  110  5e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.696745 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0675  Integrase catalytic region  26.67 
 
 		 507 aa  110  5e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.275744  hitchhiker  0.000336572 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1791  Integrase catalytic region  26.67 
 
 		 507 aa  110  5e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.459924  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2875  integrase catalytic subunit  24.61 
 
 		 506 aa  110  5e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00853486  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0315  Integrase catalytic region  26.67 
 
 		 507 aa  110  5e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.165744  normal  0.0795408 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2179  Integrase catalytic region  26.2 
 
 		 504 aa  110  8.000000000000001e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1294  Integrase catalytic region  26.2 
 
 		 504 aa  110  8.000000000000001e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2255  Integrase catalytic region  26.2 
 
 		 504 aa  110  8.000000000000001e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0016  Integrase catalytic region  26.2 
 
 		 504 aa  110  8.000000000000001e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0423553  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0886  Integrase catalytic region  26.2 
 
 		 504 aa  110  8.000000000000001e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.106081  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3489  Integrase catalytic region  26.2 
 
 		 504 aa  110  8.000000000000001e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0906  Integrase catalytic region  26.2 
 
 		 504 aa  110  8.000000000000001e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2848  Integrase catalytic region  26.2 
 
 		 504 aa  110  8.000000000000001e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1436  Integrase catalytic region  26.2 
 
 		 504 aa  110  8.000000000000001e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0458  transposase  32.95 
 
 		 584 aa  107  4e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0648  Integrase catalytic region  26.42 
 
 		 488 aa  107  4e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.509934 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0130  transposase  27.56 
 
 		 502 aa  107  6e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.295597  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1009  integrase catalytic subunit  29.97 
 
 		 412 aa  107  7e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00535974  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1319  integrase catalytic subunit  29.97 
 
 		 412 aa  107  7e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2854  integrase catalytic subunit  29.97 
 
 		 412 aa  107  7e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.230802  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6519  integrase catalytic region  28.02 
 
 		 499 aa  105  1e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.126482 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0069  Integrase catalytic region  27.15 
 
 		 502 aa  105  1e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.83421 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3717  integrase catalytic subunit  28.11 
 
 		 412 aa  105  1e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0739  integrase catalytic subunit  27.83 
 
 		 510 aa  105  2e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.281393  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0831  integrase catalytic subunit  27.83 
 
 		 510 aa  105  2e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1214  integrase catalytic subunit  27.83 
 
 		 510 aa  105  2e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3099  integrase catalytic subunit  27.83 
 
 		 510 aa  105  2e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.277104  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2866  Integrase catalytic region  26.74 
 
 		 503 aa  104  4e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00185303  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2556  integrase catalytic subunit  27.92 
 
 		 501 aa  103  1e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2899  integrase catalytic subunit  27.92 
 
 		 501 aa  103  1e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4866  integrase catalytic subunit  27.92 
 
 		 501 aa  103  1e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4956  integrase catalytic subunit  27.92 
 
 		 501 aa  103  1e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0004  integrase catalytic subunit  27.92 
 
 		 501 aa  103  1e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3204  integrase catalytic subunit  27.92 
 
 		 501 aa  103  1e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3299  integrase catalytic subunit  27.92 
 
 		 501 aa  103  1e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3668  IstA2  31.23 
 
 		 564 aa  102  2e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0182144  normal  0.155285 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>