More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_1436 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010814  Glov_2255  Integrase catalytic region  100 
 
 
504 aa  1045    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0886  Integrase catalytic region  100 
 
 
504 aa  1045    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.106081  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2848  Integrase catalytic region  100 
 
 
504 aa  1045    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2866  Integrase catalytic region  80.75 
 
 
503 aa  862    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00185303  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1294  Integrase catalytic region  100 
 
 
504 aa  1045    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0906  Integrase catalytic region  100 
 
 
504 aa  1045    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0016  Integrase catalytic region  100 
 
 
504 aa  1045    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0423553  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1436  Integrase catalytic region  100 
 
 
504 aa  1045    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2412  Integrase catalytic region  62.03 
 
 
503 aa  670    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.305963 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2179  Integrase catalytic region  100 
 
 
504 aa  1045    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4066  Integrase catalytic region  62.03 
 
 
503 aa  671    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3489  Integrase catalytic region  100 
 
 
504 aa  1045    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2875  integrase catalytic subunit  63.83 
 
 
506 aa  684    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00853486  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2884  Integrase catalytic region  62.03 
 
 
503 aa  671    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.53685e-20 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0318  integrase catalytic subunit  51.61 
 
 
499 aa  515  1.0000000000000001e-145  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0789  integrase catalytic subunit  51.61 
 
 
499 aa  515  1.0000000000000001e-145  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.972954  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3914  integrase catalytic subunit  51.61 
 
 
499 aa  515  1.0000000000000001e-145  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.639879  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0901  integrase catalytic subunit  51.41 
 
 
499 aa  512  1e-144  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0261682  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3714  integrase catalytic subunit  51.41 
 
 
499 aa  512  1e-144  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.16715  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3923  integrase catalytic subunit  51.11 
 
 
499 aa  512  1e-144  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0069  Integrase catalytic region  50.2 
 
 
502 aa  504  1e-141  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.83421 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3045  integrase catalytic subunit  50.6 
 
 
499 aa  503  1e-141  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3056  integrase catalytic subunit  50.6 
 
 
499 aa  503  1e-141  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.278904 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6519  integrase catalytic region  49.11 
 
 
499 aa  498  1e-140  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.126482 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1039  Integrase catalytic region  50.51 
 
 
496 aa  491  1e-137  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0651609  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0433  integrase catalytic subunit  49.31 
 
 
504 aa  487  1e-136  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.230494  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0850  integrase catalytic subunit  49.31 
 
 
504 aa  487  1e-136  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.314158  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3390  integrase catalytic subunit  48.11 
 
 
501 aa  480  1e-134  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0417622 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3053  integrase catalytic subunit  48.11 
 
 
501 aa  480  1e-134  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00502865 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3483  integrase catalytic subunit  48.11 
 
 
501 aa  480  1e-134  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.202546 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0041  Integrase catalytic region  50.4 
 
 
501 aa  481  1e-134  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.456904  normal 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5130  integrase catalytic subunit  48.11 
 
 
501 aa  480  1e-134  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.819554  normal 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5140  integrase catalytic subunit  48.11 
 
 
501 aa  480  1e-134  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.920886  normal  0.438385 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2463  integrase catalytic subunit  48.11 
 
 
501 aa  480  1e-134  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.587911  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0908  integrase catalytic subunit  48.11 
 
 
501 aa  480  1e-134  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.530345  normal  0.680535 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2255  integrase catalytic region  47.32 
 
 
502 aa  472  1e-132  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.659658  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0554  integrase catalytic region  47.7 
 
 
501 aa  473  1e-132  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5400  integrase catalytic region  47.32 
 
 
502 aa  472  1e-132  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0566  integrase catalytic region  47.7 
 
 
501 aa  473  1e-132  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.478269  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4173  integrase catalytic region  47.32 
 
 
502 aa  472  1e-132  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1227  Integrase catalytic region  48.2 
 
 
497 aa  453  1.0000000000000001e-126  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4982  integrase catalytic subunit  50.83 
 
 
423 aa  433  1e-120  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1971  integrase catalytic subunit  48.92 
 
 
373 aa  376  1e-103  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0139673  normal  0.752349 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1042  Integrase catalytic region  41.58 
 
 
508 aa  369  1e-101  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.861303  normal  0.109435 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4688  Integrase catalytic region  41.98 
 
 
508 aa  369  1e-101  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2556  integrase catalytic subunit  41.7 
 
 
501 aa  364  3e-99  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2899  integrase catalytic subunit  41.7 
 
 
501 aa  364  3e-99  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4866  integrase catalytic subunit  41.7 
 
 
501 aa  364  3e-99  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4956  integrase catalytic subunit  41.7 
 
 
501 aa  364  3e-99  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0004  integrase catalytic subunit  41.7 
 
 
501 aa  364  3e-99  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3204  integrase catalytic subunit  41.7 
 
 
501 aa  364  3e-99  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3299  integrase catalytic subunit  41.7 
 
 
501 aa  364  3e-99  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3173  Integrase catalytic region  41.26 
 
 
496 aa  362  8e-99  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2408  Integrase catalytic region  41.06 
 
 
496 aa  362  8e-99  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1070  Integrase catalytic region  41.06 
 
 
496 aa  362  8e-99  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.47791  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0483  integrase catalytic subunit  41.58 
 
 
508 aa  362  1e-98  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3365  integrase catalytic subunit  41.58 
 
 
508 aa  362  1e-98  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0739  integrase catalytic subunit  40.88 
 
 
510 aa  362  1e-98  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.281393  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0831  integrase catalytic subunit  40.88 
 
 
510 aa  362  1e-98  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1214  integrase catalytic subunit  40.88 
 
 
510 aa  362  1e-98  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3099  integrase catalytic subunit  40.88 
 
 
510 aa  362  1e-98  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.277104  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1464  putative transposase  41.34 
 
 
497 aa  360  4e-98  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2997  putative transposase  41.34 
 
 
497 aa  360  4e-98  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3304  putative transposase  41.34 
 
 
497 aa  360  4e-98  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.299203 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5321  ISPsy20, transposase IstA  39.44 
 
 
501 aa  357  2.9999999999999997e-97  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2113  Integrase catalytic region  39.8 
 
 
503 aa  357  2.9999999999999997e-97  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3052  integrase catalytic subunit  41.53 
 
 
504 aa  357  3.9999999999999996e-97  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.96491 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0130  transposase  39.88 
 
 
502 aa  356  6.999999999999999e-97  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.295597  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0070  transposase  40.61 
 
 
503 aa  349  6e-95  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.177477 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4455  putative transposase  40.61 
 
 
503 aa  349  6e-95  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0417  integrase catalytic subunit  39.8 
 
 
509 aa  341  2e-92  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.328365  normal  0.377294 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1251  integrase catalytic subunit  39.8 
 
 
509 aa  341  2e-92  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.539956  normal 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3235  integrase catalytic subunit  39.04 
 
 
508 aa  333  3e-90  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3044  IS21 family transposase  38.69 
 
 
505 aa  332  1e-89  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1639  IS21 family transposase  38.69 
 
 
505 aa  332  1e-89  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0683  IS21 family transposase  38.69 
 
 
505 aa  332  1e-89  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3403  IS21 family transposase  38.69 
 
 
505 aa  332  1e-89  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0155  transposase IstA for insertion sequence IS1326  40.32 
 
 
507 aa  330  3e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.791462  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2677  Integrase catalytic region  39.45 
 
 
507 aa  322  9.999999999999999e-87  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.696745 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0675  Integrase catalytic region  39.45 
 
 
507 aa  322  9.999999999999999e-87  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.275744  hitchhiker  0.000336572 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0315  Integrase catalytic region  39.45 
 
 
507 aa  322  9.999999999999999e-87  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.165744  normal  0.0795408 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1791  Integrase catalytic region  39.45 
 
 
507 aa  322  9.999999999999999e-87  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.459924  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0648  Integrase catalytic region  39.19 
 
 
488 aa  313  2.9999999999999996e-84  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.509934 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5105  hypothetical protein  50.18 
 
 
290 aa  297  4e-79  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.262443 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2004  transposase  33.53 
 
 
494 aa  249  8e-65  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2198  transposase  33.53 
 
 
494 aa  249  8e-65  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2294  transposase  33.53 
 
 
494 aa  249  8e-65  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2831  transposase  33.53 
 
 
494 aa  249  8e-65  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1016  IstA2  31.74 
 
 
499 aa  238  1e-61  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.133303 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1501  IstA2  31.74 
 
 
499 aa  238  1e-61  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0307163  hitchhiker  0.000409094 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1175  IstA2  31.74 
 
 
499 aa  238  1e-61  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0070794  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2077  IstB-like ATP-binding protein  49.77 
 
 
356 aa  218  2e-55  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4458  transposase  32.14 
 
 
442 aa  208  2e-52  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000107543  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0683  transposase  29.35 
 
 
504 aa  203  5e-51  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4983  transposase  30 
 
 
497 aa  201  1.9999999999999998e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.712907  normal 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4958  transposase  29.98 
 
 
502 aa  200  5e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0704  integrase catalytic region  30.24 
 
 
498 aa  199  9e-50  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.275152  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5139  hypothetical protein  29.11 
 
 
468 aa  156  7e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.235994  normal  0.315254 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3264  transposase  30.53 
 
 
509 aa  155  1e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.354242  normal  0.73638 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5110  hypothetical protein  45.9 
 
 
199 aa  155  2e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.122941  normal  0.136795 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>