More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_3226 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_0221  transposase  100 
 
 		 565 aa  1130    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.113746  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1871  transposase  100 
 
 		 565 aa  1130    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.333339  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3017  transposase  100 
 
 		 565 aa  1130    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3226  transposase  100 
 
 		 565 aa  1130    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0458  transposase  71.45 
 
 		 584 aa  756    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1780  transposase  72.02 
 
 		 558 aa  799    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.466747  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3656  IstA2  60.75 
 
 		 556 aa  622  1e-177  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.165396 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4517  IstA2  60.86 
 
 		 555 aa  623  1e-177  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3668  IstA2  60.14 
 
 		 564 aa  614  9.999999999999999e-175  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0182144  normal  0.155285 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2530  IstA2  60.26 
 
 		 539 aa  600  1e-170  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000000787231  hitchhiker  0.00491611 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3045  IstA2  57.89 
 
 		 534 aa  556  1e-157  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000242102  hitchhiker  0.00242323 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5335  IstA2  57.89 
 
 		 534 aa  556  1e-157  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2079  IstA2  57.71 
 
 		 534 aa  553  1e-156  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0246359  hitchhiker  0.00457727 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3264  transposase  50.99 
 
 		 509 aa  482  1e-135  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.354242  normal  0.73638 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1175  IstA2  37.21 
 
 		 499 aa  261  2e-68  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0070794  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1016  IstA2  37.21 
 
 		 499 aa  261  2e-68  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.133303 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1501  IstA2  37.21 
 
 		 499 aa  261  2e-68  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0307163  hitchhiker  0.000409094 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2831  transposase  33.83 
 
 		 494 aa  251  2e-65  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2294  transposase  33.83 
 
 		 494 aa  251  2e-65  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2198  transposase  33.83 
 
 		 494 aa  251  2e-65  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2004  transposase  33.83 
 
 		 494 aa  251  2e-65  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4458  transposase  34.95 
 
 		 442 aa  228  3e-58  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000107543  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4983  transposase  33.12 
 
 		 497 aa  218  2e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.712907  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4958  transposase  33.12 
 
 		 502 aa  217  5e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0704  integrase catalytic region  32.56 
 
 		 498 aa  206  8e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.275152  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0024  transposase (25)  32.3 
 
 		 501 aa  188  2e-46  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0619695  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0485  transposase (25)  32.3 
 
 		 501 aa  188  2e-46  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1288  transposase (25)  32.3 
 
 		 501 aa  188  2e-46  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.540829  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2218  transposase (25)  32.3 
 
 		 501 aa  188  2e-46  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1227  Integrase catalytic region  34.41 
 
 		 497 aa  187  6e-46  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1995  hypothetical protein  33.08 
 
 		 504 aa  186  1.0000000000000001e-45  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0823  hypothetical protein  33.08 
 
 		 504 aa  186  1.0000000000000001e-45  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2200  hypothetical protein  33.84 
 
 		 334 aa  171  3e-41  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6519  integrase catalytic region  29.4 
 
 		 499 aa  171  4e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.126482 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0683  transposase  28.57 
 
 		 504 aa  164  3e-39  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3235  integrase catalytic subunit  30.68 
 
 		 508 aa  164  4.0000000000000004e-39  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4066  Integrase catalytic region  31.07 
 
 		 503 aa  164  5.0000000000000005e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2884  Integrase catalytic region  31.07 
 
 		 503 aa  164  5.0000000000000005e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.53685e-20 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2412  Integrase catalytic region  31.07 
 
 		 503 aa  163  7e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.305963 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0417  integrase catalytic subunit  29.92 
 
 		 509 aa  163  9e-39  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.328365  normal  0.377294 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1251  integrase catalytic subunit  29.92 
 
 		 509 aa  163  9e-39  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.539956  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0901  integrase catalytic subunit  31.86 
 
 		 499 aa  162  2e-38  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0261682  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3714  integrase catalytic subunit  31.86 
 
 		 499 aa  162  2e-38  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.16715  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3923  integrase catalytic subunit  31.62 
 
 		 499 aa  162  2e-38  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1791  Integrase catalytic region  32.15 
 
 		 507 aa  160  7e-38  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.459924  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0315  Integrase catalytic region  32.15 
 
 		 507 aa  160  7e-38  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.165744  normal  0.0795408 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0675  Integrase catalytic region  32.15 
 
 		 507 aa  160  7e-38  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.275744  hitchhiker  0.000336572 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2677  Integrase catalytic region  32.15 
 
 		 507 aa  160  7e-38  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.696745 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0554  integrase catalytic region  33.66 
 
 		 501 aa  159  1e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0566  integrase catalytic region  33.66 
 
 		 501 aa  159  1e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.478269  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0683  IS21 family transposase  30.92 
 
 		 505 aa  158  3e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1639  IS21 family transposase  30.92 
 
 		 505 aa  158  3e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3044  IS21 family transposase  30.92 
 
 		 505 aa  158  3e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3403  IS21 family transposase  30.92 
 
 		 505 aa  158  3e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2749  hypothetical protein  28.53 
 
 		 501 aa  157  4e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.596289  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0483  integrase catalytic subunit  30.8 
 
 		 508 aa  157  4e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3365  integrase catalytic subunit  30.8 
 
 		 508 aa  157  4e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0318  integrase catalytic subunit  31.21 
 
 		 499 aa  156  9e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0789  integrase catalytic subunit  31.21 
 
 		 499 aa  156  9e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.972954  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3914  integrase catalytic subunit  31.21 
 
 		 499 aa  156  9e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.639879  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1042  Integrase catalytic region  30.67 
 
 		 508 aa  156  1e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.861303  normal  0.109435 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4688  Integrase catalytic region  30.39 
 
 		 508 aa  156  1e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0648  Integrase catalytic region  30.25 
 
 		 488 aa  155  2e-36  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.509934 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3045  integrase catalytic subunit  31.67 
 
 		 499 aa  152  1e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3056  integrase catalytic subunit  31.67 
 
 		 499 aa  152  1e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.278904 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0041  Integrase catalytic region  34.24 
 
 		 501 aa  151  3e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.456904  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2875  integrase catalytic subunit  31.84 
 
 		 506 aa  150  4e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00853486  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0300  transposase  30.79 
 
 		 529 aa  150  7e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3052  integrase catalytic subunit  30.79 
 
 		 504 aa  149  2.0000000000000003e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.96491 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1802  transposase  37.29 
 
 		 464 aa  149  2.0000000000000003e-34  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.716345  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0155  transposase IstA for insertion sequence IS1326  28.78 
 
 		 507 aa  149  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.791462  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1039  Integrase catalytic region  30.79 
 
 		 496 aa  149  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0651609  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5140  integrase catalytic subunit  32.51 
 
 		 501 aa  148  3e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.920886  normal  0.438385 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5130  integrase catalytic subunit  32.51 
 
 		 501 aa  148  3e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.819554  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2463  integrase catalytic subunit  32.51 
 
 		 501 aa  148  3e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.587911  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3483  integrase catalytic subunit  32.51 
 
 		 501 aa  148  3e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.202546 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0908  integrase catalytic subunit  32.51 
 
 		 501 aa  148  3e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.530345  normal  0.680535 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3053  integrase catalytic subunit  32.51 
 
 		 501 aa  148  3e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00502865 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3390  integrase catalytic subunit  32.51 
 
 		 501 aa  148  3e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0417622 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5400  integrase catalytic region  32.92 
 
 		 502 aa  147  6e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4173  integrase catalytic region  32.92 
 
 		 502 aa  147  6e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2255  integrase catalytic region  32.92 
 
 		 502 aa  147  6e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.659658  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0130  transposase  29.28 
 
 		 502 aa  146  8.000000000000001e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.295597  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1070  Integrase catalytic region  27.36 
 
 		 496 aa  145  2e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.47791  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3173  Integrase catalytic region  27.6 
 
 		 496 aa  145  2e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0433  integrase catalytic subunit  30.95 
 
 		 504 aa  145  2e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.230494  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0850  integrase catalytic subunit  30.95 
 
 		 504 aa  145  2e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.314158  normal  1 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2408  Integrase catalytic region  27.36 
 
 		 496 aa  145  2e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5321  ISPsy20, transposase IstA  28.4 
 
 		 501 aa  144  3e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0069  Integrase catalytic region  29.82 
 
 		 502 aa  144  4e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.83421 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2866  Integrase catalytic region  31.17 
 
 		 503 aa  144  6e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00185303  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1294  Integrase catalytic region  28.28 
 
 		 504 aa  142  9.999999999999999e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0906  Integrase catalytic region  28.28 
 
 		 504 aa  142  9.999999999999999e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3489  Integrase catalytic region  28.28 
 
 		 504 aa  142  9.999999999999999e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0886  Integrase catalytic region  28.28 
 
 		 504 aa  142  9.999999999999999e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.106081  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2848  Integrase catalytic region  28.28 
 
 		 504 aa  142  9.999999999999999e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2255  Integrase catalytic region  28.28 
 
 		 504 aa  142  9.999999999999999e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2179  Integrase catalytic region  28.28 
 
 		 504 aa  142  9.999999999999999e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0004  integrase catalytic subunit  30.11 
 
 		 501 aa  143  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3204  integrase catalytic subunit  30.11 
 
 		 501 aa  143  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>