More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_4983 on replicon NC_009508
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009508  Swit_4958  transposase  99.2 
 
 		 502 aa  1018    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4983  transposase  100 
 
 		 497 aa  1024    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.712907  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5139  hypothetical protein  89.5 
 
 		 468 aa  786    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.235994  normal  0.315254 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0704  integrase catalytic region  77.71 
 
 		 498 aa  818    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.275152  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4458  transposase  35.88 
 
 		 442 aa  270  5.9999999999999995e-71  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000107543  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1501  IstA2  34.8 
 
 		 499 aa  263  4e-69  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0307163  hitchhiker  0.000409094 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1175  IstA2  34.8 
 
 		 499 aa  263  4e-69  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0070794  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1016  IstA2  34.8 
 
 		 499 aa  263  4e-69  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.133303 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2294  transposase  33.41 
 
 		 494 aa  258  2e-67  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2198  transposase  33.41 
 
 		 494 aa  258  2e-67  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2004  transposase  33.41 
 
 		 494 aa  258  2e-67  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2831  transposase  33.41 
 
 		 494 aa  258  2e-67  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2311  transposase  51.77 
 
 		 273 aa  237  3e-61  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.280065  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2875  integrase catalytic subunit  33.41 
 
 		 506 aa  235  1.0000000000000001e-60  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00853486  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0566  integrase catalytic region  34.49 
 
 		 501 aa  233  6e-60  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.478269  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0554  integrase catalytic region  34.49 
 
 		 501 aa  233  6e-60  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1227  Integrase catalytic region  32.27 
 
 		 497 aa  232  1e-59  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4066  Integrase catalytic region  32.9 
 
 		 503 aa  231  2e-59  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2884  Integrase catalytic region  32.9 
 
 		 503 aa  231  2e-59  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.53685e-20 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2412  Integrase catalytic region  32.9 
 
 		 503 aa  231  2e-59  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.305963 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0433  integrase catalytic subunit  33.2 
 
 		 504 aa  224  4e-57  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.230494  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0850  integrase catalytic subunit  33.2 
 
 		 504 aa  224  4e-57  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.314158  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5140  integrase catalytic subunit  32.85 
 
 		 501 aa  223  4.9999999999999996e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.920886  normal  0.438385 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5130  integrase catalytic subunit  32.85 
 
 		 501 aa  223  4.9999999999999996e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.819554  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3053  integrase catalytic subunit  32.85 
 
 		 501 aa  223  4.9999999999999996e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00502865 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3483  integrase catalytic subunit  32.85 
 
 		 501 aa  223  4.9999999999999996e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.202546 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3390  integrase catalytic subunit  32.85 
 
 		 501 aa  223  4.9999999999999996e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0417622 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0908  integrase catalytic subunit  32.85 
 
 		 501 aa  223  4.9999999999999996e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.530345  normal  0.680535 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2463  integrase catalytic subunit  32.85 
 
 		 501 aa  223  4.9999999999999996e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.587911  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1780  transposase  33.9 
 
 		 558 aa  218  1e-55  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.466747  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1871  transposase  33.19 
 
 		 565 aa  212  1e-53  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.333339  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0221  transposase  33.19 
 
 		 565 aa  212  1e-53  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.113746  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3017  transposase  33.19 
 
 		 565 aa  212  1e-53  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3226  transposase  33.19 
 
 		 565 aa  212  1e-53  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0683  transposase  30.18 
 
 		 504 aa  211  2e-53  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0041  Integrase catalytic region  31.87 
 
 		 501 aa  208  2e-52  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.456904  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3045  integrase catalytic subunit  31.66 
 
 		 499 aa  207  3e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3056  integrase catalytic subunit  31.66 
 
 		 499 aa  207  3e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.278904 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0648  Integrase catalytic region  32.51 
 
 		 488 aa  206  7e-52  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.509934 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3044  IS21 family transposase  33.33 
 
 		 505 aa  205  1e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3403  IS21 family transposase  33.33 
 
 		 505 aa  205  1e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0683  IS21 family transposase  33.33 
 
 		 505 aa  205  1e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1639  IS21 family transposase  33.33 
 
 		 505 aa  205  1e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0315  Integrase catalytic region  32.99 
 
 		 507 aa  204  2e-51  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.165744  normal  0.0795408 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1791  Integrase catalytic region  32.99 
 
 		 507 aa  204  2e-51  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.459924  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0675  Integrase catalytic region  32.99 
 
 		 507 aa  204  2e-51  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.275744  hitchhiker  0.000336572 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2677  Integrase catalytic region  32.99 
 
 		 507 aa  204  2e-51  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.696745 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2866  Integrase catalytic region  31.73 
 
 		 503 aa  203  5e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00185303  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0901  integrase catalytic subunit  31.07 
 
 		 499 aa  202  9.999999999999999e-51  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0261682  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3714  integrase catalytic subunit  31.07 
 
 		 499 aa  202  9.999999999999999e-51  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.16715  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1294  Integrase catalytic region  30 
 
 		 504 aa  201  1.9999999999999998e-50  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0886  Integrase catalytic region  30 
 
 		 504 aa  201  1.9999999999999998e-50  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.106081  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0016  Integrase catalytic region  30 
 
 		 504 aa  201  1.9999999999999998e-50  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0423553  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2179  Integrase catalytic region  30 
 
 		 504 aa  201  1.9999999999999998e-50  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6519  integrase catalytic region  30.77 
 
 		 499 aa  202  1.9999999999999998e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.126482 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2255  Integrase catalytic region  30 
 
 		 504 aa  201  1.9999999999999998e-50  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2848  Integrase catalytic region  30 
 
 		 504 aa  201  1.9999999999999998e-50  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3489  Integrase catalytic region  30 
 
 		 504 aa  201  1.9999999999999998e-50  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1436  Integrase catalytic region  30 
 
 		 504 aa  201  1.9999999999999998e-50  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0906  Integrase catalytic region  30 
 
 		 504 aa  201  1.9999999999999998e-50  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5400  integrase catalytic region  31.65 
 
 		 502 aa  201  3e-50  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4173  integrase catalytic region  31.65 
 
 		 502 aa  201  3e-50  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2255  integrase catalytic region  31.65 
 
 		 502 aa  201  3e-50  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.659658  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4982  integrase catalytic subunit  34.18 
 
 		 423 aa  201  3.9999999999999996e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0318  integrase catalytic subunit  31.07 
 
 		 499 aa  201  3.9999999999999996e-50  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0789  integrase catalytic subunit  31.07 
 
 		 499 aa  201  3.9999999999999996e-50  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.972954  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3914  integrase catalytic subunit  31.07 
 
 		 499 aa  201  3.9999999999999996e-50  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.639879  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3264  transposase  31.06 
 
 		 509 aa  198  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.354242  normal  0.73638 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0417  integrase catalytic subunit  32.89 
 
 		 509 aa  198  1.0000000000000001e-49  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.328365  normal  0.377294 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1251  integrase catalytic subunit  32.89 
 
 		 509 aa  198  1.0000000000000001e-49  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.539956  normal  1 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4688  Integrase catalytic region  32.21 
 
 		 508 aa  198  2.0000000000000003e-49  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0024  transposase (25)  34.46 
 
 		 501 aa  198  2.0000000000000003e-49  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0619695  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0485  transposase (25)  34.46 
 
 		 501 aa  198  2.0000000000000003e-49  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1288  transposase (25)  34.46 
 
 		 501 aa  198  2.0000000000000003e-49  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.540829  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2218  transposase (25)  34.46 
 
 		 501 aa  198  2.0000000000000003e-49  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1042  Integrase catalytic region  31.4 
 
 		 508 aa  197  4.0000000000000005e-49  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.861303  normal  0.109435 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0069  Integrase catalytic region  30.64 
 
 		 502 aa  197  4.0000000000000005e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.83421 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3173  Integrase catalytic region  32.02 
 
 		 496 aa  197  5.000000000000001e-49  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1039  Integrase catalytic region  31.88 
 
 		 496 aa  195  1e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0651609  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3945  transposase  68.61 
 
 		 145 aa  194  3e-48  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3923  integrase catalytic subunit  29.91 
 
 		 499 aa  192  1e-47  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1070  Integrase catalytic region  31.6 
 
 		 496 aa  192  1e-47  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.47791  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2408  Integrase catalytic region  31.6 
 
 		 496 aa  192  1e-47  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0458  transposase  32.77 
 
 		 584 aa  192  2e-47  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1643  transposase  32.62 
 
 		 493 aa  192  2e-47  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.432337  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1657  transposase  32.62 
 
 		 493 aa  192  2e-47  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0483  integrase catalytic subunit  31.46 
 
 		 508 aa  191  2.9999999999999997e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3365  integrase catalytic subunit  31.46 
 
 		 508 aa  191  2.9999999999999997e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4517  IstA2  32.84 
 
 		 555 aa  190  5.999999999999999e-47  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0130  transposase  30.59 
 
 		 502 aa  189  8e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.295597  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2530  IstA2  32.97 
 
 		 539 aa  189  9e-47  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000000787231  hitchhiker  0.00491611 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3656  IstA2  33.19 
 
 		 556 aa  189  9e-47  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.165396 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3668  IstA2  32.53 
 
 		 564 aa  189  9e-47  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0182144  normal  0.155285 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1464  putative transposase  31.49 
 
 		 497 aa  188  2e-46  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2997  putative transposase  31.49 
 
 		 497 aa  188  2e-46  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3304  putative transposase  31.49 
 
 		 497 aa  188  2e-46  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.299203 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2556  integrase catalytic subunit  31.32 
 
 		 501 aa  187  4e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2899  integrase catalytic subunit  31.32 
 
 		 501 aa  187  4e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4866  integrase catalytic subunit  31.32 
 
 		 501 aa  187  4e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4956  integrase catalytic subunit  31.32 
 
 		 501 aa  187  4e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>