295 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_0339 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013411  GYMC61_0339  hypothetical protein  100 
 
 		 387 aa  797    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3067  hypothetical protein  97.83 
 
 		 501 aa  657    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2738  Integrase catalytic region  74.77 
 
 		 501 aa  517  1.0000000000000001e-145  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0024  transposase (25)  37.82 
 
 		 501 aa  114  3e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0619695  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0485  transposase (25)  37.82 
 
 		 501 aa  114  3e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1288  transposase (25)  37.82 
 
 		 501 aa  114  3e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.540829  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2200  hypothetical protein  37.82 
 
 		 334 aa  114  3e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2218  transposase (25)  37.82 
 
 		 501 aa  114  3e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2749  hypothetical protein  25.77 
 
 		 501 aa  113  7.000000000000001e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.596289  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1802  transposase  32.39 
 
 		 464 aa  105  1e-21  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.716345  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0823  hypothetical protein  29.64 
 
 		 504 aa  105  1e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1995  hypothetical protein  29.64 
 
 		 504 aa  105  1e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1659  transposase  34.41 
 
 		 323 aa  101  2e-20  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0706  transposase  36.09 
 
 		 309 aa  95.9  1e-18  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.642121  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1799  transposase  28.94 
 
 		 507 aa  91.3  2e-17  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.161181  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0314  transposase  35.5 
 
 		 309 aa  92  2e-17  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.00173653  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0028  transposase  35.5 
 
 		 309 aa  92  2e-17  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.355464  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1412  transposase  25.07 
 
 		 507 aa  87.8  3e-16  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0995  transposase  25.59 
 
 		 500 aa  86.3  8e-16  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0155  transposase IstA for insertion sequence IS1326  32.09 
 
 		 507 aa  81.3  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.791462  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1016  IstA2  33.74 
 
 		 499 aa  78.6  0.0000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.133303 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1501  IstA2  33.74 
 
 		 499 aa  78.6  0.0000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0307163  hitchhiker  0.000409094 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1175  IstA2  33.74 
 
 		 499 aa  78.6  0.0000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0070794  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0683  transposase  31.61 
 
 		 504 aa  75.9  0.000000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2884  Integrase catalytic region  28.83 
 
 		 503 aa  75.5  0.000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.53685e-20 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4066  Integrase catalytic region  28.83 
 
 		 503 aa  75.5  0.000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1227  Integrase catalytic region  34.33 
 
 		 497 aa  75.1  0.000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2412  Integrase catalytic region  30.52 
 
 		 503 aa  73.9  0.000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.305963 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4458  transposase  27.34 
 
 		 442 aa  69.3  0.0000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000107543  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1657  transposase  28.21 
 
 		 493 aa  68.9  0.0000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1643  transposase  28.21 
 
 		 493 aa  68.9  0.0000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.432337  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3226  transposase  29.12 
 
 		 565 aa  68.2  0.0000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2004  transposase  24.78 
 
 		 494 aa  68.2  0.0000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2198  transposase  24.78 
 
 		 494 aa  68.2  0.0000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2294  transposase  24.78 
 
 		 494 aa  68.2  0.0000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2831  transposase  24.78 
 
 		 494 aa  68.2  0.0000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2875  integrase catalytic subunit  26.94 
 
 		 506 aa  68.6  0.0000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00853486  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0221  transposase  29.12 
 
 		 565 aa  68.2  0.0000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.113746  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3017  transposase  29.12 
 
 		 565 aa  68.2  0.0000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1871  transposase  29.12 
 
 		 565 aa  68.2  0.0000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.333339  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3264  transposase  31.13 
 
 		 509 aa  67.4  0.0000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.354242  normal  0.73638 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1971  integrase catalytic subunit  28.9 
 
 		 373 aa  67.4  0.0000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0139673  normal  0.752349 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0300  transposase  28.11 
 
 		 529 aa  66.2  0.0000000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1780  transposase  29.12 
 
 		 558 aa  65.9  0.000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.466747  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0483  integrase catalytic subunit  30.64 
 
 		 508 aa  65.1  0.000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3365  integrase catalytic subunit  30.64 
 
 		 508 aa  65.1  0.000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0417  integrase catalytic subunit  34.69 
 
 		 509 aa  65.1  0.000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.328365  normal  0.377294 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1251  integrase catalytic subunit  34.69 
 
 		 509 aa  65.1  0.000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.539956  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1139  Integrase catalytic region  29.03 
 
 		 474 aa  65.1  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.650058  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0315  Integrase catalytic region  26.46 
 
 		 507 aa  64.7  0.000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.165744  normal  0.0795408 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2677  Integrase catalytic region  26.46 
 
 		 507 aa  64.7  0.000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.696745 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1791  Integrase catalytic region  26.46 
 
 		 507 aa  64.7  0.000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.459924  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0675  Integrase catalytic region  26.46 
 
 		 507 aa  64.7  0.000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.275744  hitchhiker  0.000336572 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1589  Integrase catalytic region  30.71 
 
 		 502 aa  64.3  0.000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4858  Integrase catalytic region  30.71 
 
 		 502 aa  63.9  0.000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0252827  normal  0.0109178 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4855  Integrase catalytic region  30.71 
 
 		 502 aa  63.9  0.000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000769666 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1063  Integrase catalytic region  30.71 
 
 		 502 aa  63.9  0.000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.877216  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2874  Integrase catalytic region  30.71 
 
 		 502 aa  63.9  0.000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1052  Integrase catalytic region  30.71 
 
 		 502 aa  63.5  0.000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.437105  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1072  Integrase catalytic region  30.71 
 
 		 502 aa  63.9  0.000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0943  Integrase catalytic region  30.71 
 
 		 502 aa  63.5  0.000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.346378  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6478  Integrase catalytic region  30.71 
 
 		 507 aa  63.9  0.000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2939  Integrase catalytic region  30.71 
 
 		 502 aa  63.5  0.000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.620801  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03390  transposase  26.96 
 
 		 494 aa  63.2  0.000000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.309069  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1042  Integrase catalytic region  30.06 
 
 		 508 aa  62.8  0.000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.861303  normal  0.109435 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1097  Integrase catalytic region  30.71 
 
 		 474 aa  62.8  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.81424  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0648  Integrase catalytic region  26.07 
 
 		 488 aa  61.6  0.00000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.509934 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0566  integrase catalytic region  27.46 
 
 		 501 aa  62  0.00000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.478269  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0554  integrase catalytic region  27.46 
 
 		 501 aa  62  0.00000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4688  Integrase catalytic region  30.06 
 
 		 508 aa  61.6  0.00000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3403  IS21 family transposase  29.14 
 
 		 505 aa  60.1  0.00000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3044  IS21 family transposase  29.14 
 
 		 505 aa  60.1  0.00000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1639  IS21 family transposase  29.14 
 
 		 505 aa  60.1  0.00000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0683  IS21 family transposase  29.14 
 
 		 505 aa  60.1  0.00000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3235  integrase catalytic subunit  25.22 
 
 		 508 aa  59.7  0.00000009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0069  Integrase catalytic region  28.25 
 
 		 502 aa  58.5  0.0000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.83421 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0901  integrase catalytic subunit  28.25 
 
 		 499 aa  57.4  0.0000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0261682  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3714  integrase catalytic subunit  28.25 
 
 		 499 aa  57.4  0.0000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.16715  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3923  integrase catalytic subunit  28.25 
 
 		 499 aa  57  0.0000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3280  transposase  26.9 
 
 		 363 aa  56.6  0.0000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.32687 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5321  ISPsy20, transposase IstA  30.77 
 
 		 501 aa  56.2  0.0000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3717  integrase catalytic subunit  30.4 
 
 		 412 aa  56.2  0.0000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0077  insertion sequence transposase  28.89 
 
 		 340 aa  55.8  0.000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4054  transposase  31.11 
 
 		 491 aa  56.2  0.000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1628  transposase  31.11 
 
 		 491 aa  56.2  0.000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1904  insertion sequence transposase  28.89 
 
 		 340 aa  55.8  0.000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00789725 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3532  transposase  31.11 
 
 		 491 aa  56.2  0.000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.447396  normal  0.0612525 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1441  transposase  31.11 
 
 		 491 aa  56.2  0.000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.31725  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1457  integrase  28.48 
 
 		 410 aa  55.8  0.000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3393  transposase  31.11 
 
 		 491 aa  56.2  0.000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.39722  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3336  insertion sequence transposase  31.11 
 
 		 491 aa  56.2  0.000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3634  putative transposase  28.89 
 
 		 338 aa  55.8  0.000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4125  insertion sequence transposase  28.89 
 
 		 340 aa  55.8  0.000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.44357  normal  0.500657 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3672  insertion sequence transposase  28.89 
 
 		 340 aa  55.8  0.000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000543988  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3800  insertion sequence transposase  28.89 
 
 		 340 aa  55.8  0.000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1238  transposase  31.11 
 
 		 491 aa  56.2  0.000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00126413 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0036  transposase  31.11 
 
 		 491 aa  56.2  0.000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0634  insertion sequence transposase  28.89 
 
 		 340 aa  55.8  0.000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0933756  normal  0.145557 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0448  insertion sequence transposase  28.89 
 
 		 340 aa  55.8  0.000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.453908  hitchhiker  0.00000287146 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0689  insertion sequence transposase  28.89 
 
 		 340 aa  55.8  0.000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>