More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_1097 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_1052  Integrase catalytic region  93.23 
 
 
502 aa  929    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.437105  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1063  Integrase catalytic region  93.82 
 
 
502 aa  934    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.877216  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4855  Integrase catalytic region  93.63 
 
 
502 aa  934    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000769666 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1589  Integrase catalytic region  93.43 
 
 
502 aa  931    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1097  Integrase catalytic region  100 
 
 
474 aa  956    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.81424  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0943  Integrase catalytic region  93.03 
 
 
502 aa  926    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.346378  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2874  Integrase catalytic region  93.63 
 
 
502 aa  934    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4858  Integrase catalytic region  93.63 
 
 
502 aa  934    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0252827  normal  0.0109178 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6478  Integrase catalytic region  92.11 
 
 
507 aa  919    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1072  Integrase catalytic region  93.63 
 
 
502 aa  932    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1139  Integrase catalytic region  98.73 
 
 
474 aa  942    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.650058  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2939  Integrase catalytic region  93.43 
 
 
502 aa  931    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.620801  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0317  transposase, IS21 family  55.85 
 
 
496 aa  492  9.999999999999999e-139  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0223423  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3159  transposase, IS21 family  55.65 
 
 
496 aa  482  1e-135  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2090  transposase, IS21 family  55.65 
 
 
496 aa  482  1e-135  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4040  hypothetical protein  55.65 
 
 
496 aa  482  1e-135  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0010  transposase, IS21 family  55.24 
 
 
496 aa  480  1e-134  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2468  integrase catalytic subunit  51 
 
 
514 aa  467  9.999999999999999e-131  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3280  transposase  52.5 
 
 
363 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.32687 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1510  integrase catalytic region  38.01 
 
 
427 aa  182  1e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1464  integrase catalytic region  38.01 
 
 
427 aa  182  1e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2452  integrase catalytic region  38.01 
 
 
427 aa  182  1e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.227029 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2798  integrase catalytic region  38.01 
 
 
427 aa  182  1e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3888  integrase catalytic region  38.01 
 
 
427 aa  182  1e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4700  integrase catalytic region  38.01 
 
 
427 aa  182  1e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.670986  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5534  integrase catalytic region  38.01 
 
 
427 aa  182  1e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010373  M446_7013  hypothetical protein  38.01 
 
 
427 aa  182  1e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6916  integrase catalytic region  38.01 
 
 
427 aa  182  1e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.803027  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1457  integrase  36.51 
 
 
410 aa  171  3e-41  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3279  IS21 family transposase  63.78 
 
 
131 aa  161  2e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.175621 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5106  integrase catalytic subunit  34.26 
 
 
431 aa  151  3e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.214322  normal  0.182706 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0210  transposase, IS21 family  28.57 
 
 
417 aa  150  5e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000847159 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3717  integrase catalytic subunit  32.76 
 
 
412 aa  146  8.000000000000001e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1009  integrase catalytic subunit  32.08 
 
 
412 aa  144  5e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00535974  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1319  integrase catalytic subunit  32.08 
 
 
412 aa  144  5e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2854  integrase catalytic subunit  32.08 
 
 
412 aa  144  5e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.230802  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6841  integrase catalytic subunit  34.39 
 
 
257 aa  140  4.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6519  integrase catalytic region  28.94 
 
 
499 aa  140  6e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.126482 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2538  integrase catalytic subunit  33.45 
 
 
424 aa  139  1e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.178355  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0119  Integrase catalytic region  33.22 
 
 
449 aa  137  4e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1081  Integrase catalytic region  33.22 
 
 
449 aa  137  4e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.333924  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4458  transposase  28.6 
 
 
442 aa  134  5e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000107543  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0566  integrase catalytic region  28.66 
 
 
501 aa  133  6.999999999999999e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.478269  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0554  integrase catalytic region  28.66 
 
 
501 aa  133  6.999999999999999e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3338  IS100, transposase  32.05 
 
 
340 aa  132  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0136  insertion sequence transposase  31.75 
 
 
340 aa  131  3e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0217084 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1049  insertion sequence transposase  31.75 
 
 
340 aa  131  3e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0362189  normal  0.0286616 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0689  insertion sequence transposase  31.75 
 
 
340 aa  131  3e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0077  insertion sequence transposase  31.75 
 
 
340 aa  131  3e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2171  insertion sequence transposase  31.75 
 
 
340 aa  131  3e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0335942 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2155  insertion sequence transposase  31.75 
 
 
340 aa  131  3e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0564082  normal  0.0481856 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0448  insertion sequence transposase  31.75 
 
 
340 aa  131  3e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.453908  hitchhiker  0.00000287146 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0314  insertion sequence transposase  31.75 
 
 
340 aa  131  3e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.415268  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0634  insertion sequence transposase  31.75 
 
 
340 aa  131  3e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0933756  normal  0.145557 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0888  insertion sequence transposase  31.75 
 
 
340 aa  131  3e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0176798  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0530  insertion sequence transposase  31.75 
 
 
340 aa  131  3e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000118737  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1904  insertion sequence transposase  31.75 
 
 
340 aa  131  3e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00789725 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1294  insertion sequence transposase  31.75 
 
 
340 aa  131  3e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2088  insertion sequence transposase  31.75 
 
 
340 aa  131  3e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.207066 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2025  insertion sequence transposase  31.75 
 
 
340 aa  131  3e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2797  insertion sequence transposase  31.75 
 
 
340 aa  131  3e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000133045  normal  0.199341 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3951  insertion sequence transposase  31.75 
 
 
340 aa  131  3e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3672  insertion sequence transposase  31.75 
 
 
340 aa  131  3e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000543988  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3800  insertion sequence transposase  31.75 
 
 
340 aa  131  3e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0015  IS21 family transposase  31.75 
 
 
340 aa  131  3e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2527  insertion sequence transposase  31.75 
 
 
340 aa  131  3e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2586  insertion sequence transposase  31.75 
 
 
340 aa  131  3e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00244507  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3154  insertion sequence transposase  31.75 
 
 
340 aa  131  3e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2905  insertion sequence transposase  31.75 
 
 
340 aa  131  3e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00121621  normal  0.994964 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2960  insertion sequence transposase  31.75 
 
 
340 aa  131  3e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00154243 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4125  insertion sequence transposase  31.75 
 
 
340 aa  131  3e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.44357  normal  0.500657 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3444  insertion sequence transposase  31.75 
 
 
340 aa  131  3e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2677  insertion sequence transposase  31.75 
 
 
340 aa  131  3e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.585168  normal  0.0366075 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3487  insertion sequence transposase  31.75 
 
 
340 aa  131  3e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.169046 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3216  insertion sequence transposase  31.75 
 
 
340 aa  131  3e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000564447  normal  0.0522706 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3634  putative transposase  32.05 
 
 
338 aa  131  3e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3280  insertion sequence transposase  31.75 
 
 
340 aa  131  3e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0112823 
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0001  IS21 family transposase  31.75 
 
 
340 aa  131  3e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000122483 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2392  insertion sequence transposase  31.75 
 
 
340 aa  131  3e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.392902  normal 
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0029  IS21 family transposase  31.75 
 
 
340 aa  131  3e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0048  IS100 transposase orfA  31.85 
 
 
340 aa  130  5.0000000000000004e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1554  Integrase catalytic region  33.33 
 
 
413 aa  130  7.000000000000001e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0318  integrase catalytic subunit  29.38 
 
 
499 aa  130  7.000000000000001e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0789  integrase catalytic subunit  29.38 
 
 
499 aa  130  7.000000000000001e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.972954  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3914  integrase catalytic subunit  29.38 
 
 
499 aa  130  7.000000000000001e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.639879  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1305  transposase  32.17 
 
 
491 aa  129  9.000000000000001e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0036  transposase  32.17 
 
 
491 aa  129  9.000000000000001e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1238  transposase  32.17 
 
 
491 aa  129  9.000000000000001e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00126413 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1939  transposase  32.17 
 
 
491 aa  129  9.000000000000001e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0012517  normal  0.673499 
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0098  IS21 family transposase  32.17 
 
 
491 aa  129  9.000000000000001e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  5.2973499999999993e-20  hitchhiker  2.05788e-63 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4054  transposase  32.17 
 
 
491 aa  129  9.000000000000001e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3923  integrase catalytic subunit  29.17 
 
 
499 aa  129  9.000000000000001e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2877  transposase  32.17 
 
 
491 aa  129  9.000000000000001e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3336  insertion sequence transposase  32.17 
 
 
491 aa  129  9.000000000000001e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3393  transposase  32.17 
 
 
491 aa  129  9.000000000000001e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.39722  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3532  transposase  32.17 
 
 
491 aa  129  9.000000000000001e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.447396  normal  0.0612525 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1183  transposase  32.48 
 
 
489 aa  129  1.0000000000000001e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000138357 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1441  transposase  31.85 
 
 
491 aa  128  2.0000000000000002e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.31725  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1628  transposase  31.85 
 
 
491 aa  128  2.0000000000000002e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3056  integrase catalytic subunit  28.24 
 
 
499 aa  127  4.0000000000000003e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.278904 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>