More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_3280 on replicon NC_008543
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008543  Bcen2424_3280  transposase  100 
 
 		 363 aa  742    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.32687 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0317  transposase, IS21 family  64.15 
 
 		 496 aa  450  1e-125  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0223423  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2090  transposase, IS21 family  64.15 
 
 		 496 aa  434  1e-121  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3159  transposase, IS21 family  64.15 
 
 		 496 aa  434  1e-121  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4040  hypothetical protein  64.15 
 
 		 496 aa  434  1e-121  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0010  transposase, IS21 family  63.03 
 
 		 496 aa  431  1e-120  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2468  integrase catalytic subunit  58.87 
 
 		 514 aa  416  9.999999999999999e-116  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4858  Integrase catalytic region  57.22 
 
 		 502 aa  402  1e-111  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0252827  normal  0.0109178 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2874  Integrase catalytic region  57.22 
 
 		 502 aa  402  1e-111  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4855  Integrase catalytic region  57.22 
 
 		 502 aa  402  1e-111  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000769666 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1589  Integrase catalytic region  57.5 
 
 		 502 aa  402  1e-111  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1063  Integrase catalytic region  57.22 
 
 		 502 aa  401  9.999999999999999e-111  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.877216  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0943  Integrase catalytic region  57.22 
 
 		 502 aa  401  9.999999999999999e-111  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.346378  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2939  Integrase catalytic region  56.94 
 
 		 502 aa  400  9.999999999999999e-111  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.620801  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6478  Integrase catalytic region  57.22 
 
 		 507 aa  400  9.999999999999999e-111  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1072  Integrase catalytic region  57.22 
 
 		 502 aa  401  9.999999999999999e-111  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1052  Integrase catalytic region  57.22 
 
 		 502 aa  401  9.999999999999999e-111  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.437105  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1139  Integrase catalytic region  52.5 
 
 		 474 aa  347  2e-94  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.650058  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1097  Integrase catalytic region  52.5 
 
 		 474 aa  346  4e-94  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.81424  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4700  integrase catalytic region  38.03 
 
 		 427 aa  136  4e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.670986  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1464  integrase catalytic region  38.03 
 
 		 427 aa  136  4e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1510  integrase catalytic region  38.03 
 
 		 427 aa  136  4e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2452  integrase catalytic region  38.03 
 
 		 427 aa  136  4e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.227029 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3888  integrase catalytic region  38.03 
 
 		 427 aa  136  4e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5534  integrase catalytic region  38.03 
 
 		 427 aa  136  4e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2798  integrase catalytic region  38.03 
 
 		 427 aa  136  4e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6916  integrase catalytic region  38.03 
 
 		 427 aa  136  4e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.803027  normal  1 
 
 
-
 
NC_010373  M446_7013  hypothetical protein  38.03 
 
 		 427 aa  136  4e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1457  integrase  32.84 
 
 		 410 aa  124  3e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4066  Integrase catalytic region  30.93 
 
 		 503 aa  122  7e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2884  Integrase catalytic region  30.93 
 
 		 503 aa  122  7e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.53685e-20 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2412  Integrase catalytic region  34.48 
 
 		 503 aa  122  9e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.305963 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4983  transposase  29.34 
 
 		 497 aa  119  7e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.712907  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4958  transposase  29.34 
 
 		 502 aa  119  7.999999999999999e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5139  hypothetical protein  29.34 
 
 		 468 aa  119  9.999999999999999e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.235994  normal  0.315254 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2875  integrase catalytic subunit  29.39 
 
 		 506 aa  118  9.999999999999999e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00853486  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2255  integrase catalytic region  30.94 
 
 		 502 aa  117  3e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.659658  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4173  integrase catalytic region  30.94 
 
 		 502 aa  117  3e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5400  integrase catalytic region  30.94 
 
 		 502 aa  117  3e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1227  Integrase catalytic region  34.3 
 
 		 497 aa  115  1.0000000000000001e-24  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0704  integrase catalytic region  28.39 
 
 		 498 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.275152  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4982  integrase catalytic subunit  29.55 
 
 		 423 aa  113  6e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2866  Integrase catalytic region  31.61 
 
 		 503 aa  112  9e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00185303  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0016  Integrase catalytic region  30.13 
 
 		 504 aa  110  4.0000000000000004e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0423553  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1436  Integrase catalytic region  30.13 
 
 		 504 aa  110  4.0000000000000004e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3053  integrase catalytic subunit  29.55 
 
 		 501 aa  110  4.0000000000000004e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00502865 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2463  integrase catalytic subunit  29.55 
 
 		 501 aa  110  4.0000000000000004e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.587911  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0908  integrase catalytic subunit  29.55 
 
 		 501 aa  110  4.0000000000000004e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.530345  normal  0.680535 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3489  Integrase catalytic region  30.13 
 
 		 504 aa  110  4.0000000000000004e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2255  Integrase catalytic region  30.13 
 
 		 504 aa  110  4.0000000000000004e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2848  Integrase catalytic region  30.13 
 
 		 504 aa  110  4.0000000000000004e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0886  Integrase catalytic region  30.13 
 
 		 504 aa  110  4.0000000000000004e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.106081  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1294  Integrase catalytic region  30.13 
 
 		 504 aa  110  4.0000000000000004e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5130  integrase catalytic subunit  29.55 
 
 		 501 aa  110  4.0000000000000004e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.819554  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0906  Integrase catalytic region  30.13 
 
 		 504 aa  110  4.0000000000000004e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2179  Integrase catalytic region  30.13 
 
 		 504 aa  110  4.0000000000000004e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3483  integrase catalytic subunit  29.55 
 
 		 501 aa  110  4.0000000000000004e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.202546 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3390  integrase catalytic subunit  29.55 
 
 		 501 aa  110  4.0000000000000004e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0417622 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5140  integrase catalytic subunit  29.55 
 
 		 501 aa  110  4.0000000000000004e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.920886  normal  0.438385 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5106  integrase catalytic subunit  36.32 
 
 		 431 aa  108  1e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.214322  normal  0.182706 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1791  putative transposase catalytic subunit  26.88 
 
 		 507 aa  107  2e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1009  integrase catalytic subunit  31.31 
 
 		 412 aa  107  2e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00535974  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1319  integrase catalytic subunit  31.31 
 
 		 412 aa  107  2e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2854  integrase catalytic subunit  31.31 
 
 		 412 aa  107  2e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.230802  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3717  integrase catalytic subunit  31.31 
 
 		 412 aa  107  3e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0433  integrase catalytic subunit  33.04 
 
 		 504 aa  106  6e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.230494  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0850  integrase catalytic subunit  33.04 
 
 		 504 aa  106  6e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.314158  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0119  Integrase catalytic region  32.17 
 
 		 449 aa  106  6e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1081  Integrase catalytic region  32.17 
 
 		 449 aa  106  6e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.333924  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1554  Integrase catalytic region  31.28 
 
 		 413 aa  104  2e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0199  Integrase catalytic region  27.04 
 
 		 512 aa  103  4e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0240231 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6529  Integrase catalytic region  27.04 
 
 		 512 aa  103  4e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.277485  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4737  integrase catalytic region  27.62 
 
 		 510 aa  103  5e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6239  integrase catalytic region  27.62 
 
 		 510 aa  103  5e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2511  integrase catalytic region  27.62 
 
 		 510 aa  103  5e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2295  integrase catalytic region  27.62 
 
 		 510 aa  103  5e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.218611  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0018  integrase catalytic region  27.62 
 
 		 510 aa  103  5e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5653  integrase catalytic region  27.62 
 
 		 510 aa  103  5e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3873  Integrase catalytic region  25.38 
 
 		 531 aa  102  9e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0464732  normal  0.0452112 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6519  integrase catalytic region  27.19 
 
 		 499 aa  101  2e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.126482 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1971  integrase catalytic subunit  30.66 
 
 		 373 aa  101  2e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0139673  normal  0.752349 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1512  Integrase catalytic region  29.11 
 
 		 425 aa  100  3e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3923  integrase catalytic subunit  28.07 
 
 		 499 aa  100  3e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3693  Integrase catalytic region  29.11 
 
 		 425 aa  100  3e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3058  Integrase catalytic region  29.11 
 
 		 425 aa  100  3e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1326  Integrase catalytic region  29.54 
 
 		 425 aa  100  4e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0786  Integrase catalytic region  30.21 
 
 		 410 aa  100  5e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1464  putative transposase  29.15 
 
 		 497 aa  100  5e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2997  putative transposase  29.15 
 
 		 497 aa  100  5e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3304  putative transposase  29.15 
 
 		 497 aa  100  5e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.299203 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3857  Integrase catalytic region  26.2 
 
 		 508 aa  99  1e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4458  transposase  30.95 
 
 		 442 aa  99  1e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000107543  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1192  Integrase catalytic region  26.2 
 
 		 508 aa  99  1e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6440  Integrase catalytic region  26.2 
 
 		 508 aa  99  1e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000175464 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2311  transposase  30.53 
 
 		 273 aa  98.2  2e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.280065  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0901  integrase catalytic subunit  27.78 
 
 		 499 aa  97.1  5e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0261682  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3714  integrase catalytic subunit  27.78 
 
 		 499 aa  97.1  5e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.16715  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3045  integrase catalytic subunit  31.11 
 
 		 499 aa  96.7  6e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3056  integrase catalytic subunit  31.11 
 
 		 499 aa  96.7  6e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.278904 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0210  transposase, IS21 family  25 
 
 		 417 aa  95.9  9e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000847159 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>