More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_3857 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010681  Bphyt_3857  Integrase catalytic region  100 
 
 		 508 aa  1056    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1791  putative transposase catalytic subunit  70.41 
 
 		 507 aa  746    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0199  Integrase catalytic region  60.63 
 
 		 512 aa  645    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0240231 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6529  Integrase catalytic region  60.63 
 
 		 512 aa  645    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.277485  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1192  Integrase catalytic region  100 
 
 		 508 aa  1056    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6440  Integrase catalytic region  100 
 
 		 508 aa  1056    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000175464 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0018  integrase catalytic region  59.84 
 
 		 510 aa  616  1e-175  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2295  integrase catalytic region  59.84 
 
 		 510 aa  616  1e-175  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.218611  normal  1 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6239  integrase catalytic region  59.84 
 
 		 510 aa  616  1e-175  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2511  integrase catalytic region  59.84 
 
 		 510 aa  616  1e-175  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4737  integrase catalytic region  59.84 
 
 		 510 aa  616  1e-175  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5653  integrase catalytic region  59.84 
 
 		 510 aa  616  1e-175  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0638  Integrase catalytic region  49.2 
 
 		 504 aa  514  1e-144  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.316321  normal  0.0202803 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0624  transposase  59.27 
 
 		 610 aa  492  9.999999999999999e-139  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.337489  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13460  transposase  35.92 
 
 		 694 aa  234  3e-60  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000225344  hitchhiker  0.00142582 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3873  Integrase catalytic region  34.13 
 
 		 531 aa  226  5.0000000000000005e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0464732  normal  0.0452112 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1310  Integrase catalytic region  30.84 
 
 		 518 aa  192  2e-47  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0359  Integrase catalytic region  30.84 
 
 		 518 aa  192  2e-47  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.694452  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1893  Integrase catalytic region  30.84 
 
 		 518 aa  192  2e-47  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.265792  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4252  Integrase catalytic region  30.84 
 
 		 518 aa  192  2e-47  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0009  Integrase catalytic region  31.65 
 
 		 523 aa  190  5.999999999999999e-47  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1811  integrase catalytic subunit  32.5 
 
 		 510 aa  180  5.999999999999999e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.14945  normal  1 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3716  Integrase catalytic region  33.08 
 
 		 523 aa  179  8e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  normal  0.124306 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2841  ISPsy14, transposase  32.04 
 
 		 504 aa  173  7.999999999999999e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0126762  n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9835  transposase  33.71 
 
 		 517 aa  172  1e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0559  integrase catalytic subunit  32.49 
 
 		 517 aa  171  2e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1363  Integrase catalytic region  29.97 
 
 		 507 aa  170  6e-41  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0134  Integrase catalytic region  29.97 
 
 		 507 aa  170  6e-41  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.53025 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1554  integrase catalytic subunit  33.76 
 
 		 519 aa  169  1e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2053  integrase catalytic subunit  33.76 
 
 		 519 aa  169  1e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3414  integrase catalytic subunit  33.76 
 
 		 519 aa  169  1e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.604761  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0850  Integrase catalytic region  31.2 
 
 		 513 aa  165  2.0000000000000002e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2120  Integrase catalytic region  31.2 
 
 		 513 aa  165  2.0000000000000002e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0442814  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3092  Integrase catalytic region  31.2 
 
 		 513 aa  165  2.0000000000000002e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.30832  normal  0.801547 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3293  Integrase catalytic region  31.2 
 
 		 513 aa  165  2.0000000000000002e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.823799  normal  0.964616 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4851  Integrase catalytic region  31.2 
 
 		 513 aa  165  2.0000000000000002e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.242832  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2963  Integrase catalytic region  31.2 
 
 		 513 aa  165  2.0000000000000002e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5321  Integrase catalytic region  31.2 
 
 		 513 aa  165  2.0000000000000002e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.354079 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5580  Integrase catalytic region  31.2 
 
 		 513 aa  165  2.0000000000000002e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6163  Integrase catalytic region  31.2 
 
 		 513 aa  165  2.0000000000000002e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2154  Integrase catalytic region  31.2 
 
 		 513 aa  165  2.0000000000000002e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.944811  normal  0.172855 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6805  Integrase catalytic region  31.2 
 
 		 513 aa  165  2.0000000000000002e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4302  Integrase catalytic region  31.2 
 
 		 513 aa  165  2.0000000000000002e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00408602 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6473  Integrase catalytic region  31.2 
 
 		 513 aa  165  2.0000000000000002e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2788  Integrase catalytic region  31.2 
 
 		 513 aa  165  2.0000000000000002e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.952319  normal  0.0224954 
 
 
-
 
NC_013733  Slin_6980  Integrase catalytic region  31.2 
 
 		 513 aa  165  2.0000000000000002e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3694  Integrase catalytic region  31.2 
 
 		 513 aa  165  2.0000000000000002e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00066117  hitchhiker  0.00045424 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3788  Integrase catalytic region  31.2 
 
 		 513 aa  165  2.0000000000000002e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0608543 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4234  Integrase catalytic region  31.2 
 
 		 513 aa  165  2.0000000000000002e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.115769  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0215  Integrase catalytic region  27.73 
 
 		 527 aa  163  6e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0303  integrase catalytic subunit  26.87 
 
 		 519 aa  163  6e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3016  integrase catalytic subunit  26.87 
 
 		 519 aa  163  6e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2132  integrase catalytic subunit  26.87 
 
 		 519 aa  163  6e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3399  integrase catalytic subunit  31.03 
 
 		 515 aa  163  8.000000000000001e-39  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.976382  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3740  putative transposase  33.06 
 
 		 512 aa  163  8.000000000000001e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2303  integrase catalytic subunit  31.03 
 
 		 515 aa  163  8.000000000000001e-39  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.268136  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0283  integrase catalytic subunit  31.03 
 
 		 515 aa  163  8.000000000000001e-39  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.188339  n/a   
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3485  integrase catalytic subunit  31.03 
 
 		 515 aa  163  8.000000000000001e-39  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.522877  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0988  integrase catalytic subunit  30.89 
 
 		 513 aa  162  1e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1299  integrase catalytic subunit  30.89 
 
 		 513 aa  162  1e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2660  integrase catalytic subunit  30.89 
 
 		 513 aa  162  1e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.549324  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3187  integrase catalytic subunit  30.89 
 
 		 513 aa  162  1e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3708  integrase catalytic subunit  30.89 
 
 		 513 aa  162  1e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0892  integrase catalytic subunit  30.89 
 
 		 513 aa  161  2e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1075  integrase catalytic subunit  30.89 
 
 		 475 aa  161  2e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1250  integrase catalytic subunit  33.89 
 
 		 513 aa  161  3e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4128  integrase catalytic subunit  30.62 
 
 		 513 aa  160  3e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5344  integrase catalytic subunit  27.79 
 
 		 523 aa  160  4e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.830623 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0682  Integrase catalytic region  27.35 
 
 		 537 aa  159  1e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5654  Integrase catalytic region  29.96 
 
 		 512 aa  159  1e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4730  integrase catalytic region  32.16 
 
 		 518 aa  159  2e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5628  integrase catalytic region  32.16 
 
 		 518 aa  159  2e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6206  integrase catalytic region  32.16 
 
 		 518 aa  159  2e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1224  integrase catalytic subunit  31.35 
 
 		 513 aa  158  2e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1328  integrase catalytic subunit  29.55 
 
 		 513 aa  158  2e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0892  Integrase catalytic region  27.35 
 
 		 537 aa  158  3e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4315  Integrase catalytic region  27.35 
 
 		 537 aa  158  3e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009471  Acry_3593  integrase catalytic subunit  27.78 
 
 		 513 aa  155  2e-36  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  normal  0.454266 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3086  integrase catalytic subunit  26.95 
 
 		 531 aa  150  6e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2443  integrase catalytic subunit  26.95 
 
 		 531 aa  150  6e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.45047  normal  0.859725 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1342  integrase catalytic subunit  26.95 
 
 		 531 aa  150  6e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0836  integrase catalytic subunit  26.95 
 
 		 531 aa  150  6e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.649092 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1463  transposase  31.32 
 
 		 487 aa  150  7e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0706  integrase catalytic region  29.89 
 
 		 528 aa  148  3e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.00978905  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0119  Integrase catalytic region  32.24 
 
 		 449 aa  148  3e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1081  Integrase catalytic region  32.24 
 
 		 449 aa  148  3e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.333924  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2289  integrase catalytic region  30.08 
 
 		 516 aa  146  9e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4798  integrase catalytic region  30.08 
 
 		 516 aa  146  9e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.288871  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0037  Integrase catalytic region  29.47 
 
 		 515 aa  145  2e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06058  hypothetical protein  29.92 
 
 		 510 aa  145  2e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06964  hypothetical protein  29.92 
 
 		 510 aa  145  2e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01935  hypothetical protein  29.92 
 
 		 510 aa  145  2e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00182  transposase  30.09 
 
 		 510 aa  144  3e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1795  putative transposase  31.86 
 
 		 517 aa  144  4e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.765121  normal  1 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3717  integrase catalytic subunit  30.28 
 
 		 412 aa  144  4e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1009  integrase catalytic subunit  30.28 
 
 		 412 aa  144  5e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00535974  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1319  integrase catalytic subunit  30.28 
 
 		 412 aa  144  5e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2854  integrase catalytic subunit  30.28 
 
 		 412 aa  144  5e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.230802  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4229  integrase catalytic subunit  30.03 
 
 		 514 aa  143  9e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0193  integrase catalytic subunit  30.27 
 
 		 514 aa  142  9.999999999999999e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>