More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_1009 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008607  Ppro_3717  integrase catalytic subunit  97.57 
 
 
412 aa  812    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1009  integrase catalytic subunit  100 
 
 
412 aa  857    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00535974  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1319  integrase catalytic subunit  100 
 
 
412 aa  857    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2854  integrase catalytic subunit  100 
 
 
412 aa  857    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.230802  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1457  integrase  37.78 
 
 
410 aa  223  4e-57  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2538  integrase catalytic subunit  41.38 
 
 
424 aa  218  1e-55  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.178355  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2798  integrase catalytic region  36.77 
 
 
427 aa  218  2e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2452  integrase catalytic region  36.77 
 
 
427 aa  218  2e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.227029 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1464  integrase catalytic region  36.77 
 
 
427 aa  218  2e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010373  M446_7013  hypothetical protein  36.77 
 
 
427 aa  218  2e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6916  integrase catalytic region  36.77 
 
 
427 aa  218  2e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.803027  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5534  integrase catalytic region  36.77 
 
 
427 aa  218  2e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4700  integrase catalytic region  36.77 
 
 
427 aa  218  2e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.670986  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3888  integrase catalytic region  36.77 
 
 
427 aa  218  2e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1510  integrase catalytic region  36.77 
 
 
427 aa  218  2e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0119  Integrase catalytic region  35.88 
 
 
449 aa  212  1e-53  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5106  integrase catalytic subunit  36.15 
 
 
431 aa  212  1e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.214322  normal  0.182706 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1081  Integrase catalytic region  35.88 
 
 
449 aa  212  1e-53  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.333924  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1554  Integrase catalytic region  33.73 
 
 
413 aa  208  1e-52  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0210  transposase, IS21 family  31.96 
 
 
417 aa  201  3e-50  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000847159 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2909  ISGsu6, transposase OrfA  41.37 
 
 
342 aa  199  1.0000000000000001e-49  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.29922  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3407  ISGsu6, transposase OrfA  41.37 
 
 
342 aa  199  1.0000000000000001e-49  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1264  integrase catalytic subunit  42 
 
 
336 aa  197  2.0000000000000003e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0642781  normal  0.0493016 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0136  integrase catalytic subunit  36.39 
 
 
434 aa  197  2.0000000000000003e-49  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0324788  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2833  integrase catalytic subunit  36.39 
 
 
434 aa  197  2.0000000000000003e-49  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0020  hypothetical protein  42.65 
 
 
348 aa  196  8.000000000000001e-49  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2884  hypothetical protein  42.65 
 
 
348 aa  196  8.000000000000001e-49  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1563  hypothetical protein  42.65 
 
 
340 aa  195  1e-48  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1238  transposase  39.61 
 
 
491 aa  195  1e-48  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00126413 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3532  transposase  39.61 
 
 
491 aa  195  2e-48  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.447396  normal  0.0612525 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4125  insertion sequence transposase  39.55 
 
 
340 aa  194  2e-48  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.44357  normal  0.500657 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4054  transposase  39.61 
 
 
491 aa  195  2e-48  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3444  insertion sequence transposase  39.55 
 
 
340 aa  194  2e-48  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3672  insertion sequence transposase  39.55 
 
 
340 aa  194  2e-48  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000543988  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3487  insertion sequence transposase  39.55 
 
 
340 aa  194  2e-48  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.169046 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3951  insertion sequence transposase  39.55 
 
 
340 aa  194  2e-48  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3800  insertion sequence transposase  39.55 
 
 
340 aa  194  2e-48  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2392  insertion sequence transposase  39.55 
 
 
340 aa  194  2e-48  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.392902  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2171  insertion sequence transposase  39.55 
 
 
340 aa  194  2e-48  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0335942 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2155  insertion sequence transposase  39.55 
 
 
340 aa  194  2e-48  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0564082  normal  0.0481856 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3216  insertion sequence transposase  39.55 
 
 
340 aa  194  2e-48  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000564447  normal  0.0522706 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2088  insertion sequence transposase  39.55 
 
 
340 aa  194  2e-48  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.207066 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3336  insertion sequence transposase  39.61 
 
 
491 aa  195  2e-48  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0530  insertion sequence transposase  39.55 
 
 
340 aa  194  2e-48  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000118737  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1939  transposase  39.61 
 
 
491 aa  195  2e-48  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0012517  normal  0.673499 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2025  insertion sequence transposase  39.55 
 
 
340 aa  194  2e-48  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1441  transposase  39.61 
 
 
491 aa  195  2e-48  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.31725  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1904  insertion sequence transposase  39.55 
 
 
340 aa  194  2e-48  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00789725 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3280  insertion sequence transposase  39.55 
 
 
340 aa  194  2e-48  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0112823 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1628  transposase  39.61 
 
 
491 aa  195  2e-48  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2586  insertion sequence transposase  39.55 
 
 
340 aa  194  2e-48  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00244507  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0689  insertion sequence transposase  39.55 
 
 
340 aa  194  2e-48  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2905  insertion sequence transposase  39.55 
 
 
340 aa  194  2e-48  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00121621  normal  0.994964 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2960  insertion sequence transposase  39.55 
 
 
340 aa  194  2e-48  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00154243 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2677  insertion sequence transposase  39.55 
 
 
340 aa  194  2e-48  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.585168  normal  0.0366075 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3393  transposase  39.61 
 
 
491 aa  195  2e-48  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.39722  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2797  insertion sequence transposase  39.55 
 
 
340 aa  194  2e-48  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000133045  normal  0.199341 
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0001  IS21 family transposase  39.55 
 
 
340 aa  194  2e-48  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000122483 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0888  insertion sequence transposase  39.55 
 
 
340 aa  194  2e-48  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0176798  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1305  transposase  39.61 
 
 
491 aa  195  2e-48  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3154  insertion sequence transposase  39.55 
 
 
340 aa  194  2e-48  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1049  insertion sequence transposase  39.55 
 
 
340 aa  194  2e-48  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0362189  normal  0.0286616 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2877  transposase  39.61 
 
 
491 aa  195  2e-48  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0036  transposase  39.61 
 
 
491 aa  195  2e-48  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0098  IS21 family transposase  39.61 
 
 
491 aa  195  2e-48  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  5.2973499999999993e-20  hitchhiker  2.05788e-63 
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0029  IS21 family transposase  39.55 
 
 
340 aa  194  2e-48  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0136  insertion sequence transposase  39.55 
 
 
340 aa  194  2e-48  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0217084 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0448  insertion sequence transposase  39.55 
 
 
340 aa  194  2e-48  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.453908  hitchhiker  0.00000287146 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0314  insertion sequence transposase  39.55 
 
 
340 aa  194  2e-48  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.415268  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0077  insertion sequence transposase  39.55 
 
 
340 aa  194  2e-48  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0015  IS21 family transposase  39.55 
 
 
340 aa  194  2e-48  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0634  insertion sequence transposase  39.55 
 
 
340 aa  194  2e-48  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0933756  normal  0.145557 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2527  insertion sequence transposase  39.55 
 
 
340 aa  194  2e-48  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1294  insertion sequence transposase  39.55 
 
 
340 aa  194  2e-48  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3338  IS100, transposase  39.48 
 
 
340 aa  192  9e-48  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3634  putative transposase  39.55 
 
 
338 aa  191  2e-47  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1183  transposase  39.61 
 
 
489 aa  191  2e-47  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000138357 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0048  IS100 transposase orfA  38.83 
 
 
340 aa  189  8e-47  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0247  ISRSO6-transposase ORFA protein  38.33 
 
 
347 aa  184  2.0000000000000003e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0946447  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2333  ISRSO6-transposase ORFA protein  38.33 
 
 
347 aa  184  2.0000000000000003e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.764175  normal  0.115531 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0451  ISRSO6-transposase ORFA protein  38.33 
 
 
347 aa  184  2.0000000000000003e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.886933  normal  0.322563 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0952  ISRSO3-transposase ORFA protein  38.33 
 
 
354 aa  184  2.0000000000000003e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.273706  normal  0.107434 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0020  transposase for insertion sequence  37.94 
 
 
340 aa  182  8.000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09530  integrase  37.29 
 
 
341 aa  175  9.999999999999999e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31560  Transposase  37.29 
 
 
341 aa  175  9.999999999999999e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009788  EcE24377A_D0043  IS21 family transposase  33.61 
 
 
390 aa  175  9.999999999999999e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.920387  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3370  IS21 family transposase  33.61 
 
 
390 aa  175  9.999999999999999e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0036  IS21 family transposase  33.61 
 
 
390 aa  175  9.999999999999999e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2921  IS21 family transposase  33.61 
 
 
390 aa  175  9.999999999999999e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0019  IS21 family transposase  33.61 
 
 
390 aa  175  9.999999999999999e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0506229  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0994  IS21 family transposase  33.61 
 
 
390 aa  175  9.999999999999999e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2228  IS21 family transposase  33.61 
 
 
390 aa  175  9.999999999999999e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.503141  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3341  IS21 family transposase  33.61 
 
 
390 aa  175  9.999999999999999e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36480  transposase, helix-turn-helix, Fis-type  37.29 
 
 
341 aa  174  2.9999999999999996e-42  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49630  helix-turn-helix, Fis-type  37.29 
 
 
341 aa  174  2.9999999999999996e-42  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.840005  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3144  IS2 transposase orfA  33.61 
 
 
390 aa  174  3.9999999999999995e-42  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0046  ISGsu6, transposase OrfA  37.7 
 
 
341 aa  172  6.999999999999999e-42  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.688016  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2593  ISGsu6, transposase OrfA  37.7 
 
 
341 aa  172  6.999999999999999e-42  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.243982  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2797  integrase catalytic subunit  36.72 
 
 
341 aa  171  3e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3282  integrase catalytic subunit  36.72 
 
 
341 aa  171  3e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.590315  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>