More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_5106 on replicon NC_009508
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_1457  integrase  92.86 
 
 		 410 aa  770    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5106  integrase catalytic subunit  100 
 
 		 431 aa  871    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.214322  normal  0.182706 
 
 
-
 
NC_010373  M446_7013  hypothetical protein  61.3 
 
 		 427 aa  471  1e-132  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4700  integrase catalytic region  61.3 
 
 		 427 aa  471  1e-132  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.670986  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3888  integrase catalytic region  61.3 
 
 		 427 aa  471  1e-132  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2452  integrase catalytic region  61.3 
 
 		 427 aa  471  1e-132  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.227029 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1510  integrase catalytic region  61.3 
 
 		 427 aa  471  1e-132  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1464  integrase catalytic region  61.3 
 
 		 427 aa  471  1e-132  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6916  integrase catalytic region  61.3 
 
 		 427 aa  471  1e-132  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.803027  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5534  integrase catalytic region  61.3 
 
 		 427 aa  471  1e-132  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2798  integrase catalytic region  61.3 
 
 		 427 aa  471  1e-132  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4930  transposase Tn3 family protein  100 
 
 		 492 aa  397  1e-109  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.142055  normal  0.882247 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6841  integrase catalytic subunit  61.63 
 
 		 257 aa  313  4.999999999999999e-84  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1554  Integrase catalytic region  36.69 
 
 		 413 aa  225  1e-57  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3717  integrase catalytic subunit  38.39 
 
 		 412 aa  218  2e-55  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0119  Integrase catalytic region  37.62 
 
 		 449 aa  217  2.9999999999999998e-55  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1081  Integrase catalytic region  37.62 
 
 		 449 aa  217  2.9999999999999998e-55  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.333924  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1009  integrase catalytic subunit  36.39 
 
 		 412 aa  215  9.999999999999999e-55  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00535974  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1319  integrase catalytic subunit  36.39 
 
 		 412 aa  215  9.999999999999999e-55  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2854  integrase catalytic subunit  36.39 
 
 		 412 aa  215  9.999999999999999e-55  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.230802  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2538  integrase catalytic subunit  38.87 
 
 		 424 aa  191  2e-47  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.178355  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0952  ISRSO3-transposase ORFA protein  42.04 
 
 		 354 aa  187  3e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.273706  normal  0.107434 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1264  integrase catalytic subunit  42.16 
 
 		 336 aa  187  4e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0642781  normal  0.0493016 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0136  integrase catalytic subunit  35.25 
 
 		 434 aa  186  5e-46  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0324788  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2833  integrase catalytic subunit  35.25 
 
 		 434 aa  186  5e-46  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0210  transposase, IS21 family  32.61 
 
 		 417 aa  186  7e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000847159 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1052  Integrase catalytic region  36.01 
 
 		 502 aa  186  8e-46  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.437105  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0247  ISRSO6-transposase ORFA protein  42.35 
 
 		 347 aa  185  1.0000000000000001e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0946447  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2333  ISRSO6-transposase ORFA protein  42.35 
 
 		 347 aa  185  1.0000000000000001e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.764175  normal  0.115531 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0451  ISRSO6-transposase ORFA protein  42.35 
 
 		 347 aa  185  1.0000000000000001e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.886933  normal  0.322563 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0943  Integrase catalytic region  36.01 
 
 		 502 aa  185  1.0000000000000001e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.346378  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2939  Integrase catalytic region  36.01 
 
 		 502 aa  186  1.0000000000000001e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.620801  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7663  integrase catalytic region  42.26 
 
 		 348 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1063  Integrase catalytic region  35.73 
 
 		 502 aa  185  2.0000000000000003e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.877216  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1072  Integrase catalytic region  35.73 
 
 		 502 aa  185  2.0000000000000003e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2874  Integrase catalytic region  35.73 
 
 		 502 aa  185  2.0000000000000003e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4855  Integrase catalytic region  35.73 
 
 		 502 aa  185  2.0000000000000003e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000769666 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4858  Integrase catalytic region  35.73 
 
 		 502 aa  185  2.0000000000000003e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0252827  normal  0.0109178 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6478  Integrase catalytic region  37.46 
 
 		 507 aa  182  1e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1589  Integrase catalytic region  35.46 
 
 		 502 aa  182  1e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0020  hypothetical protein  37.82 
 
 		 348 aa  180  4.999999999999999e-44  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2884  hypothetical protein  37.82 
 
 		 348 aa  180  4.999999999999999e-44  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9617  transposase  59.63 
 
 		 230 aa  180  5.999999999999999e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.106287  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1563  hypothetical protein  37.5 
 
 		 340 aa  172  6.999999999999999e-42  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3159  transposase, IS21 family  35.79 
 
 		 496 aa  171  2e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4040  hypothetical protein  35.79 
 
 		 496 aa  171  2e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2090  transposase, IS21 family  35.79 
 
 		 496 aa  171  2e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2909  ISGsu6, transposase OrfA  38.89 
 
 		 342 aa  170  4e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.29922  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3407  ISGsu6, transposase OrfA  38.89 
 
 		 342 aa  170  4e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0317  transposase, IS21 family  35.79 
 
 		 496 aa  170  5e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0223423  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3634  putative transposase  35.9 
 
 		 338 aa  167  2.9999999999999998e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4125  insertion sequence transposase  35.9 
 
 		 340 aa  167  2.9999999999999998e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.44357  normal  0.500657 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3487  insertion sequence transposase  35.9 
 
 		 340 aa  167  2.9999999999999998e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.169046 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3800  insertion sequence transposase  35.9 
 
 		 340 aa  167  2.9999999999999998e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3672  insertion sequence transposase  35.9 
 
 		 340 aa  167  2.9999999999999998e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000543988  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3532  transposase  35.9 
 
 		 491 aa  167  2.9999999999999998e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.447396  normal  0.0612525 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4054  transposase  35.9 
 
 		 491 aa  167  2.9999999999999998e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3951  insertion sequence transposase  35.9 
 
 		 340 aa  167  2.9999999999999998e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1294  insertion sequence transposase  35.9 
 
 		 340 aa  167  2.9999999999999998e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0029  IS21 family transposase  35.9 
 
 		 340 aa  167  2.9999999999999998e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1049  insertion sequence transposase  35.9 
 
 		 340 aa  167  2.9999999999999998e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0362189  normal  0.0286616 
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0098  IS21 family transposase  35.9 
 
 		 491 aa  167  2.9999999999999998e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  5.2973499999999993e-20  hitchhiker  2.05788e-63 
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0001  IS21 family transposase  35.9 
 
 		 340 aa  167  2.9999999999999998e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000122483 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3338  IS100, transposase  35.9 
 
 		 340 aa  167  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3216  insertion sequence transposase  35.9 
 
 		 340 aa  167  2.9999999999999998e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000564447  normal  0.0522706 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0036  transposase  35.9 
 
 		 491 aa  167  2.9999999999999998e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0314  insertion sequence transposase  35.9 
 
 		 340 aa  167  2.9999999999999998e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.415268  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3444  insertion sequence transposase  35.9 
 
 		 340 aa  167  2.9999999999999998e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0634  insertion sequence transposase  35.9 
 
 		 340 aa  167  2.9999999999999998e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0933756  normal  0.145557 
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0015  IS21 family transposase  35.9 
 
 		 340 aa  167  2.9999999999999998e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0888  insertion sequence transposase  35.9 
 
 		 340 aa  167  2.9999999999999998e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0176798  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0689  insertion sequence transposase  35.9 
 
 		 340 aa  167  2.9999999999999998e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0530  insertion sequence transposase  35.9 
 
 		 340 aa  167  2.9999999999999998e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000118737  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0077  insertion sequence transposase  35.9 
 
 		 340 aa  167  2.9999999999999998e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1441  transposase  35.9 
 
 		 491 aa  167  2.9999999999999998e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.31725  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1305  transposase  35.9 
 
 		 491 aa  167  2.9999999999999998e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2025  insertion sequence transposase  35.9 
 
 		 340 aa  167  2.9999999999999998e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1939  transposase  35.9 
 
 		 491 aa  167  2.9999999999999998e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0012517  normal  0.673499 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1904  insertion sequence transposase  35.9 
 
 		 340 aa  167  2.9999999999999998e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00789725 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2155  insertion sequence transposase  35.9 
 
 		 340 aa  167  2.9999999999999998e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0564082  normal  0.0481856 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3280  insertion sequence transposase  35.9 
 
 		 340 aa  167  2.9999999999999998e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0112823 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2088  insertion sequence transposase  35.9 
 
 		 340 aa  167  2.9999999999999998e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.207066 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1628  transposase  35.9 
 
 		 491 aa  167  2.9999999999999998e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3336  insertion sequence transposase  35.9 
 
 		 491 aa  167  2.9999999999999998e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2171  insertion sequence transposase  35.9 
 
 		 340 aa  167  2.9999999999999998e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0335942 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2527  insertion sequence transposase  35.9 
 
 		 340 aa  167  2.9999999999999998e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2392  insertion sequence transposase  35.9 
 
 		 340 aa  167  2.9999999999999998e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.392902  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1238  transposase  35.9 
 
 		 491 aa  167  2.9999999999999998e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00126413 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2677  insertion sequence transposase  35.9 
 
 		 340 aa  167  2.9999999999999998e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.585168  normal  0.0366075 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2586  insertion sequence transposase  35.9 
 
 		 340 aa  167  2.9999999999999998e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00244507  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2877  transposase  35.9 
 
 		 491 aa  167  2.9999999999999998e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2797  insertion sequence transposase  35.9 
 
 		 340 aa  167  2.9999999999999998e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000133045  normal  0.199341 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2905  insertion sequence transposase  35.9 
 
 		 340 aa  167  2.9999999999999998e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00121621  normal  0.994964 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3154  insertion sequence transposase  35.9 
 
 		 340 aa  167  2.9999999999999998e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2960  insertion sequence transposase  35.9 
 
 		 340 aa  167  2.9999999999999998e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00154243 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3393  transposase  35.9 
 
 		 491 aa  167  2.9999999999999998e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.39722  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0136  insertion sequence transposase  35.9 
 
 		 340 aa  167  2.9999999999999998e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0217084 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0448  insertion sequence transposase  35.9 
 
 		 340 aa  167  2.9999999999999998e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.453908  hitchhiker  0.00000287146 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1183  transposase  35.9 
 
 		 489 aa  167  4e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000138357 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31560  Transposase  38.34 
 
 		 341 aa  166  8e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>