294 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_9617 on replicon NC_011991
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011991  Avi_9617  transposase  100 
 
 		 230 aa  462  1e-129  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.106287  n/a   
 
 
-
 
NC_010373  M446_7013  hypothetical protein  62.26 
 
 		 427 aa  196  4.0000000000000005e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2452  integrase catalytic region  62.26 
 
 		 427 aa  196  4.0000000000000005e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.227029 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1510  integrase catalytic region  62.26 
 
 		 427 aa  196  4.0000000000000005e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1464  integrase catalytic region  62.26 
 
 		 427 aa  196  4.0000000000000005e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4700  integrase catalytic region  62.26 
 
 		 427 aa  196  4.0000000000000005e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.670986  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3888  integrase catalytic region  62.26 
 
 		 427 aa  196  4.0000000000000005e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2798  integrase catalytic region  62.26 
 
 		 427 aa  196  4.0000000000000005e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5534  integrase catalytic region  62.26 
 
 		 427 aa  196  4.0000000000000005e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6916  integrase catalytic region  62.26 
 
 		 427 aa  196  4.0000000000000005e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.803027  normal  1 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6841  integrase catalytic subunit  58.55 
 
 		 257 aa  186  2e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1457  integrase  63.4 
 
 		 410 aa  183  2.0000000000000003e-45  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5106  integrase catalytic subunit  59.63 
 
 		 431 aa  180  2e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.214322  normal  0.182706 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1183  transposase  38.71 
 
 		 489 aa  100  2e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000138357 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3634  putative transposase  38.71 
 
 		 338 aa  99.4  4e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4054  transposase  38.06 
 
 		 491 aa  99  5e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2877  transposase  38.06 
 
 		 491 aa  99  5e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3393  transposase  38.06 
 
 		 491 aa  99  5e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.39722  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3336  insertion sequence transposase  38.06 
 
 		 491 aa  99  5e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3532  transposase  38.06 
 
 		 491 aa  99  5e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.447396  normal  0.0612525 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1939  transposase  38.06 
 
 		 491 aa  99  5e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0012517  normal  0.673499 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1305  transposase  38.06 
 
 		 491 aa  99  5e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0036  transposase  38.06 
 
 		 491 aa  99  5e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1441  transposase  38.06 
 
 		 491 aa  99  5e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.31725  normal  1 
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0098  IS21 family transposase  38.06 
 
 		 491 aa  99  5e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  5.2973499999999993e-20  hitchhiker  2.05788e-63 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1628  transposase  38.06 
 
 		 491 aa  99  5e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1238  transposase  38.06 
 
 		 491 aa  99  6e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00126413 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3951  insertion sequence transposase  38.06 
 
 		 340 aa  98.2  9e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2527  insertion sequence transposase  38.06 
 
 		 340 aa  98.2  9e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4125  insertion sequence transposase  38.06 
 
 		 340 aa  98.2  9e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.44357  normal  0.500657 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3800  insertion sequence transposase  38.06 
 
 		 340 aa  98.2  9e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3487  insertion sequence transposase  38.06 
 
 		 340 aa  98.2  9e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.169046 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3672  insertion sequence transposase  38.06 
 
 		 340 aa  98.2  9e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000543988  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2088  insertion sequence transposase  38.06 
 
 		 340 aa  98.2  9e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.207066 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2171  insertion sequence transposase  38.06 
 
 		 340 aa  98.2  9e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0335942 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2155  insertion sequence transposase  38.06 
 
 		 340 aa  98.2  9e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0564082  normal  0.0481856 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2025  insertion sequence transposase  38.06 
 
 		 340 aa  98.2  9e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2960  insertion sequence transposase  38.06 
 
 		 340 aa  98.2  9e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00154243 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3444  insertion sequence transposase  38.06 
 
 		 340 aa  98.2  9e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0689  insertion sequence transposase  38.06 
 
 		 340 aa  98.2  9e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2797  insertion sequence transposase  38.06 
 
 		 340 aa  98.2  9e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000133045  normal  0.199341 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2677  insertion sequence transposase  38.06 
 
 		 340 aa  98.2  9e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.585168  normal  0.0366075 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2392  insertion sequence transposase  38.06 
 
 		 340 aa  98.2  9e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.392902  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3154  insertion sequence transposase  38.06 
 
 		 340 aa  98.2  9e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1904  insertion sequence transposase  38.06 
 
 		 340 aa  98.2  9e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00789725 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3338  IS100, transposase  38.06 
 
 		 340 aa  98.2  9e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2586  insertion sequence transposase  38.06 
 
 		 340 aa  98.2  9e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00244507  normal  1 
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0015  IS21 family transposase  38.06 
 
 		 340 aa  98.2  9e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0888  insertion sequence transposase  38.06 
 
 		 340 aa  98.2  9e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0176798  normal  1 
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0001  IS21 family transposase  38.06 
 
 		 340 aa  98.2  9e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000122483 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1049  insertion sequence transposase  38.06 
 
 		 340 aa  98.2  9e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0362189  normal  0.0286616 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0077  insertion sequence transposase  38.06 
 
 		 340 aa  98.2  9e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0314  insertion sequence transposase  38.06 
 
 		 340 aa  98.2  9e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.415268  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0530  insertion sequence transposase  38.06 
 
 		 340 aa  98.2  9e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000118737  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0448  insertion sequence transposase  38.06 
 
 		 340 aa  98.2  9e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.453908  hitchhiker  0.00000287146 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0136  insertion sequence transposase  38.06 
 
 		 340 aa  98.2  9e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0217084 
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0029  IS21 family transposase  38.06 
 
 		 340 aa  98.2  9e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0634  insertion sequence transposase  38.06 
 
 		 340 aa  98.2  9e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0933756  normal  0.145557 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2905  insertion sequence transposase  38.06 
 
 		 340 aa  98.2  9e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00121621  normal  0.994964 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1294  insertion sequence transposase  38.06 
 
 		 340 aa  98.2  9e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3216  insertion sequence transposase  38.06 
 
 		 340 aa  98.2  9e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000564447  normal  0.0522706 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3280  insertion sequence transposase  38.06 
 
 		 340 aa  98.2  9e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0112823 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31560  Transposase  40.13 
 
 		 341 aa  94.7  1e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09530  integrase  40.13 
 
 		 341 aa  94.7  1e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0048  IS100 transposase orfA  36.77 
 
 		 340 aa  94  2e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1554  Integrase catalytic region  33.12 
 
 		 413 aa  94.4  2e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2538  integrase catalytic subunit  39.33 
 
 		 424 aa  92.8  4e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.178355  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49630  helix-turn-helix, Fis-type  40.25 
 
 		 341 aa  92  6e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.840005  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36480  transposase, helix-turn-helix, Fis-type  40.25 
 
 		 341 aa  92  6e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0210  transposase, IS21 family  37.11 
 
 		 417 aa  90.9  2e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000847159 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1081  Integrase catalytic region  42.86 
 
 		 449 aa  86.7  3e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.333924  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0020  transposase for insertion sequence  34.69 
 
 		 340 aa  86.7  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0119  Integrase catalytic region  42.86 
 
 		 449 aa  86.7  3e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0952  ISRSO3-transposase ORFA protein  33.33 
 
 		 354 aa  85.5  6e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.273706  normal  0.107434 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0247  ISRSO6-transposase ORFA protein  35.42 
 
 		 347 aa  84.7  0.000000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0946447  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2333  ISRSO6-transposase ORFA protein  35.42 
 
 		 347 aa  84.7  0.000000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.764175  normal  0.115531 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0451  ISRSO6-transposase ORFA protein  35.42 
 
 		 347 aa  84.7  0.000000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.886933  normal  0.322563 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4791  IstB ATP binding domain-containing protein  43.7 
 
 		 284 aa  83.6  0.000000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7663  integrase catalytic region  37.84 
 
 		 348 aa  83.2  0.000000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1264  integrase catalytic subunit  43.7 
 
 		 336 aa  82.8  0.000000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0642781  normal  0.0493016 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0356  integrase catalytic region  41.67 
 
 		 347 aa  82.8  0.000000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0020  hypothetical protein  36.64 
 
 		 348 aa  81.6  0.00000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2884  hypothetical protein  36.64 
 
 		 348 aa  81.6  0.00000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0019  ISPsy4, transposase  39.02 
 
 		 340 aa  79  0.00000000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0292  ISPsy4, transposase  39.02 
 
 		 340 aa  79  0.00000000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0833  ISPsy4, transposase  39.02 
 
 		 340 aa  79  0.00000000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0865  ISPsy4, transposase  39.02 
 
 		 340 aa  79  0.00000000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1095  ISPsy4, transposase  39.02 
 
 		 340 aa  79  0.00000000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.189576  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1659  ISPsy4, transposase  39.02 
 
 		 340 aa  79  0.00000000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2321  ISPsy4, transposase  39.02 
 
 		 340 aa  79  0.00000000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.000712156  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3433  ISPsy4, transposase  39.02 
 
 		 340 aa  79  0.00000000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.45779  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3608  ISPsy4, transposase  39.02 
 
 		 340 aa  79  0.00000000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.656873  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4013  ISPsy4, transposase  39.02 
 
 		 340 aa  79  0.00000000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4269  ISPsy4, transposase  39.02 
 
 		 340 aa  79  0.00000000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4625  ISPsy4, transposase  39.02 
 
 		 340 aa  79  0.00000000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.146787  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4730  ISPsy4, transposase  39.02 
 
 		 340 aa  79  0.00000000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4769  ISPsy4, transposase  39.02 
 
 		 340 aa  79  0.00000000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5575  ISPsy4, transposase  39.02 
 
 		 340 aa  79  0.00000000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004632  PSPTO_B0040  ISPsy4, transposase  39.02 
 
 		 340 aa  79  0.00000000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.348986  n/a   
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0013  ISPsy4, transposase  39.02 
 
 		 340 aa  79  0.00000000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.292398  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>