More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpAngola_A3532 on replicon NC_010159
Organism: Yersinia pestis Angola



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010159  YpAngola_A2677  insertion sequence transposase  100 
 
 
340 aa  654    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.585168  normal  0.0366075 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0448  insertion sequence transposase  100 
 
 
340 aa  654    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.453908  hitchhiker  0.00000287146 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2960  insertion sequence transposase  100 
 
 
340 aa  654    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00154243 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0530  insertion sequence transposase  100 
 
 
340 aa  654    Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000118737  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3154  insertion sequence transposase  100 
 
 
340 aa  654    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3951  insertion sequence transposase  100 
 
 
340 aa  654    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0888  insertion sequence transposase  100 
 
 
340 aa  654    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0176798  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3336  insertion sequence transposase  100 
 
 
491 aa  1022    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1441  transposase  99.8 
 
 
491 aa  1020    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.31725  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3634  putative transposase  99.35 
 
 
338 aa  645    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2088  insertion sequence transposase  100 
 
 
340 aa  654    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.207066 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4125  insertion sequence transposase  100 
 
 
340 aa  654    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.44357  normal  0.500657 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2155  insertion sequence transposase  100 
 
 
340 aa  654    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0564082  normal  0.0481856 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0048  IS100 transposase orfA  99.03 
 
 
340 aa  647    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0689  insertion sequence transposase  100 
 
 
340 aa  654    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3216  insertion sequence transposase  100 
 
 
340 aa  654    Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000564447  normal  0.0522706 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1238  transposase  99.8 
 
 
491 aa  1019    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00126413 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1183  transposase  99.59 
 
 
489 aa  1013    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000138357 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3280  insertion sequence transposase  100 
 
 
340 aa  654    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0112823 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1049  insertion sequence transposase  100 
 
 
340 aa  654    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0362189  normal  0.0286616 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3393  transposase  100 
 
 
491 aa  1022    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.39722  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1294  insertion sequence transposase  100 
 
 
340 aa  654    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3444  insertion sequence transposase  100 
 
 
340 aa  654    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1628  transposase  99.8 
 
 
491 aa  1020    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3487  insertion sequence transposase  100 
 
 
340 aa  654    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.169046 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1305  transposase  100 
 
 
491 aa  1022    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3532  transposase  100 
 
 
491 aa  1022    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.447396  normal  0.0612525 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1904  insertion sequence transposase  100 
 
 
340 aa  654    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00789725 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3672  insertion sequence transposase  100 
 
 
340 aa  654    Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000543988  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2025  insertion sequence transposase  100 
 
 
340 aa  654    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3800  insertion sequence transposase  100 
 
 
340 aa  654    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1939  transposase  100 
 
 
491 aa  1022    Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0012517  normal  0.673499 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2171  insertion sequence transposase  100 
 
 
340 aa  654    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0335942 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4054  transposase  100 
 
 
491 aa  1022    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0634  insertion sequence transposase  100 
 
 
340 aa  654    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0933756  normal  0.145557 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2527  insertion sequence transposase  100 
 
 
340 aa  654    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2586  insertion sequence transposase  100 
 
 
340 aa  654    Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00244507  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2797  insertion sequence transposase  100 
 
 
340 aa  654    Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000133045  normal  0.199341 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2877  transposase  100 
 
 
491 aa  1022    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2905  insertion sequence transposase  100 
 
 
340 aa  654    Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00121621  normal  0.994964 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0036  transposase  100 
 
 
491 aa  1022    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0077  insertion sequence transposase  100 
 
 
340 aa  654    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0098  IS21 family transposase  100 
 
 
491 aa  1022    Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  5.2973499999999993e-20  hitchhiker  2.05788e-63 
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0001  IS21 family transposase  100 
 
 
340 aa  654    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000122483 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2392  insertion sequence transposase  100 
 
 
340 aa  654    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.392902  normal 
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0029  IS21 family transposase  100 
 
 
340 aa  654    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0015  IS21 family transposase  100 
 
 
340 aa  654    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0136  insertion sequence transposase  100 
 
 
340 aa  654    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0217084 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0314  insertion sequence transposase  100 
 
 
340 aa  654    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.415268  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3338  IS100, transposase  99.68 
 
 
340 aa  652    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0020  transposase for insertion sequence  86.77 
 
 
340 aa  581  1e-164  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2906  transposase/IS protein  96.41 
 
 
259 aa  380  1e-104  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000283064  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2961  transposase/IS protein  96.41 
 
 
259 aa  380  1e-104  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00126267 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0449  transposase/IS protein  96.41 
 
 
259 aa  380  1e-104  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000734492 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3153  transposase/IS protein  96.41 
 
 
259 aa  380  1e-104  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.640291  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0315  transposase/IS protein  96.41 
 
 
259 aa  380  1e-104  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.107694  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2154  transposase/IS protein  96.41 
 
 
259 aa  380  1e-104  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.108603  normal  0.0411543 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4126  transposase/IS protein  96.41 
 
 
259 aa  380  1e-104  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.142881  normal  0.387354 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0887  transposase/IS protein  96.41 
 
 
259 aa  380  1e-104  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0122074  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1050  transposase/IS protein  96.41 
 
 
259 aa  380  1e-104  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0434314  normal  0.0157914 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3279  transposase/IS protein  96.41 
 
 
259 aa  380  1e-104  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00346701 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1293  transposase/IS protein  96.41 
 
 
259 aa  380  1e-104  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3486  transposase/IS protein  96.41 
 
 
259 aa  380  1e-104  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.159215 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3633  transposase/IS protein  96.41 
 
 
259 aa  380  1e-104  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1905  transposase/IS protein  96.41 
 
 
259 aa  380  1e-104  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00414414 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3217  transposase/IS protein  96.41 
 
 
259 aa  380  1e-104  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.0000088143  normal  0.0723332 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0688  transposase/IS protein  96.41 
 
 
259 aa  380  1e-104  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3445  transposase/IS protein  96.41 
 
 
259 aa  380  1e-104  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2024  transposase/IS protein  96.41 
 
 
259 aa  380  1e-104  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3671  transposase/IS protein  96.41 
 
 
259 aa  380  1e-104  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000902436  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2089  transposase/IS protein  96.41 
 
 
259 aa  380  1e-104  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.184657 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3801  transposase/IS protein  96.41 
 
 
259 aa  380  1e-104  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0635  transposase/IS protein  96.41 
 
 
259 aa  380  1e-104  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.144534  normal  0.136264 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0531  transposase/IS protein  96.41 
 
 
259 aa  380  1e-104  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0444538  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2587  transposase/IS protein  96.41 
 
 
259 aa  380  1e-104  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.160971  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2678  transposase/IS protein  96.41 
 
 
259 aa  380  1e-104  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0328651 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2798  transposase/IS protein  96.41 
 
 
259 aa  380  1e-104  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000000346589  normal  0.174192 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2172  transposase/IS protein  96.41 
 
 
259 aa  380  1e-104  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0697469 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2391  transposase/IS protein  96.41 
 
 
259 aa  380  1e-104  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.298615  normal 
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0016  transposase/IS protein  96.41 
 
 
259 aa  380  1e-104  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0002  transposase/IS protein  96.41 
 
 
259 aa  380  1e-104  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000307192 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0135  transposase/IS protein  96.41 
 
 
259 aa  380  1e-104  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0293303 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2526  transposase/IS protein  96.41 
 
 
259 aa  380  1e-104  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3952  transposase/IS protein  95.9 
 
 
259 aa  377  1e-103  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0030  transposase/IS protein  95.9 
 
 
259 aa  377  1e-103  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0078  transposase/IS protein  95.9 
 
 
259 aa  377  1e-103  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0019  transposase/IS protein  93.85 
 
 
260 aa  373  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0049  transposase/IS protein  94.36 
 
 
260 aa  371  1e-101  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2909  ISGsu6, transposase OrfA  53.47 
 
 
342 aa  329  8e-89  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.29922  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3407  ISGsu6, transposase OrfA  53.47 
 
 
342 aa  329  8e-89  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0046  ISGsu6, transposase OrfA  50.33 
 
 
341 aa  321  9.999999999999999e-87  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.688016  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2593  ISGsu6, transposase OrfA  50.33 
 
 
341 aa  321  9.999999999999999e-87  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.243982  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36480  transposase, helix-turn-helix, Fis-type  52.3 
 
 
341 aa  321  1.9999999999999998e-86  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49630  helix-turn-helix, Fis-type  52.3 
 
 
341 aa  321  1.9999999999999998e-86  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.840005  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31560  Transposase  52.3 
 
 
341 aa  320  3.9999999999999996e-86  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09530  integrase  52.3 
 
 
341 aa  320  5e-86  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0020  hypothetical protein  50 
 
 
348 aa  319  6e-86  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2884  hypothetical protein  50 
 
 
348 aa  319  6e-86  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2797  integrase catalytic subunit  50.16 
 
 
341 aa  318  1e-85  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3282  integrase catalytic subunit  50.16 
 
 
341 aa  318  1e-85  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.590315  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>