More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_7013 on replicon NC_010373
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010511  M446_2798  integrase catalytic region  100 
 
 
427 aa  851    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3888  integrase catalytic region  100 
 
 
427 aa  851    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6916  integrase catalytic region  100 
 
 
427 aa  851    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.803027  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1464  integrase catalytic region  100 
 
 
427 aa  851    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1510  integrase catalytic region  100 
 
 
427 aa  851    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2452  integrase catalytic region  100 
 
 
427 aa  851    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.227029 
 
 
-
 
NC_010373  M446_7013  hypothetical protein  100 
 
 
427 aa  851    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5534  integrase catalytic region  100 
 
 
427 aa  851    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4700  integrase catalytic region  100 
 
 
427 aa  851    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.670986  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1457  integrase  61.35 
 
 
410 aa  481  1e-135  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5106  integrase catalytic subunit  61.63 
 
 
431 aa  473  1e-132  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.214322  normal  0.182706 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6841  integrase catalytic subunit  60.7 
 
 
257 aa  316  6e-85  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1081  Integrase catalytic region  40.15 
 
 
449 aa  228  1e-58  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.333924  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0119  Integrase catalytic region  40.15 
 
 
449 aa  228  1e-58  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1554  Integrase catalytic region  35.32 
 
 
413 aa  226  8e-58  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3717  integrase catalytic subunit  37.33 
 
 
412 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2538  integrase catalytic subunit  39.88 
 
 
424 aa  220  3.9999999999999997e-56  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.178355  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1009  integrase catalytic subunit  36.77 
 
 
412 aa  218  1e-55  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00535974  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1319  integrase catalytic subunit  36.77 
 
 
412 aa  218  1e-55  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2854  integrase catalytic subunit  36.77 
 
 
412 aa  218  1e-55  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.230802  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4858  Integrase catalytic region  36.53 
 
 
502 aa  205  1e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0252827  normal  0.0109178 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2874  Integrase catalytic region  36.53 
 
 
502 aa  205  1e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4855  Integrase catalytic region  36.53 
 
 
502 aa  205  1e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000769666 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1052  Integrase catalytic region  36.8 
 
 
502 aa  205  2e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.437105  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1063  Integrase catalytic region  36.53 
 
 
502 aa  204  2e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.877216  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1072  Integrase catalytic region  36.53 
 
 
502 aa  204  2e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2939  Integrase catalytic region  36.8 
 
 
502 aa  204  2e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.620801  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0943  Integrase catalytic region  36.8 
 
 
502 aa  204  3e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.346378  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1589  Integrase catalytic region  36.27 
 
 
502 aa  201  9.999999999999999e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6478  Integrase catalytic region  37.04 
 
 
507 aa  199  1.0000000000000001e-49  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9617  transposase  62.26 
 
 
230 aa  195  2e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.106287  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0952  ISRSO3-transposase ORFA protein  39.87 
 
 
354 aa  191  2e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.273706  normal  0.107434 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2090  transposase, IS21 family  38.4 
 
 
496 aa  191  2e-47  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3159  transposase, IS21 family  38.4 
 
 
496 aa  191  2e-47  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0317  transposase, IS21 family  38.68 
 
 
496 aa  191  2e-47  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0223423  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4040  hypothetical protein  38.4 
 
 
496 aa  191  2e-47  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7663  integrase catalytic region  42.07 
 
 
348 aa  191  2.9999999999999997e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0136  integrase catalytic subunit  36.12 
 
 
434 aa  189  7e-47  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0324788  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2833  integrase catalytic subunit  36.12 
 
 
434 aa  189  7e-47  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3634  putative transposase  36.81 
 
 
338 aa  189  9e-47  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0015  IS21 family transposase  36.97 
 
 
340 aa  188  1e-46  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0530  insertion sequence transposase  36.97 
 
 
340 aa  188  1e-46  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000118737  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1294  insertion sequence transposase  36.97 
 
 
340 aa  188  1e-46  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0448  insertion sequence transposase  36.97 
 
 
340 aa  188  1e-46  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.453908  hitchhiker  0.00000287146 
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0001  IS21 family transposase  36.97 
 
 
340 aa  188  1e-46  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000122483 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0136  insertion sequence transposase  36.97 
 
 
340 aa  188  1e-46  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0217084 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0077  insertion sequence transposase  36.97 
 
 
340 aa  188  1e-46  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0029  IS21 family transposase  36.97 
 
 
340 aa  188  1e-46  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0888  insertion sequence transposase  36.97 
 
 
340 aa  188  1e-46  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0176798  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0689  insertion sequence transposase  36.97 
 
 
340 aa  188  1e-46  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0314  insertion sequence transposase  36.97 
 
 
340 aa  188  1e-46  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.415268  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1049  insertion sequence transposase  36.97 
 
 
340 aa  188  1e-46  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0362189  normal  0.0286616 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0634  insertion sequence transposase  36.97 
 
 
340 aa  188  1e-46  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0933756  normal  0.145557 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2025  insertion sequence transposase  36.97 
 
 
340 aa  188  1e-46  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3672  insertion sequence transposase  36.97 
 
 
340 aa  188  1e-46  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000543988  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3800  insertion sequence transposase  36.97 
 
 
340 aa  188  1e-46  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4125  insertion sequence transposase  36.97 
 
 
340 aa  188  1e-46  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.44357  normal  0.500657 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2155  insertion sequence transposase  36.97 
 
 
340 aa  188  1e-46  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0564082  normal  0.0481856 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2088  insertion sequence transposase  36.97 
 
 
340 aa  188  1e-46  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.207066 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2392  insertion sequence transposase  36.97 
 
 
340 aa  188  1e-46  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.392902  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2171  insertion sequence transposase  36.97 
 
 
340 aa  188  1e-46  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0335942 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2586  insertion sequence transposase  36.97 
 
 
340 aa  188  1e-46  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00244507  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2527  insertion sequence transposase  36.97 
 
 
340 aa  188  1e-46  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2797  insertion sequence transposase  36.97 
 
 
340 aa  188  1e-46  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000133045  normal  0.199341 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2677  insertion sequence transposase  36.97 
 
 
340 aa  188  1e-46  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.585168  normal  0.0366075 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2905  insertion sequence transposase  36.97 
 
 
340 aa  188  1e-46  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00121621  normal  0.994964 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2960  insertion sequence transposase  36.97 
 
 
340 aa  188  1e-46  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00154243 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1904  insertion sequence transposase  36.97 
 
 
340 aa  188  1e-46  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00789725 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3154  insertion sequence transposase  36.97 
 
 
340 aa  188  1e-46  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3216  insertion sequence transposase  36.97 
 
 
340 aa  188  1e-46  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000564447  normal  0.0522706 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3280  insertion sequence transposase  36.97 
 
 
340 aa  188  1e-46  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0112823 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3444  insertion sequence transposase  36.97 
 
 
340 aa  188  1e-46  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3487  insertion sequence transposase  36.97 
 
 
340 aa  188  1e-46  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.169046 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3951  insertion sequence transposase  36.97 
 
 
340 aa  188  1e-46  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1238  transposase  37.93 
 
 
491 aa  187  2e-46  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00126413 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1183  transposase  37.78 
 
 
489 aa  188  2e-46  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000138357 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1441  transposase  38.1 
 
 
491 aa  188  2e-46  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.31725  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1628  transposase  38.1 
 
 
491 aa  188  2e-46  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0098  IS21 family transposase  37.93 
 
 
491 aa  187  3e-46  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  5.2973499999999993e-20  hitchhiker  2.05788e-63 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0036  transposase  37.93 
 
 
491 aa  187  3e-46  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1305  transposase  37.93 
 
 
491 aa  187  3e-46  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4054  transposase  37.93 
 
 
491 aa  187  3e-46  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1939  transposase  37.93 
 
 
491 aa  187  3e-46  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0012517  normal  0.673499 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3532  transposase  37.93 
 
 
491 aa  187  3e-46  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.447396  normal  0.0612525 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2877  transposase  37.93 
 
 
491 aa  187  3e-46  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3336  insertion sequence transposase  37.93 
 
 
491 aa  187  3e-46  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3393  transposase  37.93 
 
 
491 aa  187  3e-46  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.39722  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0247  ISRSO6-transposase ORFA protein  40.13 
 
 
347 aa  187  4e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0946447  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2333  ISRSO6-transposase ORFA protein  40.13 
 
 
347 aa  187  4e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.764175  normal  0.115531 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0451  ISRSO6-transposase ORFA protein  40.13 
 
 
347 aa  187  4e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.886933  normal  0.322563 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0048  IS100 transposase orfA  38.73 
 
 
340 aa  187  4e-46  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3338  IS100, transposase  37.3 
 
 
340 aa  186  6e-46  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0010  transposase, IS21 family  38.4 
 
 
496 aa  186  7e-46  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1139  Integrase catalytic region  37.69 
 
 
474 aa  182  1e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.650058  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1097  Integrase catalytic region  38.01 
 
 
474 aa  181  2e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.81424  normal 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0210  transposase, IS21 family  30 
 
 
417 aa  181  2.9999999999999997e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000847159 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1264  integrase catalytic subunit  41.72 
 
 
336 aa  178  1e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0642781  normal  0.0493016 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0020  hypothetical protein  36.09 
 
 
348 aa  175  9.999999999999999e-43  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2884  hypothetical protein  36.09 
 
 
348 aa  175  9.999999999999999e-43  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2468  integrase catalytic subunit  35.26 
 
 
514 aa  175  9.999999999999999e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>