More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_1264 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007973  Rmet_1264  integrase catalytic subunit  100 
 
 
336 aa  687    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0642781  normal  0.0493016 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0020  hypothetical protein  53.75 
 
 
348 aa  363  2e-99  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1563  hypothetical protein  53.75 
 
 
340 aa  363  2e-99  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2884  hypothetical protein  53.75 
 
 
348 aa  363  2e-99  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7663  integrase catalytic region  57.77 
 
 
348 aa  363  2e-99  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0046  ISGsu6, transposase OrfA  55.62 
 
 
341 aa  357  9.999999999999999e-98  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.688016  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2593  ISGsu6, transposase OrfA  55.62 
 
 
341 aa  357  9.999999999999999e-98  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.243982  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0321  integrase catalytic subunit  55.79 
 
 
341 aa  356  2.9999999999999997e-97  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0105931 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1118  integrase catalytic subunit  55.79 
 
 
341 aa  356  2.9999999999999997e-97  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1789  integrase catalytic subunit  55.79 
 
 
341 aa  356  2.9999999999999997e-97  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2272  integrase catalytic subunit  55.79 
 
 
341 aa  356  2.9999999999999997e-97  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0220216  hitchhiker  0.000461104 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2539  integrase catalytic subunit  55.79 
 
 
341 aa  356  2.9999999999999997e-97  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00047026  hitchhiker  0.00000000018385 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2586  integrase catalytic subunit  55.79 
 
 
341 aa  356  2.9999999999999997e-97  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0248633  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2797  integrase catalytic subunit  55.79 
 
 
341 aa  356  2.9999999999999997e-97  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3282  integrase catalytic subunit  55.79 
 
 
341 aa  356  2.9999999999999997e-97  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.590315  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0952  ISRSO3-transposase ORFA protein  54.91 
 
 
354 aa  355  5e-97  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.273706  normal  0.107434 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0247  ISRSO6-transposase ORFA protein  54.91 
 
 
347 aa  355  5.999999999999999e-97  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0946447  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2333  ISRSO6-transposase ORFA protein  54.91 
 
 
347 aa  355  5.999999999999999e-97  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.764175  normal  0.115531 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0451  ISRSO6-transposase ORFA protein  54.91 
 
 
347 aa  355  5.999999999999999e-97  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.886933  normal  0.322563 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2909  ISGsu6, transposase OrfA  59.8 
 
 
342 aa  349  4e-95  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.29922  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3407  ISGsu6, transposase OrfA  59.8 
 
 
342 aa  349  4e-95  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31560  Transposase  54.95 
 
 
341 aa  337  9.999999999999999e-92  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09530  integrase  54.95 
 
 
341 aa  337  9.999999999999999e-92  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36480  transposase, helix-turn-helix, Fis-type  54.95 
 
 
341 aa  337  1.9999999999999998e-91  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49630  helix-turn-helix, Fis-type  54.95 
 
 
341 aa  337  1.9999999999999998e-91  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.840005  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0019  ISPsy4, transposase  52.52 
 
 
340 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0055  ISPsy4, transposase  52.52 
 
 
340 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0194  ISPsy4, transposase  52.52 
 
 
340 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0292  ISPsy4, transposase  52.52 
 
 
340 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0833  ISPsy4, transposase  52.52 
 
 
340 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0865  ISPsy4, transposase  52.52 
 
 
340 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1095  ISPsy4, transposase  52.52 
 
 
340 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.189576  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1659  ISPsy4, transposase  52.52 
 
 
340 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2321  ISPsy4, transposase  52.52 
 
 
340 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.000712156  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2387  ISPsy4, transposase  52.52 
 
 
340 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.010584  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2740  ISPsy4, transposase  52.52 
 
 
340 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3013  ISPsy4, transposase  52.52 
 
 
340 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0378398  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3224  ISPsy4, transposase  52.52 
 
 
340 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.038075  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3433  ISPsy4, transposase  52.52 
 
 
340 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.45779  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3608  ISPsy4, transposase  52.52 
 
 
340 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.656873  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4013  ISPsy4, transposase  52.52 
 
 
340 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4269  ISPsy4, transposase  52.52 
 
 
340 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4625  ISPsy4, transposase  52.52 
 
 
340 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.146787  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4730  ISPsy4, transposase  52.52 
 
 
340 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4769  ISPsy4, transposase  52.52 
 
 
340 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5575  ISPsy4, transposase  52.52 
 
 
340 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004632  PSPTO_B0040  ISPsy4, transposase  52.52 
 
 
340 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.348986  n/a   
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0013  ISPsy4, transposase  52.52 
 
 
340 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.292398  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3216  insertion sequence transposase  49.25 
 
 
340 aa  316  3e-85  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000564447  normal  0.0522706 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3154  insertion sequence transposase  49.25 
 
 
340 aa  316  3e-85  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2171  insertion sequence transposase  49.25 
 
 
340 aa  316  3e-85  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0335942 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2155  insertion sequence transposase  49.25 
 
 
340 aa  316  3e-85  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0564082  normal  0.0481856 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2025  insertion sequence transposase  49.25 
 
 
340 aa  316  3e-85  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4125  insertion sequence transposase  49.25 
 
 
340 aa  316  3e-85  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.44357  normal  0.500657 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1904  insertion sequence transposase  49.25 
 
 
340 aa  316  3e-85  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00789725 
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0029  IS21 family transposase  49.25 
 
 
340 aa  316  3e-85  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2088  insertion sequence transposase  49.25 
 
 
340 aa  316  3e-85  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.207066 
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0001  IS21 family transposase  49.25 
 
 
340 aa  316  3e-85  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000122483 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0077  insertion sequence transposase  49.25 
 
 
340 aa  316  3e-85  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0448  insertion sequence transposase  49.25 
 
 
340 aa  316  3e-85  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.453908  hitchhiker  0.00000287146 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0314  insertion sequence transposase  49.25 
 
 
340 aa  316  3e-85  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.415268  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0136  insertion sequence transposase  49.25 
 
 
340 aa  316  3e-85  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0217084 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3280  insertion sequence transposase  49.25 
 
 
340 aa  316  3e-85  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0112823 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0530  insertion sequence transposase  49.25 
 
 
340 aa  316  3e-85  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000118737  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0634  insertion sequence transposase  49.25 
 
 
340 aa  316  3e-85  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0933756  normal  0.145557 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3672  insertion sequence transposase  49.25 
 
 
340 aa  316  3e-85  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000543988  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3800  insertion sequence transposase  49.25 
 
 
340 aa  316  3e-85  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3951  insertion sequence transposase  49.25 
 
 
340 aa  316  3e-85  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3444  insertion sequence transposase  49.25 
 
 
340 aa  316  3e-85  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3487  insertion sequence transposase  49.25 
 
 
340 aa  316  3e-85  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.169046 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2905  insertion sequence transposase  49.25 
 
 
340 aa  316  3e-85  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00121621  normal  0.994964 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1294  insertion sequence transposase  49.25 
 
 
340 aa  316  3e-85  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0015  IS21 family transposase  49.25 
 
 
340 aa  316  3e-85  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2392  insertion sequence transposase  49.25 
 
 
340 aa  316  3e-85  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.392902  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2586  insertion sequence transposase  49.25 
 
 
340 aa  316  3e-85  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00244507  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2960  insertion sequence transposase  49.25 
 
 
340 aa  316  3e-85  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00154243 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2677  insertion sequence transposase  49.25 
 
 
340 aa  316  3e-85  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.585168  normal  0.0366075 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2797  insertion sequence transposase  49.25 
 
 
340 aa  316  3e-85  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000133045  normal  0.199341 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2527  insertion sequence transposase  49.25 
 
 
340 aa  316  3e-85  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1049  insertion sequence transposase  49.25 
 
 
340 aa  316  3e-85  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0362189  normal  0.0286616 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0689  insertion sequence transposase  49.25 
 
 
340 aa  316  3e-85  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0888  insertion sequence transposase  49.25 
 
 
340 aa  316  3e-85  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0176798  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3338  IS100, transposase  49.25 
 
 
340 aa  314  9.999999999999999e-85  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3634  putative transposase  49.25 
 
 
338 aa  312  5.999999999999999e-84  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0020  transposase for insertion sequence  48.8 
 
 
340 aa  311  1e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0048  IS100 transposase orfA  48.96 
 
 
340 aa  310  2e-83  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1441  transposase  52.36 
 
 
491 aa  310  2.9999999999999997e-83  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.31725  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1628  transposase  52.36 
 
 
491 aa  310  2.9999999999999997e-83  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1939  transposase  52.36 
 
 
491 aa  310  2.9999999999999997e-83  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0012517  normal  0.673499 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0036  transposase  52.36 
 
 
491 aa  310  2.9999999999999997e-83  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0098  IS21 family transposase  52.36 
 
 
491 aa  310  2.9999999999999997e-83  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  5.2973499999999993e-20  hitchhiker  2.05788e-63 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3336  insertion sequence transposase  52.36 
 
 
491 aa  310  2.9999999999999997e-83  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3532  transposase  52.36 
 
 
491 aa  310  2.9999999999999997e-83  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.447396  normal  0.0612525 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4054  transposase  52.36 
 
 
491 aa  310  2.9999999999999997e-83  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1305  transposase  52.36 
 
 
491 aa  310  2.9999999999999997e-83  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3393  transposase  52.36 
 
 
491 aa  310  2.9999999999999997e-83  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.39722  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2877  transposase  52.36 
 
 
491 aa  310  2.9999999999999997e-83  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1238  transposase  52.36 
 
 
491 aa  310  2.9999999999999997e-83  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00126413 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1183  transposase  52.36 
 
 
489 aa  306  5.0000000000000004e-82  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000138357 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0356  integrase catalytic region  49.11 
 
 
347 aa  289  6e-77  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>