More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_2833 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_0136  integrase catalytic subunit  100 
 
 		 434 aa  899    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0324788  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2833  integrase catalytic subunit  100 
 
 		 434 aa  899    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0119  Integrase catalytic region  43.1 
 
 		 449 aa  304  2.0000000000000002e-81  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1081  Integrase catalytic region  43.1 
 
 		 449 aa  304  2.0000000000000002e-81  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.333924  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5624  integrase catalytic region  38.01 
 
 		 429 aa  237  3e-61  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.205652  normal  0.723097 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1847  integrase catalytic region  38.01 
 
 		 429 aa  237  3e-61  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.154194 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1706  integrase catalytic region  38.01 
 
 		 429 aa  237  3e-61  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4913  integrase catalytic subunit  35.84 
 
 		 428 aa  231  2e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.279769 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0210  transposase, IS21 family  34.25 
 
 		 417 aa  230  3e-59  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000847159 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1554  Integrase catalytic region  35.19 
 
 		 413 aa  216  7e-55  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0376  Integrase catalytic region  37.94 
 
 		 426 aa  207  2e-52  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2305  Integrase catalytic region  37.94 
 
 		 426 aa  207  2e-52  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0786  Integrase catalytic region  35.86 
 
 		 410 aa  203  6e-51  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0012  putative transposase  35.46 
 
 		 416 aa  202  6e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.116272 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0099  putative transposase  35.46 
 
 		 435 aa  202  7e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.431039 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3717  integrase catalytic subunit  36.44 
 
 		 412 aa  201  9.999999999999999e-51  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1326  Integrase catalytic region  36.64 
 
 		 425 aa  198  2.0000000000000003e-49  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1009  integrase catalytic subunit  36.39 
 
 		 412 aa  198  2.0000000000000003e-49  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00535974  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1319  integrase catalytic subunit  36.39 
 
 		 412 aa  198  2.0000000000000003e-49  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2854  integrase catalytic subunit  36.39 
 
 		 412 aa  198  2.0000000000000003e-49  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.230802  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3693  Integrase catalytic region  36.91 
 
 		 425 aa  196  8.000000000000001e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3058  Integrase catalytic region  36.91 
 
 		 425 aa  196  8.000000000000001e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1512  Integrase catalytic region  36.91 
 
 		 425 aa  196  8.000000000000001e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1457  integrase  34.54 
 
 		 410 aa  193  5e-48  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2538  integrase catalytic subunit  41.39 
 
 		 424 aa  192  9e-48  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.178355  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6916  integrase catalytic region  37.36 
 
 		 427 aa  187  3e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.803027  normal  1 
 
 
-
 
NC_010373  M446_7013  hypothetical protein  37.36 
 
 		 427 aa  187  3e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3888  integrase catalytic region  37.36 
 
 		 427 aa  187  3e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2452  integrase catalytic region  37.36 
 
 		 427 aa  187  3e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.227029 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1464  integrase catalytic region  37.36 
 
 		 427 aa  187  3e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4700  integrase catalytic region  37.36 
 
 		 427 aa  187  3e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.670986  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2798  integrase catalytic region  37.36 
 
 		 427 aa  187  3e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5534  integrase catalytic region  37.36 
 
 		 427 aa  187  3e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1510  integrase catalytic region  37.36 
 
 		 427 aa  187  3e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5106  integrase catalytic subunit  34.89 
 
 		 431 aa  182  9.000000000000001e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.214322  normal  0.182706 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2921  IS21 family transposase  34.31 
 
 		 390 aa  182  1e-44  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0994  IS21 family transposase  34.04 
 
 		 390 aa  182  1e-44  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3370  IS21 family transposase  34.04 
 
 		 390 aa  182  1e-44  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009788  EcE24377A_D0043  IS21 family transposase  34.31 
 
 		 390 aa  182  1e-44  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.920387  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2228  IS21 family transposase  34.04 
 
 		 390 aa  182  1e-44  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.503141  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0019  IS21 family transposase  34.04 
 
 		 390 aa  182  1e-44  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0506229  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0036  IS21 family transposase  34.31 
 
 		 390 aa  182  1e-44  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3341  IS21 family transposase  34.31 
 
 		 390 aa  182  1e-44  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0020  hypothetical protein  35.83 
 
 		 348 aa  181  2.9999999999999997e-44  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2884  hypothetical protein  35.83 
 
 		 348 aa  181  2.9999999999999997e-44  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3144  IS2 transposase orfA  33.25 
 
 		 390 aa  180  4e-44  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1563  hypothetical protein  36.73 
 
 		 340 aa  180  4.999999999999999e-44  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0020  transposase for insertion sequence  36.98 
 
 		 340 aa  175  9.999999999999999e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0048  IS100 transposase orfA  37.3 
 
 		 340 aa  169  9e-41  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1904  insertion sequence transposase  36.33 
 
 		 340 aa  169  1e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00789725 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2527  insertion sequence transposase  36.33 
 
 		 340 aa  169  1e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2171  insertion sequence transposase  36.33 
 
 		 340 aa  169  1e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0335942 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2905  insertion sequence transposase  36.33 
 
 		 340 aa  169  1e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00121621  normal  0.994964 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3487  insertion sequence transposase  36.33 
 
 		 340 aa  169  1e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.169046 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3444  insertion sequence transposase  36.33 
 
 		 340 aa  169  1e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2025  insertion sequence transposase  36.33 
 
 		 340 aa  169  1e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2088  insertion sequence transposase  36.33 
 
 		 340 aa  169  1e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.207066 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2797  insertion sequence transposase  36.33 
 
 		 340 aa  169  1e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000133045  normal  0.199341 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2586  insertion sequence transposase  36.33 
 
 		 340 aa  169  1e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00244507  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2677  insertion sequence transposase  36.33 
 
 		 340 aa  169  1e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.585168  normal  0.0366075 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2392  insertion sequence transposase  36.33 
 
 		 340 aa  169  1e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.392902  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3280  insertion sequence transposase  36.33 
 
 		 340 aa  169  1e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0112823 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3216  insertion sequence transposase  36.33 
 
 		 340 aa  169  1e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000564447  normal  0.0522706 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3154  insertion sequence transposase  36.33 
 
 		 340 aa  169  1e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2960  insertion sequence transposase  36.33 
 
 		 340 aa  169  1e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00154243 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2155  insertion sequence transposase  36.33 
 
 		 340 aa  169  1e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0564082  normal  0.0481856 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2909  ISGsu6, transposase OrfA  37.83 
 
 		 342 aa  169  1e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.29922  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3407  ISGsu6, transposase OrfA  37.83 
 
 		 342 aa  169  1e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0001  IS21 family transposase  36.33 
 
 		 340 aa  169  1e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000122483 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3951  insertion sequence transposase  36.33 
 
 		 340 aa  169  1e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4125  insertion sequence transposase  36.33 
 
 		 340 aa  169  1e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.44357  normal  0.500657 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0448  insertion sequence transposase  36.33 
 
 		 340 aa  169  1e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.453908  hitchhiker  0.00000287146 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0314  insertion sequence transposase  36.33 
 
 		 340 aa  169  1e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.415268  normal  1 
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0015  IS21 family transposase  36.33 
 
 		 340 aa  169  1e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0029  IS21 family transposase  36.33 
 
 		 340 aa  169  1e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0530  insertion sequence transposase  36.33 
 
 		 340 aa  169  1e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000118737  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0634  insertion sequence transposase  36.33 
 
 		 340 aa  169  1e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0933756  normal  0.145557 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3338  IS100, transposase  36.33 
 
 		 340 aa  169  1e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0689  insertion sequence transposase  36.33 
 
 		 340 aa  169  1e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1049  insertion sequence transposase  36.33 
 
 		 340 aa  169  1e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0362189  normal  0.0286616 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0888  insertion sequence transposase  36.33 
 
 		 340 aa  169  1e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0176798  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1294  insertion sequence transposase  36.33 
 
 		 340 aa  169  1e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3672  insertion sequence transposase  36.33 
 
 		 340 aa  169  1e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000543988  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3800  insertion sequence transposase  36.33 
 
 		 340 aa  169  1e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0136  insertion sequence transposase  36.33 
 
 		 340 aa  169  1e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0217084 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0077  insertion sequence transposase  36.33 
 
 		 340 aa  169  1e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0952  ISRSO3-transposase ORFA protein  35.6 
 
 		 354 aa  168  2e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.273706  normal  0.107434 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1441  transposase  36.33 
 
 		 491 aa  168  2e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.31725  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2877  transposase  36.33 
 
 		 491 aa  168  2e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1939  transposase  36.33 
 
 		 491 aa  168  2e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0012517  normal  0.673499 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1628  transposase  36.33 
 
 		 491 aa  168  2e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3393  transposase  36.33 
 
 		 491 aa  168  2e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.39722  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3336  insertion sequence transposase  36.33 
 
 		 491 aa  168  2e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4054  transposase  36.33 
 
 		 491 aa  168  2e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1305  transposase  36.33 
 
 		 491 aa  168  2e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0098  IS21 family transposase  36.33 
 
 		 491 aa  168  2e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  5.2973499999999993e-20  hitchhiker  2.05788e-63 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1238  transposase  36.33 
 
 		 491 aa  168  2e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00126413 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3532  transposase  36.33 
 
 		 491 aa  168  2e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.447396  normal  0.0612525 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0036  transposase  36.33 
 
 		 491 aa  168  2e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1264  integrase catalytic subunit  36.71 
 
 		 336 aa  167  2.9999999999999998e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0642781  normal  0.0493016 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>