More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_3058 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011145  AnaeK_0786  Integrase catalytic region  83.17 
 
 
410 aa  682    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1326  Integrase catalytic region  96.24 
 
 
425 aa  828    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1512  Integrase catalytic region  100 
 
 
425 aa  851    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3693  Integrase catalytic region  100 
 
 
425 aa  851    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3058  Integrase catalytic region  100 
 
 
425 aa  851    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0012  putative transposase  45.8 
 
 
416 aa  312  6.999999999999999e-84  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.116272 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0099  putative transposase  45.8 
 
 
435 aa  312  6.999999999999999e-84  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.431039 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1706  integrase catalytic region  45.93 
 
 
429 aa  298  9e-80  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5624  integrase catalytic region  45.93 
 
 
429 aa  298  9e-80  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.205652  normal  0.723097 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1847  integrase catalytic region  45.93 
 
 
429 aa  298  9e-80  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.154194 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4913  integrase catalytic subunit  47.88 
 
 
428 aa  289  6e-77  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.279769 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2305  Integrase catalytic region  45.37 
 
 
426 aa  287  2.9999999999999996e-76  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0376  Integrase catalytic region  45.37 
 
 
426 aa  287  2.9999999999999996e-76  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0119  Integrase catalytic region  36.62 
 
 
449 aa  201  1.9999999999999998e-50  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1081  Integrase catalytic region  36.62 
 
 
449 aa  201  1.9999999999999998e-50  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.333924  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0136  integrase catalytic subunit  36.91 
 
 
434 aa  196  8.000000000000001e-49  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0324788  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2833  integrase catalytic subunit  36.91 
 
 
434 aa  196  8.000000000000001e-49  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1865  Integrase catalytic region  31.34 
 
 
413 aa  150  3e-35  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1464  integrase catalytic region  32.79 
 
 
427 aa  149  7e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5534  integrase catalytic region  32.79 
 
 
427 aa  149  7e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1510  integrase catalytic region  32.79 
 
 
427 aa  149  7e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3888  integrase catalytic region  32.79 
 
 
427 aa  149  7e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2452  integrase catalytic region  32.79 
 
 
427 aa  149  7e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.227029 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2798  integrase catalytic region  32.79 
 
 
427 aa  149  7e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6916  integrase catalytic region  32.79 
 
 
427 aa  149  7e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.803027  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4700  integrase catalytic region  32.79 
 
 
427 aa  149  7e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.670986  normal 
 
 
-
 
NC_010373  M446_7013  hypothetical protein  32.79 
 
 
427 aa  149  7e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0290  integrase catalytic subunit  30.3 
 
 
495 aa  144  4e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.196451  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0662  integrase catalytic subunit  30 
 
 
495 aa  139  6e-32  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0102982  hitchhiker  0.000000317754 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2239  integrase catalytic subunit  30 
 
 
495 aa  139  6e-32  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0237102 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2538  integrase catalytic subunit  34.43 
 
 
424 aa  138  2e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.178355  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0026  integrase catalytic subunit  33.24 
 
 
512 aa  137  4e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1296  integrase catalytic subunit  33.24 
 
 
512 aa  137  4e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.709062  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2216  integrase catalytic subunit  33.24 
 
 
512 aa  137  4e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3717  integrase catalytic subunit  29.34 
 
 
412 aa  135  9.999999999999999e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1009  integrase catalytic subunit  29.26 
 
 
412 aa  133  5e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00535974  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1319  integrase catalytic subunit  29.26 
 
 
412 aa  133  5e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2854  integrase catalytic subunit  29.26 
 
 
412 aa  133  5e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.230802  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1530  integrase catalytic subunit  34.16 
 
 
523 aa  133  6e-30  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2334  integrase catalytic subunit  34.16 
 
 
523 aa  133  6e-30  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0019  ISPsy4, transposase  33.92 
 
 
340 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0055  ISPsy4, transposase  33.92 
 
 
340 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0194  ISPsy4, transposase  33.92 
 
 
340 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0292  ISPsy4, transposase  33.92 
 
 
340 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0833  ISPsy4, transposase  33.92 
 
 
340 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0865  ISPsy4, transposase  33.92 
 
 
340 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1095  ISPsy4, transposase  33.92 
 
 
340 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.189576  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1659  ISPsy4, transposase  33.92 
 
 
340 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2321  ISPsy4, transposase  33.92 
 
 
340 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.000712156  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2387  ISPsy4, transposase  33.92 
 
 
340 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.010584  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2740  ISPsy4, transposase  33.92 
 
 
340 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3013  ISPsy4, transposase  33.92 
 
 
340 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0378398  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3224  ISPsy4, transposase  33.92 
 
 
340 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.038075  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3433  ISPsy4, transposase  33.92 
 
 
340 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.45779  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3608  ISPsy4, transposase  33.92 
 
 
340 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.656873  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4013  ISPsy4, transposase  33.92 
 
 
340 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4269  ISPsy4, transposase  33.92 
 
 
340 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4625  ISPsy4, transposase  33.92 
 
 
340 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.146787  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4730  ISPsy4, transposase  33.92 
 
 
340 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4769  ISPsy4, transposase  33.92 
 
 
340 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5575  ISPsy4, transposase  33.92 
 
 
340 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004632  PSPTO_B0040  ISPsy4, transposase  33.92 
 
 
340 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.348986  n/a   
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0013  ISPsy4, transposase  33.92 
 
 
340 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.292398  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0649  integrase catalytic subunit  29.9 
 
 
306 aa  132  1.0000000000000001e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00201548 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1457  integrase  31.84 
 
 
410 aa  132  1.0000000000000001e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3144  IS2 transposase orfA  32.23 
 
 
390 aa  130  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0210  transposase, IS21 family  25.96 
 
 
417 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000847159 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0943  Integrase catalytic region  30.14 
 
 
502 aa  128  2.0000000000000002e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.346378  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2939  Integrase catalytic region  30.14 
 
 
502 aa  128  2.0000000000000002e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.620801  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2468  integrase catalytic subunit  31.13 
 
 
514 aa  128  2.0000000000000002e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3370  IS21 family transposase  32.51 
 
 
390 aa  127  3e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0019  IS21 family transposase  32.51 
 
 
390 aa  127  3e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0506229  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0994  IS21 family transposase  32.51 
 
 
390 aa  127  3e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2228  IS21 family transposase  32.51 
 
 
390 aa  127  3e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.503141  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1554  Integrase catalytic region  30.21 
 
 
413 aa  127  5e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3341  IS21 family transposase  32.26 
 
 
390 aa  126  6e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009788  EcE24377A_D0043  IS21 family transposase  32.26 
 
 
390 aa  126  6e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.920387  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2921  IS21 family transposase  32.26 
 
 
390 aa  126  6e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0036  IS21 family transposase  32.26 
 
 
390 aa  126  6e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0317  transposase, IS21 family  30.29 
 
 
496 aa  125  1e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0223423  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4855  Integrase catalytic region  29.62 
 
 
502 aa  125  1e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000769666 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1264  integrase catalytic subunit  33.65 
 
 
336 aa  125  1e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0642781  normal  0.0493016 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4858  Integrase catalytic region  29.62 
 
 
502 aa  125  1e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0252827  normal  0.0109178 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2874  Integrase catalytic region  29.62 
 
 
502 aa  125  1e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1063  Integrase catalytic region  29.59 
 
 
502 aa  125  2e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.877216  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1072  Integrase catalytic region  29.59 
 
 
502 aa  125  2e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1052  Integrase catalytic region  29.59 
 
 
502 aa  124  2e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.437105  normal 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5106  integrase catalytic subunit  31.79 
 
 
431 aa  125  2e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.214322  normal  0.182706 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3634  putative transposase  34.75 
 
 
338 aa  125  2e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1183  transposase  34.75 
 
 
489 aa  124  3e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000138357 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2797  insertion sequence transposase  34.73 
 
 
340 aa  124  3e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000133045  normal  0.199341 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2905  insertion sequence transposase  34.73 
 
 
340 aa  124  3e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00121621  normal  0.994964 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0888  insertion sequence transposase  34.73 
 
 
340 aa  124  3e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0176798  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3444  insertion sequence transposase  34.73 
 
 
340 aa  124  3e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1441  transposase  34.73 
 
 
491 aa  124  3e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.31725  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1305  transposase  34.73 
 
 
491 aa  124  3e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0029  IS21 family transposase  34.73 
 
 
340 aa  124  3e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1628  transposase  34.73 
 
 
491 aa  124  3e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2527  insertion sequence transposase  34.73 
 
 
340 aa  124  3e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1904  insertion sequence transposase  34.73 
 
 
340 aa  124  3e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00789725 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>