More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_3873 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_3873  Integrase catalytic region  100 
 
 		 531 aa  1088    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0464732  normal  0.0452112 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4252  Integrase catalytic region  51.37 
 
 		 518 aa  518  1e-146  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0359  Integrase catalytic region  51.37 
 
 		 518 aa  518  1e-146  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.694452  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1310  Integrase catalytic region  51.37 
 
 		 518 aa  518  1e-146  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1893  Integrase catalytic region  51.37 
 
 		 518 aa  518  1e-146  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.265792  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0009  Integrase catalytic region  52.06 
 
 		 523 aa  511  1e-144  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13460  transposase  58.29 
 
 		 694 aa  493  9.999999999999999e-139  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000225344  hitchhiker  0.00142582 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0638  Integrase catalytic region  34.14 
 
 		 504 aa  258  2e-67  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.316321  normal  0.0202803 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0199  Integrase catalytic region  35.76 
 
 		 512 aa  233  7.000000000000001e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0240231 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6529  Integrase catalytic region  35.76 
 
 		 512 aa  233  7.000000000000001e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.277485  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3857  Integrase catalytic region  34.13 
 
 		 508 aa  226  6e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1192  Integrase catalytic region  34.13 
 
 		 508 aa  226  6e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6440  Integrase catalytic region  34.13 
 
 		 508 aa  226  6e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000175464 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1791  putative transposase catalytic subunit  30.24 
 
 		 507 aa  225  1e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6239  integrase catalytic region  33.56 
 
 		 510 aa  224  3e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5653  integrase catalytic region  33.56 
 
 		 510 aa  224  3e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2295  integrase catalytic region  33.56 
 
 		 510 aa  224  3e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.218611  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0018  integrase catalytic region  33.56 
 
 		 510 aa  224  3e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2511  integrase catalytic region  33.56 
 
 		 510 aa  224  3e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4737  integrase catalytic region  33.56 
 
 		 510 aa  224  3e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3016  integrase catalytic subunit  30.11 
 
 		 519 aa  192  9e-48  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2132  integrase catalytic subunit  30.11 
 
 		 519 aa  192  9e-48  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0303  integrase catalytic subunit  30.11 
 
 		 519 aa  192  9e-48  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3740  putative transposase  30.16 
 
 		 512 aa  186  1.0000000000000001e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1811  integrase catalytic subunit  31.83 
 
 		 510 aa  186  1.0000000000000001e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.14945  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00182  transposase  27.62 
 
 		 510 aa  183  7e-45  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06964  hypothetical protein  27.62 
 
 		 510 aa  182  1e-44  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01935  hypothetical protein  27.62 
 
 		 510 aa  182  1e-44  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06058  hypothetical protein  27.62 
 
 		 510 aa  182  1e-44  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2256  integrase catalytic subunit  29.7 
 
 		 514 aa  180  4.999999999999999e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0559  integrase catalytic subunit  30.18 
 
 		 517 aa  179  7e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9835  transposase  33.95 
 
 		 517 aa  178  2e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0410  integrase catalytic subunit  29.21 
 
 		 514 aa  177  3e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0752835  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0598  integrase catalytic subunit  29.21 
 
 		 514 aa  177  3e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1852  integrase catalytic subunit  29.21 
 
 		 514 aa  177  3e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.687265  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2396  integrase catalytic subunit  29.21 
 
 		 514 aa  177  3e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.483197  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3180  integrase catalytic subunit  29.21 
 
 		 514 aa  177  3e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.150597  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0134  Integrase catalytic region  33.43 
 
 		 507 aa  177  6e-43  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.53025 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1363  Integrase catalytic region  33.43 
 
 		 507 aa  176  7e-43  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0997  integrase catalytic subunit  29.03 
 
 		 514 aa  175  1.9999999999999998e-42  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0193  integrase catalytic subunit  34.42 
 
 		 514 aa  174  2.9999999999999996e-42  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1628  integrase catalytic subunit  34.42 
 
 		 514 aa  174  2.9999999999999996e-42  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2982  integrase catalytic subunit  29.49 
 
 		 514 aa  173  6.999999999999999e-42  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00424027  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2841  ISPsy14, transposase  32.79 
 
 		 504 aa  172  1e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0126762  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3716  Integrase catalytic region  29.2 
 
 		 523 aa  171  3e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  normal  0.124306 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0836  integrase catalytic subunit  30.19 
 
 		 531 aa  171  3e-41  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.649092 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1342  integrase catalytic subunit  30.19 
 
 		 531 aa  171  3e-41  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2443  integrase catalytic subunit  30.19 
 
 		 531 aa  171  3e-41  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.45047  normal  0.859725 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3086  integrase catalytic subunit  30.19 
 
 		 531 aa  171  3e-41  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0215  Integrase catalytic region  29.5 
 
 		 527 aa  170  5e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4229  integrase catalytic subunit  28.6 
 
 		 514 aa  168  2e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0706  integrase catalytic region  29.08 
 
 		 528 aa  165  2.0000000000000002e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.00978905  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0624  transposase  30.31 
 
 		 610 aa  164  3e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.337489  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1554  integrase catalytic subunit  28.29 
 
 		 519 aa  164  5.0000000000000005e-39  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2053  integrase catalytic subunit  28.29 
 
 		 519 aa  164  5.0000000000000005e-39  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3414  integrase catalytic subunit  28.29 
 
 		 519 aa  164  5.0000000000000005e-39  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.604761  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3187  integrase catalytic subunit  27.24 
 
 		 513 aa  162  1e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3708  integrase catalytic subunit  27.24 
 
 		 513 aa  162  1e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1463  transposase  35.61 
 
 		 487 aa  160  4e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0988  integrase catalytic subunit  27.04 
 
 		 513 aa  160  4e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1299  integrase catalytic subunit  27.04 
 
 		 513 aa  160  4e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2660  integrase catalytic subunit  27.04 
 
 		 513 aa  160  4e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.549324  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4128  integrase catalytic subunit  26.85 
 
 		 513 aa  160  5e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0892  integrase catalytic subunit  27.04 
 
 		 513 aa  160  5e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1429  integrase catalytic subunit  28.54 
 
 		 524 aa  158  2e-37  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.398273  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1482  integrase catalytic subunit  28.54 
 
 		 524 aa  158  2e-37  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1925  integrase catalytic subunit  28.54 
 
 		 524 aa  159  2e-37  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.683538  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2241  integrase catalytic subunit  28.54 
 
 		 524 aa  158  2e-37  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1075  integrase catalytic subunit  29.43 
 
 		 475 aa  158  3e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1224  integrase catalytic subunit  27.95 
 
 		 513 aa  157  3e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0682  Integrase catalytic region  28.6 
 
 		 537 aa  155  1e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0892  Integrase catalytic region  28.6 
 
 		 537 aa  156  1e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009471  Acry_3593  integrase catalytic subunit  28.1 
 
 		 513 aa  155  1e-36  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  normal  0.454266 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4315  Integrase catalytic region  28.6 
 
 		 537 aa  156  1e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1038  integrase catalytic region  31.51 
 
 		 488 aa  154  5e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3399  integrase catalytic subunit  28.43 
 
 		 515 aa  152  2e-35  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.976382  n/a   
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3485  integrase catalytic subunit  28.43 
 
 		 515 aa  152  2e-35  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.522877  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2303  integrase catalytic subunit  28.43 
 
 		 515 aa  152  2e-35  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.268136  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0283  integrase catalytic subunit  28.43 
 
 		 515 aa  152  2e-35  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.188339  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5654  Integrase catalytic region  31.41 
 
 		 512 aa  151  3e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1938  integrase catalytic subunit  30.99 
 
 		 512 aa  149  1.0000000000000001e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.441696  normal  0.123274 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4290  integrase catalytic subunit  30.61 
 
 		 512 aa  149  2.0000000000000003e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.559076  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4396  integrase catalytic subunit  30.61 
 
 		 512 aa  149  2.0000000000000003e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.624598  normal  0.336917 
 
 
-
 
NC_008761  Pnap_4788  integrase catalytic subunit  30.61 
 
 		 512 aa  149  2.0000000000000003e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1250  integrase catalytic subunit  31.3 
 
 		 513 aa  146  1e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1855  integrase catalytic subunit  31.03 
 
 		 507 aa  145  1e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5194  integrase catalytic subunit  27.27 
 
 		 525 aa  145  2e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.471073 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1795  putative transposase  27.42 
 
 		 517 aa  144  3e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.765121  normal  1 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4138  integrase catalytic subunit  29.37 
 
 		 513 aa  143  9e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3594  integrase catalytic subunit  31.03 
 
 		 514 aa  142  1.9999999999999998e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3092  Integrase catalytic region  26.8 
 
 		 513 aa  141  3e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.30832  normal  0.801547 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3293  Integrase catalytic region  26.8 
 
 		 513 aa  141  3e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.823799  normal  0.964616 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2154  Integrase catalytic region  26.8 
 
 		 513 aa  141  3e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.944811  normal  0.172855 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0850  Integrase catalytic region  26.8 
 
 		 513 aa  141  3e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4234  Integrase catalytic region  26.8 
 
 		 513 aa  141  3e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.115769  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2788  Integrase catalytic region  26.8 
 
 		 513 aa  141  3e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.952319  normal  0.0224954 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3694  Integrase catalytic region  26.8 
 
 		 513 aa  141  3e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00066117  hitchhiker  0.00045424 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3788  Integrase catalytic region  26.8 
 
 		 513 aa  141  3e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0608543 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2120  Integrase catalytic region  26.8 
 
 		 513 aa  141  3e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0442814  normal  1 
 
 
-
 
NC_013733  Slin_6980  Integrase catalytic region  26.8 
 
 		 513 aa  141  3e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>