More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_1554 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_1554  integrase catalytic subunit  100 
 
 		 519 aa  1090    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2053  integrase catalytic subunit  100 
 
 		 519 aa  1090    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3414  integrase catalytic subunit  100 
 
 		 519 aa  1090    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.604761  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0988  integrase catalytic subunit  51.55 
 
 		 513 aa  548  1e-155  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1299  integrase catalytic subunit  51.55 
 
 		 513 aa  548  1e-155  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2660  integrase catalytic subunit  51.55 
 
 		 513 aa  548  1e-155  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.549324  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3187  integrase catalytic subunit  51.55 
 
 		 513 aa  549  1e-155  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3708  integrase catalytic subunit  51.55 
 
 		 513 aa  549  1e-155  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4128  integrase catalytic subunit  51.55 
 
 		 513 aa  547  1e-154  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0892  integrase catalytic subunit  51.55 
 
 		 513 aa  547  1e-154  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4138  integrase catalytic subunit  51.15 
 
 		 513 aa  538  9.999999999999999e-153  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4229  integrase catalytic subunit  51.94 
 
 		 514 aa  541  9.999999999999999e-153  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0410  integrase catalytic subunit  51.94 
 
 		 514 aa  541  9.999999999999999e-153  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0752835  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0598  integrase catalytic subunit  51.94 
 
 		 514 aa  541  9.999999999999999e-153  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1224  integrase catalytic subunit  51.94 
 
 		 513 aa  538  9.999999999999999e-153  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1852  integrase catalytic subunit  51.94 
 
 		 514 aa  541  9.999999999999999e-153  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.687265  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2396  integrase catalytic subunit  51.94 
 
 		 514 aa  541  9.999999999999999e-153  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.483197  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3180  integrase catalytic subunit  51.94 
 
 		 514 aa  541  9.999999999999999e-153  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.150597  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1250  integrase catalytic subunit  52.05 
 
 		 513 aa  535  1e-151  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1328  integrase catalytic subunit  51.16 
 
 		 513 aa  537  1e-151  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0193  integrase catalytic subunit  51.36 
 
 		 514 aa  534  1e-150  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0997  integrase catalytic subunit  51.36 
 
 		 514 aa  533  1e-150  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1628  integrase catalytic subunit  51.36 
 
 		 514 aa  534  1e-150  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2982  integrase catalytic subunit  51.55 
 
 		 514 aa  533  1e-150  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00424027  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2256  integrase catalytic subunit  50.78 
 
 		 514 aa  529  1e-149  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2841  ISPsy14, transposase  50.1 
 
 		 504 aa  512  1e-144  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0126762  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1075  integrase catalytic subunit  51.67 
 
 		 475 aa  511  1e-143  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3716  Integrase catalytic region  48.36 
 
 		 523 aa  500  1e-140  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  normal  0.124306 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06964  hypothetical protein  49.11 
 
 		 510 aa  498  1e-139  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00182  transposase  49.11 
 
 		 510 aa  498  1e-139  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01935  hypothetical protein  49.11 
 
 		 510 aa  498  1e-139  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06058  hypothetical protein  49.11 
 
 		 510 aa  498  1e-139  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6206  integrase catalytic region  46.55 
 
 		 518 aa  490  1e-137  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6260  integrase catalytic subunit  47.6 
 
 		 517 aa  489  1e-137  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.441371  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5628  integrase catalytic region  46.55 
 
 		 518 aa  490  1e-137  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4730  integrase catalytic region  46.55 
 
 		 518 aa  490  1e-137  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1811  integrase catalytic subunit  48.24 
 
 		 510 aa  485  1e-136  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.14945  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4798  integrase catalytic region  47.51 
 
 		 516 aa  479  1e-134  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.288871  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3740  putative transposase  45.49 
 
 		 512 aa  479  1e-134  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2289  integrase catalytic region  47.51 
 
 		 516 aa  479  1e-134  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1795  putative transposase  47.31 
 
 		 517 aa  477  1e-133  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.765121  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1855  integrase catalytic subunit  46.48 
 
 		 507 aa  464  1e-129  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3594  integrase catalytic subunit  46.05 
 
 		 514 aa  462  1e-129  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1938  integrase catalytic subunit  45.07 
 
 		 512 aa  455  1e-127  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.441696  normal  0.123274 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4290  integrase catalytic subunit  44.79 
 
 		 512 aa  454  1.0000000000000001e-126  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.559076  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4396  integrase catalytic subunit  44.79 
 
 		 512 aa  454  1.0000000000000001e-126  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.624598  normal  0.336917 
 
 
-
 
NC_008761  Pnap_4788  integrase catalytic subunit  44.79 
 
 		 512 aa  454  1.0000000000000001e-126  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4696  integrase catalytic subunit  43.92 
 
 		 505 aa  444  1e-123  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.569862 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1038  integrase catalytic region  45.05 
 
 		 488 aa  436  1e-121  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5654  Integrase catalytic region  41.41 
 
 		 512 aa  423  1e-117  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9835  transposase  42.44 
 
 		 517 aa  423  1e-117  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009471  Acry_3593  integrase catalytic subunit  39.06 
 
 		 513 aa  423  1e-117  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  normal  0.454266 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0559  integrase catalytic subunit  42.16 
 
 		 517 aa  419  1e-116  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2303  integrase catalytic subunit  41.19 
 
 		 515 aa  417  9.999999999999999e-116  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.268136  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0283  integrase catalytic subunit  41.19 
 
 		 515 aa  417  9.999999999999999e-116  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.188339  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3399  integrase catalytic subunit  41.19 
 
 		 515 aa  417  9.999999999999999e-116  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.976382  n/a   
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3485  integrase catalytic subunit  41.19 
 
 		 515 aa  417  9.999999999999999e-116  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.522877  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5194  integrase catalytic subunit  41.79 
 
 		 525 aa  409  1e-113  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.471073 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1463  transposase  42.16 
 
 		 487 aa  392  1e-108  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0706  integrase catalytic region  39.31 
 
 		 528 aa  391  1e-107  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.00978905  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5452  integrase catalytic region  44.47 
 
 		 458 aa  374  1e-102  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.681559  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1363  Integrase catalytic region  38.51 
 
 		 507 aa  353  5e-96  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0134  Integrase catalytic region  38.51 
 
 		 507 aa  353  5.9999999999999994e-96  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.53025 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2548  integrase catalytic subunit  39.26 
 
 		 518 aa  351  2e-95  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0303  integrase catalytic subunit  40.25 
 
 		 519 aa  339  7e-92  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2132  integrase catalytic subunit  40.25 
 
 		 519 aa  339  7e-92  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3016  integrase catalytic subunit  40.25 
 
 		 519 aa  339  7e-92  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5850  Integrase catalytic region  35.53 
 
 		 513 aa  334  2e-90  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0780  Integrase catalytic region  42.46 
 
 		 432 aa  328  1.0000000000000001e-88  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0612  integrase catalytic subunit  43.78 
 
 		 472 aa  314  1.9999999999999998e-84  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.352245  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3293  Integrase catalytic region  40.42 
 
 		 513 aa  312  1e-83  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.823799  normal  0.964616 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4851  Integrase catalytic region  40.42 
 
 		 513 aa  312  1e-83  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.242832  normal  1 
 
 
-
 
NC_013733  Slin_6980  Integrase catalytic region  40.42 
 
 		 513 aa  312  1e-83  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5580  Integrase catalytic region  40.42 
 
 		 513 aa  312  1e-83  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4302  Integrase catalytic region  40.42 
 
 		 513 aa  312  1e-83  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00408602 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2154  Integrase catalytic region  40.42 
 
 		 513 aa  312  1e-83  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.944811  normal  0.172855 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6805  Integrase catalytic region  40.42 
 
 		 513 aa  312  1e-83  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2788  Integrase catalytic region  40.42 
 
 		 513 aa  312  1e-83  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.952319  normal  0.0224954 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3092  Integrase catalytic region  40.42 
 
 		 513 aa  312  1e-83  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.30832  normal  0.801547 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3694  Integrase catalytic region  40.42 
 
 		 513 aa  312  1e-83  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00066117  hitchhiker  0.00045424 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4234  Integrase catalytic region  40.42 
 
 		 513 aa  312  1e-83  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.115769  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3788  Integrase catalytic region  40.42 
 
 		 513 aa  312  1e-83  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0608543 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0850  Integrase catalytic region  40.42 
 
 		 513 aa  312  1e-83  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6473  Integrase catalytic region  40.42 
 
 		 513 aa  312  1e-83  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2963  Integrase catalytic region  40.42 
 
 		 513 aa  312  1e-83  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6163  Integrase catalytic region  40.42 
 
 		 513 aa  312  1e-83  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2120  Integrase catalytic region  40.42 
 
 		 513 aa  312  1e-83  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0442814  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5321  Integrase catalytic region  40.42 
 
 		 513 aa  312  1e-83  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.354079 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02341  hypothetical protein  52.94 
 
 		 539 aa  302  1e-80  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0037  Integrase catalytic region  33.71 
 
 		 515 aa  288  1e-76  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1596  Integrase catalytic region  34.67 
 
 		 512 aa  267  2.9999999999999995e-70  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.151594  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5413  integrase catalytic region  47.65 
 
 		 385 aa  266  5e-70  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.694464 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0148  Integrase catalytic region  36.36 
 
 		 520 aa  259  9e-68  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0052  Integrase catalytic region  36.36 
 
 		 521 aa  259  1e-67  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1429  integrase catalytic subunit  31 
 
 		 524 aa  235  1.0000000000000001e-60  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.398273  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1482  integrase catalytic subunit  31 
 
 		 524 aa  235  1.0000000000000001e-60  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1925  integrase catalytic subunit  31 
 
 		 524 aa  235  1.0000000000000001e-60  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.683538  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2241  integrase catalytic subunit  31 
 
 		 524 aa  235  1.0000000000000001e-60  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1830  transposase subunit  31.16 
 
 		 526 aa  234  4.0000000000000004e-60  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.733482  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2791  TRm23a transposase  44.09 
 
 		 260 aa  231  3e-59  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.297528  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>