More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_3485 on replicon NC_009469
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009484  Acry_2303  integrase catalytic subunit  100 
 
 
515 aa  1033    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.268136  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3399  integrase catalytic subunit  100 
 
 
515 aa  1033    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.976382  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0283  integrase catalytic subunit  100 
 
 
515 aa  1033    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.188339  n/a   
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3485  integrase catalytic subunit  100 
 
 
515 aa  1033    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.522877  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1463  transposase  70.43 
 
 
487 aa  665    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1811  integrase catalytic subunit  54.47 
 
 
510 aa  544  1e-153  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.14945  normal 
 
 
-
 
NC_009471  Acry_3593  integrase catalytic subunit  51.94 
 
 
513 aa  522  1e-147  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  normal  0.454266 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4128  integrase catalytic subunit  51.64 
 
 
513 aa  510  1e-143  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0988  integrase catalytic subunit  51.45 
 
 
513 aa  509  1e-143  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1224  integrase catalytic subunit  51.84 
 
 
513 aa  511  1e-143  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1299  integrase catalytic subunit  51.45 
 
 
513 aa  509  1e-143  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2660  integrase catalytic subunit  51.45 
 
 
513 aa  509  1e-143  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.549324  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3187  integrase catalytic subunit  51.45 
 
 
513 aa  511  1e-143  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3708  integrase catalytic subunit  51.45 
 
 
513 aa  511  1e-143  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0892  integrase catalytic subunit  51.45 
 
 
513 aa  508  9.999999999999999e-143  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5654  Integrase catalytic region  52.33 
 
 
512 aa  506  9.999999999999999e-143  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2841  ISPsy14, transposase  49.8 
 
 
504 aa  495  1e-139  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0126762  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1075  integrase catalytic subunit  52.21 
 
 
475 aa  475  1e-133  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3716  Integrase catalytic region  47.97 
 
 
523 aa  473  1e-132  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  normal  0.124306 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3740  putative transposase  46.15 
 
 
512 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4229  integrase catalytic subunit  47.02 
 
 
514 aa  467  9.999999999999999e-131  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0410  integrase catalytic subunit  47.51 
 
 
514 aa  467  9.999999999999999e-131  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0752835  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0598  integrase catalytic subunit  47.51 
 
 
514 aa  467  9.999999999999999e-131  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0997  integrase catalytic subunit  47.51 
 
 
514 aa  466  9.999999999999999e-131  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1852  integrase catalytic subunit  47.51 
 
 
514 aa  467  9.999999999999999e-131  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.687265  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2396  integrase catalytic subunit  47.51 
 
 
514 aa  467  9.999999999999999e-131  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.483197  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3180  integrase catalytic subunit  47.51 
 
 
514 aa  467  9.999999999999999e-131  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.150597  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0193  integrase catalytic subunit  46.45 
 
 
514 aa  464  1e-129  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1628  integrase catalytic subunit  46.45 
 
 
514 aa  464  1e-129  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2256  integrase catalytic subunit  46.83 
 
 
514 aa  459  9.999999999999999e-129  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2982  integrase catalytic subunit  46.64 
 
 
514 aa  461  9.999999999999999e-129  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00424027  n/a   
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6260  integrase catalytic subunit  47.32 
 
 
517 aa  451  1e-125  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.441371  normal 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4290  integrase catalytic subunit  47.3 
 
 
512 aa  444  1e-123  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.559076  normal 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4396  integrase catalytic subunit  47.3 
 
 
512 aa  444  1e-123  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.624598  normal  0.336917 
 
 
-
 
NC_008761  Pnap_4788  integrase catalytic subunit  47.3 
 
 
512 aa  444  1e-123  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1938  integrase catalytic subunit  48.55 
 
 
512 aa  442  9.999999999999999e-123  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.441696  normal  0.123274 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2289  integrase catalytic region  47.05 
 
 
516 aa  437  1e-121  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4798  integrase catalytic region  47.05 
 
 
516 aa  437  1e-121  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.288871  normal 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6206  integrase catalytic region  46.35 
 
 
518 aa  434  1e-120  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5628  integrase catalytic region  46.35 
 
 
518 aa  434  1e-120  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4730  integrase catalytic region  46.35 
 
 
518 aa  434  1e-120  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1795  putative transposase  45.63 
 
 
517 aa  431  1e-119  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.765121  normal 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3248  transposase  99.53 
 
 
225 aa  427  1e-118  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.136244  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4696  integrase catalytic subunit  46.08 
 
 
505 aa  423  1e-117  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.569862 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1554  integrase catalytic subunit  41.19 
 
 
519 aa  417  9.999999999999999e-116  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2053  integrase catalytic subunit  41.19 
 
 
519 aa  417  9.999999999999999e-116  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3414  integrase catalytic subunit  41.19 
 
 
519 aa  417  9.999999999999999e-116  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.604761  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1855  integrase catalytic subunit  45.42 
 
 
507 aa  416  9.999999999999999e-116  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3594  integrase catalytic subunit  45.38 
 
 
514 aa  418  9.999999999999999e-116  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1250  integrase catalytic subunit  42.28 
 
 
513 aa  413  1e-114  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5452  integrase catalytic region  51.97 
 
 
458 aa  411  1e-113  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.681559  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1328  integrase catalytic subunit  41.68 
 
 
513 aa  411  1e-113  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0706  integrase catalytic region  44.12 
 
 
528 aa  411  1e-113  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.00978905  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1363  Integrase catalytic region  42.66 
 
 
507 aa  399  9.999999999999999e-111  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0134  Integrase catalytic region  42.66 
 
 
507 aa  399  9.999999999999999e-111  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.53025 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9835  transposase  43.75 
 
 
517 aa  401  9.999999999999999e-111  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0559  integrase catalytic subunit  41.91 
 
 
517 aa  397  1e-109  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4138  integrase catalytic subunit  40.54 
 
 
513 aa  396  1e-109  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1038  integrase catalytic region  42.89 
 
 
488 aa  378  1e-103  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00182  transposase  37.76 
 
 
510 aa  374  1e-102  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5194  integrase catalytic subunit  40.76 
 
 
525 aa  374  1e-102  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.471073 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06058  hypothetical protein  37.76 
 
 
510 aa  374  1e-102  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01935  hypothetical protein  37.76 
 
 
510 aa  374  1e-102  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06964  hypothetical protein  37.76 
 
 
510 aa  374  1e-102  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2120  Integrase catalytic region  38.24 
 
 
513 aa  330  4e-89  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0442814  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6473  Integrase catalytic region  38.24 
 
 
513 aa  330  4e-89  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013733  Slin_6980  Integrase catalytic region  38.24 
 
 
513 aa  330  4e-89  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6805  Integrase catalytic region  38.24 
 
 
513 aa  330  4e-89  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6163  Integrase catalytic region  38.24 
 
 
513 aa  330  4e-89  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4851  Integrase catalytic region  38.24 
 
 
513 aa  330  4e-89  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.242832  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5321  Integrase catalytic region  38.24 
 
 
513 aa  330  4e-89  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.354079 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4302  Integrase catalytic region  38.24 
 
 
513 aa  330  4e-89  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00408602 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3293  Integrase catalytic region  38.24 
 
 
513 aa  330  4e-89  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.823799  normal  0.964616 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2963  Integrase catalytic region  38.24 
 
 
513 aa  330  4e-89  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2788  Integrase catalytic region  38.24 
 
 
513 aa  330  4e-89  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.952319  normal  0.0224954 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5580  Integrase catalytic region  38.24 
 
 
513 aa  330  4e-89  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2154  Integrase catalytic region  38.24 
 
 
513 aa  330  4e-89  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.944811  normal  0.172855 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3092  Integrase catalytic region  38.24 
 
 
513 aa  330  4e-89  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.30832  normal  0.801547 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3694  Integrase catalytic region  38.24 
 
 
513 aa  330  4e-89  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00066117  hitchhiker  0.00045424 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0850  Integrase catalytic region  38.24 
 
 
513 aa  330  4e-89  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3788  Integrase catalytic region  38.24 
 
 
513 aa  330  4e-89  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0608543 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4234  Integrase catalytic region  38.24 
 
 
513 aa  330  4e-89  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.115769  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0612  integrase catalytic subunit  47.36 
 
 
472 aa  314  2.9999999999999996e-84  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.352245  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2548  integrase catalytic subunit  36.69 
 
 
518 aa  313  3.9999999999999997e-84  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5850  Integrase catalytic region  37.4 
 
 
513 aa  312  9e-84  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3016  integrase catalytic subunit  36.16 
 
 
519 aa  311  2e-83  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2132  integrase catalytic subunit  36.16 
 
 
519 aa  311  2e-83  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0303  integrase catalytic subunit  36.16 
 
 
519 aa  311  2e-83  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2791  TRm23a transposase  55.56 
 
 
260 aa  290  4e-77  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.297528  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0037  Integrase catalytic region  33.66 
 
 
515 aa  288  2e-76  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0780  Integrase catalytic region  36.93 
 
 
432 aa  282  1e-74  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5413  integrase catalytic region  49.82 
 
 
385 aa  276  8e-73  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.694464 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1925  integrase catalytic subunit  33.4 
 
 
524 aa  258  2e-67  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.683538  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1429  integrase catalytic subunit  33.4 
 
 
524 aa  257  3e-67  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.398273  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1482  integrase catalytic subunit  33.4 
 
 
524 aa  257  3e-67  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2241  integrase catalytic subunit  33.4 
 
 
524 aa  257  3e-67  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1830  transposase subunit  31.68 
 
 
526 aa  249  1e-64  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.733482  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0148  Integrase catalytic region  32.13 
 
 
520 aa  235  1.0000000000000001e-60  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1596  Integrase catalytic region  31.24 
 
 
512 aa  234  2.0000000000000002e-60  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.151594  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0052  Integrase catalytic region  32.18 
 
 
521 aa  235  2.0000000000000002e-60  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>