More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_0134 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_0134  Integrase catalytic region  100 
 
 		 507 aa  1058    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.53025 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1363  Integrase catalytic region  99.8 
 
 		 507 aa  1057    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0559  integrase catalytic subunit  49.7 
 
 		 517 aa  494  9.999999999999999e-139  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2841  ISPsy14, transposase  45.17 
 
 		 504 aa  430  1e-119  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0126762  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0892  integrase catalytic subunit  43.59 
 
 		 513 aa  423  1e-117  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0988  integrase catalytic subunit  43.59 
 
 		 513 aa  423  1e-117  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1299  integrase catalytic subunit  43.59 
 
 		 513 aa  423  1e-117  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2660  integrase catalytic subunit  43.59 
 
 		 513 aa  423  1e-117  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.549324  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3187  integrase catalytic subunit  43.39 
 
 		 513 aa  422  1e-117  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3708  integrase catalytic subunit  43.39 
 
 		 513 aa  422  1e-117  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4128  integrase catalytic subunit  43.39 
 
 		 513 aa  421  1e-116  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1224  integrase catalytic subunit  43.79 
 
 		 513 aa  420  1e-116  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3740  putative transposase  42.49 
 
 		 512 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3716  Integrase catalytic region  43.39 
 
 		 523 aa  405  1.0000000000000001e-112  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  normal  0.124306 
 
 
-
 
NC_009471  Acry_3593  integrase catalytic subunit  43.31 
 
 		 513 aa  403  1e-111  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  normal  0.454266 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0283  integrase catalytic subunit  42.66 
 
 		 515 aa  399  9.999999999999999e-111  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.188339  n/a   
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3485  integrase catalytic subunit  42.66 
 
 		 515 aa  399  9.999999999999999e-111  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.522877  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3399  integrase catalytic subunit  42.66 
 
 		 515 aa  399  9.999999999999999e-111  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.976382  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2303  integrase catalytic subunit  42.66 
 
 		 515 aa  399  9.999999999999999e-111  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.268136  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1075  integrase catalytic subunit  43.55 
 
 		 475 aa  395  1e-109  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4290  integrase catalytic subunit  41.7 
 
 		 512 aa  397  1e-109  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.559076  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4396  integrase catalytic subunit  41.7 
 
 		 512 aa  397  1e-109  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.624598  normal  0.336917 
 
 
-
 
NC_008761  Pnap_4788  integrase catalytic subunit  41.7 
 
 		 512 aa  397  1e-109  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0193  integrase catalytic subunit  43.14 
 
 		 514 aa  389  1e-107  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1628  integrase catalytic subunit  43.14 
 
 		 514 aa  389  1e-107  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5654  Integrase catalytic region  43.7 
 
 		 512 aa  392  1e-107  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4229  integrase catalytic subunit  43.33 
 
 		 514 aa  388  1e-106  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0410  integrase catalytic subunit  43.14 
 
 		 514 aa  385  1e-105  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0752835  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0598  integrase catalytic subunit  43.14 
 
 		 514 aa  385  1e-105  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0997  integrase catalytic subunit  42.75 
 
 		 514 aa  382  1e-105  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1852  integrase catalytic subunit  43.14 
 
 		 514 aa  385  1e-105  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.687265  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2396  integrase catalytic subunit  43.14 
 
 		 514 aa  385  1e-105  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.483197  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2982  integrase catalytic subunit  42.75 
 
 		 514 aa  383  1e-105  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00424027  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3180  integrase catalytic subunit  43.14 
 
 		 514 aa  385  1e-105  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.150597  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2256  integrase catalytic subunit  42.55 
 
 		 514 aa  381  1e-104  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9835  transposase  42.41 
 
 		 517 aa  378  1e-103  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1938  integrase catalytic subunit  40.83 
 
 		 512 aa  374  1e-102  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.441696  normal  0.123274 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1811  integrase catalytic subunit  42.69 
 
 		 510 aa  373  1e-102  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.14945  normal  1 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6260  integrase catalytic subunit  40.9 
 
 		 517 aa  372  1e-101  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.441371  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0706  integrase catalytic region  41.76 
 
 		 528 aa  370  1e-101  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.00978905  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1855  integrase catalytic subunit  40.16 
 
 		 507 aa  369  1e-101  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1250  integrase catalytic subunit  40.67 
 
 		 513 aa  368  1e-100  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4798  integrase catalytic region  40.08 
 
 		 516 aa  366  1e-100  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.288871  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2289  integrase catalytic region  40.08 
 
 		 516 aa  366  1e-100  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1795  putative transposase  39.03 
 
 		 517 aa  363  3e-99  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.765121  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1463  transposase  42.27 
 
 		 487 aa  363  3e-99  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3594  integrase catalytic subunit  39.96 
 
 		 514 aa  363  4e-99  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4138  integrase catalytic subunit  39.05 
 
 		 513 aa  360  5e-98  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4696  integrase catalytic subunit  39.13 
 
 		 505 aa  356  3.9999999999999996e-97  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.569862 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5628  integrase catalytic region  39.34 
 
 		 518 aa  355  6.999999999999999e-97  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4730  integrase catalytic region  39.34 
 
 		 518 aa  355  6.999999999999999e-97  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6206  integrase catalytic region  39.34 
 
 		 518 aa  355  6.999999999999999e-97  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1328  integrase catalytic subunit  39.05 
 
 		 513 aa  354  2e-96  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1554  integrase catalytic subunit  38.51 
 
 		 519 aa  353  5.9999999999999994e-96  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2053  integrase catalytic subunit  38.51 
 
 		 519 aa  353  5.9999999999999994e-96  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3414  integrase catalytic subunit  38.51 
 
 		 519 aa  353  5.9999999999999994e-96  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.604761  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06058  hypothetical protein  37.67 
 
 		 510 aa  349  7e-95  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06964  hypothetical protein  37.67 
 
 		 510 aa  349  7e-95  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01935  hypothetical protein  37.67 
 
 		 510 aa  349  7e-95  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00182  transposase  37.67 
 
 		 510 aa  348  9e-95  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6473  Integrase catalytic region  38.66 
 
 		 513 aa  324  2e-87  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4851  Integrase catalytic region  38.66 
 
 		 513 aa  324  2e-87  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.242832  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1038  integrase catalytic region  38.1 
 
 		 488 aa  325  2e-87  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5580  Integrase catalytic region  38.66 
 
 		 513 aa  324  2e-87  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2120  Integrase catalytic region  38.66 
 
 		 513 aa  324  2e-87  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0442814  normal  1 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6805  Integrase catalytic region  38.66 
 
 		 513 aa  324  2e-87  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2154  Integrase catalytic region  38.66 
 
 		 513 aa  324  2e-87  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.944811  normal  0.172855 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6163  Integrase catalytic region  38.66 
 
 		 513 aa  324  2e-87  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2963  Integrase catalytic region  38.66 
 
 		 513 aa  324  2e-87  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4234  Integrase catalytic region  38.66 
 
 		 513 aa  324  2e-87  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.115769  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3694  Integrase catalytic region  38.66 
 
 		 513 aa  324  2e-87  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00066117  hitchhiker  0.00045424 
 
 
-
 
NC_013733  Slin_6980  Integrase catalytic region  38.66 
 
 		 513 aa  324  2e-87  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3788  Integrase catalytic region  38.66 
 
 		 513 aa  324  2e-87  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0608543 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3293  Integrase catalytic region  38.66 
 
 		 513 aa  324  2e-87  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.823799  normal  0.964616 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5321  Integrase catalytic region  38.66 
 
 		 513 aa  324  2e-87  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.354079 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0850  Integrase catalytic region  38.66 
 
 		 513 aa  324  2e-87  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3092  Integrase catalytic region  38.66 
 
 		 513 aa  324  2e-87  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.30832  normal  0.801547 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4302  Integrase catalytic region  38.66 
 
 		 513 aa  324  2e-87  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00408602 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2788  Integrase catalytic region  38.66 
 
 		 513 aa  324  2e-87  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.952319  normal  0.0224954 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5452  integrase catalytic region  42.18 
 
 		 458 aa  322  8e-87  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.681559  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5194  integrase catalytic subunit  36.62 
 
 		 525 aa  321  1.9999999999999998e-86  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.471073 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2548  integrase catalytic subunit  36.88 
 
 		 518 aa  319  7e-86  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0303  integrase catalytic subunit  36.76 
 
 		 519 aa  313  3.9999999999999997e-84  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2132  integrase catalytic subunit  36.76 
 
 		 519 aa  313  3.9999999999999997e-84  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3016  integrase catalytic subunit  36.76 
 
 		 519 aa  313  3.9999999999999997e-84  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0780  Integrase catalytic region  39.06 
 
 		 432 aa  283  5.000000000000001e-75  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1925  integrase catalytic subunit  35.52 
 
 		 524 aa  273  6e-72  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.683538  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1429  integrase catalytic subunit  35.33 
 
 		 524 aa  271  2e-71  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.398273  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1482  integrase catalytic subunit  35.33 
 
 		 524 aa  271  2e-71  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2241  integrase catalytic subunit  35.33 
 
 		 524 aa  271  2e-71  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0052  Integrase catalytic region  34.52 
 
 		 521 aa  270  4e-71  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5850  Integrase catalytic region  33.4 
 
 		 513 aa  270  4e-71  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0148  Integrase catalytic region  34.52 
 
 		 520 aa  270  5e-71  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0612  integrase catalytic subunit  39.58 
 
 		 472 aa  256  7e-67  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.352245  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0037  Integrase catalytic region  30.92 
 
 		 515 aa  245  9.999999999999999e-64  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1596  Integrase catalytic region  33.4 
 
 		 512 aa  243  7e-63  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.151594  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1830  transposase subunit  33.65 
 
 		 526 aa  242  1e-62  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.733482  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3122  hypothetical protein  37.66 
 
 		 316 aa  214  1.9999999999999998e-54  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2217  integrase catalytic subunit  40.53 
 
 		 302 aa  210  6e-53  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000287605 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5413  integrase catalytic region  41.91 
 
 		 385 aa  204  3e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.694464 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>