More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_3086 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011206  Lferr_0215  Integrase catalytic region  64.07 
 
 		 527 aa  661    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0682  Integrase catalytic region  71.78 
 
 		 537 aa  758    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5344  integrase catalytic subunit  66.67 
 
 		 523 aa  700    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.830623 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0892  Integrase catalytic region  71.59 
 
 		 537 aa  755    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4315  Integrase catalytic region  71.59 
 
 		 537 aa  755    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0836  integrase catalytic subunit  100 
 
 		 531 aa  1093    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.649092 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1342  integrase catalytic subunit  100 
 
 		 531 aa  1093    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2443  integrase catalytic subunit  100 
 
 		 531 aa  1093    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.45047  normal  0.859725 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3086  integrase catalytic subunit  100 
 
 		 531 aa  1093    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0199  Integrase catalytic region  28.9 
 
 		 512 aa  177  6e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0240231 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6529  Integrase catalytic region  28.9 
 
 		 512 aa  177  6e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.277485  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3873  Integrase catalytic region  30.19 
 
 		 531 aa  174  2.9999999999999996e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0464732  normal  0.0452112 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1791  putative transposase catalytic subunit  29.37 
 
 		 507 aa  168  2e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2295  integrase catalytic region  28.72 
 
 		 510 aa  165  2.0000000000000002e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.218611  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4737  integrase catalytic region  28.72 
 
 		 510 aa  165  2.0000000000000002e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2511  integrase catalytic region  28.72 
 
 		 510 aa  165  2.0000000000000002e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5653  integrase catalytic region  28.72 
 
 		 510 aa  165  2.0000000000000002e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0018  integrase catalytic region  28.72 
 
 		 510 aa  165  2.0000000000000002e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6239  integrase catalytic region  28.72 
 
 		 510 aa  165  2.0000000000000002e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0638  Integrase catalytic region  27.89 
 
 		 504 aa  164  3e-39  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.316321  normal  0.0202803 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0009  Integrase catalytic region  31.09 
 
 		 523 aa  161  3e-38  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1893  Integrase catalytic region  30.63 
 
 		 518 aa  160  4e-38  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.265792  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1310  Integrase catalytic region  30.63 
 
 		 518 aa  160  4e-38  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0359  Integrase catalytic region  30.63 
 
 		 518 aa  160  4e-38  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.694452  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4252  Integrase catalytic region  30.63 
 
 		 518 aa  160  4e-38  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0624  transposase  29.7 
 
 		 610 aa  154  4e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.337489  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6440  Integrase catalytic region  27.37 
 
 		 508 aa  150  7e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000175464 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1192  Integrase catalytic region  27.37 
 
 		 508 aa  150  7e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3857  Integrase catalytic region  27.37 
 
 		 508 aa  150  7e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0134  Integrase catalytic region  27.16 
 
 		 507 aa  133  6.999999999999999e-30  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.53025 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1363  Integrase catalytic region  27.16 
 
 		 507 aa  133  7.999999999999999e-30  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13460  transposase  29.05 
 
 		 694 aa  131  3e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000225344  hitchhiker  0.00142582 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1009  integrase catalytic subunit  29.7 
 
 		 412 aa  124  5e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00535974  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1319  integrase catalytic subunit  29.7 
 
 		 412 aa  124  5e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2854  integrase catalytic subunit  29.7 
 
 		 412 aa  124  5e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.230802  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3717  integrase catalytic subunit  29.89 
 
 		 412 aa  123  8e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0136  integrase catalytic subunit  33.44 
 
 		 434 aa  122  9.999999999999999e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0324788  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2833  integrase catalytic subunit  33.44 
 
 		 434 aa  122  9.999999999999999e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2841  ISPsy14, transposase  27.62 
 
 		 504 aa  122  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0126762  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3716  Integrase catalytic region  26.33 
 
 		 523 aa  121  1.9999999999999998e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  normal  0.124306 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1328  integrase catalytic subunit  26 
 
 		 513 aa  119  9.999999999999999e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9835  transposase  29.45 
 
 		 517 aa  118  3e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1250  integrase catalytic subunit  29.31 
 
 		 513 aa  117  6.9999999999999995e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1811  integrase catalytic subunit  30.64 
 
 		 510 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.14945  normal  1 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4138  integrase catalytic subunit  25 
 
 		 513 aa  115  2.0000000000000002e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0559  integrase catalytic subunit  29.03 
 
 		 517 aa  114  3e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3740  putative transposase  27.46 
 
 		 512 aa  115  3e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0997  integrase catalytic subunit  25.73 
 
 		 514 aa  114  3e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2982  integrase catalytic subunit  26.05 
 
 		 514 aa  114  4.0000000000000004e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00424027  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4128  integrase catalytic subunit  26.26 
 
 		 513 aa  113  8.000000000000001e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0988  integrase catalytic subunit  26.47 
 
 		 513 aa  113  9e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1299  integrase catalytic subunit  26.47 
 
 		 513 aa  113  9e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2660  integrase catalytic subunit  26.47 
 
 		 513 aa  113  9e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.549324  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3187  integrase catalytic subunit  26.47 
 
 		 513 aa  113  9e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3708  integrase catalytic subunit  26.47 
 
 		 513 aa  113  9e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4229  integrase catalytic subunit  26.67 
 
 		 514 aa  113  1.0000000000000001e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0892  integrase catalytic subunit  26.47 
 
 		 513 aa  112  1.0000000000000001e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0706  integrase catalytic region  26.63 
 
 		 528 aa  111  3e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.00978905  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2548  integrase catalytic subunit  27.2 
 
 		 518 aa  110  5e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0193  integrase catalytic subunit  25.36 
 
 		 514 aa  110  6e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1628  integrase catalytic subunit  25.36 
 
 		 514 aa  110  6e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0210  transposase, IS21 family  24.4 
 
 		 417 aa  110  7.000000000000001e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000847159 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0376  Integrase catalytic region  29.48 
 
 		 426 aa  109  1e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2305  Integrase catalytic region  29.48 
 
 		 426 aa  109  1e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2798  integrase catalytic region  29.06 
 
 		 427 aa  108  2e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010373  M446_7013  hypothetical protein  29.06 
 
 		 427 aa  108  2e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6916  integrase catalytic region  29.06 
 
 		 427 aa  108  2e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.803027  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4700  integrase catalytic region  29.06 
 
 		 427 aa  108  2e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.670986  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1464  integrase catalytic region  29.06 
 
 		 427 aa  108  2e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3888  integrase catalytic region  29.06 
 
 		 427 aa  108  2e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5534  integrase catalytic region  29.06 
 
 		 427 aa  108  2e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2452  integrase catalytic region  29.06 
 
 		 427 aa  108  2e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.227029 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1510  integrase catalytic region  29.06 
 
 		 427 aa  108  2e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0410  integrase catalytic subunit  25.1 
 
 		 514 aa  108  3e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0752835  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0598  integrase catalytic subunit  25.1 
 
 		 514 aa  108  3e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1852  integrase catalytic subunit  25.1 
 
 		 514 aa  108  3e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.687265  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2396  integrase catalytic subunit  25.1 
 
 		 514 aa  108  3e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.483197  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3180  integrase catalytic subunit  25.1 
 
 		 514 aa  108  3e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.150597  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1063  Integrase catalytic region  31.25 
 
 		 502 aa  105  3e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.877216  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1052  Integrase catalytic region  31.25 
 
 		 502 aa  105  3e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.437105  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4858  Integrase catalytic region  31.25 
 
 		 502 aa  105  3e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0252827  normal  0.0109178 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4855  Integrase catalytic region  31.25 
 
 		 502 aa  105  3e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000769666 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2939  Integrase catalytic region  31.25 
 
 		 502 aa  104  3e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.620801  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2874  Integrase catalytic region  31.25 
 
 		 502 aa  105  3e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6478  Integrase catalytic region  31.25 
 
 		 507 aa  104  3e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1072  Integrase catalytic region  31.25 
 
 		 502 aa  105  3e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0943  Integrase catalytic region  31.25 
 
 		 502 aa  104  4e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.346378  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1139  Integrase catalytic region  29.38 
 
 		 474 aa  104  4e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.650058  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1554  integrase catalytic subunit  24.47 
 
 		 519 aa  104  4e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2053  integrase catalytic subunit  24.47 
 
 		 519 aa  104  4e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3414  integrase catalytic subunit  24.47 
 
 		 519 aa  104  4e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.604761  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1589  Integrase catalytic region  31.25 
 
 		 502 aa  103  9e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1224  integrase catalytic subunit  26.72 
 
 		 513 aa  103  9e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1706  integrase catalytic region  28.76 
 
 		 429 aa  102  1e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1847  integrase catalytic region  28.76 
 
 		 429 aa  102  1e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.154194 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5624  integrase catalytic region  28.76 
 
 		 429 aa  102  1e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.205652  normal  0.723097 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0300  transposase  27.06 
 
 		 529 aa  103  1e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2256  integrase catalytic subunit  24.58 
 
 		 514 aa  102  1e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4913  integrase catalytic subunit  27.81 
 
 		 428 aa  102  2e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.279769 
 
 
-
 
NC_009471  Acry_3593  integrase catalytic subunit  26.37 
 
 		 513 aa  101  3e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  normal  0.454266 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>