More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_1328 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008577  Shewana3_1250  integrase catalytic subunit  72.32 
 
 
513 aa  794    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4138  integrase catalytic subunit  86.35 
 
 
513 aa  947    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1328  integrase catalytic subunit  100 
 
 
513 aa  1068    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0410  integrase catalytic subunit  53.19 
 
 
514 aa  555  1e-157  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0752835  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0598  integrase catalytic subunit  53.19 
 
 
514 aa  555  1e-157  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1852  integrase catalytic subunit  53.19 
 
 
514 aa  555  1e-157  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.687265  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2396  integrase catalytic subunit  53.19 
 
 
514 aa  555  1e-157  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.483197  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3180  integrase catalytic subunit  53.19 
 
 
514 aa  555  1e-157  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.150597  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0997  integrase catalytic subunit  52.9 
 
 
514 aa  553  1e-156  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2256  integrase catalytic subunit  52.7 
 
 
514 aa  551  1e-156  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4229  integrase catalytic subunit  52.99 
 
 
514 aa  548  1e-155  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0193  integrase catalytic subunit  52.79 
 
 
514 aa  550  1e-155  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1628  integrase catalytic subunit  52.79 
 
 
514 aa  550  1e-155  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2982  integrase catalytic subunit  52.99 
 
 
514 aa  549  1e-155  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00424027  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1554  integrase catalytic subunit  51.16 
 
 
519 aa  537  1e-151  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2053  integrase catalytic subunit  51.16 
 
 
519 aa  537  1e-151  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3414  integrase catalytic subunit  51.16 
 
 
519 aa  537  1e-151  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.604761  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4128  integrase catalytic subunit  50.78 
 
 
513 aa  521  1e-147  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0892  integrase catalytic subunit  50.58 
 
 
513 aa  519  1e-146  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0988  integrase catalytic subunit  50.58 
 
 
513 aa  520  1e-146  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1299  integrase catalytic subunit  50.58 
 
 
513 aa  520  1e-146  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2660  integrase catalytic subunit  50.58 
 
 
513 aa  520  1e-146  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.549324  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3187  integrase catalytic subunit  50.58 
 
 
513 aa  521  1e-146  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3708  integrase catalytic subunit  50.58 
 
 
513 aa  521  1e-146  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06058  hypothetical protein  49.61 
 
 
510 aa  514  1e-144  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00182  transposase  49.61 
 
 
510 aa  513  1e-144  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01935  hypothetical protein  49.61 
 
 
510 aa  514  1e-144  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1224  integrase catalytic subunit  50.97 
 
 
513 aa  514  1e-144  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06964  hypothetical protein  49.61 
 
 
510 aa  514  1e-144  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2841  ISPsy14, transposase  50.39 
 
 
504 aa  510  1e-143  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0126762  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4798  integrase catalytic region  49.9 
 
 
516 aa  483  1e-135  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.288871  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2289  integrase catalytic region  49.9 
 
 
516 aa  483  1e-135  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6260  integrase catalytic subunit  47.01 
 
 
517 aa  481  1e-134  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.441371  normal 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3716  Integrase catalytic region  48.53 
 
 
523 aa  478  1e-134  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  normal  0.124306 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5628  integrase catalytic region  47.3 
 
 
518 aa  478  1e-133  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1795  putative transposase  47.68 
 
 
517 aa  478  1e-133  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.765121  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4730  integrase catalytic region  47.3 
 
 
518 aa  478  1e-133  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6206  integrase catalytic region  47.3 
 
 
518 aa  478  1e-133  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1075  integrase catalytic subunit  49.79 
 
 
475 aa  476  1e-133  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1938  integrase catalytic subunit  47.77 
 
 
512 aa  469  1.0000000000000001e-131  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.441696  normal  0.123274 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4290  integrase catalytic subunit  46.62 
 
 
512 aa  467  9.999999999999999e-131  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.559076  normal 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4396  integrase catalytic subunit  46.62 
 
 
512 aa  467  9.999999999999999e-131  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.624598  normal  0.336917 
 
 
-
 
NC_008761  Pnap_4788  integrase catalytic subunit  46.62 
 
 
512 aa  467  9.999999999999999e-131  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3594  integrase catalytic subunit  46.33 
 
 
514 aa  466  9.999999999999999e-131  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1855  integrase catalytic subunit  46.58 
 
 
507 aa  463  1e-129  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1811  integrase catalytic subunit  46.29 
 
 
510 aa  460  9.999999999999999e-129  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.14945  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3740  putative transposase  43.97 
 
 
512 aa  457  1e-127  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4696  integrase catalytic subunit  45.58 
 
 
505 aa  435  1e-121  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.569862 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5654  Integrase catalytic region  44.4 
 
 
512 aa  431  1e-119  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5194  integrase catalytic subunit  42.8 
 
 
525 aa  421  1e-116  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.471073 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1463  transposase  44.51 
 
 
487 aa  415  9.999999999999999e-116  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1038  integrase catalytic region  42.31 
 
 
488 aa  412  1e-114  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009471  Acry_3593  integrase catalytic subunit  41.27 
 
 
513 aa  414  1e-114  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  normal  0.454266 
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3485  integrase catalytic subunit  41.68 
 
 
515 aa  411  1e-113  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.522877  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2303  integrase catalytic subunit  41.68 
 
 
515 aa  411  1e-113  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.268136  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0283  integrase catalytic subunit  41.68 
 
 
515 aa  411  1e-113  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.188339  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3399  integrase catalytic subunit  41.68 
 
 
515 aa  411  1e-113  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.976382  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0780  Integrase catalytic region  45.81 
 
 
432 aa  379  1e-104  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0706  integrase catalytic region  40.23 
 
 
528 aa  379  1e-104  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.00978905  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5452  integrase catalytic region  44.94 
 
 
458 aa  377  1e-103  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.681559  normal 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9835  transposase  40 
 
 
517 aa  370  1e-101  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0559  integrase catalytic subunit  39.38 
 
 
517 aa  365  1e-99  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2548  integrase catalytic subunit  41.26 
 
 
518 aa  364  2e-99  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3016  integrase catalytic subunit  38.18 
 
 
519 aa  359  6e-98  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2132  integrase catalytic subunit  38.18 
 
 
519 aa  359  6e-98  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0303  integrase catalytic subunit  38.18 
 
 
519 aa  359  6e-98  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1363  Integrase catalytic region  39.05 
 
 
507 aa  355  2e-96  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0134  Integrase catalytic region  39.05 
 
 
507 aa  354  2e-96  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.53025 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0612  integrase catalytic subunit  47.69 
 
 
472 aa  353  5e-96  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.352245  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02341  hypothetical protein  52.35 
 
 
539 aa  328  2.0000000000000001e-88  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5850  Integrase catalytic region  36.79 
 
 
513 aa  328  2.0000000000000001e-88  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5413  integrase catalytic region  46.38 
 
 
385 aa  276  5e-73  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.694464 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2963  Integrase catalytic region  34.28 
 
 
513 aa  276  7e-73  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3092  Integrase catalytic region  34.28 
 
 
513 aa  276  7e-73  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.30832  normal  0.801547 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5321  Integrase catalytic region  34.28 
 
 
513 aa  276  7e-73  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.354079 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0850  Integrase catalytic region  34.28 
 
 
513 aa  276  7e-73  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2154  Integrase catalytic region  34.28 
 
 
513 aa  276  7e-73  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.944811  normal  0.172855 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4234  Integrase catalytic region  34.28 
 
 
513 aa  276  7e-73  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.115769  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4302  Integrase catalytic region  34.28 
 
 
513 aa  276  7e-73  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00408602 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3694  Integrase catalytic region  34.28 
 
 
513 aa  276  7e-73  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00066117  hitchhiker  0.00045424 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6473  Integrase catalytic region  34.28 
 
 
513 aa  276  7e-73  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3293  Integrase catalytic region  34.28 
 
 
513 aa  276  7e-73  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.823799  normal  0.964616 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2788  Integrase catalytic region  34.28 
 
 
513 aa  276  7e-73  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.952319  normal  0.0224954 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5580  Integrase catalytic region  34.28 
 
 
513 aa  276  7e-73  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3788  Integrase catalytic region  34.28 
 
 
513 aa  276  7e-73  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0608543 
 
 
-
 
NC_013733  Slin_6980  Integrase catalytic region  34.28 
 
 
513 aa  276  7e-73  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6163  Integrase catalytic region  34.28 
 
 
513 aa  276  7e-73  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6805  Integrase catalytic region  34.28 
 
 
513 aa  276  7e-73  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4851  Integrase catalytic region  34.28 
 
 
513 aa  276  7e-73  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.242832  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2120  Integrase catalytic region  34.28 
 
 
513 aa  276  7e-73  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0442814  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2791  TRm23a transposase  49.81 
 
 
260 aa  253  4.0000000000000004e-66  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.297528  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1596  Integrase catalytic region  32.76 
 
 
512 aa  242  1e-62  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.151594  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0148  Integrase catalytic region  32.76 
 
 
520 aa  241  2.9999999999999997e-62  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0052  Integrase catalytic region  32.62 
 
 
521 aa  238  2e-61  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1830  transposase subunit  31.39 
 
 
526 aa  236  8e-61  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.733482  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0037  Integrase catalytic region  30.27 
 
 
515 aa  232  1e-59  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1925  integrase catalytic subunit  31.76 
 
 
524 aa  231  3e-59  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.683538  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1429  integrase catalytic subunit  31.76 
 
 
524 aa  230  5e-59  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.398273  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1482  integrase catalytic subunit  31.76 
 
 
524 aa  230  5e-59  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2241  integrase catalytic subunit  31.76 
 
 
524 aa  230  5e-59  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>