More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_1463 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009484  Acry_0283  integrase catalytic subunit  70.43 
 
 		 515 aa  684    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.188339  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2303  integrase catalytic subunit  70.43 
 
 		 515 aa  684    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.268136  n/a   
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3485  integrase catalytic subunit  70.43 
 
 		 515 aa  684    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.522877  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3399  integrase catalytic subunit  70.43 
 
 		 515 aa  684    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.976382  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1463  transposase  100 
 
 		 487 aa  986    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1811  integrase catalytic subunit  58.9 
 
 		 510 aa  551  1e-156  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.14945  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5654  Integrase catalytic region  57.58 
 
 		 512 aa  529  1e-149  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009471  Acry_3593  integrase catalytic subunit  56.26 
 
 		 513 aa  521  1e-147  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  normal  0.454266 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4128  integrase catalytic subunit  52.06 
 
 		 513 aa  502  1e-141  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0892  integrase catalytic subunit  52.26 
 
 		 513 aa  504  1e-141  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0988  integrase catalytic subunit  52.26 
 
 		 513 aa  504  1e-141  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1299  integrase catalytic subunit  52.26 
 
 		 513 aa  504  1e-141  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2660  integrase catalytic subunit  52.26 
 
 		 513 aa  504  1e-141  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.549324  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3187  integrase catalytic subunit  52.26 
 
 		 513 aa  504  1e-141  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3708  integrase catalytic subunit  52.26 
 
 		 513 aa  504  1e-141  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1075  integrase catalytic subunit  52.52 
 
 		 475 aa  499  1e-140  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1224  integrase catalytic subunit  52.47 
 
 		 513 aa  497  1e-139  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0997  integrase catalytic subunit  53.46 
 
 		 514 aa  492  9.999999999999999e-139  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3740  putative transposase  50.31 
 
 		 512 aa  489  1e-137  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3716  Integrase catalytic region  51.54 
 
 		 523 aa  487  1e-136  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  normal  0.124306 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2841  ISPsy14, transposase  51.9 
 
 		 504 aa  485  1e-136  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0126762  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0410  integrase catalytic subunit  52.62 
 
 		 514 aa  485  1e-136  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0752835  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0598  integrase catalytic subunit  52.62 
 
 		 514 aa  485  1e-136  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1852  integrase catalytic subunit  52.62 
 
 		 514 aa  485  1e-136  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.687265  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2396  integrase catalytic subunit  52.62 
 
 		 514 aa  485  1e-136  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.483197  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3180  integrase catalytic subunit  52.62 
 
 		 514 aa  485  1e-136  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.150597  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4229  integrase catalytic subunit  52.31 
 
 		 514 aa  484  1e-135  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0193  integrase catalytic subunit  52.1 
 
 		 514 aa  484  1e-135  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1628  integrase catalytic subunit  52.1 
 
 		 514 aa  484  1e-135  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2982  integrase catalytic subunit  52.31 
 
 		 514 aa  484  1e-135  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00424027  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2256  integrase catalytic subunit  52.41 
 
 		 514 aa  480  1e-134  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6260  integrase catalytic subunit  50.21 
 
 		 517 aa  449  1e-125  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.441371  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2289  integrase catalytic region  50.1 
 
 		 516 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4798  integrase catalytic region  50.1 
 
 		 516 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.288871  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5628  integrase catalytic region  49.58 
 
 		 518 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4730  integrase catalytic region  49.58 
 
 		 518 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6206  integrase catalytic region  49.58 
 
 		 518 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1938  integrase catalytic subunit  49.79 
 
 		 512 aa  436  1e-121  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.441696  normal  0.123274 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1855  integrase catalytic subunit  48.26 
 
 		 507 aa  437  1e-121  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1250  integrase catalytic subunit  44.61 
 
 		 513 aa  430  1e-119  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3594  integrase catalytic subunit  48.06 
 
 		 514 aa  429  1e-119  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4696  integrase catalytic subunit  47.77 
 
 		 505 aa  429  1e-119  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.569862 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1795  putative transposase  46.73 
 
 		 517 aa  427  1e-118  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.765121  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1328  integrase catalytic subunit  44.51 
 
 		 513 aa  422  1e-117  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4290  integrase catalytic subunit  47.45 
 
 		 512 aa  418  9.999999999999999e-116  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.559076  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4396  integrase catalytic subunit  47.45 
 
 		 512 aa  418  9.999999999999999e-116  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.624598  normal  0.336917 
 
 
-
 
NC_008761  Pnap_4788  integrase catalytic subunit  47.45 
 
 		 512 aa  418  9.999999999999999e-116  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06058  hypothetical protein  42.45 
 
 		 510 aa  412  1e-114  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01935  hypothetical protein  42.45 
 
 		 510 aa  412  1e-114  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06964  hypothetical protein  42.45 
 
 		 510 aa  412  1e-114  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4138  integrase catalytic subunit  44.28 
 
 		 513 aa  414  1e-114  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0559  integrase catalytic subunit  44.72 
 
 		 517 aa  411  1e-113  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00182  transposase  42.24 
 
 		 510 aa  410  1e-113  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1554  integrase catalytic subunit  42.16 
 
 		 519 aa  407  1.0000000000000001e-112  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2053  integrase catalytic subunit  42.16 
 
 		 519 aa  407  1.0000000000000001e-112  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3414  integrase catalytic subunit  42.16 
 
 		 519 aa  407  1.0000000000000001e-112  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.604761  n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9835  transposase  44.99 
 
 		 517 aa  400  9.999999999999999e-111  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5452  integrase catalytic region  53.62 
 
 		 458 aa  400  9.999999999999999e-111  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.681559  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0706  integrase catalytic region  45.66 
 
 		 528 aa  397  1e-109  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.00978905  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1038  integrase catalytic region  44.28 
 
 		 488 aa  375  1e-102  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0134  Integrase catalytic region  42.27 
 
 		 507 aa  370  1e-101  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.53025 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1363  Integrase catalytic region  42.27 
 
 		 507 aa  371  1e-101  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5194  integrase catalytic subunit  41.25 
 
 		 525 aa  339  5e-92  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.471073 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3016  integrase catalytic subunit  37.68 
 
 		 519 aa  335  1e-90  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2132  integrase catalytic subunit  37.68 
 
 		 519 aa  335  1e-90  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0303  integrase catalytic subunit  37.68 
 
 		 519 aa  335  1e-90  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013733  Slin_6980  Integrase catalytic region  39.68 
 
 		 513 aa  331  2e-89  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3788  Integrase catalytic region  39.68 
 
 		 513 aa  331  2e-89  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0608543 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2548  integrase catalytic subunit  39.8 
 
 		 518 aa  331  2e-89  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4234  Integrase catalytic region  39.68 
 
 		 513 aa  331  2e-89  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.115769  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4851  Integrase catalytic region  39.68 
 
 		 513 aa  331  2e-89  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.242832  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5580  Integrase catalytic region  39.68 
 
 		 513 aa  331  2e-89  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2963  Integrase catalytic region  39.68 
 
 		 513 aa  331  2e-89  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6163  Integrase catalytic region  39.68 
 
 		 513 aa  331  2e-89  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5321  Integrase catalytic region  39.68 
 
 		 513 aa  331  2e-89  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.354079 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2120  Integrase catalytic region  39.68 
 
 		 513 aa  331  2e-89  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0442814  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3092  Integrase catalytic region  39.68 
 
 		 513 aa  331  2e-89  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.30832  normal  0.801547 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6473  Integrase catalytic region  39.68 
 
 		 513 aa  331  2e-89  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4302  Integrase catalytic region  39.68 
 
 		 513 aa  331  2e-89  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00408602 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6805  Integrase catalytic region  39.68 
 
 		 513 aa  331  2e-89  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3293  Integrase catalytic region  39.68 
 
 		 513 aa  331  2e-89  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.823799  normal  0.964616 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2154  Integrase catalytic region  39.68 
 
 		 513 aa  331  2e-89  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.944811  normal  0.172855 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2788  Integrase catalytic region  39.68 
 
 		 513 aa  331  2e-89  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.952319  normal  0.0224954 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3694  Integrase catalytic region  39.68 
 
 		 513 aa  331  2e-89  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00066117  hitchhiker  0.00045424 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0850  Integrase catalytic region  39.68 
 
 		 513 aa  331  2e-89  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0612  integrase catalytic subunit  51.68 
 
 		 472 aa  323  4e-87  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.352245  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5850  Integrase catalytic region  38.19 
 
 		 513 aa  321  1.9999999999999998e-86  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2791  TRm23a transposase  60.61 
 
 		 260 aa  283  4.0000000000000003e-75  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.297528  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0780  Integrase catalytic region  39.45 
 
 		 432 aa  272  9e-72  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5413  integrase catalytic region  54.22 
 
 		 385 aa  269  8.999999999999999e-71  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.694464 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3248  transposase  72.43 
 
 		 225 aa  268  2e-70  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.136244  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0037  Integrase catalytic region  35.35 
 
 		 515 aa  254  2.0000000000000002e-66  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0052  Integrase catalytic region  33.87 
 
 		 521 aa  252  9.000000000000001e-66  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0148  Integrase catalytic region  33.87 
 
 		 520 aa  252  1e-65  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1925  integrase catalytic subunit  34.55 
 
 		 524 aa  251  2e-65  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.683538  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1429  integrase catalytic subunit  34.55 
 
 		 524 aa  250  3e-65  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.398273  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1482  integrase catalytic subunit  34.55 
 
 		 524 aa  250  3e-65  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2241  integrase catalytic subunit  34.55 
 
 		 524 aa  250  3e-65  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1830  transposase subunit  33.87 
 
 		 526 aa  245  1.9999999999999999e-63  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.733482  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02341  hypothetical protein  45.06 
 
 		 539 aa  230  5e-59  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>