110 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_3248 on replicon NC_009467
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009467  Acry_3248  transposase  100 
 
 		 225 aa  452  1.0000000000000001e-126  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.136244  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3399  integrase catalytic subunit  99.53 
 
 		 515 aa  427  1e-119  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.976382  n/a   
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3485  integrase catalytic subunit  99.53 
 
 		 515 aa  427  1e-119  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.522877  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0283  integrase catalytic subunit  99.53 
 
 		 515 aa  427  1e-119  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.188339  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2303  integrase catalytic subunit  99.53 
 
 		 515 aa  427  1e-119  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.268136  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1463  transposase  72.43 
 
 		 487 aa  267  1e-70  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2791  TRm23a transposase  54.42 
 
 		 260 aa  226  2e-58  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.297528  n/a   
 
 
-
 
NC_009471  Acry_3593  integrase catalytic subunit  54.42 
 
 		 513 aa  223  2e-57  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  normal  0.454266 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4128  integrase catalytic subunit  54.42 
 
 		 513 aa  222  3e-57  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0988  integrase catalytic subunit  53.95 
 
 		 513 aa  221  9e-57  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1299  integrase catalytic subunit  53.95 
 
 		 513 aa  221  9e-57  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2660  integrase catalytic subunit  53.95 
 
 		 513 aa  221  9e-57  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.549324  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3187  integrase catalytic subunit  53.95 
 
 		 513 aa  221  9e-57  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3708  integrase catalytic subunit  53.95 
 
 		 513 aa  221  9e-57  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0892  integrase catalytic subunit  53.95 
 
 		 513 aa  221  9.999999999999999e-57  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5654  Integrase catalytic region  53.95 
 
 		 512 aa  219  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1224  integrase catalytic subunit  53.95 
 
 		 513 aa  218  6e-56  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1811  integrase catalytic subunit  53.77 
 
 		 510 aa  215  4e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.14945  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3740  putative transposase  50 
 
 		 512 aa  206  2e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2841  ISPsy14, transposase  50.48 
 
 		 504 aa  198  5e-50  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0126762  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3716  Integrase catalytic region  49.54 
 
 		 523 aa  197  1.0000000000000001e-49  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  normal  0.124306 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4229  integrase catalytic subunit  49.54 
 
 		 514 aa  194  7e-49  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0410  integrase catalytic subunit  49.54 
 
 		 514 aa  194  9e-49  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0752835  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0598  integrase catalytic subunit  49.54 
 
 		 514 aa  194  9e-49  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1852  integrase catalytic subunit  49.54 
 
 		 514 aa  194  9e-49  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.687265  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2396  integrase catalytic subunit  49.54 
 
 		 514 aa  194  9e-49  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.483197  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3180  integrase catalytic subunit  49.54 
 
 		 514 aa  194  9e-49  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.150597  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0997  integrase catalytic subunit  49.54 
 
 		 514 aa  192  2e-48  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2982  integrase catalytic subunit  49.54 
 
 		 514 aa  192  3e-48  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00424027  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1250  integrase catalytic subunit  46.3 
 
 		 513 aa  192  4e-48  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2256  integrase catalytic subunit  49.54 
 
 		 514 aa  192  4e-48  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0193  integrase catalytic subunit  47.69 
 
 		 514 aa  189  4e-47  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1628  integrase catalytic subunit  47.69 
 
 		 514 aa  189  4e-47  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5413  integrase catalytic region  46.26 
 
 		 385 aa  188  5.999999999999999e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.694464 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1075  integrase catalytic subunit  56.65 
 
 		 475 aa  188  7e-47  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1328  integrase catalytic subunit  43.52 
 
 		 513 aa  187  1e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5452  integrase catalytic region  45.79 
 
 		 458 aa  186  3e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.681559  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3594  integrase catalytic subunit  48.15 
 
 		 514 aa  182  5.0000000000000004e-45  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4138  integrase catalytic subunit  43.52 
 
 		 513 aa  178  4.999999999999999e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1855  integrase catalytic subunit  48.33 
 
 		 507 aa  175  4e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4696  integrase catalytic subunit  49.04 
 
 		 505 aa  173  1.9999999999999998e-42  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.569862 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1795  putative transposase  45.62 
 
 		 517 aa  171  6.999999999999999e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.765121  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4290  integrase catalytic subunit  44.25 
 
 		 512 aa  171  6.999999999999999e-42  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.559076  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4396  integrase catalytic subunit  44.25 
 
 		 512 aa  171  6.999999999999999e-42  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.624598  normal  0.336917 
 
 
-
 
NC_008761  Pnap_4788  integrase catalytic subunit  44.25 
 
 		 512 aa  171  6.999999999999999e-42  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6260  integrase catalytic subunit  46.33 
 
 		 517 aa  170  1e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.441371  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1554  integrase catalytic subunit  41.2 
 
 		 519 aa  165  5e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2053  integrase catalytic subunit  41.2 
 
 		 519 aa  165  5e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3414  integrase catalytic subunit  41.2 
 
 		 519 aa  165  5e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.604761  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1938  integrase catalytic subunit  46.54 
 
 		 512 aa  164  8e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.441696  normal  0.123274 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6206  integrase catalytic region  42.86 
 
 		 518 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2289  integrase catalytic region  45.16 
 
 		 516 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4730  integrase catalytic region  42.86 
 
 		 518 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4798  integrase catalytic region  45.16 
 
 		 516 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.288871  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5628  integrase catalytic region  42.86 
 
 		 518 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0612  integrase catalytic subunit  46.05 
 
 		 472 aa  162  3e-39  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.352245  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1736  integrase, catalytic region  47.89 
 
 		 204 aa  161  6e-39  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.210569 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0706  integrase catalytic region  44.39 
 
 		 528 aa  158  7e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.00978905  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0559  integrase catalytic subunit  41.98 
 
 		 517 aa  155  5.0000000000000005e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5194  integrase catalytic subunit  41.96 
 
 		 525 aa  150  2e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.471073 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9835  transposase  43.63 
 
 		 517 aa  147  1.0000000000000001e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1363  Integrase catalytic region  40.67 
 
 		 507 aa  142  4e-33  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0134  Integrase catalytic region  40.67 
 
 		 507 aa  142  5e-33  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.53025 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00182  transposase  37.16 
 
 		 510 aa  139  3e-32  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01935  hypothetical protein  37.16 
 
 		 510 aa  139  4.999999999999999e-32  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06058  hypothetical protein  37.16 
 
 		 510 aa  139  4.999999999999999e-32  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06964  hypothetical protein  37.16 
 
 		 510 aa  139  4.999999999999999e-32  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0780  Integrase catalytic region  37.16 
 
 		 432 aa  139  4.999999999999999e-32  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02341  hypothetical protein  37.04 
 
 		 539 aa  137  1e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5850  Integrase catalytic region  38.86 
 
 		 513 aa  130  2.0000000000000002e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6163  Integrase catalytic region  38.64 
 
 		 513 aa  129  3e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4851  Integrase catalytic region  38.64 
 
 		 513 aa  129  3e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.242832  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4302  Integrase catalytic region  38.64 
 
 		 513 aa  129  3e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00408602 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4234  Integrase catalytic region  38.64 
 
 		 513 aa  129  3e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.115769  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5321  Integrase catalytic region  38.64 
 
 		 513 aa  129  3e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.354079 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5580  Integrase catalytic region  38.64 
 
 		 513 aa  129  3e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1038  integrase catalytic region  40.91 
 
 		 488 aa  129  3e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6805  Integrase catalytic region  38.64 
 
 		 513 aa  129  3e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6473  Integrase catalytic region  38.64 
 
 		 513 aa  129  3e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013733  Slin_6980  Integrase catalytic region  38.64 
 
 		 513 aa  129  3e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0850  Integrase catalytic region  38.64 
 
 		 513 aa  129  3e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2120  Integrase catalytic region  38.64 
 
 		 513 aa  129  3e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0442814  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2154  Integrase catalytic region  38.64 
 
 		 513 aa  129  3e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.944811  normal  0.172855 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2788  Integrase catalytic region  38.64 
 
 		 513 aa  129  3e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.952319  normal  0.0224954 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2963  Integrase catalytic region  38.64 
 
 		 513 aa  129  3e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3092  Integrase catalytic region  38.64 
 
 		 513 aa  129  3e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.30832  normal  0.801547 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3293  Integrase catalytic region  38.64 
 
 		 513 aa  129  3e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.823799  normal  0.964616 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3694  Integrase catalytic region  38.64 
 
 		 513 aa  129  3e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00066117  hitchhiker  0.00045424 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3788  Integrase catalytic region  38.64 
 
 		 513 aa  129  3e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0608543 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2548  integrase catalytic subunit  36.41 
 
 		 518 aa  126  3e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0180  ISPsy14, transposase  45.7 
 
 		 156 aa  123  3e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0303  integrase catalytic subunit  34.6 
 
 		 519 aa  119  3.9999999999999996e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2132  integrase catalytic subunit  34.6 
 
 		 519 aa  119  3.9999999999999996e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3016  integrase catalytic subunit  34.6 
 
 		 519 aa  119  3.9999999999999996e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1429  integrase catalytic subunit  34.27 
 
 		 524 aa  110  1.0000000000000001e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.398273  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1482  integrase catalytic subunit  34.27 
 
 		 524 aa  110  1.0000000000000001e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1925  integrase catalytic subunit  34.27 
 
 		 524 aa  110  1.0000000000000001e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.683538  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2241  integrase catalytic subunit  34.27 
 
 		 524 aa  110  1.0000000000000001e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1830  transposase subunit  32.7 
 
 		 526 aa  97.4  2e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.733482  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0037  Integrase catalytic region  28.91 
 
 		 515 aa  97.1  2e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>