109 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_1736 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008782  Ajs_1736  integrase, catalytic region  100 
 
 		 204 aa  422  1e-117  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.210569 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3594  integrase catalytic subunit  99.48 
 
 		 514 aa  392  1e-108  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1855  integrase catalytic subunit  98.43 
 
 		 507 aa  387  1e-107  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4696  integrase catalytic subunit  62.83 
 
 		 505 aa  246  2e-64  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.569862 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1938  integrase catalytic subunit  59.04 
 
 		 512 aa  230  1e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.441696  normal  0.123274 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4290  integrase catalytic subunit  57.22 
 
 		 512 aa  227  1e-58  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.559076  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4396  integrase catalytic subunit  57.22 
 
 		 512 aa  227  1e-58  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.624598  normal  0.336917 
 
 
-
 
NC_008761  Pnap_4788  integrase catalytic subunit  57.22 
 
 		 512 aa  227  1e-58  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6206  integrase catalytic region  52.04 
 
 		 518 aa  202  4e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4730  integrase catalytic region  52.04 
 
 		 518 aa  202  4e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5628  integrase catalytic region  52.04 
 
 		 518 aa  202  4e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2289  integrase catalytic region  54.92 
 
 		 516 aa  200  9e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4798  integrase catalytic region  54.92 
 
 		 516 aa  200  9e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.288871  normal  1 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6260  integrase catalytic subunit  49.22 
 
 		 517 aa  193  2e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.441371  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1795  putative transposase  48.97 
 
 		 517 aa  187  8e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.765121  normal  1 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4229  integrase catalytic subunit  48.94 
 
 		 514 aa  187  1e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0410  integrase catalytic subunit  48.94 
 
 		 514 aa  186  2e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0752835  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0598  integrase catalytic subunit  48.94 
 
 		 514 aa  186  2e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1852  integrase catalytic subunit  48.94 
 
 		 514 aa  186  2e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.687265  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2396  integrase catalytic subunit  48.94 
 
 		 514 aa  186  2e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.483197  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3180  integrase catalytic subunit  48.94 
 
 		 514 aa  186  2e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.150597  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1250  integrase catalytic subunit  48.17 
 
 		 513 aa  185  5e-46  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2841  ISPsy14, transposase  50.53 
 
 		 504 aa  184  7e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0126762  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2256  integrase catalytic subunit  48.4 
 
 		 514 aa  183  1.0000000000000001e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2982  integrase catalytic subunit  48.4 
 
 		 514 aa  183  1.0000000000000001e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00424027  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0892  integrase catalytic subunit  51.04 
 
 		 513 aa  183  2.0000000000000003e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0988  integrase catalytic subunit  51.04 
 
 		 513 aa  183  2.0000000000000003e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1299  integrase catalytic subunit  51.04 
 
 		 513 aa  183  2.0000000000000003e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2660  integrase catalytic subunit  51.04 
 
 		 513 aa  183  2.0000000000000003e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.549324  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3187  integrase catalytic subunit  51.04 
 
 		 513 aa  183  2.0000000000000003e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3708  integrase catalytic subunit  51.04 
 
 		 513 aa  183  2.0000000000000003e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0997  integrase catalytic subunit  47.87 
 
 		 514 aa  182  3e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4128  integrase catalytic subunit  51.04 
 
 		 513 aa  182  4.0000000000000006e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1328  integrase catalytic subunit  47.12 
 
 		 513 aa  179  2.9999999999999997e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0193  integrase catalytic subunit  46.81 
 
 		 514 aa  178  4.999999999999999e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1628  integrase catalytic subunit  46.81 
 
 		 514 aa  178  4.999999999999999e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1811  integrase catalytic subunit  46.67 
 
 		 510 aa  177  1e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.14945  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3740  putative transposase  45.79 
 
 		 512 aa  174  8e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4138  integrase catalytic subunit  45.26 
 
 		 513 aa  171  1e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2791  TRm23a transposase  46.28 
 
 		 260 aa  169  3e-41  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.297528  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3716  Integrase catalytic region  46.88 
 
 		 523 aa  169  3e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  normal  0.124306 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1224  integrase catalytic subunit  49.48 
 
 		 513 aa  166  2.9999999999999998e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5413  integrase catalytic region  41.97 
 
 		 385 aa  165  2.9999999999999998e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.694464 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5452  integrase catalytic region  43.62 
 
 		 458 aa  165  4e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.681559  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1554  integrase catalytic subunit  47.64 
 
 		 519 aa  164  5.9999999999999996e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2053  integrase catalytic subunit  47.64 
 
 		 519 aa  164  5.9999999999999996e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3414  integrase catalytic subunit  47.64 
 
 		 519 aa  164  5.9999999999999996e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.604761  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01935  hypothetical protein  42.41 
 
 		 510 aa  163  2.0000000000000002e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02341  hypothetical protein  42.41 
 
 		 539 aa  163  2.0000000000000002e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06058  hypothetical protein  42.41 
 
 		 510 aa  163  2.0000000000000002e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06964  hypothetical protein  42.41 
 
 		 510 aa  163  2.0000000000000002e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3399  integrase catalytic subunit  47.89 
 
 		 515 aa  162  4.0000000000000004e-39  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.976382  n/a   
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3485  integrase catalytic subunit  47.89 
 
 		 515 aa  162  4.0000000000000004e-39  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.522877  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0283  integrase catalytic subunit  47.89 
 
 		 515 aa  162  4.0000000000000004e-39  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.188339  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2303  integrase catalytic subunit  47.89 
 
 		 515 aa  162  4.0000000000000004e-39  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.268136  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5654  Integrase catalytic region  44.33 
 
 		 512 aa  162  4.0000000000000004e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3248  transposase  47.89 
 
 		 225 aa  161  5.0000000000000005e-39  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.136244  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00182  transposase  41.88 
 
 		 510 aa  161  6e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009471  Acry_3593  integrase catalytic subunit  42.11 
 
 		 513 aa  157  9e-38  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  normal  0.454266 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1075  integrase catalytic subunit  51.55 
 
 		 475 aa  156  2e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5194  integrase catalytic subunit  41.84 
 
 		 525 aa  154  7e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.471073 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1463  transposase  50.89 
 
 		 487 aa  152  2e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1038  integrase catalytic region  46.02 
 
 		 488 aa  151  5.9999999999999996e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0706  integrase catalytic region  42.55 
 
 		 528 aa  145  3e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.00978905  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0780  Integrase catalytic region  40 
 
 		 432 aa  140  1.9999999999999998e-32  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0612  integrase catalytic subunit  44.27 
 
 		 472 aa  138  4.999999999999999e-32  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.352245  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0559  integrase catalytic subunit  39.79 
 
 		 517 aa  137  7.999999999999999e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9835  transposase  39.58 
 
 		 517 aa  130  1.0000000000000001e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2548  integrase catalytic subunit  37.63 
 
 		 518 aa  127  8.000000000000001e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4302  Integrase catalytic region  39.44 
 
 		 513 aa  120  9.999999999999999e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00408602 
 
 
-
 
NC_013733  Slin_6980  Integrase catalytic region  39.44 
 
 		 513 aa  120  9.999999999999999e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6805  Integrase catalytic region  39.44 
 
 		 513 aa  120  9.999999999999999e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6473  Integrase catalytic region  39.44 
 
 		 513 aa  120  9.999999999999999e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5580  Integrase catalytic region  39.44 
 
 		 513 aa  120  9.999999999999999e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6163  Integrase catalytic region  39.44 
 
 		 513 aa  120  9.999999999999999e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4851  Integrase catalytic region  39.44 
 
 		 513 aa  120  9.999999999999999e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.242832  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5321  Integrase catalytic region  39.44 
 
 		 513 aa  120  9.999999999999999e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.354079 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0850  Integrase catalytic region  39.44 
 
 		 513 aa  120  9.999999999999999e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2120  Integrase catalytic region  39.44 
 
 		 513 aa  120  9.999999999999999e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0442814  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2154  Integrase catalytic region  39.44 
 
 		 513 aa  120  9.999999999999999e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.944811  normal  0.172855 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2788  Integrase catalytic region  39.44 
 
 		 513 aa  120  9.999999999999999e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.952319  normal  0.0224954 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2963  Integrase catalytic region  39.44 
 
 		 513 aa  120  9.999999999999999e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3092  Integrase catalytic region  39.44 
 
 		 513 aa  120  9.999999999999999e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.30832  normal  0.801547 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3293  Integrase catalytic region  39.44 
 
 		 513 aa  120  9.999999999999999e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.823799  normal  0.964616 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3694  Integrase catalytic region  39.44 
 
 		 513 aa  120  9.999999999999999e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00066117  hitchhiker  0.00045424 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3788  Integrase catalytic region  39.44 
 
 		 513 aa  120  9.999999999999999e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0608543 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4234  Integrase catalytic region  39.44 
 
 		 513 aa  120  9.999999999999999e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.115769  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1363  Integrase catalytic region  36.79 
 
 		 507 aa  119  1.9999999999999998e-26  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0134  Integrase catalytic region  36.79 
 
 		 507 aa  119  3e-26  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.53025 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0303  integrase catalytic subunit  36.79 
 
 		 519 aa  119  3.9999999999999996e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2132  integrase catalytic subunit  36.79 
 
 		 519 aa  119  3.9999999999999996e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3016  integrase catalytic subunit  36.79 
 
 		 519 aa  119  3.9999999999999996e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5850  Integrase catalytic region  36 
 
 		 513 aa  119  3.9999999999999996e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0180  ISPsy14, transposase  38.41 
 
 		 156 aa  113  2.0000000000000002e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2213  hypothetical protein  28.27 
 
 		 223 aa  90.1  2e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.775376  unclonable  0.000000000124078 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0037  Integrase catalytic region  31.09 
 
 		 515 aa  89  4e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4531  hypothetical protein  80.77 
 
 		 52 aa  84.3  0.000000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0093  putative transposase for insertion sequence  42.45 
 
 		 121 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0081  transposase subunit  42.11 
 
 		 95 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0460466  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0148  Integrase catalytic region  30.57 
 
 		 520 aa  78.2  0.00000000000009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>