75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1106A_A0093 on replicon NC_009078
Organism: Burkholderia pseudomallei 1106a



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009078  BURPS1106A_A0093  putative transposase for insertion sequence  100 
 
 
121 aa  249  1e-65  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0081  transposase subunit  85.26 
 
 
95 aa  170  5.999999999999999e-42  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0460466  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5194  integrase catalytic subunit  55.93 
 
 
525 aa  120  5e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.471073 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3180  integrase catalytic subunit  44.44 
 
 
514 aa  87.4  5e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.150597  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2396  integrase catalytic subunit  44.44 
 
 
514 aa  87.4  5e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.483197  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1852  integrase catalytic subunit  44.44 
 
 
514 aa  87.4  5e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.687265  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0598  integrase catalytic subunit  44.44 
 
 
514 aa  87.4  5e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0410  integrase catalytic subunit  44.44 
 
 
514 aa  87.4  5e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0752835  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4229  integrase catalytic subunit  44.44 
 
 
514 aa  87.4  5e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6260  integrase catalytic subunit  42.86 
 
 
517 aa  87  7e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.441371  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1795  putative transposase  41.73 
 
 
517 aa  86.3  1e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.765121  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0997  integrase catalytic subunit  46.81 
 
 
514 aa  86.3  1e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2982  integrase catalytic subunit  45.74 
 
 
514 aa  85.5  2e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00424027  n/a   
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6206  integrase catalytic region  43.59 
 
 
518 aa  85.1  3e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4730  integrase catalytic region  43.59 
 
 
518 aa  85.1  3e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5628  integrase catalytic region  43.59 
 
 
518 aa  85.1  3e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2256  integrase catalytic subunit  45.74 
 
 
514 aa  85.1  3e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1038  integrase catalytic region  44.44 
 
 
488 aa  84.3  5e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1736  integrase, catalytic region  42.45 
 
 
204 aa  81.3  0.000000000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.210569 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0193  integrase catalytic subunit  45.54 
 
 
514 aa  80.1  0.000000000000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3594  integrase catalytic subunit  42.45 
 
 
514 aa  80.1  0.000000000000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1628  integrase catalytic subunit  45.54 
 
 
514 aa  80.1  0.000000000000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1855  integrase catalytic subunit  42.45 
 
 
507 aa  79.3  0.00000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5413  integrase catalytic region  43.43 
 
 
385 aa  78.2  0.00000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.694464 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4696  integrase catalytic subunit  45.26 
 
 
505 aa  78.2  0.00000000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.569862 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2289  integrase catalytic region  44.55 
 
 
516 aa  77.4  0.00000000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4798  integrase catalytic region  44.55 
 
 
516 aa  77.4  0.00000000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.288871  normal 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5317  transposase  44.58 
 
 
104 aa  73.6  0.0000000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.353566  normal 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5452  integrase catalytic region  42.42 
 
 
458 aa  72.8  0.000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.681559  normal 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4290  integrase catalytic subunit  40 
 
 
512 aa  71.6  0.000000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.559076  normal 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4396  integrase catalytic subunit  40 
 
 
512 aa  71.6  0.000000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.624598  normal  0.336917 
 
 
-
 
NC_008761  Pnap_4788  integrase catalytic subunit  40 
 
 
512 aa  71.6  0.000000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1938  integrase catalytic subunit  41.67 
 
 
512 aa  70.9  0.000000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.441696  normal  0.123274 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2841  ISPsy14, transposase  42.42 
 
 
504 aa  69.7  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0126762  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4128  integrase catalytic subunit  40.62 
 
 
513 aa  69.3  0.00000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2660  integrase catalytic subunit  40.82 
 
 
513 aa  68.6  0.00000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.549324  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0892  integrase catalytic subunit  40.82 
 
 
513 aa  68.6  0.00000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0988  integrase catalytic subunit  40.82 
 
 
513 aa  68.6  0.00000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1299  integrase catalytic subunit  40.82 
 
 
513 aa  68.6  0.00000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3708  integrase catalytic subunit  40.82 
 
 
513 aa  68.6  0.00000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3187  integrase catalytic subunit  40.82 
 
 
513 aa  68.6  0.00000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1554  integrase catalytic subunit  38 
 
 
519 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2053  integrase catalytic subunit  38 
 
 
519 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3414  integrase catalytic subunit  38 
 
 
519 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.604761  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0180  ISPsy14, transposase  38.54 
 
 
156 aa  65.1  0.0000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3740  putative transposase  35.78 
 
 
512 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1328  integrase catalytic subunit  35.58 
 
 
513 aa  60.8  0.000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1250  integrase catalytic subunit  37.76 
 
 
513 aa  60.5  0.000000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0706  integrase catalytic region  37.76 
 
 
528 aa  60.5  0.000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.00978905  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5654  Integrase catalytic region  39 
 
 
512 aa  59.3  0.00000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1811  integrase catalytic subunit  40.82 
 
 
510 aa  58.2  0.00000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.14945  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1224  integrase catalytic subunit  38.54 
 
 
513 aa  57.4  0.00000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2303  integrase catalytic subunit  36.89 
 
 
515 aa  57  0.00000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.268136  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0283  integrase catalytic subunit  36.89 
 
 
515 aa  57  0.00000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.188339  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3399  integrase catalytic subunit  36.89 
 
 
515 aa  57  0.00000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.976382  n/a   
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3485  integrase catalytic subunit  36.89 
 
 
515 aa  57  0.00000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.522877  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3248  transposase  36.89 
 
 
225 aa  57  0.00000009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.136244  n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9835  transposase  37 
 
 
517 aa  56.2  0.0000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0559  integrase catalytic subunit  34.69 
 
 
517 aa  56.2  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01935  hypothetical protein  31.3 
 
 
510 aa  52  0.000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02341  hypothetical protein  31.3 
 
 
539 aa  52.4  0.000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06058  hypothetical protein  31.3 
 
 
510 aa  52  0.000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06964  hypothetical protein  31.3 
 
 
510 aa  52  0.000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00182  transposase  31.3 
 
 
510 aa  52  0.000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0612  integrase catalytic subunit  35.35 
 
 
472 aa  52  0.000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.352245  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4138  integrase catalytic subunit  30.1 
 
 
513 aa  51.6  0.000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3716  Integrase catalytic region  33.67 
 
 
523 aa  50.1  0.00001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  normal  0.124306 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3016  integrase catalytic subunit  28.91 
 
 
519 aa  49.7  0.00002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2132  integrase catalytic subunit  28.91 
 
 
519 aa  49.7  0.00002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0303  integrase catalytic subunit  28.91 
 
 
519 aa  49.7  0.00002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2791  TRm23a transposase  31 
 
 
260 aa  47.8  0.00005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.297528  n/a   
 
 
-
 
NC_009471  Acry_3593  integrase catalytic subunit  31.37 
 
 
513 aa  45.1  0.0003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  normal  0.454266 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1463  transposase  60 
 
 
487 aa  42.4  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1075  integrase catalytic subunit  41.27 
 
 
475 aa  42  0.003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0780  Integrase catalytic region  37.25 
 
 
432 aa  41.2  0.004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>