267 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_2213 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013216  Dtox_2213  hypothetical protein  100 
 
 
223 aa  468  1.0000000000000001e-131  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.775376  unclonable  0.000000000124078 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0303  integrase catalytic subunit  46.15 
 
 
519 aa  202  3e-51  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2132  integrase catalytic subunit  46.15 
 
 
519 aa  202  3e-51  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3016  integrase catalytic subunit  46.15 
 
 
519 aa  202  3e-51  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02341  hypothetical protein  32.54 
 
 
539 aa  132  3e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06964  hypothetical protein  32.54 
 
 
510 aa  132  5e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06058  hypothetical protein  32.54 
 
 
510 aa  132  5e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1811  integrase catalytic subunit  37.32 
 
 
510 aa  132  5e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.14945  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01935  hypothetical protein  32.54 
 
 
510 aa  132  5e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00182  transposase  32.54 
 
 
510 aa  131  6.999999999999999e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5413  integrase catalytic region  36.67 
 
 
385 aa  128  6e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.694464 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5452  integrase catalytic region  35.24 
 
 
458 aa  126  3e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.681559  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1328  integrase catalytic subunit  31.92 
 
 
513 aa  123  2e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2791  TRm23a transposase  34.29 
 
 
260 aa  122  3e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.297528  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0193  integrase catalytic subunit  32.54 
 
 
514 aa  121  9.999999999999999e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1628  integrase catalytic subunit  32.54 
 
 
514 aa  121  9.999999999999999e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5654  Integrase catalytic region  30.95 
 
 
512 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0612  integrase catalytic subunit  34.88 
 
 
472 aa  120  1.9999999999999998e-26  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.352245  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0997  integrase catalytic subunit  31.58 
 
 
514 aa  119  3e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2256  integrase catalytic subunit  31.86 
 
 
514 aa  118  6e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2982  integrase catalytic subunit  31.86 
 
 
514 aa  118  6e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00424027  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0559  integrase catalytic subunit  33.01 
 
 
517 aa  118  9e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0410  integrase catalytic subunit  31.58 
 
 
514 aa  117  9.999999999999999e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0752835  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0598  integrase catalytic subunit  31.58 
 
 
514 aa  117  9.999999999999999e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1852  integrase catalytic subunit  31.58 
 
 
514 aa  117  9.999999999999999e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.687265  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2396  integrase catalytic subunit  31.58 
 
 
514 aa  117  9.999999999999999e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.483197  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3180  integrase catalytic subunit  31.58 
 
 
514 aa  117  9.999999999999999e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.150597  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3740  putative transposase  32.23 
 
 
512 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4229  integrase catalytic subunit  31.37 
 
 
514 aa  116  1.9999999999999998e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0892  integrase catalytic subunit  33.33 
 
 
513 aa  116  1.9999999999999998e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0988  integrase catalytic subunit  33.33 
 
 
513 aa  116  1.9999999999999998e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1299  integrase catalytic subunit  33.33 
 
 
513 aa  116  1.9999999999999998e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2660  integrase catalytic subunit  33.33 
 
 
513 aa  116  1.9999999999999998e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.549324  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3187  integrase catalytic subunit  33.33 
 
 
513 aa  116  1.9999999999999998e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3708  integrase catalytic subunit  33.33 
 
 
513 aa  116  1.9999999999999998e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009471  Acry_3593  integrase catalytic subunit  32.38 
 
 
513 aa  117  1.9999999999999998e-25  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  normal  0.454266 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2841  ISPsy14, transposase  35.24 
 
 
504 aa  115  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0126762  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4128  integrase catalytic subunit  33.33 
 
 
513 aa  115  3.9999999999999997e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1250  integrase catalytic subunit  31.16 
 
 
513 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1224  integrase catalytic subunit  34.76 
 
 
513 aa  114  1.0000000000000001e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4138  integrase catalytic subunit  30.48 
 
 
513 aa  113  2.0000000000000002e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1554  integrase catalytic subunit  32.38 
 
 
519 aa  109  3e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2053  integrase catalytic subunit  32.38 
 
 
519 aa  109  3e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3414  integrase catalytic subunit  32.38 
 
 
519 aa  109  3e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.604761  n/a   
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6260  integrase catalytic subunit  31.19 
 
 
517 aa  108  9.000000000000001e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.441371  normal 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4290  integrase catalytic subunit  30.23 
 
 
512 aa  107  2e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.559076  normal 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4396  integrase catalytic subunit  30.23 
 
 
512 aa  107  2e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.624598  normal  0.336917 
 
 
-
 
NC_008761  Pnap_4788  integrase catalytic subunit  30.23 
 
 
512 aa  107  2e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1938  integrase catalytic subunit  30.28 
 
 
512 aa  106  4e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.441696  normal  0.123274 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3594  integrase catalytic subunit  29.19 
 
 
514 aa  104  1e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1429  integrase catalytic subunit  31.82 
 
 
524 aa  103  2e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.398273  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1482  integrase catalytic subunit  31.82 
 
 
524 aa  103  2e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1925  integrase catalytic subunit  31.82 
 
 
524 aa  103  2e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.683538  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2241  integrase catalytic subunit  31.82 
 
 
524 aa  103  2e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1855  integrase catalytic subunit  29.19 
 
 
507 aa  103  2e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1463  transposase  34.03 
 
 
487 aa  102  6e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3716  Integrase catalytic region  32.86 
 
 
523 aa  99.8  3e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  normal  0.124306 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1075  integrase catalytic subunit  33.71 
 
 
475 aa  98.2  9e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1596  Integrase catalytic region  29.46 
 
 
512 aa  97.4  1e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.151594  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3399  integrase catalytic subunit  31.67 
 
 
515 aa  96.3  4e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.976382  n/a   
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3485  integrase catalytic subunit  31.67 
 
 
515 aa  96.3  4e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.522877  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0283  integrase catalytic subunit  31.67 
 
 
515 aa  96.3  4e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.188339  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2303  integrase catalytic subunit  31.67 
 
 
515 aa  96.3  4e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.268136  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0706  integrase catalytic region  30.81 
 
 
528 aa  95.9  4e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.00978905  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1795  putative transposase  28.11 
 
 
517 aa  95.5  6e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.765121  normal 
 
 
-
 
NC_013733  Slin_6980  Integrase catalytic region  30.92 
 
 
513 aa  94  1e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3788  Integrase catalytic region  30.92 
 
 
513 aa  94  1e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0608543 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2120  Integrase catalytic region  30.92 
 
 
513 aa  94  1e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0442814  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5321  Integrase catalytic region  30.92 
 
 
513 aa  94  1e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.354079 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5580  Integrase catalytic region  30.92 
 
 
513 aa  94  1e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2788  Integrase catalytic region  30.92 
 
 
513 aa  94  1e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.952319  normal  0.0224954 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6473  Integrase catalytic region  30.92 
 
 
513 aa  94  1e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2154  Integrase catalytic region  30.92 
 
 
513 aa  94  1e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.944811  normal  0.172855 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4234  Integrase catalytic region  30.92 
 
 
513 aa  94  1e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.115769  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4302  Integrase catalytic region  30.92 
 
 
513 aa  94  1e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00408602 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4851  Integrase catalytic region  30.92 
 
 
513 aa  94  1e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.242832  normal 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6805  Integrase catalytic region  30.92 
 
 
513 aa  94  1e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2963  Integrase catalytic region  30.92 
 
 
513 aa  94  1e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0850  Integrase catalytic region  30.92 
 
 
513 aa  94  1e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6163  Integrase catalytic region  30.92 
 
 
513 aa  94  1e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3092  Integrase catalytic region  30.92 
 
 
513 aa  94  1e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.30832  normal  0.801547 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3694  Integrase catalytic region  30.92 
 
 
513 aa  94  1e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00066117  hitchhiker  0.00045424 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3293  Integrase catalytic region  30.92 
 
 
513 aa  94  1e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.823799  normal  0.964616 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4696  integrase catalytic subunit  27.27 
 
 
505 aa  92.4  5e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.569862 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3248  transposase  29.73 
 
 
225 aa  90.9  1e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.136244  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1736  integrase, catalytic region  28.27 
 
 
204 aa  90.1  3e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.210569 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4730  integrase catalytic region  26.15 
 
 
518 aa  89.4  5e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5628  integrase catalytic region  26.15 
 
 
518 aa  89.4  5e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6206  integrase catalytic region  26.15 
 
 
518 aa  89.4  5e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0780  Integrase catalytic region  32.3 
 
 
432 aa  88.6  7e-17  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9835  transposase  30.43 
 
 
517 aa  88.6  7e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0134  Integrase catalytic region  29.11 
 
 
507 aa  87  2e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.53025 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1363  Integrase catalytic region  29.11 
 
 
507 aa  87  2e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4798  integrase catalytic region  27.4 
 
 
516 aa  84.7  9e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.288871  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2289  integrase catalytic region  27.4 
 
 
516 aa  84.7  9e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1830  transposase subunit  33.59 
 
 
526 aa  84  0.000000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.733482  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2548  integrase catalytic subunit  30.05 
 
 
518 aa  83.6  0.000000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5850  Integrase catalytic region  28.57 
 
 
513 aa  83.2  0.000000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0037  Integrase catalytic region  24.64 
 
 
515 aa  81.6  0.000000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5194  integrase catalytic subunit  27.65 
 
 
525 aa  80.9  0.00000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.471073 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>