More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A3740 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007951  Bxe_A3740  putative transposase  100 
 
 
512 aa  1066    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4128  integrase catalytic subunit  54 
 
 
513 aa  571  1e-161  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0988  integrase catalytic subunit  53.8 
 
 
513 aa  569  1e-161  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1299  integrase catalytic subunit  53.8 
 
 
513 aa  569  1e-161  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2660  integrase catalytic subunit  53.8 
 
 
513 aa  569  1e-161  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.549324  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3187  integrase catalytic subunit  53.8 
 
 
513 aa  568  1e-161  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3708  integrase catalytic subunit  53.8 
 
 
513 aa  568  1e-161  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0892  integrase catalytic subunit  53.61 
 
 
513 aa  568  1e-160  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1224  integrase catalytic subunit  53.8 
 
 
513 aa  557  1e-157  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2841  ISPsy14, transposase  52.57 
 
 
504 aa  548  1e-155  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0126762  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1075  integrase catalytic subunit  53.89 
 
 
475 aa  533  1e-150  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1811  integrase catalytic subunit  51.47 
 
 
510 aa  516  1.0000000000000001e-145  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.14945  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1938  integrase catalytic subunit  50.68 
 
 
512 aa  512  1e-144  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.441696  normal  0.123274 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6260  integrase catalytic subunit  48.66 
 
 
517 aa  505  9.999999999999999e-143  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.441371  normal 
 
 
-
 
NC_009471  Acry_3593  integrase catalytic subunit  47.84 
 
 
513 aa  496  1e-139  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  normal  0.454266 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5654  Integrase catalytic region  49.61 
 
 
512 aa  494  9.999999999999999e-139  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3716  Integrase catalytic region  49.13 
 
 
523 aa  490  1e-137  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  normal  0.124306 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4290  integrase catalytic subunit  46.48 
 
 
512 aa  488  1e-137  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.559076  normal 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4396  integrase catalytic subunit  46.48 
 
 
512 aa  488  1e-137  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.624598  normal  0.336917 
 
 
-
 
NC_008761  Pnap_4788  integrase catalytic subunit  46.48 
 
 
512 aa  488  1e-137  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1855  integrase catalytic subunit  49.21 
 
 
507 aa  491  1e-137  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3594  integrase catalytic subunit  48.93 
 
 
514 aa  489  1e-137  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4696  integrase catalytic subunit  48.22 
 
 
505 aa  485  1e-136  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.569862 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4730  integrase catalytic region  46.53 
 
 
518 aa  482  1e-135  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0410  integrase catalytic subunit  48.27 
 
 
514 aa  483  1e-135  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0752835  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0598  integrase catalytic subunit  48.27 
 
 
514 aa  483  1e-135  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1852  integrase catalytic subunit  48.27 
 
 
514 aa  483  1e-135  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.687265  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2396  integrase catalytic subunit  48.27 
 
 
514 aa  483  1e-135  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.483197  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3180  integrase catalytic subunit  48.27 
 
 
514 aa  483  1e-135  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.150597  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5628  integrase catalytic region  46.53 
 
 
518 aa  482  1e-135  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6206  integrase catalytic region  46.53 
 
 
518 aa  482  1e-135  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1554  integrase catalytic subunit  45.49 
 
 
519 aa  479  1e-134  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2053  integrase catalytic subunit  45.49 
 
 
519 aa  479  1e-134  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3414  integrase catalytic subunit  45.49 
 
 
519 aa  479  1e-134  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.604761  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0193  integrase catalytic subunit  47.5 
 
 
514 aa  479  1e-134  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1628  integrase catalytic subunit  47.5 
 
 
514 aa  479  1e-134  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4229  integrase catalytic subunit  47.5 
 
 
514 aa  477  1e-133  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0997  integrase catalytic subunit  48.08 
 
 
514 aa  477  1e-133  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2256  integrase catalytic subunit  47.5 
 
 
514 aa  476  1e-133  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1463  transposase  50.31 
 
 
487 aa  472  1e-132  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2289  integrase catalytic region  47.46 
 
 
516 aa  474  1e-132  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4798  integrase catalytic region  47.46 
 
 
516 aa  474  1e-132  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.288871  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2982  integrase catalytic subunit  47.12 
 
 
514 aa  473  1e-132  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00424027  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0283  integrase catalytic subunit  46.15 
 
 
515 aa  469  1.0000000000000001e-131  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.188339  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2303  integrase catalytic subunit  46.15 
 
 
515 aa  469  1.0000000000000001e-131  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.268136  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3399  integrase catalytic subunit  46.15 
 
 
515 aa  469  1.0000000000000001e-131  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.976382  n/a   
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3485  integrase catalytic subunit  46.15 
 
 
515 aa  469  1.0000000000000001e-131  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.522877  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0559  integrase catalytic subunit  46.15 
 
 
517 aa  466  9.999999999999999e-131  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00182  transposase  43.58 
 
 
510 aa  456  1e-127  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06964  hypothetical protein  43.58 
 
 
510 aa  457  1e-127  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1795  putative transposase  45.72 
 
 
517 aa  458  1e-127  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.765121  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06058  hypothetical protein  43.58 
 
 
510 aa  457  1e-127  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01935  hypothetical protein  43.58 
 
 
510 aa  457  1e-127  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4138  integrase catalytic subunit  44.75 
 
 
513 aa  458  1e-127  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1328  integrase catalytic subunit  43.97 
 
 
513 aa  457  1e-127  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1250  integrase catalytic subunit  43.19 
 
 
513 aa  446  1.0000000000000001e-124  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9835  transposase  43.95 
 
 
517 aa  428  1e-118  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0706  integrase catalytic region  42.55 
 
 
528 aa  423  1e-117  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.00978905  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0134  Integrase catalytic region  42.49 
 
 
507 aa  416  9.999999999999999e-116  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.53025 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5452  integrase catalytic region  49.18 
 
 
458 aa  415  9.999999999999999e-116  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.681559  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1363  Integrase catalytic region  42.49 
 
 
507 aa  416  9.999999999999999e-116  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5194  integrase catalytic subunit  41.2 
 
 
525 aa  393  1e-108  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.471073 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1038  integrase catalytic region  41.01 
 
 
488 aa  386  1e-106  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2132  integrase catalytic subunit  38.72 
 
 
519 aa  378  1e-103  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0303  integrase catalytic subunit  38.72 
 
 
519 aa  378  1e-103  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3016  integrase catalytic subunit  38.72 
 
 
519 aa  378  1e-103  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2548  integrase catalytic subunit  38.06 
 
 
518 aa  355  7.999999999999999e-97  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3788  Integrase catalytic region  40.69 
 
 
513 aa  349  8e-95  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0608543 
 
 
-
 
NC_013733  Slin_6980  Integrase catalytic region  40.69 
 
 
513 aa  349  8e-95  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5321  Integrase catalytic region  40.69 
 
 
513 aa  349  8e-95  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.354079 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4851  Integrase catalytic region  40.69 
 
 
513 aa  349  8e-95  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.242832  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3092  Integrase catalytic region  40.69 
 
 
513 aa  349  8e-95  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.30832  normal  0.801547 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0850  Integrase catalytic region  40.69 
 
 
513 aa  349  8e-95  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6163  Integrase catalytic region  40.69 
 
 
513 aa  349  8e-95  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6805  Integrase catalytic region  40.69 
 
 
513 aa  349  8e-95  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6473  Integrase catalytic region  40.69 
 
 
513 aa  349  8e-95  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4302  Integrase catalytic region  40.69 
 
 
513 aa  349  8e-95  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00408602 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2788  Integrase catalytic region  40.69 
 
 
513 aa  349  8e-95  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.952319  normal  0.0224954 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2120  Integrase catalytic region  40.69 
 
 
513 aa  349  8e-95  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0442814  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2154  Integrase catalytic region  40.69 
 
 
513 aa  349  8e-95  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.944811  normal  0.172855 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4234  Integrase catalytic region  40.69 
 
 
513 aa  349  8e-95  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.115769  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3293  Integrase catalytic region  40.69 
 
 
513 aa  349  8e-95  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.823799  normal  0.964616 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5580  Integrase catalytic region  40.69 
 
 
513 aa  349  8e-95  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2963  Integrase catalytic region  40.69 
 
 
513 aa  349  8e-95  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3694  Integrase catalytic region  40.69 
 
 
513 aa  349  8e-95  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00066117  hitchhiker  0.00045424 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0612  integrase catalytic subunit  45.32 
 
 
472 aa  345  2e-93  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.352245  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5850  Integrase catalytic region  37.72 
 
 
513 aa  336  5.999999999999999e-91  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0780  Integrase catalytic region  42.23 
 
 
432 aa  332  1e-89  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5413  integrase catalytic region  52.11 
 
 
385 aa  299  9e-80  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.694464 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0037  Integrase catalytic region  34.17 
 
 
515 aa  297  3e-79  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1596  Integrase catalytic region  35.53 
 
 
512 aa  283  4.0000000000000003e-75  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.151594  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2791  TRm23a transposase  54.12 
 
 
260 aa  278  2e-73  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.297528  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1429  integrase catalytic subunit  32.95 
 
 
524 aa  268  2e-70  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.398273  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1482  integrase catalytic subunit  32.95 
 
 
524 aa  268  2e-70  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1925  integrase catalytic subunit  32.95 
 
 
524 aa  268  2e-70  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.683538  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2241  integrase catalytic subunit  32.95 
 
 
524 aa  268  2e-70  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0148  Integrase catalytic region  32.12 
 
 
520 aa  258  2e-67  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0052  Integrase catalytic region  31.72 
 
 
521 aa  254  2.0000000000000002e-66  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02341  hypothetical protein  43.01 
 
 
539 aa  252  1e-65  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1830  transposase subunit  32.45 
 
 
526 aa  251  3e-65  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.733482  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>