More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_0037 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_0037  Integrase catalytic region  100 
 
 		 515 aa  1083    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3293  Integrase catalytic region  40.08 
 
 		 513 aa  368  1e-100  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.823799  normal  0.964616 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2963  Integrase catalytic region  40.08 
 
 		 513 aa  368  1e-100  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3694  Integrase catalytic region  40.08 
 
 		 513 aa  368  1e-100  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00066117  hitchhiker  0.00045424 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0850  Integrase catalytic region  40.08 
 
 		 513 aa  368  1e-100  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5321  Integrase catalytic region  40.08 
 
 		 513 aa  368  1e-100  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.354079 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6805  Integrase catalytic region  40.08 
 
 		 513 aa  368  1e-100  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4302  Integrase catalytic region  40.08 
 
 		 513 aa  368  1e-100  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00408602 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6473  Integrase catalytic region  40.08 
 
 		 513 aa  368  1e-100  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3092  Integrase catalytic region  40.08 
 
 		 513 aa  368  1e-100  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.30832  normal  0.801547 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4234  Integrase catalytic region  40.08 
 
 		 513 aa  368  1e-100  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.115769  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4851  Integrase catalytic region  40.08 
 
 		 513 aa  368  1e-100  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.242832  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3788  Integrase catalytic region  40.08 
 
 		 513 aa  368  1e-100  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0608543 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5580  Integrase catalytic region  40.08 
 
 		 513 aa  368  1e-100  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013733  Slin_6980  Integrase catalytic region  40.08 
 
 		 513 aa  368  1e-100  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2788  Integrase catalytic region  40.08 
 
 		 513 aa  368  1e-100  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.952319  normal  0.0224954 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2120  Integrase catalytic region  40.08 
 
 		 513 aa  368  1e-100  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0442814  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2154  Integrase catalytic region  40.08 
 
 		 513 aa  368  1e-100  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.944811  normal  0.172855 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6163  Integrase catalytic region  40.08 
 
 		 513 aa  368  1e-100  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1429  integrase catalytic subunit  39.85 
 
 		 524 aa  363  3e-99  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.398273  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1482  integrase catalytic subunit  39.85 
 
 		 524 aa  363  3e-99  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1925  integrase catalytic subunit  39.85 
 
 		 524 aa  364  3e-99  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.683538  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2241  integrase catalytic subunit  39.85 
 
 		 524 aa  363  3e-99  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1830  transposase subunit  38.4 
 
 		 526 aa  360  4e-98  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.733482  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0148  Integrase catalytic region  37.69 
 
 		 520 aa  355  1e-96  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0052  Integrase catalytic region  37.62 
 
 		 521 aa  352  8.999999999999999e-96  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1596  Integrase catalytic region  37.7 
 
 		 512 aa  345  8e-94  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.151594  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0706  integrase catalytic region  33.4 
 
 		 528 aa  305  9.000000000000001e-82  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.00978905  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3740  putative transposase  34.17 
 
 		 512 aa  297  3e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4229  integrase catalytic subunit  33.78 
 
 		 514 aa  295  1e-78  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0997  integrase catalytic subunit  33.78 
 
 		 514 aa  294  2e-78  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0410  integrase catalytic subunit  33.4 
 
 		 514 aa  291  2e-77  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0752835  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0598  integrase catalytic subunit  33.4 
 
 		 514 aa  291  2e-77  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1852  integrase catalytic subunit  33.4 
 
 		 514 aa  291  2e-77  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.687265  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2396  integrase catalytic subunit  33.4 
 
 		 514 aa  291  2e-77  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.483197  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2982  integrase catalytic subunit  33.4 
 
 		 514 aa  291  2e-77  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00424027  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3180  integrase catalytic subunit  33.4 
 
 		 514 aa  291  2e-77  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.150597  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0559  integrase catalytic subunit  33.46 
 
 		 517 aa  291  2e-77  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0193  integrase catalytic subunit  33.21 
 
 		 514 aa  290  5.0000000000000004e-77  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1628  integrase catalytic subunit  33.21 
 
 		 514 aa  290  5.0000000000000004e-77  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1554  integrase catalytic subunit  33.71 
 
 		 519 aa  288  1e-76  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2053  integrase catalytic subunit  33.71 
 
 		 519 aa  288  1e-76  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3414  integrase catalytic subunit  33.71 
 
 		 519 aa  288  1e-76  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.604761  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2303  integrase catalytic subunit  33.66 
 
 		 515 aa  288  2e-76  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.268136  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2256  integrase catalytic subunit  33.21 
 
 		 514 aa  287  2e-76  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3399  integrase catalytic subunit  33.66 
 
 		 515 aa  288  2e-76  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.976382  n/a   
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3485  integrase catalytic subunit  33.66 
 
 		 515 aa  288  2e-76  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.522877  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0283  integrase catalytic subunit  33.66 
 
 		 515 aa  288  2e-76  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.188339  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2841  ISPsy14, transposase  33.2 
 
 		 504 aa  286  8e-76  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0126762  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0988  integrase catalytic subunit  33.2 
 
 		 513 aa  285  1.0000000000000001e-75  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1299  integrase catalytic subunit  33.2 
 
 		 513 aa  285  1.0000000000000001e-75  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2660  integrase catalytic subunit  33.2 
 
 		 513 aa  285  1.0000000000000001e-75  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.549324  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3187  integrase catalytic subunit  33.2 
 
 		 513 aa  285  1.0000000000000001e-75  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3708  integrase catalytic subunit  33.2 
 
 		 513 aa  285  1.0000000000000001e-75  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1855  integrase catalytic subunit  33.79 
 
 		 507 aa  285  1.0000000000000001e-75  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0892  integrase catalytic subunit  33.2 
 
 		 513 aa  285  2.0000000000000002e-75  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4128  integrase catalytic subunit  33.01 
 
 		 513 aa  283  5.000000000000001e-75  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1224  integrase catalytic subunit  33.2 
 
 		 513 aa  283  5.000000000000001e-75  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3594  integrase catalytic subunit  33.46 
 
 		 514 aa  283  7.000000000000001e-75  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9835  transposase  32.81 
 
 		 517 aa  279  8e-74  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6260  integrase catalytic subunit  31.74 
 
 		 517 aa  276  8e-73  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.441371  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4290  integrase catalytic subunit  32.7 
 
 		 512 aa  273  4.0000000000000004e-72  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.559076  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4396  integrase catalytic subunit  32.7 
 
 		 512 aa  273  4.0000000000000004e-72  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.624598  normal  0.336917 
 
 
-
 
NC_008761  Pnap_4788  integrase catalytic subunit  32.7 
 
 		 512 aa  273  4.0000000000000004e-72  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1938  integrase catalytic subunit  32.57 
 
 		 512 aa  272  1e-71  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.441696  normal  0.123274 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1075  integrase catalytic subunit  35.98 
 
 		 475 aa  271  2.9999999999999997e-71  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5654  Integrase catalytic region  30.43 
 
 		 512 aa  267  2.9999999999999995e-70  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4696  integrase catalytic subunit  32.23 
 
 		 505 aa  267  4e-70  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.569862 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1811  integrase catalytic subunit  32.56 
 
 		 510 aa  265  1e-69  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.14945  normal  1 
 
 
-
 
NC_009471  Acry_3593  integrase catalytic subunit  28.96 
 
 		 513 aa  264  2e-69  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  normal  0.454266 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3716  Integrase catalytic region  30.58 
 
 		 523 aa  259  6e-68  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  normal  0.124306 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01935  hypothetical protein  31.23 
 
 		 510 aa  256  7e-67  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06964  hypothetical protein  31.23 
 
 		 510 aa  256  7e-67  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06058  hypothetical protein  31.23 
 
 		 510 aa  256  7e-67  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1038  integrase catalytic region  31.25 
 
 		 488 aa  255  1.0000000000000001e-66  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00182  transposase  31.03 
 
 		 510 aa  254  3e-66  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2289  integrase catalytic region  30.83 
 
 		 516 aa  251  2e-65  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4798  integrase catalytic region  30.83 
 
 		 516 aa  251  2e-65  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.288871  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1250  integrase catalytic subunit  31.74 
 
 		 513 aa  249  1e-64  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5628  integrase catalytic region  31.37 
 
 		 518 aa  247  4e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6206  integrase catalytic region  31.37 
 
 		 518 aa  247  4e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4730  integrase catalytic region  31.37 
 
 		 518 aa  247  4e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0303  integrase catalytic subunit  31.33 
 
 		 519 aa  246  8e-64  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2132  integrase catalytic subunit  31.33 
 
 		 519 aa  246  8e-64  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3016  integrase catalytic subunit  31.33 
 
 		 519 aa  246  8e-64  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0134  Integrase catalytic region  30.92 
 
 		 507 aa  245  9.999999999999999e-64  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.53025 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1363  Integrase catalytic region  30.92 
 
 		 507 aa  245  9.999999999999999e-64  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1463  transposase  35.35 
 
 		 487 aa  244  1.9999999999999999e-63  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5194  integrase catalytic subunit  31.51 
 
 		 525 aa  241  2e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.471073 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1795  putative transposase  29.73 
 
 		 517 aa  236  5.0000000000000005e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.765121  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5452  integrase catalytic region  33.33 
 
 		 458 aa  234  4.0000000000000004e-60  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.681559  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1328  integrase catalytic subunit  30.27 
 
 		 513 aa  232  1e-59  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4138  integrase catalytic subunit  30.36 
 
 		 513 aa  230  4e-59  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0612  integrase catalytic subunit  35.64 
 
 		 472 aa  203  6e-51  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.352245  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2548  integrase catalytic subunit  31.04 
 
 		 518 aa  200  5e-50  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5850  Integrase catalytic region  26.4 
 
 		 513 aa  187  3e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5413  integrase catalytic region  34.83 
 
 		 385 aa  180  4.999999999999999e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.694464 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0780  Integrase catalytic region  29 
 
 		 432 aa  177  5e-43  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3122  hypothetical protein  33.22 
 
 		 316 aa  168  2e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2217  integrase catalytic subunit  36.43 
 
 		 302 aa  166  1.0000000000000001e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000287605 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>