More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_2305 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_2305  Integrase catalytic region  100 
 
 
426 aa  865    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0376  Integrase catalytic region  100 
 
 
426 aa  865    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5624  integrase catalytic region  57.24 
 
 
429 aa  464  1e-129  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.205652  normal  0.723097 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1847  integrase catalytic region  57.24 
 
 
429 aa  464  1e-129  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.154194 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1706  integrase catalytic region  57.24 
 
 
429 aa  464  1e-129  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4913  integrase catalytic subunit  57.62 
 
 
428 aa  442  1e-123  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.279769 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0012  putative transposase  50.72 
 
 
416 aa  411  1e-114  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.116272 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0099  putative transposase  50.72 
 
 
435 aa  412  1e-114  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.431039 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1326  Integrase catalytic region  45.8 
 
 
425 aa  308  2.0000000000000002e-82  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0786  Integrase catalytic region  46.04 
 
 
410 aa  306  7e-82  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3693  Integrase catalytic region  45.37 
 
 
425 aa  299  6e-80  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1512  Integrase catalytic region  45.37 
 
 
425 aa  299  6e-80  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3058  Integrase catalytic region  45.37 
 
 
425 aa  299  6e-80  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1081  Integrase catalytic region  40.34 
 
 
449 aa  256  6e-67  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.333924  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0119  Integrase catalytic region  40.34 
 
 
449 aa  256  6e-67  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0136  integrase catalytic subunit  37.94 
 
 
434 aa  219  7.999999999999999e-56  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0324788  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2833  integrase catalytic subunit  37.94 
 
 
434 aa  219  7.999999999999999e-56  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0210  transposase, IS21 family  29.08 
 
 
417 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000847159 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2538  integrase catalytic subunit  34.67 
 
 
424 aa  155  1e-36  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.178355  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0019  ISPsy4, transposase  35.81 
 
 
340 aa  152  1e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0055  ISPsy4, transposase  35.81 
 
 
340 aa  152  1e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0194  ISPsy4, transposase  35.81 
 
 
340 aa  152  1e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0292  ISPsy4, transposase  35.81 
 
 
340 aa  152  1e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0833  ISPsy4, transposase  35.81 
 
 
340 aa  152  1e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0865  ISPsy4, transposase  35.81 
 
 
340 aa  152  1e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1095  ISPsy4, transposase  35.81 
 
 
340 aa  152  1e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.189576  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1659  ISPsy4, transposase  35.81 
 
 
340 aa  152  1e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2321  ISPsy4, transposase  35.81 
 
 
340 aa  152  1e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.000712156  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2387  ISPsy4, transposase  35.81 
 
 
340 aa  152  1e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.010584  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2740  ISPsy4, transposase  35.81 
 
 
340 aa  152  1e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3013  ISPsy4, transposase  35.81 
 
 
340 aa  152  1e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0378398  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3224  ISPsy4, transposase  35.81 
 
 
340 aa  152  1e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.038075  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3433  ISPsy4, transposase  35.81 
 
 
340 aa  152  1e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.45779  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3608  ISPsy4, transposase  35.81 
 
 
340 aa  152  1e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.656873  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4013  ISPsy4, transposase  35.81 
 
 
340 aa  152  1e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4269  ISPsy4, transposase  35.81 
 
 
340 aa  152  1e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4625  ISPsy4, transposase  35.81 
 
 
340 aa  152  1e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.146787  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4730  ISPsy4, transposase  35.81 
 
 
340 aa  152  1e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4769  ISPsy4, transposase  35.81 
 
 
340 aa  152  1e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5575  ISPsy4, transposase  35.81 
 
 
340 aa  152  1e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004632  PSPTO_B0040  ISPsy4, transposase  35.81 
 
 
340 aa  152  1e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.348986  n/a   
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0013  ISPsy4, transposase  35.81 
 
 
340 aa  152  1e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.292398  n/a   
 
 
-
 
NC_009788  EcE24377A_D0043  IS21 family transposase  32.18 
 
 
390 aa  151  2e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.920387  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2921  IS21 family transposase  32.18 
 
 
390 aa  151  2e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0036  IS21 family transposase  32.18 
 
 
390 aa  151  2e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3341  IS21 family transposase  32.18 
 
 
390 aa  151  2e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0290  integrase catalytic subunit  32.09 
 
 
495 aa  151  3e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.196451  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3370  IS21 family transposase  32.43 
 
 
390 aa  150  3e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0994  IS21 family transposase  32.43 
 
 
390 aa  150  3e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2228  IS21 family transposase  32.43 
 
 
390 aa  150  3e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.503141  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0019  IS21 family transposase  32.43 
 
 
390 aa  150  3e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0506229  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0662  integrase catalytic subunit  32.09 
 
 
495 aa  149  8e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0102982  hitchhiker  0.000000317754 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2239  integrase catalytic subunit  32.09 
 
 
495 aa  149  8e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0237102 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3144  IS2 transposase orfA  33.33 
 
 
390 aa  148  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0020  hypothetical protein  31.63 
 
 
348 aa  144  2e-33  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2884  hypothetical protein  31.63 
 
 
348 aa  144  2e-33  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2452  integrase catalytic region  32.5 
 
 
427 aa  142  8e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.227029 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5534  integrase catalytic region  32.5 
 
 
427 aa  142  8e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010373  M446_7013  hypothetical protein  32.5 
 
 
427 aa  142  8e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2798  integrase catalytic region  32.5 
 
 
427 aa  142  8e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4700  integrase catalytic region  32.5 
 
 
427 aa  142  8e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.670986  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1464  integrase catalytic region  32.5 
 
 
427 aa  142  8e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3888  integrase catalytic region  32.5 
 
 
427 aa  142  8e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1510  integrase catalytic region  32.5 
 
 
427 aa  142  8e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6916  integrase catalytic region  32.5 
 
 
427 aa  142  8e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.803027  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1563  hypothetical protein  31.89 
 
 
340 aa  142  1.9999999999999998e-32  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1457  integrase  31.95 
 
 
410 aa  140  3.9999999999999997e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0649  integrase catalytic subunit  32.31 
 
 
306 aa  139  7.999999999999999e-32  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00201548 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0026  integrase catalytic subunit  31.79 
 
 
512 aa  139  8.999999999999999e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1296  integrase catalytic subunit  31.79 
 
 
512 aa  139  8.999999999999999e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.709062  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2216  integrase catalytic subunit  31.79 
 
 
512 aa  139  8.999999999999999e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1554  Integrase catalytic region  28.65 
 
 
413 aa  139  1e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0097  integrase core subunit  34.54 
 
 
300 aa  136  8e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.368489 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1227  Integrase catalytic region  30.86 
 
 
497 aa  134  3.9999999999999996e-30  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1865  Integrase catalytic region  29.56 
 
 
413 aa  134  5e-30  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1530  integrase catalytic subunit  32.35 
 
 
523 aa  132  1.0000000000000001e-29  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2334  integrase catalytic subunit  32.35 
 
 
523 aa  132  1.0000000000000001e-29  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1264  integrase catalytic subunit  32.34 
 
 
336 aa  131  3e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0642781  normal  0.0493016 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5106  integrase catalytic subunit  32.02 
 
 
431 aa  131  3e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.214322  normal  0.182706 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3717  integrase catalytic subunit  26.71 
 
 
412 aa  127  5e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1009  integrase catalytic subunit  27.55 
 
 
412 aa  125  1e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00535974  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1319  integrase catalytic subunit  27.55 
 
 
412 aa  125  1e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2854  integrase catalytic subunit  27.55 
 
 
412 aa  125  1e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.230802  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2909  ISGsu6, transposase OrfA  34.63 
 
 
342 aa  125  2e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.29922  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3407  ISGsu6, transposase OrfA  34.63 
 
 
342 aa  125  2e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1042  Integrase catalytic region  30.83 
 
 
508 aa  121  1.9999999999999998e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.861303  normal  0.109435 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0952  ISRSO3-transposase ORFA protein  31.33 
 
 
354 aa  121  3e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.273706  normal  0.107434 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7663  integrase catalytic region  32.59 
 
 
348 aa  121  3e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1657  transposase  27.95 
 
 
493 aa  120  4.9999999999999996e-26  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3634  putative transposase  31.6 
 
 
338 aa  120  4.9999999999999996e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1643  transposase  27.95 
 
 
493 aa  120  4.9999999999999996e-26  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.432337  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0356  integrase catalytic region  32.19 
 
 
347 aa  120  4.9999999999999996e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0199  Integrase catalytic region  33.1 
 
 
512 aa  120  6e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0240231 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6529  Integrase catalytic region  33.1 
 
 
512 aa  120  6e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.277485  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0247  ISRSO6-transposase ORFA protein  31.91 
 
 
347 aa  120  7e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0946447  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2333  ISRSO6-transposase ORFA protein  31.91 
 
 
347 aa  120  7e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.764175  normal  0.115531 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0451  ISRSO6-transposase ORFA protein  31.91 
 
 
347 aa  120  7e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.886933  normal  0.322563 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1183  transposase  31.6 
 
 
489 aa  120  7e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000138357 
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0001  IS21 family transposase  32.69 
 
 
340 aa  117  3e-25  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000122483 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2586  insertion sequence transposase  32.69 
 
 
340 aa  117  3e-25  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00244507  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>