More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_p0012 on replicon NC_009475
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009475  BBta_p0099  putative transposase  100 
 
 		 435 aa  843    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.431039 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0012  putative transposase  100 
 
 		 416 aa  842    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.116272 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5624  integrase catalytic region  56.97 
 
 		 429 aa  445  1.0000000000000001e-124  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.205652  normal  0.723097 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1706  integrase catalytic region  56.97 
 
 		 429 aa  445  1.0000000000000001e-124  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1847  integrase catalytic region  56.97 
 
 		 429 aa  445  1.0000000000000001e-124  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.154194 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4913  integrase catalytic subunit  56.25 
 
 		 428 aa  444  1e-123  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.279769 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0376  Integrase catalytic region  50.72 
 
 		 426 aa  400  9.999999999999999e-111  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2305  Integrase catalytic region  50.72 
 
 		 426 aa  400  9.999999999999999e-111  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1326  Integrase catalytic region  45.56 
 
 		 425 aa  314  1.9999999999999998e-84  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3058  Integrase catalytic region  45.8 
 
 		 425 aa  312  6.999999999999999e-84  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3693  Integrase catalytic region  45.8 
 
 		 425 aa  312  6.999999999999999e-84  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1512  Integrase catalytic region  45.8 
 
 		 425 aa  312  6.999999999999999e-84  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0786  Integrase catalytic region  45.45 
 
 		 410 aa  312  9e-84  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1081  Integrase catalytic region  39.42 
 
 		 449 aa  236  8e-61  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.333924  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0119  Integrase catalytic region  39.42 
 
 		 449 aa  236  8e-61  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0136  integrase catalytic subunit  35.46 
 
 		 434 aa  202  6e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0324788  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2833  integrase catalytic subunit  35.46 
 
 		 434 aa  202  6e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1554  Integrase catalytic region  30.79 
 
 		 413 aa  170  5e-41  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0019  ISPsy4, transposase  37.17 
 
 		 340 aa  155  1e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0055  ISPsy4, transposase  37.17 
 
 		 340 aa  155  1e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0194  ISPsy4, transposase  37.17 
 
 		 340 aa  155  1e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0292  ISPsy4, transposase  37.17 
 
 		 340 aa  155  1e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0833  ISPsy4, transposase  37.17 
 
 		 340 aa  155  1e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0865  ISPsy4, transposase  37.17 
 
 		 340 aa  155  1e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1095  ISPsy4, transposase  37.17 
 
 		 340 aa  155  1e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.189576  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1659  ISPsy4, transposase  37.17 
 
 		 340 aa  155  1e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2321  ISPsy4, transposase  37.17 
 
 		 340 aa  155  1e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.000712156  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2387  ISPsy4, transposase  37.17 
 
 		 340 aa  155  1e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.010584  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2740  ISPsy4, transposase  37.17 
 
 		 340 aa  155  1e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3013  ISPsy4, transposase  37.17 
 
 		 340 aa  155  1e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0378398  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3224  ISPsy4, transposase  37.17 
 
 		 340 aa  155  1e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.038075  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3433  ISPsy4, transposase  37.17 
 
 		 340 aa  155  1e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.45779  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3608  ISPsy4, transposase  37.17 
 
 		 340 aa  155  1e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.656873  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4013  ISPsy4, transposase  37.17 
 
 		 340 aa  155  1e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4269  ISPsy4, transposase  37.17 
 
 		 340 aa  155  1e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4625  ISPsy4, transposase  37.17 
 
 		 340 aa  155  1e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.146787  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4730  ISPsy4, transposase  37.17 
 
 		 340 aa  155  1e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4769  ISPsy4, transposase  37.17 
 
 		 340 aa  155  1e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5575  ISPsy4, transposase  37.17 
 
 		 340 aa  155  1e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004632  PSPTO_B0040  ISPsy4, transposase  37.17 
 
 		 340 aa  155  1e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.348986  n/a   
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0013  ISPsy4, transposase  37.17 
 
 		 340 aa  155  1e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.292398  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0210  transposase, IS21 family  29.51 
 
 		 417 aa  152  8e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000847159 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3888  integrase catalytic region  32.35 
 
 		 427 aa  151  2e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1510  integrase catalytic region  32.35 
 
 		 427 aa  151  2e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1464  integrase catalytic region  32.35 
 
 		 427 aa  151  2e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010373  M446_7013  hypothetical protein  32.35 
 
 		 427 aa  151  2e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5534  integrase catalytic region  32.35 
 
 		 427 aa  151  2e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2452  integrase catalytic region  32.35 
 
 		 427 aa  151  2e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.227029 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4700  integrase catalytic region  32.35 
 
 		 427 aa  151  2e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.670986  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6916  integrase catalytic region  32.35 
 
 		 427 aa  151  2e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.803027  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2798  integrase catalytic region  32.35 
 
 		 427 aa  151  2e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2538  integrase catalytic subunit  35.5 
 
 		 424 aa  150  4e-35  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.178355  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1009  integrase catalytic subunit  29.51 
 
 		 412 aa  149  7e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00535974  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1319  integrase catalytic subunit  29.51 
 
 		 412 aa  149  7e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2854  integrase catalytic subunit  29.51 
 
 		 412 aa  149  7e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.230802  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2228  IS21 family transposase  34.26 
 
 		 390 aa  147  3e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.503141  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0994  IS21 family transposase  34.26 
 
 		 390 aa  147  3e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0036  IS21 family transposase  33.98 
 
 		 390 aa  147  3e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2921  IS21 family transposase  33.98 
 
 		 390 aa  147  3e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0019  IS21 family transposase  34.26 
 
 		 390 aa  147  3e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0506229  n/a   
 
 
-
 
NC_009788  EcE24377A_D0043  IS21 family transposase  33.98 
 
 		 390 aa  147  3e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.920387  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3370  IS21 family transposase  34.26 
 
 		 390 aa  147  3e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3341  IS21 family transposase  33.98 
 
 		 390 aa  147  3e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3717  integrase catalytic subunit  28.78 
 
 		 412 aa  146  8.000000000000001e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1457  integrase  32.29 
 
 		 410 aa  143  6e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5106  integrase catalytic subunit  32.23 
 
 		 431 aa  139  7.999999999999999e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.214322  normal  0.182706 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0737  hypothetical protein  67.33 
 
 		 142 aa  139  1e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3144  IS2 transposase orfA  33.51 
 
 		 390 aa  137  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1264  integrase catalytic subunit  36.11 
 
 		 336 aa  136  7.000000000000001e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0642781  normal  0.0493016 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0020  hypothetical protein  31.8 
 
 		 348 aa  135  9e-31  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2884  hypothetical protein  31.8 
 
 		 348 aa  135  9e-31  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1563  hypothetical protein  31.8 
 
 		 340 aa  135  9.999999999999999e-31  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0290  integrase catalytic subunit  28.97 
 
 		 495 aa  132  1.0000000000000001e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.196451  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2909  ISGsu6, transposase OrfA  35.46 
 
 		 342 aa  131  2.0000000000000002e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.29922  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3407  ISGsu6, transposase OrfA  35.46 
 
 		 342 aa  131  2.0000000000000002e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0662  integrase catalytic subunit  28.97 
 
 		 495 aa  131  3e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0102982  hitchhiker  0.000000317754 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2239  integrase catalytic subunit  28.97 
 
 		 495 aa  131  3e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0237102 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0026  integrase catalytic subunit  33.14 
 
 		 512 aa  130  4.0000000000000003e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1296  integrase catalytic subunit  33.14 
 
 		 512 aa  130  4.0000000000000003e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.709062  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2216  integrase catalytic subunit  33.14 
 
 		 512 aa  130  4.0000000000000003e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0952  ISRSO3-transposase ORFA protein  31.1 
 
 		 354 aa  130  5.0000000000000004e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.273706  normal  0.107434 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1530  integrase catalytic subunit  32.37 
 
 		 523 aa  129  1.0000000000000001e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2334  integrase catalytic subunit  32.37 
 
 		 523 aa  129  1.0000000000000001e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0247  ISRSO6-transposase ORFA protein  31.25 
 
 		 347 aa  126  7e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0946447  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2333  ISRSO6-transposase ORFA protein  31.25 
 
 		 347 aa  126  7e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.764175  normal  0.115531 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0451  ISRSO6-transposase ORFA protein  31.25 
 
 		 347 aa  126  7e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.886933  normal  0.322563 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0581  integrase catalytic subunit  32.87 
 
 		 517 aa  125  2e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2756  integrase catalytic subunit  32.87 
 
 		 517 aa  125  2e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0020  transposase for insertion sequence  32.19 
 
 		 340 aa  123  5e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0097  integrase core subunit  37.08 
 
 		 300 aa  120  3e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.368489 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1227  Integrase catalytic region  29.76 
 
 		 497 aa  120  3.9999999999999996e-26  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31560  Transposase  34.82 
 
 		 341 aa  120  4.9999999999999996e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0356  integrase catalytic region  31.63 
 
 		 347 aa  120  4.9999999999999996e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0649  integrase catalytic subunit  29.24 
 
 		 306 aa  120  7e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00201548 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09530  integrase  33.97 
 
 		 341 aa  119  9e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4958  transposase  29.97 
 
 		 502 aa  119  9.999999999999999e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4983  transposase  29.97 
 
 		 497 aa  119  9.999999999999999e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.712907  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49630  helix-turn-helix, Fis-type  35.05 
 
 		 341 aa  118  1.9999999999999998e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.840005  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36480  transposase, helix-turn-helix, Fis-type  35.05 
 
 		 341 aa  118  1.9999999999999998e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0136  insertion sequence transposase  31.7 
 
 		 340 aa  117  3.9999999999999997e-25  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0217084 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>