More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcSMS35_3144 on replicon NC_010498
Organism: Escherichia coli SMS-3-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009790  EcE24377A_E0036  IS21 family transposase  91.03 
 
 		 390 aa  730    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0019  IS21 family transposase  90.77 
 
 		 390 aa  729    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0506229  n/a   
 
 
-
 
NC_009788  EcE24377A_D0043  IS21 family transposase  91.03 
 
 		 390 aa  730    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.920387  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2228  IS21 family transposase  90.77 
 
 		 390 aa  729    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.503141  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0994  IS21 family transposase  90.77 
 
 		 390 aa  729    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2921  IS21 family transposase  91.03 
 
 		 390 aa  730    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3144  IS2 transposase orfA  100 
 
 		 390 aa  818    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3370  IS21 family transposase  90.77 
 
 		 390 aa  729    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3341  IS21 family transposase  91.03 
 
 		 390 aa  730    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0097  integrase core subunit  93.33 
 
 		 300 aa  565  1e-160  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.368489 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0210  transposase, IS21 family  33.79 
 
 		 417 aa  207  4e-52  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000847159 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0141  putative transposase  78.63 
 
 		 371 aa  193  4e-48  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1554  Integrase catalytic region  32.76 
 
 		 413 aa  190  2.9999999999999997e-47  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0136  integrase catalytic subunit  33.25 
 
 		 434 aa  190  2.9999999999999997e-47  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0324788  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2833  integrase catalytic subunit  33.25 
 
 		 434 aa  190  2.9999999999999997e-47  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3717  integrase catalytic subunit  33.43 
 
 		 412 aa  187  4e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1009  integrase catalytic subunit  34.57 
 
 		 412 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00535974  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1319  integrase catalytic subunit  34.57 
 
 		 412 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2854  integrase catalytic subunit  34.57 
 
 		 412 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.230802  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1847  integrase catalytic region  33.97 
 
 		 429 aa  179  1e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.154194 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1706  integrase catalytic region  33.97 
 
 		 429 aa  179  1e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5624  integrase catalytic region  33.97 
 
 		 429 aa  179  1e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.205652  normal  0.723097 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4700  integrase catalytic region  33.89 
 
 		 427 aa  177  2e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.670986  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3888  integrase catalytic region  33.89 
 
 		 427 aa  177  2e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2452  integrase catalytic region  33.89 
 
 		 427 aa  177  2e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.227029 
 
 
-
 
NC_010373  M446_7013  hypothetical protein  33.89 
 
 		 427 aa  177  2e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1510  integrase catalytic region  33.89 
 
 		 427 aa  177  2e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2798  integrase catalytic region  33.89 
 
 		 427 aa  177  2e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6916  integrase catalytic region  33.89 
 
 		 427 aa  177  2e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.803027  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5534  integrase catalytic region  33.89 
 
 		 427 aa  177  2e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1464  integrase catalytic region  33.89 
 
 		 427 aa  177  2e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0119  Integrase catalytic region  32.53 
 
 		 449 aa  173  5e-42  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1081  Integrase catalytic region  32.53 
 
 		 449 aa  173  5e-42  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.333924  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1457  integrase  33.6 
 
 		 410 aa  171  2e-41  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31560  Transposase  38.39 
 
 		 341 aa  169  6e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36480  transposase, helix-turn-helix, Fis-type  38.39 
 
 		 341 aa  169  8e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0075  transposase  88.04 
 
 		 136 aa  169  8e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.36944 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09530  integrase  38.39 
 
 		 341 aa  169  8e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49630  helix-turn-helix, Fis-type  38.39 
 
 		 341 aa  169  8e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.840005  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4913  integrase catalytic subunit  32.88 
 
 		 428 aa  164  2.0000000000000002e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.279769 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2538  integrase catalytic subunit  31.56 
 
 		 424 aa  160  3e-38  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.178355  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2909  ISGsu6, transposase OrfA  37.03 
 
 		 342 aa  159  8e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.29922  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3407  ISGsu6, transposase OrfA  37.03 
 
 		 342 aa  159  8e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0952  ISRSO3-transposase ORFA protein  36.77 
 
 		 354 aa  158  1e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.273706  normal  0.107434 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0012  putative transposase  33.51 
 
 		 416 aa  158  1e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.116272 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0099  putative transposase  33.51 
 
 		 435 aa  159  1e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.431039 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1865  Integrase catalytic region  30.94 
 
 		 413 aa  157  3e-37  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7663  integrase catalytic region  35.88 
 
 		 348 aa  156  7e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0356  integrase catalytic region  36.25 
 
 		 347 aa  155  8e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5106  integrase catalytic subunit  33.16 
 
 		 431 aa  155  1e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.214322  normal  0.182706 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1326  Integrase catalytic region  32.99 
 
 		 425 aa  154  2e-36  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0376  Integrase catalytic region  33.33 
 
 		 426 aa  154  2.9999999999999998e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2305  Integrase catalytic region  33.33 
 
 		 426 aa  154  2.9999999999999998e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0786  Integrase catalytic region  31.52 
 
 		 410 aa  153  5e-36  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1512  Integrase catalytic region  32.23 
 
 		 425 aa  151  2e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3693  Integrase catalytic region  32.23 
 
 		 425 aa  151  2e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3058  Integrase catalytic region  32.23 
 
 		 425 aa  151  2e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0019  ISPsy4, transposase  35.39 
 
 		 340 aa  150  3e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0055  ISPsy4, transposase  35.39 
 
 		 340 aa  150  3e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0194  ISPsy4, transposase  35.39 
 
 		 340 aa  150  3e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0292  ISPsy4, transposase  35.39 
 
 		 340 aa  150  3e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0833  ISPsy4, transposase  35.39 
 
 		 340 aa  150  3e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0865  ISPsy4, transposase  35.39 
 
 		 340 aa  150  3e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1095  ISPsy4, transposase  35.39 
 
 		 340 aa  150  3e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.189576  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1659  ISPsy4, transposase  35.39 
 
 		 340 aa  150  3e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2321  ISPsy4, transposase  35.39 
 
 		 340 aa  150  3e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.000712156  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2387  ISPsy4, transposase  35.39 
 
 		 340 aa  150  3e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.010584  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2740  ISPsy4, transposase  35.39 
 
 		 340 aa  150  3e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3013  ISPsy4, transposase  35.39 
 
 		 340 aa  150  3e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0378398  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3224  ISPsy4, transposase  35.39 
 
 		 340 aa  150  3e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.038075  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3433  ISPsy4, transposase  35.39 
 
 		 340 aa  150  3e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.45779  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3608  ISPsy4, transposase  35.39 
 
 		 340 aa  150  3e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.656873  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4013  ISPsy4, transposase  35.39 
 
 		 340 aa  150  3e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4269  ISPsy4, transposase  35.39 
 
 		 340 aa  150  3e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4625  ISPsy4, transposase  35.39 
 
 		 340 aa  150  3e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.146787  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4730  ISPsy4, transposase  35.39 
 
 		 340 aa  150  3e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4769  ISPsy4, transposase  35.39 
 
 		 340 aa  150  3e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5575  ISPsy4, transposase  35.39 
 
 		 340 aa  150  3e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004632  PSPTO_B0040  ISPsy4, transposase  35.39 
 
 		 340 aa  150  3e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.348986  n/a   
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0013  ISPsy4, transposase  35.39 
 
 		 340 aa  150  3e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.292398  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1264  integrase catalytic subunit  34.67 
 
 		 336 aa  150  3e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0642781  normal  0.0493016 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0247  ISRSO6-transposase ORFA protein  36.54 
 
 		 347 aa  150  4e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0946447  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2333  ISRSO6-transposase ORFA protein  36.54 
 
 		 347 aa  150  4e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.764175  normal  0.115531 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0451  ISRSO6-transposase ORFA protein  36.54 
 
 		 347 aa  150  4e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.886933  normal  0.322563 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0020  hypothetical protein  34.3 
 
 		 348 aa  150  5e-35  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2884  hypothetical protein  34.3 
 
 		 348 aa  150  5e-35  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1047  integrase catalytic subunit  33.76 
 
 		 403 aa  149  1.0000000000000001e-34  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1563  hypothetical protein  34.55 
 
 		 340 aa  147  3e-34  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2586  insertion sequence transposase  32.9 
 
 		 340 aa  144  2e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00244507  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0077  insertion sequence transposase  32.9 
 
 		 340 aa  144  2e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1238  transposase  32.9 
 
 		 491 aa  144  2e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00126413 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1294  insertion sequence transposase  32.9 
 
 		 340 aa  144  2e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0136  insertion sequence transposase  32.9 
 
 		 340 aa  144  2e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0217084 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2392  insertion sequence transposase  32.9 
 
 		 340 aa  144  2e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.392902  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0448  insertion sequence transposase  32.9 
 
 		 340 aa  144  2e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.453908  hitchhiker  0.00000287146 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2025  insertion sequence transposase  32.9 
 
 		 340 aa  144  2e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0314  insertion sequence transposase  32.9 
 
 		 340 aa  144  2e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.415268  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0689  insertion sequence transposase  32.9 
 
 		 340 aa  144  2e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1049  insertion sequence transposase  32.9 
 
 		 340 aa  144  2e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0362189  normal  0.0286616 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0888  insertion sequence transposase  32.9 
 
 		 340 aa  144  2e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0176798  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>