More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_1865 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013124  Afer_1865  Integrase catalytic region  100 
 
 
413 aa  829    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2538  integrase catalytic subunit  40.36 
 
 
424 aa  220  3e-56  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.178355  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1554  Integrase catalytic region  35.99 
 
 
413 aa  214  2.9999999999999995e-54  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0290  integrase catalytic subunit  33.33 
 
 
495 aa  169  7e-41  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.196451  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0662  integrase catalytic subunit  33.07 
 
 
495 aa  167  4e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0102982  hitchhiker  0.000000317754 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2239  integrase catalytic subunit  33.07 
 
 
495 aa  167  4e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0237102 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3717  integrase catalytic subunit  33.33 
 
 
412 aa  166  5.9999999999999996e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1464  integrase catalytic region  34.71 
 
 
427 aa  161  2e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010373  M446_7013  hypothetical protein  34.71 
 
 
427 aa  161  2e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4700  integrase catalytic region  34.71 
 
 
427 aa  161  2e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.670986  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3888  integrase catalytic region  34.71 
 
 
427 aa  161  2e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2798  integrase catalytic region  34.71 
 
 
427 aa  161  2e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1510  integrase catalytic region  34.71 
 
 
427 aa  161  2e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6916  integrase catalytic region  34.71 
 
 
427 aa  161  2e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.803027  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5534  integrase catalytic region  34.71 
 
 
427 aa  161  2e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2452  integrase catalytic region  34.71 
 
 
427 aa  161  2e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.227029 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1009  integrase catalytic subunit  33.53 
 
 
412 aa  160  3e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00535974  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1319  integrase catalytic subunit  33.53 
 
 
412 aa  160  3e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2854  integrase catalytic subunit  33.53 
 
 
412 aa  160  3e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.230802  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0119  Integrase catalytic region  33.18 
 
 
449 aa  158  1e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1081  Integrase catalytic region  33.18 
 
 
449 aa  158  1e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.333924  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0664  ISChy4, transposase  79.05 
 
 
108 aa  157  3e-37  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0020  transposase for insertion sequence  34.43 
 
 
340 aa  155  9e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1326  Integrase catalytic region  31.85 
 
 
425 aa  155  1e-36  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1264  integrase catalytic subunit  36.66 
 
 
336 aa  154  4e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0642781  normal  0.0493016 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0046  ISGsu6, transposase OrfA  35.22 
 
 
341 aa  153  5.9999999999999996e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.688016  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2593  ISGsu6, transposase OrfA  35.22 
 
 
341 aa  153  5.9999999999999996e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.243982  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0210  transposase, IS21 family  28.5 
 
 
417 aa  152  7e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000847159 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0321  integrase catalytic subunit  34.91 
 
 
341 aa  152  1e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0105931 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1118  integrase catalytic subunit  34.91 
 
 
341 aa  152  1e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1789  integrase catalytic subunit  34.91 
 
 
341 aa  152  1e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2272  integrase catalytic subunit  34.91 
 
 
341 aa  152  1e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0220216  hitchhiker  0.000461104 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2539  integrase catalytic subunit  34.91 
 
 
341 aa  152  1e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00047026  hitchhiker  0.00000000018385 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2586  integrase catalytic subunit  34.91 
 
 
341 aa  152  1e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0248633  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2797  integrase catalytic subunit  34.91 
 
 
341 aa  152  1e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3282  integrase catalytic subunit  34.91 
 
 
341 aa  152  1e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.590315  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1457  integrase  35.28 
 
 
410 aa  151  2e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3058  Integrase catalytic region  31.34 
 
 
425 aa  150  3e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1512  Integrase catalytic region  31.34 
 
 
425 aa  150  3e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3693  Integrase catalytic region  31.34 
 
 
425 aa  150  3e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3370  IS21 family transposase  31.65 
 
 
390 aa  150  3e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2921  IS21 family transposase  31.65 
 
 
390 aa  150  3e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0036  IS21 family transposase  31.65 
 
 
390 aa  150  3e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2228  IS21 family transposase  31.65 
 
 
390 aa  150  3e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.503141  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0994  IS21 family transposase  31.65 
 
 
390 aa  150  3e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3341  IS21 family transposase  31.65 
 
 
390 aa  150  3e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0019  IS21 family transposase  31.65 
 
 
390 aa  150  3e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0506229  n/a   
 
 
-
 
NC_009788  EcE24377A_D0043  IS21 family transposase  31.65 
 
 
390 aa  150  3e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.920387  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36480  transposase, helix-turn-helix, Fis-type  36.66 
 
 
341 aa  150  4e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49630  helix-turn-helix, Fis-type  36.66 
 
 
341 aa  150  4e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.840005  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31560  Transposase  36.66 
 
 
341 aa  150  5e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1628  transposase  33.65 
 
 
491 aa  150  5e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1441  transposase  33.65 
 
 
491 aa  150  5e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.31725  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3393  transposase  33.65 
 
 
491 aa  150  6e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.39722  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4054  transposase  33.65 
 
 
491 aa  150  6e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2877  transposase  33.65 
 
 
491 aa  150  6e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0036  transposase  33.65 
 
 
491 aa  150  6e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3532  transposase  33.65 
 
 
491 aa  150  6e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.447396  normal  0.0612525 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3336  insertion sequence transposase  33.65 
 
 
491 aa  150  6e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0098  IS21 family transposase  33.65 
 
 
491 aa  150  6e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  5.2973499999999993e-20  hitchhiker  2.05788e-63 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1305  transposase  33.65 
 
 
491 aa  150  6e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1238  transposase  33.65 
 
 
491 aa  149  6e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00126413 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1939  transposase  33.65 
 
 
491 aa  150  6e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0012517  normal  0.673499 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09530  integrase  36.66 
 
 
341 aa  149  8e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3338  IS100, transposase  33.54 
 
 
340 aa  149  8e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3487  insertion sequence transposase  33.54 
 
 
340 aa  149  9e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.169046 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3951  insertion sequence transposase  33.54 
 
 
340 aa  149  9e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3444  insertion sequence transposase  33.54 
 
 
340 aa  149  9e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4125  insertion sequence transposase  33.54 
 
 
340 aa  149  9e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.44357  normal  0.500657 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3154  insertion sequence transposase  33.54 
 
 
340 aa  149  9e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2960  insertion sequence transposase  33.54 
 
 
340 aa  149  9e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00154243 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2586  insertion sequence transposase  33.54 
 
 
340 aa  149  9e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00244507  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2527  insertion sequence transposase  33.54 
 
 
340 aa  149  9e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3280  insertion sequence transposase  33.54 
 
 
340 aa  149  9e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0112823 
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0029  IS21 family transposase  33.54 
 
 
340 aa  149  9e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3216  insertion sequence transposase  33.54 
 
 
340 aa  149  9e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000564447  normal  0.0522706 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2088  insertion sequence transposase  33.54 
 
 
340 aa  149  9e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.207066 
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0015  IS21 family transposase  33.54 
 
 
340 aa  149  9e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0001  IS21 family transposase  33.54 
 
 
340 aa  149  9e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000122483 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2797  insertion sequence transposase  33.54 
 
 
340 aa  149  9e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000133045  normal  0.199341 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2905  insertion sequence transposase  33.54 
 
 
340 aa  149  9e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00121621  normal  0.994964 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3800  insertion sequence transposase  33.54 
 
 
340 aa  149  9e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3672  insertion sequence transposase  33.54 
 
 
340 aa  149  9e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000543988  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0448  insertion sequence transposase  33.54 
 
 
340 aa  149  9e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.453908  hitchhiker  0.00000287146 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0314  insertion sequence transposase  33.54 
 
 
340 aa  149  9e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.415268  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0634  insertion sequence transposase  33.54 
 
 
340 aa  149  9e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0933756  normal  0.145557 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0689  insertion sequence transposase  33.54 
 
 
340 aa  149  9e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0530  insertion sequence transposase  33.54 
 
 
340 aa  149  9e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000118737  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0136  insertion sequence transposase  33.54 
 
 
340 aa  149  9e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0217084 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2171  insertion sequence transposase  33.54 
 
 
340 aa  149  9e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0335942 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1049  insertion sequence transposase  33.54 
 
 
340 aa  149  9e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0362189  normal  0.0286616 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2392  insertion sequence transposase  33.54 
 
 
340 aa  149  9e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.392902  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1294  insertion sequence transposase  33.54 
 
 
340 aa  149  9e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2155  insertion sequence transposase  33.54 
 
 
340 aa  149  9e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0564082  normal  0.0481856 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0888  insertion sequence transposase  33.54 
 
 
340 aa  149  9e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0176798  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0077  insertion sequence transposase  33.54 
 
 
340 aa  149  9e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1904  insertion sequence transposase  33.54 
 
 
340 aa  149  9e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00789725 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2025  insertion sequence transposase  33.54 
 
 
340 aa  149  9e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2677  insertion sequence transposase  33.54 
 
 
340 aa  149  9e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.585168  normal  0.0366075 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1563  hypothetical protein  35.12 
 
 
340 aa  149  1.0000000000000001e-34  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>