More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_1047 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009513  Lreu_1047  integrase catalytic subunit  100 
 
 		 403 aa  835    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1361  integrase catalytic subunit  43.1 
 
 		 409 aa  345  6e-94  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0258  Integrase catalytic region  36.59 
 
 		 400 aa  219  8.999999999999998e-56  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0130  Integrase catalytic region  36.59 
 
 		 400 aa  219  8.999999999999998e-56  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2087  Integrase catalytic region  36.59 
 
 		 400 aa  219  8.999999999999998e-56  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.347453  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2293  Integrase catalytic region  36.59 
 
 		 400 aa  219  8.999999999999998e-56  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03420  transposase  29.66 
 
 		 405 aa  171  3e-41  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.869961  normal  1 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0210  transposase, IS21 family  33.33 
 
 		 417 aa  167  2e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000847159 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1264  integrase catalytic subunit  33.56 
 
 		 336 aa  149  6e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0642781  normal  0.0493016 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0136  integrase catalytic subunit  28.78 
 
 		 434 aa  149  9e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0324788  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2833  integrase catalytic subunit  28.78 
 
 		 434 aa  149  9e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0020  hypothetical protein  36.9 
 
 		 348 aa  148  1.0000000000000001e-34  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2884  hypothetical protein  36.9 
 
 		 348 aa  148  1.0000000000000001e-34  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1457  integrase  32.48 
 
 		 410 aa  148  1.0000000000000001e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1563  hypothetical protein  36.9 
 
 		 340 aa  148  2.0000000000000003e-34  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3717  integrase catalytic subunit  29.67 
 
 		 412 aa  147  3e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1009  integrase catalytic subunit  28.9 
 
 		 412 aa  145  1e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00535974  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1319  integrase catalytic subunit  28.9 
 
 		 412 aa  145  1e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2854  integrase catalytic subunit  28.9 
 
 		 412 aa  145  1e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.230802  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1865  Integrase catalytic region  29.73 
 
 		 413 aa  144  2e-33  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1554  Integrase catalytic region  29.12 
 
 		 413 aa  143  6e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3672  insertion sequence transposase  32.01 
 
 		 340 aa  140  6e-32  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000543988  normal  1 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0020  transposase for insertion sequence  34.71 
 
 		 340 aa  139  6e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4125  insertion sequence transposase  32.01 
 
 		 340 aa  140  6e-32  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.44357  normal  0.500657 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3951  insertion sequence transposase  32.01 
 
 		 340 aa  140  6e-32  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3800  insertion sequence transposase  32.01 
 
 		 340 aa  140  6e-32  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2960  insertion sequence transposase  32.01 
 
 		 340 aa  140  6e-32  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00154243 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3216  insertion sequence transposase  32.01 
 
 		 340 aa  140  6e-32  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000564447  normal  0.0522706 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3154  insertion sequence transposase  32.01 
 
 		 340 aa  140  6e-32  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2905  insertion sequence transposase  32.01 
 
 		 340 aa  140  6e-32  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00121621  normal  0.994964 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3280  insertion sequence transposase  32.01 
 
 		 340 aa  140  6e-32  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0112823 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3444  insertion sequence transposase  32.01 
 
 		 340 aa  140  6e-32  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0314  insertion sequence transposase  32.01 
 
 		 340 aa  140  6e-32  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.415268  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2797  insertion sequence transposase  32.01 
 
 		 340 aa  140  6e-32  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000133045  normal  0.199341 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2677  insertion sequence transposase  32.01 
 
 		 340 aa  140  6e-32  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.585168  normal  0.0366075 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2025  insertion sequence transposase  32.01 
 
 		 340 aa  140  6e-32  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2088  insertion sequence transposase  32.01 
 
 		 340 aa  140  6e-32  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.207066 
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0029  IS21 family transposase  32.01 
 
 		 340 aa  140  6e-32  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0015  IS21 family transposase  32.01 
 
 		 340 aa  140  6e-32  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2155  insertion sequence transposase  32.01 
 
 		 340 aa  140  6e-32  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0564082  normal  0.0481856 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0634  insertion sequence transposase  32.01 
 
 		 340 aa  140  6e-32  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0933756  normal  0.145557 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0530  insertion sequence transposase  32.01 
 
 		 340 aa  140  6e-32  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000118737  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0077  insertion sequence transposase  32.01 
 
 		 340 aa  140  6e-32  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0136  insertion sequence transposase  32.01 
 
 		 340 aa  140  6e-32  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0217084 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0689  insertion sequence transposase  32.01 
 
 		 340 aa  140  6e-32  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2171  insertion sequence transposase  32.01 
 
 		 340 aa  140  6e-32  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0335942 
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0001  IS21 family transposase  32.01 
 
 		 340 aa  140  6e-32  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000122483 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1904  insertion sequence transposase  32.01 
 
 		 340 aa  140  6e-32  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00789725 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1049  insertion sequence transposase  32.01 
 
 		 340 aa  140  6e-32  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0362189  normal  0.0286616 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1294  insertion sequence transposase  32.01 
 
 		 340 aa  140  6e-32  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0888  insertion sequence transposase  32.01 
 
 		 340 aa  140  6e-32  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0176798  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0448  insertion sequence transposase  32.01 
 
 		 340 aa  140  6e-32  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.453908  hitchhiker  0.00000287146 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3487  insertion sequence transposase  32.01 
 
 		 340 aa  140  6e-32  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.169046 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2392  insertion sequence transposase  32.01 
 
 		 340 aa  140  6e-32  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.392902  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2586  insertion sequence transposase  32.01 
 
 		 340 aa  140  6e-32  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00244507  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2527  insertion sequence transposase  32.01 
 
 		 340 aa  140  6e-32  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1238  transposase  35.45 
 
 		 491 aa  137  2e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00126413 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4054  transposase  35.45 
 
 		 491 aa  137  3.0000000000000003e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2877  transposase  35.45 
 
 		 491 aa  137  3.0000000000000003e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3393  transposase  35.45 
 
 		 491 aa  137  3.0000000000000003e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.39722  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3336  insertion sequence transposase  35.45 
 
 		 491 aa  137  3.0000000000000003e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1628  transposase  35.45 
 
 		 491 aa  137  3.0000000000000003e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0036  transposase  35.45 
 
 		 491 aa  137  3.0000000000000003e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1939  transposase  35.45 
 
 		 491 aa  137  3.0000000000000003e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0012517  normal  0.673499 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1305  transposase  35.45 
 
 		 491 aa  137  3.0000000000000003e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1441  transposase  35.45 
 
 		 491 aa  137  3.0000000000000003e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.31725  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3338  IS100, transposase  32.08 
 
 		 340 aa  137  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0098  IS21 family transposase  35.45 
 
 		 491 aa  137  3.0000000000000003e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  5.2973499999999993e-20  hitchhiker  2.05788e-63 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3532  transposase  35.45 
 
 		 491 aa  137  3.0000000000000003e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.447396  normal  0.0612525 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5106  integrase catalytic subunit  32.06 
 
 		 431 aa  137  4e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.214322  normal  0.182706 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3634  putative transposase  32.01 
 
 		 338 aa  135  9.999999999999999e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0048  IS100 transposase orfA  32.84 
 
 		 340 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1183  transposase  35.45 
 
 		 489 aa  134  3.9999999999999996e-30  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000138357 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36480  transposase, helix-turn-helix, Fis-type  31.42 
 
 		 341 aa  132  1.0000000000000001e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49630  helix-turn-helix, Fis-type  31.42 
 
 		 341 aa  132  1.0000000000000001e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.840005  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2798  integrase catalytic region  28.53 
 
 		 427 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2452  integrase catalytic region  28.53 
 
 		 427 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.227029 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6916  integrase catalytic region  28.53 
 
 		 427 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.803027  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5534  integrase catalytic region  28.53 
 
 		 427 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010373  M446_7013  hypothetical protein  28.53 
 
 		 427 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1464  integrase catalytic region  28.53 
 
 		 427 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4700  integrase catalytic region  28.53 
 
 		 427 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.670986  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3888  integrase catalytic region  28.53 
 
 		 427 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1510  integrase catalytic region  28.53 
 
 		 427 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31560  Transposase  31.76 
 
 		 341 aa  131  2.0000000000000002e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09530  integrase  31.76 
 
 		 341 aa  131  2.0000000000000002e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1847  integrase catalytic region  27.43 
 
 		 429 aa  131  3e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.154194 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1706  integrase catalytic region  27.43 
 
 		 429 aa  131  3e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5624  integrase catalytic region  27.43 
 
 		 429 aa  131  3e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.205652  normal  0.723097 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3144  IS2 transposase orfA  33.76 
 
 		 390 aa  130  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7663  integrase catalytic region  28.88 
 
 		 348 aa  129  9.000000000000001e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0119  Integrase catalytic region  27.22 
 
 		 449 aa  129  1.0000000000000001e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1081  Integrase catalytic region  27.22 
 
 		 449 aa  129  1.0000000000000001e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.333924  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4913  integrase catalytic subunit  27.38 
 
 		 428 aa  129  1.0000000000000001e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.279769 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1845  Transposase and inactivated derivatives-like protein  34.63 
 
 		 278 aa  126  6e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0247  ISRSO6-transposase ORFA protein  36.59 
 
 		 347 aa  126  8.000000000000001e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0946447  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2333  ISRSO6-transposase ORFA protein  36.59 
 
 		 347 aa  126  8.000000000000001e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.764175  normal  0.115531 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0451  ISRSO6-transposase ORFA protein  36.59 
 
 		 347 aa  126  8.000000000000001e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.886933  normal  0.322563 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0952  ISRSO3-transposase ORFA protein  36.59 
 
 		 354 aa  126  8.000000000000001e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.273706  normal  0.107434 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3341  IS21 family transposase  30.83 
 
 		 390 aa  124  2e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>