More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_1361 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009513  Lreu_1361  integrase catalytic subunit  100 
 
 
409 aa  858    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1047  integrase catalytic subunit  43.1 
 
 
403 aa  345  6e-94  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0258  Integrase catalytic region  33.33 
 
 
400 aa  196  9e-49  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2293  Integrase catalytic region  33.33 
 
 
400 aa  196  9e-49  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0130  Integrase catalytic region  33.33 
 
 
400 aa  196  9e-49  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2087  Integrase catalytic region  33.33 
 
 
400 aa  196  9e-49  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.347453  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03420  transposase  29.56 
 
 
405 aa  153  5.9999999999999996e-36  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.869961  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0136  integrase catalytic subunit  30.26 
 
 
434 aa  149  6e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0324788  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2833  integrase catalytic subunit  30.26 
 
 
434 aa  149  6e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0210  transposase, IS21 family  28.7 
 
 
417 aa  147  3e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000847159 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1457  integrase  28.89 
 
 
410 aa  134  3e-30  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1845  Transposase and inactivated derivatives-like protein  34.24 
 
 
278 aa  131  2.0000000000000002e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2171  insertion sequence transposase  30.77 
 
 
340 aa  125  2e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0335942 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2155  insertion sequence transposase  30.77 
 
 
340 aa  125  2e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0564082  normal  0.0481856 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4054  transposase  29.31 
 
 
491 aa  124  2e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3951  insertion sequence transposase  30.77 
 
 
340 aa  125  2e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4125  insertion sequence transposase  30.77 
 
 
340 aa  125  2e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.44357  normal  0.500657 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0020  transposase for insertion sequence  31.41 
 
 
340 aa  124  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2797  insertion sequence transposase  30.77 
 
 
340 aa  125  2e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000133045  normal  0.199341 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2586  insertion sequence transposase  30.77 
 
 
340 aa  125  2e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00244507  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2960  insertion sequence transposase  30.77 
 
 
340 aa  125  2e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00154243 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3280  insertion sequence transposase  30.77 
 
 
340 aa  125  2e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0112823 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3216  insertion sequence transposase  30.77 
 
 
340 aa  125  2e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000564447  normal  0.0522706 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2905  insertion sequence transposase  30.77 
 
 
340 aa  125  2e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00121621  normal  0.994964 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2677  insertion sequence transposase  30.77 
 
 
340 aa  125  2e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.585168  normal  0.0366075 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3393  transposase  29.31 
 
 
491 aa  124  2e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.39722  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3800  insertion sequence transposase  30.77 
 
 
340 aa  125  2e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2088  insertion sequence transposase  30.77 
 
 
340 aa  125  2e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.207066 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3672  insertion sequence transposase  30.77 
 
 
340 aa  125  2e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000543988  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0314  insertion sequence transposase  30.77 
 
 
340 aa  125  2e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.415268  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3532  transposase  29.31 
 
 
491 aa  124  2e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.447396  normal  0.0612525 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1305  transposase  29.31 
 
 
491 aa  124  2e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0634  insertion sequence transposase  30.77 
 
 
340 aa  125  2e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0933756  normal  0.145557 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0530  insertion sequence transposase  30.77 
 
 
340 aa  125  2e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000118737  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0136  insertion sequence transposase  30.77 
 
 
340 aa  125  2e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0217084 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0448  insertion sequence transposase  30.77 
 
 
340 aa  125  2e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.453908  hitchhiker  0.00000287146 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0888  insertion sequence transposase  30.77 
 
 
340 aa  125  2e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0176798  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0689  insertion sequence transposase  30.77 
 
 
340 aa  125  2e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2392  insertion sequence transposase  30.77 
 
 
340 aa  125  2e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.392902  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2527  insertion sequence transposase  30.77 
 
 
340 aa  125  2e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3444  insertion sequence transposase  30.77 
 
 
340 aa  125  2e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1049  insertion sequence transposase  30.77 
 
 
340 aa  125  2e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0362189  normal  0.0286616 
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0001  IS21 family transposase  30.77 
 
 
340 aa  125  2e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000122483 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2025  insertion sequence transposase  30.77 
 
 
340 aa  125  2e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2877  transposase  29.31 
 
 
491 aa  124  2e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3154  insertion sequence transposase  30.77 
 
 
340 aa  125  2e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1294  insertion sequence transposase  30.77 
 
 
340 aa  125  2e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1238  transposase  29.31 
 
 
491 aa  124  2e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00126413 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1904  insertion sequence transposase  30.77 
 
 
340 aa  125  2e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00789725 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3338  IS100, transposase  30.77 
 
 
340 aa  125  2e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0077  insertion sequence transposase  30.77 
 
 
340 aa  125  2e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3336  insertion sequence transposase  29.31 
 
 
491 aa  124  2e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1939  transposase  29.31 
 
 
491 aa  124  2e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0012517  normal  0.673499 
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0029  IS21 family transposase  30.77 
 
 
340 aa  125  2e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0036  transposase  29.31 
 
 
491 aa  124  2e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0098  IS21 family transposase  29.31 
 
 
491 aa  124  2e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  5.2973499999999993e-20  hitchhiker  2.05788e-63 
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0015  IS21 family transposase  30.77 
 
 
340 aa  125  2e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3487  insertion sequence transposase  30.77 
 
 
340 aa  125  2e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.169046 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1441  transposase  29.02 
 
 
491 aa  123  7e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.31725  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1628  transposase  29.02 
 
 
491 aa  123  7e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0048  IS100 transposase orfA  30.43 
 
 
340 aa  123  8e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1257  IstB ATP binding domain-containing protein  37.32 
 
 
401 aa  123  8e-27  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.679289  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3634  putative transposase  30.43 
 
 
338 aa  119  7e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1183  transposase  29.36 
 
 
489 aa  119  7.999999999999999e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000138357 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5106  integrase catalytic subunit  27.61 
 
 
431 aa  117  3e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.214322  normal  0.182706 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2538  integrase catalytic subunit  29.05 
 
 
424 aa  115  2.0000000000000002e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.178355  n/a   
 
 
-
 
NC_010373  M446_7013  hypothetical protein  26.96 
 
 
427 aa  113  5e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4700  integrase catalytic region  26.96 
 
 
427 aa  113  5e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.670986  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3888  integrase catalytic region  26.96 
 
 
427 aa  113  5e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1510  integrase catalytic region  26.96 
 
 
427 aa  113  5e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1464  integrase catalytic region  26.96 
 
 
427 aa  113  5e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2452  integrase catalytic region  26.96 
 
 
427 aa  113  5e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.227029 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6916  integrase catalytic region  26.96 
 
 
427 aa  113  5e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.803027  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5534  integrase catalytic region  26.96 
 
 
427 aa  113  5e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2798  integrase catalytic region  26.96 
 
 
427 aa  113  5e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1999  Integrase catalytic region  33.19 
 
 
368 aa  109  8.000000000000001e-23  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0934  Integrase catalytic region  33.19 
 
 
368 aa  109  8.000000000000001e-23  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1246  Integrase catalytic region  33.19 
 
 
368 aa  109  8.000000000000001e-23  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0942  Integrase catalytic region  33.19 
 
 
368 aa  109  8.000000000000001e-23  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0280852  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0922  Integrase catalytic region  33.19 
 
 
368 aa  109  8.000000000000001e-23  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1008  Integrase catalytic region  33.19 
 
 
368 aa  109  8.000000000000001e-23  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1254  Integrase catalytic region  33.19 
 
 
368 aa  109  8.000000000000001e-23  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0110629  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1258  Integrase catalytic region  33.19 
 
 
368 aa  109  8.000000000000001e-23  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0135113  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1865  Integrase catalytic region  29.43 
 
 
413 aa  109  9.000000000000001e-23  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1554  Integrase catalytic region  27.08 
 
 
413 aa  108  1e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1081  Integrase catalytic region  26.17 
 
 
449 aa  105  1e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.333924  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0119  Integrase catalytic region  26.17 
 
 
449 aa  105  1e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3717  integrase catalytic subunit  27.67 
 
 
412 aa  101  2e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0952  ISRSO3-transposase ORFA protein  30.77 
 
 
354 aa  101  3e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.273706  normal  0.107434 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1227  Integrase catalytic region  25.66 
 
 
497 aa  101  3e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0247  ISRSO6-transposase ORFA protein  30.77 
 
 
347 aa  100  4e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0946447  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2333  ISRSO6-transposase ORFA protein  30.77 
 
 
347 aa  100  4e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.764175  normal  0.115531 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0451  ISRSO6-transposase ORFA protein  30.77 
 
 
347 aa  100  4e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.886933  normal  0.322563 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1009  integrase catalytic subunit  27.67 
 
 
412 aa  99.4  9e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00535974  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1319  integrase catalytic subunit  27.67 
 
 
412 aa  99.4  9e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2854  integrase catalytic subunit  27.67 
 
 
412 aa  99.4  9e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.230802  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0020  hypothetical protein  31.71 
 
 
348 aa  99.4  1e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1563  hypothetical protein  31.71 
 
 
340 aa  99.4  1e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2909  ISGsu6, transposase OrfA  31.36 
 
 
342 aa  99  1e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.29922  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3407  ISGsu6, transposase OrfA  31.36 
 
 
342 aa  99  1e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>