More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_03420 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013165  Shel_03420  transposase  100 
 
 
405 aa  834    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.869961  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0130  Integrase catalytic region  37.09 
 
 
400 aa  244  9.999999999999999e-64  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0258  Integrase catalytic region  37.09 
 
 
400 aa  244  9.999999999999999e-64  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2087  Integrase catalytic region  37.09 
 
 
400 aa  244  9.999999999999999e-64  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.347453  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2293  Integrase catalytic region  37.09 
 
 
400 aa  244  9.999999999999999e-64  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1845  Transposase and inactivated derivatives-like protein  39.6 
 
 
278 aa  181  2.9999999999999997e-44  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1047  integrase catalytic subunit  29.66 
 
 
403 aa  171  3e-41  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1257  IstB ATP binding domain-containing protein  37.67 
 
 
401 aa  155  8e-37  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.679289  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1361  integrase catalytic subunit  29.56 
 
 
409 aa  153  5.9999999999999996e-36  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0210  transposase, IS21 family  26.88 
 
 
417 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000847159 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0012  putative transposase  32.71 
 
 
416 aa  104  3e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.116272 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0099  putative transposase  32.71 
 
 
435 aa  104  3e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.431039 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0136  integrase catalytic subunit  27.44 
 
 
434 aa  97.8  3e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0324788  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2833  integrase catalytic subunit  27.44 
 
 
434 aa  97.8  3e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4913  integrase catalytic subunit  29.28 
 
 
428 aa  94.7  3e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.279769 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1847  integrase catalytic region  28.77 
 
 
429 aa  94  4e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.154194 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5624  integrase catalytic region  28.77 
 
 
429 aa  94  4e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.205652  normal  0.723097 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1706  integrase catalytic region  28.77 
 
 
429 aa  94  4e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1563  hypothetical protein  27.84 
 
 
340 aa  92.8  8e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0020  hypothetical protein  27.84 
 
 
348 aa  92.8  9e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2884  hypothetical protein  27.84 
 
 
348 aa  92.8  9e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1628  transposase  31.25 
 
 
491 aa  90.9  4e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1441  transposase  31.25 
 
 
491 aa  90.9  4e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.31725  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1305  transposase  31.25 
 
 
491 aa  90.5  5e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3336  insertion sequence transposase  31.25 
 
 
491 aa  90.5  5e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1939  transposase  31.25 
 
 
491 aa  90.5  5e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0012517  normal  0.673499 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2877  transposase  31.25 
 
 
491 aa  90.5  5e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3393  transposase  31.25 
 
 
491 aa  90.5  5e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.39722  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4054  transposase  31.25 
 
 
491 aa  90.5  5e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1238  transposase  31.25 
 
 
491 aa  90.5  5e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00126413 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0036  transposase  31.25 
 
 
491 aa  90.5  5e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0098  IS21 family transposase  31.25 
 
 
491 aa  90.5  5e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  5.2973499999999993e-20  hitchhiker  2.05788e-63 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3532  transposase  31.25 
 
 
491 aa  90.5  5e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.447396  normal  0.0612525 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1294  insertion sequence transposase  31.67 
 
 
340 aa  90.1  6e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0689  insertion sequence transposase  31.67 
 
 
340 aa  90.1  6e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0634  insertion sequence transposase  31.67 
 
 
340 aa  90.1  6e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0933756  normal  0.145557 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0888  insertion sequence transposase  31.67 
 
 
340 aa  90.1  6e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0176798  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0530  insertion sequence transposase  31.67 
 
 
340 aa  90.1  6e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000118737  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2025  insertion sequence transposase  31.67 
 
 
340 aa  90.1  6e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2171  insertion sequence transposase  31.67 
 
 
340 aa  90.1  6e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0335942 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2527  insertion sequence transposase  31.67 
 
 
340 aa  90.1  6e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2797  insertion sequence transposase  31.67 
 
 
340 aa  90.1  6e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000133045  normal  0.199341 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3154  insertion sequence transposase  31.67 
 
 
340 aa  90.1  6e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3487  insertion sequence transposase  31.67 
 
 
340 aa  90.1  6e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.169046 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3444  insertion sequence transposase  31.67 
 
 
340 aa  90.1  6e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1904  insertion sequence transposase  31.67 
 
 
340 aa  90.1  6e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00789725 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2088  insertion sequence transposase  31.67 
 
 
340 aa  90.1  6e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.207066 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2392  insertion sequence transposase  31.67 
 
 
340 aa  90.1  6e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.392902  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2155  insertion sequence transposase  31.67 
 
 
340 aa  90.1  6e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0564082  normal  0.0481856 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2677  insertion sequence transposase  31.67 
 
 
340 aa  90.1  6e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.585168  normal  0.0366075 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2586  insertion sequence transposase  31.67 
 
 
340 aa  90.1  6e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00244507  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2905  insertion sequence transposase  31.67 
 
 
340 aa  90.1  6e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00121621  normal  0.994964 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3216  insertion sequence transposase  31.67 
 
 
340 aa  90.1  6e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000564447  normal  0.0522706 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2960  insertion sequence transposase  31.67 
 
 
340 aa  90.1  6e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00154243 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3280  insertion sequence transposase  31.67 
 
 
340 aa  90.1  6e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0112823 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3672  insertion sequence transposase  31.67 
 
 
340 aa  90.1  6e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000543988  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3800  insertion sequence transposase  31.67 
 
 
340 aa  90.1  6e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3951  insertion sequence transposase  31.67 
 
 
340 aa  90.1  6e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4125  insertion sequence transposase  31.67 
 
 
340 aa  90.1  6e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.44357  normal  0.500657 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0136  insertion sequence transposase  31.67 
 
 
340 aa  90.1  6e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0217084 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0077  insertion sequence transposase  31.67 
 
 
340 aa  90.1  6e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0029  IS21 family transposase  31.67 
 
 
340 aa  90.1  6e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1049  insertion sequence transposase  31.67 
 
 
340 aa  90.1  6e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0362189  normal  0.0286616 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0448  insertion sequence transposase  31.67 
 
 
340 aa  90.1  6e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.453908  hitchhiker  0.00000287146 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0314  insertion sequence transposase  31.67 
 
 
340 aa  90.1  6e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.415268  normal 
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0015  IS21 family transposase  31.67 
 
 
340 aa  90.1  6e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0001  IS21 family transposase  31.67 
 
 
340 aa  90.1  6e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000122483 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1865  Integrase catalytic region  27.37 
 
 
413 aa  89.7  8e-17  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3338  IS100, transposase  31.25 
 
 
340 aa  89.7  9e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0048  IS100 transposase orfA  31.25 
 
 
340 aa  88.6  2e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0020  transposase for insertion sequence  31.67 
 
 
340 aa  88.6  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1183  transposase  30.83 
 
 
489 aa  86.7  7e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000138357 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0376  Integrase catalytic region  30.72 
 
 
426 aa  86.7  8e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2305  Integrase catalytic region  30.72 
 
 
426 aa  86.7  8e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010373  M446_7013  hypothetical protein  29.97 
 
 
427 aa  86.3  9e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1464  integrase catalytic region  29.97 
 
 
427 aa  86.3  9e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1510  integrase catalytic region  29.97 
 
 
427 aa  86.3  9e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4700  integrase catalytic region  29.97 
 
 
427 aa  86.3  9e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.670986  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5534  integrase catalytic region  29.97 
 
 
427 aa  86.3  9e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6916  integrase catalytic region  29.97 
 
 
427 aa  86.3  9e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.803027  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2798  integrase catalytic region  29.97 
 
 
427 aa  86.3  9e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3888  integrase catalytic region  29.97 
 
 
427 aa  86.3  9e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2452  integrase catalytic region  29.97 
 
 
427 aa  86.3  9e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.227029 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3634  putative transposase  30.83 
 
 
338 aa  86.3  0.000000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0649  integrase catalytic subunit  26.55 
 
 
306 aa  82.4  0.00000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00201548 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3717  integrase catalytic subunit  25.2 
 
 
412 aa  82.8  0.00000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0786  Integrase catalytic region  28.45 
 
 
410 aa  82.4  0.00000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1009  integrase catalytic subunit  25.84 
 
 
412 aa  81.6  0.00000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00535974  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1319  integrase catalytic subunit  25.84 
 
 
412 aa  81.6  0.00000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2854  integrase catalytic subunit  25.84 
 
 
412 aa  81.6  0.00000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.230802  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0119  Integrase catalytic region  28.33 
 
 
449 aa  80.9  0.00000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1081  Integrase catalytic region  28.33 
 
 
449 aa  80.9  0.00000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.333924  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1326  Integrase catalytic region  28.57 
 
 
425 aa  80.5  0.00000000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2216  integrase catalytic subunit  27.94 
 
 
512 aa  80.1  0.00000000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1296  integrase catalytic subunit  27.94 
 
 
512 aa  80.1  0.00000000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.709062  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0026  integrase catalytic subunit  27.94 
 
 
512 aa  80.1  0.00000000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0290  integrase catalytic subunit  25.74 
 
 
495 aa  79.3  0.0000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.196451  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1791  putative transposase catalytic subunit  30.59 
 
 
507 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2756  integrase catalytic subunit  30.36 
 
 
517 aa  78.6  0.0000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0581  integrase catalytic subunit  30.36 
 
 
517 aa  78.6  0.0000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>