More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_1847 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_1706  integrase catalytic region  100 
 
 		 429 aa  865    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1847  integrase catalytic region  100 
 
 		 429 aa  865    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.154194 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5624  integrase catalytic region  100 
 
 		 429 aa  865    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.205652  normal  0.723097 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4913  integrase catalytic subunit  80.19 
 
 		 428 aa  683    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.279769 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0376  Integrase catalytic region  58.14 
 
 		 426 aa  466  9.999999999999999e-131  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2305  Integrase catalytic region  58.14 
 
 		 426 aa  466  9.999999999999999e-131  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0012  putative transposase  56.97 
 
 		 416 aa  462  1e-129  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.116272 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0099  putative transposase  56.67 
 
 		 435 aa  462  1e-129  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.431039 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0786  Integrase catalytic region  46.52 
 
 		 410 aa  306  4.0000000000000004e-82  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3058  Integrase catalytic region  46.41 
 
 		 425 aa  305  7e-82  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1512  Integrase catalytic region  46.41 
 
 		 425 aa  305  7e-82  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3693  Integrase catalytic region  46.41 
 
 		 425 aa  305  7e-82  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1326  Integrase catalytic region  45.32 
 
 		 425 aa  300  3e-80  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1081  Integrase catalytic region  41.42 
 
 		 449 aa  247  3e-64  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.333924  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0119  Integrase catalytic region  41.42 
 
 		 449 aa  247  3e-64  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0136  integrase catalytic subunit  37.14 
 
 		 434 aa  236  4e-61  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0324788  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2833  integrase catalytic subunit  37.14 
 
 		 434 aa  236  4e-61  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0019  ISPsy4, transposase  38.54 
 
 		 340 aa  172  6.999999999999999e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0055  ISPsy4, transposase  38.54 
 
 		 340 aa  172  6.999999999999999e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0194  ISPsy4, transposase  38.54 
 
 		 340 aa  172  6.999999999999999e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0292  ISPsy4, transposase  38.54 
 
 		 340 aa  172  6.999999999999999e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0833  ISPsy4, transposase  38.54 
 
 		 340 aa  172  6.999999999999999e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0865  ISPsy4, transposase  38.54 
 
 		 340 aa  172  6.999999999999999e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1095  ISPsy4, transposase  38.54 
 
 		 340 aa  172  6.999999999999999e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.189576  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1659  ISPsy4, transposase  38.54 
 
 		 340 aa  172  6.999999999999999e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2321  ISPsy4, transposase  38.54 
 
 		 340 aa  172  6.999999999999999e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.000712156  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2387  ISPsy4, transposase  38.54 
 
 		 340 aa  172  6.999999999999999e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.010584  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2740  ISPsy4, transposase  38.54 
 
 		 340 aa  172  6.999999999999999e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3013  ISPsy4, transposase  38.54 
 
 		 340 aa  172  6.999999999999999e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0378398  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3224  ISPsy4, transposase  38.54 
 
 		 340 aa  172  6.999999999999999e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.038075  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3433  ISPsy4, transposase  38.54 
 
 		 340 aa  172  6.999999999999999e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.45779  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3608  ISPsy4, transposase  38.54 
 
 		 340 aa  172  6.999999999999999e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.656873  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4013  ISPsy4, transposase  38.54 
 
 		 340 aa  172  6.999999999999999e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4269  ISPsy4, transposase  38.54 
 
 		 340 aa  172  6.999999999999999e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4625  ISPsy4, transposase  38.54 
 
 		 340 aa  172  6.999999999999999e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.146787  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4730  ISPsy4, transposase  38.54 
 
 		 340 aa  172  6.999999999999999e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4769  ISPsy4, transposase  38.54 
 
 		 340 aa  172  6.999999999999999e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5575  ISPsy4, transposase  38.54 
 
 		 340 aa  172  6.999999999999999e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004632  PSPTO_B0040  ISPsy4, transposase  38.54 
 
 		 340 aa  172  6.999999999999999e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.348986  n/a   
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0013  ISPsy4, transposase  38.54 
 
 		 340 aa  172  6.999999999999999e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.292398  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0210  transposase, IS21 family  29.64 
 
 		 417 aa  171  2e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000847159 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1554  Integrase catalytic region  30.62 
 
 		 413 aa  165  2.0000000000000002e-39  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0019  IS21 family transposase  34.71 
 
 		 390 aa  163  6e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0506229  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3370  IS21 family transposase  34.71 
 
 		 390 aa  163  6e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2228  IS21 family transposase  34.71 
 
 		 390 aa  163  6e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.503141  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0994  IS21 family transposase  34.71 
 
 		 390 aa  163  6e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0036  IS21 family transposase  34.44 
 
 		 390 aa  162  1e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2921  IS21 family transposase  34.44 
 
 		 390 aa  162  1e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3341  IS21 family transposase  34.44 
 
 		 390 aa  162  1e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009788  EcE24377A_D0043  IS21 family transposase  34.44 
 
 		 390 aa  162  1e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.920387  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1457  integrase  34.15 
 
 		 410 aa  160  3e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3888  integrase catalytic region  32.53 
 
 		 427 aa  158  2e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2452  integrase catalytic region  32.53 
 
 		 427 aa  158  2e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.227029 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2798  integrase catalytic region  32.53 
 
 		 427 aa  158  2e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4700  integrase catalytic region  32.53 
 
 		 427 aa  158  2e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.670986  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5534  integrase catalytic region  32.53 
 
 		 427 aa  158  2e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6916  integrase catalytic region  32.53 
 
 		 427 aa  158  2e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.803027  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3144  IS2 transposase orfA  33.97 
 
 		 390 aa  158  2e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010373  M446_7013  hypothetical protein  32.53 
 
 		 427 aa  158  2e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1510  integrase catalytic region  32.53 
 
 		 427 aa  158  2e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1464  integrase catalytic region  32.53 
 
 		 427 aa  158  2e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5106  integrase catalytic subunit  35.96 
 
 		 431 aa  149  8e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.214322  normal  0.182706 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1183  transposase  33.98 
 
 		 489 aa  149  8e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000138357 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3634  putative transposase  33.99 
 
 		 338 aa  149  1.0000000000000001e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2538  integrase catalytic subunit  35.69 
 
 		 424 aa  147  4.0000000000000006e-34  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.178355  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1441  transposase  33.76 
 
 		 491 aa  146  9e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.31725  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1628  transposase  33.76 
 
 		 491 aa  146  9e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1305  transposase  33.76 
 
 		 491 aa  145  1e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1939  transposase  33.76 
 
 		 491 aa  145  1e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0012517  normal  0.673499 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2877  transposase  33.76 
 
 		 491 aa  145  1e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0290  integrase catalytic subunit  35.21 
 
 		 495 aa  145  1e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.196451  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4054  transposase  33.76 
 
 		 491 aa  145  1e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1238  transposase  33.76 
 
 		 491 aa  145  1e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00126413 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3336  insertion sequence transposase  33.76 
 
 		 491 aa  145  1e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0036  transposase  33.76 
 
 		 491 aa  145  1e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3393  transposase  33.76 
 
 		 491 aa  145  1e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.39722  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3532  transposase  33.76 
 
 		 491 aa  145  1e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.447396  normal  0.0612525 
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0098  IS21 family transposase  33.76 
 
 		 491 aa  145  1e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  5.2973499999999993e-20  hitchhiker  2.05788e-63 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2392  insertion sequence transposase  33.77 
 
 		 340 aa  144  2e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.392902  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1294  insertion sequence transposase  33.77 
 
 		 340 aa  144  2e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2960  insertion sequence transposase  33.77 
 
 		 340 aa  144  2e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00154243 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3444  insertion sequence transposase  33.77 
 
 		 340 aa  144  2e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3487  insertion sequence transposase  33.77 
 
 		 340 aa  144  2e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.169046 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0662  integrase catalytic subunit  35.21 
 
 		 495 aa  144  2e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0102982  hitchhiker  0.000000317754 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2239  integrase catalytic subunit  35.21 
 
 		 495 aa  144  2e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0237102 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2088  insertion sequence transposase  33.77 
 
 		 340 aa  144  2e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.207066 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0530  insertion sequence transposase  33.77 
 
 		 340 aa  144  2e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000118737  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0448  insertion sequence transposase  33.77 
 
 		 340 aa  144  2e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.453908  hitchhiker  0.00000287146 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0689  insertion sequence transposase  33.77 
 
 		 340 aa  144  2e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0634  insertion sequence transposase  33.77 
 
 		 340 aa  144  2e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0933756  normal  0.145557 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0314  insertion sequence transposase  33.77 
 
 		 340 aa  144  2e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.415268  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1904  insertion sequence transposase  33.77 
 
 		 340 aa  144  2e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00789725 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1049  insertion sequence transposase  33.77 
 
 		 340 aa  144  2e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0362189  normal  0.0286616 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0136  insertion sequence transposase  33.77 
 
 		 340 aa  144  2e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0217084 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3800  insertion sequence transposase  33.77 
 
 		 340 aa  144  2e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3672  insertion sequence transposase  33.77 
 
 		 340 aa  144  2e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000543988  normal  1 
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0001  IS21 family transposase  33.77 
 
 		 340 aa  144  2e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000122483 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2025  insertion sequence transposase  33.77 
 
 		 340 aa  144  2e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0015  IS21 family transposase  33.77 
 
 		 340 aa  144  2e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3338  IS100, transposase  33.77 
 
 		 340 aa  144  2e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>