More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpAngola_B0097 on replicon NC_010157
Organism: Yersinia pestis Angola



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010157  YpAngola_B0097  integrase core subunit  100 
 
 		 300 aa  627  1e-179  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.368489 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3144  IS2 transposase orfA  93.33 
 
 		 390 aa  565  1e-160  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3341  IS21 family transposase  92.67 
 
 		 390 aa  561  1.0000000000000001e-159  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3370  IS21 family transposase  92.33 
 
 		 390 aa  561  1.0000000000000001e-159  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0019  IS21 family transposase  92.33 
 
 		 390 aa  561  1.0000000000000001e-159  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0506229  n/a   
 
 
-
 
NC_009788  EcE24377A_D0043  IS21 family transposase  92.67 
 
 		 390 aa  561  1.0000000000000001e-159  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.920387  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2228  IS21 family transposase  92.33 
 
 		 390 aa  561  1.0000000000000001e-159  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.503141  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0994  IS21 family transposase  92.33 
 
 		 390 aa  561  1.0000000000000001e-159  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0036  IS21 family transposase  92.67 
 
 		 390 aa  561  1.0000000000000001e-159  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2921  IS21 family transposase  92.67 
 
 		 390 aa  561  1.0000000000000001e-159  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0141  putative transposase  84.48 
 
 		 371 aa  201  9.999999999999999e-51  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1847  integrase catalytic region  37.74 
 
 		 429 aa  158  9e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.154194 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1706  integrase catalytic region  37.74 
 
 		 429 aa  158  9e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5624  integrase catalytic region  37.74 
 
 		 429 aa  158  9e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.205652  normal  0.723097 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0136  integrase catalytic subunit  32.77 
 
 		 434 aa  147  2.0000000000000003e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0324788  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2833  integrase catalytic subunit  32.77 
 
 		 434 aa  147  2.0000000000000003e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0210  transposase, IS21 family  32.97 
 
 		 417 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000847159 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3717  integrase catalytic subunit  37.3 
 
 		 412 aa  145  7.0000000000000006e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4913  integrase catalytic subunit  36.88 
 
 		 428 aa  145  8.000000000000001e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.279769 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1009  integrase catalytic subunit  37.7 
 
 		 412 aa  145  1e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00535974  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1319  integrase catalytic subunit  37.7 
 
 		 412 aa  145  1e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2854  integrase catalytic subunit  37.7 
 
 		 412 aa  145  1e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.230802  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0012  putative transposase  37.08 
 
 		 416 aa  142  9e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.116272 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2305  Integrase catalytic region  34.54 
 
 		 426 aa  141  9.999999999999999e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0376  Integrase catalytic region  34.54 
 
 		 426 aa  141  9.999999999999999e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0099  putative transposase  37.08 
 
 		 435 aa  142  9.999999999999999e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.431039 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1554  Integrase catalytic region  32.06 
 
 		 413 aa  140  1.9999999999999998e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1081  Integrase catalytic region  35.76 
 
 		 449 aa  140  3e-32  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.333924  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0119  Integrase catalytic region  35.76 
 
 		 449 aa  140  3e-32  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1326  Integrase catalytic region  35.23 
 
 		 425 aa  140  3e-32  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0786  Integrase catalytic region  34.16 
 
 		 410 aa  137  2e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2798  integrase catalytic region  35.08 
 
 		 427 aa  136  4e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2452  integrase catalytic region  35.08 
 
 		 427 aa  136  4e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.227029 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1464  integrase catalytic region  35.08 
 
 		 427 aa  136  4e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1510  integrase catalytic region  35.08 
 
 		 427 aa  136  4e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3888  integrase catalytic region  35.08 
 
 		 427 aa  136  4e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1512  Integrase catalytic region  34.88 
 
 		 425 aa  136  4e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4700  integrase catalytic region  35.08 
 
 		 427 aa  136  4e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.670986  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3058  Integrase catalytic region  34.88 
 
 		 425 aa  136  4e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5534  integrase catalytic region  35.08 
 
 		 427 aa  136  4e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3693  Integrase catalytic region  34.88 
 
 		 425 aa  136  4e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6916  integrase catalytic region  35.08 
 
 		 427 aa  136  4e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.803027  normal  1 
 
 
-
 
NC_010373  M446_7013  hypothetical protein  35.08 
 
 		 427 aa  136  4e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1457  integrase  36.02 
 
 		 410 aa  127  2.0000000000000002e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1865  Integrase catalytic region  31.38 
 
 		 413 aa  118  9.999999999999999e-26  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2884  Integrase catalytic region  32.22 
 
 		 503 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.53685e-20 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4066  Integrase catalytic region  32.22 
 
 		 503 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2412  Integrase catalytic region  32.22 
 
 		 503 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.305963 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5106  integrase catalytic subunit  36.64 
 
 		 431 aa  115  1.0000000000000001e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.214322  normal  0.182706 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2538  integrase catalytic subunit  32.66 
 
 		 424 aa  114  2.0000000000000002e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.178355  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0247  ISRSO6-transposase ORFA protein  37.56 
 
 		 347 aa  110  2.0000000000000002e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0946447  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2333  ISRSO6-transposase ORFA protein  37.56 
 
 		 347 aa  110  2.0000000000000002e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.764175  normal  0.115531 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0451  ISRSO6-transposase ORFA protein  37.56 
 
 		 347 aa  110  2.0000000000000002e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.886933  normal  0.322563 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0952  ISRSO3-transposase ORFA protein  37.56 
 
 		 354 aa  111  2.0000000000000002e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.273706  normal  0.107434 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7663  integrase catalytic region  35.44 
 
 		 348 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2909  ISGsu6, transposase OrfA  36.2 
 
 		 342 aa  108  8.000000000000001e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.29922  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3407  ISGsu6, transposase OrfA  36.2 
 
 		 342 aa  108  8.000000000000001e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0199  Integrase catalytic region  30.94 
 
 		 512 aa  108  1e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0240231 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0321  integrase catalytic subunit  37.44 
 
 		 341 aa  108  1e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0105931 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1118  integrase catalytic subunit  37.44 
 
 		 341 aa  108  1e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1789  integrase catalytic subunit  37.44 
 
 		 341 aa  108  1e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2272  integrase catalytic subunit  37.44 
 
 		 341 aa  108  1e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0220216  hitchhiker  0.000461104 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2539  integrase catalytic subunit  37.44 
 
 		 341 aa  108  1e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00047026  hitchhiker  0.00000000018385 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2586  integrase catalytic subunit  37.44 
 
 		 341 aa  108  1e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0248633  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2797  integrase catalytic subunit  37.44 
 
 		 341 aa  108  1e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3282  integrase catalytic subunit  37.44 
 
 		 341 aa  108  1e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.590315  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6529  Integrase catalytic region  30.94 
 
 		 512 aa  108  1e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.277485  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0356  integrase catalytic region  35.85 
 
 		 347 aa  108  1e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2875  integrase catalytic subunit  34.78 
 
 		 506 aa  108  1e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00853486  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1589  Integrase catalytic region  32.16 
 
 		 502 aa  107  2e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0943  Integrase catalytic region  32.55 
 
 		 502 aa  107  2e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.346378  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1063  Integrase catalytic region  32.16 
 
 		 502 aa  106  4e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.877216  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31560  Transposase  35.89 
 
 		 341 aa  106  4e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4855  Integrase catalytic region  32.16 
 
 		 502 aa  106  5e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000769666 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09530  integrase  35.89 
 
 		 341 aa  106  5e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4858  Integrase catalytic region  32.16 
 
 		 502 aa  106  5e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0252827  normal  0.0109178 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6478  Integrase catalytic region  32.16 
 
 		 507 aa  106  5e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1072  Integrase catalytic region  32.16 
 
 		 502 aa  106  5e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2874  Integrase catalytic region  32.16 
 
 		 502 aa  106  5e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49630  helix-turn-helix, Fis-type  36.87 
 
 		 341 aa  106  6e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.840005  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2939  Integrase catalytic region  32.16 
 
 		 502 aa  106  6e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.620801  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1052  Integrase catalytic region  32.16 
 
 		 502 aa  106  6e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.437105  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36480  transposase, helix-turn-helix, Fis-type  36.87 
 
 		 341 aa  106  6e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1264  integrase catalytic subunit  34.11 
 
 		 336 aa  106  6e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0642781  normal  0.0493016 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0317  transposase, IS21 family  29.89 
 
 		 496 aa  105  9e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0223423  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1227  Integrase catalytic region  31.78 
 
 		 497 aa  104  2e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9835  transposase  30.37 
 
 		 517 aa  104  2e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3561  IstB ATP binding domain-containing protein  35.38 
 
 		 272 aa  104  2e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1832  integrase catalytic subunit  34.6 
 
 		 272 aa  103  3e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0290  integrase catalytic subunit  31.82 
 
 		 495 aa  102  6e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.196451  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0046  ISGsu6, transposase OrfA  35.38 
 
 		 341 aa  102  8e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.688016  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2593  ISGsu6, transposase OrfA  35.38 
 
 		 341 aa  102  8e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.243982  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0648  Integrase catalytic region  31.58 
 
 		 488 aa  102  8e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.509934 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3159  transposase, IS21 family  29.52 
 
 		 496 aa  102  9e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2090  transposase, IS21 family  29.52 
 
 		 496 aa  102  9e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4040  hypothetical protein  29.52 
 
 		 496 aa  102  9e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3634  putative transposase  34.5 
 
 		 338 aa  102  1e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1047  integrase catalytic subunit  31.73 
 
 		 403 aa  101  1e-20  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2171  insertion sequence transposase  33.33 
 
 		 340 aa  100  2e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0335942 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3487  insertion sequence transposase  33.33 
 
 		 340 aa  100  2e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.169046 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>