71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SbBS512_A0141 on replicon NC_010660
Organism: Shigella boydii CDC 3083-94



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010660  SbBS512_A0141  putative transposase  100 
 
 		 371 aa  763    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2228  IS21 family transposase  88.89 
 
 		 390 aa  214  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.503141  n/a   
 
 
-
 
NC_009788  EcE24377A_D0043  IS21 family transposase  88.89 
 
 		 390 aa  214  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.920387  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0019  IS21 family transposase  88.89 
 
 		 390 aa  214  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0506229  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0036  IS21 family transposase  88.89 
 
 		 390 aa  214  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0994  IS21 family transposase  88.89 
 
 		 390 aa  214  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2921  IS21 family transposase  88.89 
 
 		 390 aa  214  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3341  IS21 family transposase  88.89 
 
 		 390 aa  214  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3370  IS21 family transposase  88.89 
 
 		 390 aa  214  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0097  integrase core subunit  84.48 
 
 		 300 aa  202  9e-51  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.368489 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3144  IS2 transposase orfA  78.63 
 
 		 390 aa  194  3e-48  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02340  hypothetical protein  33.21 
 
 		 407 aa  129  9.000000000000001e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03113  hypothetical protein  32.84 
 
 		 459 aa  129  1.0000000000000001e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02188  hypothetical protein  32.84 
 
 		 459 aa  129  1.0000000000000001e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00950  hypothetical protein  32.84 
 
 		 459 aa  129  1.0000000000000001e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03586  hypothetical protein  32.84 
 
 		 459 aa  129  1.0000000000000001e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06152  hypothetical protein  32.84 
 
 		 459 aa  129  1.0000000000000001e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06289  hypothetical protein  32.84 
 
 		 459 aa  129  1.0000000000000001e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06704  hypothetical protein  32.84 
 
 		 459 aa  129  1.0000000000000001e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06260  hypothetical protein  32.84 
 
 		 459 aa  129  1.0000000000000001e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06773  hypothetical protein  32.84 
 
 		 459 aa  129  1.0000000000000001e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06945  hypothetical protein  32.84 
 
 		 459 aa  129  1.0000000000000001e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05721  hypothetical protein  32.84 
 
 		 459 aa  128  2.0000000000000002e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05657  hypothetical protein  32.84 
 
 		 459 aa  128  2.0000000000000002e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05509  hypothetical protein  32.84 
 
 		 459 aa  128  2.0000000000000002e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00115  transposase  32.84 
 
 		 459 aa  128  2.0000000000000002e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00293  hypothetical protein  32.84 
 
 		 459 aa  128  2.0000000000000002e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03267  hypothetical protein  32.84 
 
 		 459 aa  128  2.0000000000000002e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01127  hypothetical protein  32.84 
 
 		 459 aa  128  2.0000000000000002e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03172  hypothetical protein  32.84 
 
 		 459 aa  128  2.0000000000000002e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02919  hypothetical protein  32.84 
 
 		 459 aa  127  3e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02282  hypothetical protein  33.21 
 
 		 459 aa  127  4.0000000000000003e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03190  hypothetical protein  32.95 
 
 		 448 aa  125  8.000000000000001e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03704  hypothetical protein  32.84 
 
 		 316 aa  125  8.000000000000001e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03176  hypothetical protein  32.93 
 
 		 391 aa  113  4.0000000000000004e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02641  hypothetical protein  32.14 
 
 		 406 aa  109  7.000000000000001e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04959  hypothetical protein  31.75 
 
 		 403 aa  108  1e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1424  hypothetical protein  28.04 
 
 		 472 aa  93.2  6e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0184  hypothetical protein  28.94 
 
 		 472 aa  92.8  9e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2032  hypothetical protein  28.94 
 
 		 472 aa  92.8  9e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0195  hypothetical protein  28.94 
 
 		 472 aa  92.8  9e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1893  hypothetical protein  29.2 
 
 		 472 aa  89.4  9e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0064  hypothetical protein  29.2 
 
 		 472 aa  89.4  9e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01865  hypothetical protein  30.67 
 
 		 379 aa  87.4  3e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05272  hypothetical protein  33.77 
 
 		 243 aa  86.7  7e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00497  hypothetical protein  33.77 
 
 		 194 aa  85.1  0.000000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00457  hypothetical protein  33.77 
 
 		 194 aa  85.1  0.000000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00498  hypothetical protein  38.54 
 
 		 259 aa  57  0.0000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00456  hypothetical protein  38.54 
 
 		 259 aa  57  0.0000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0706  integrase catalytic region  33.04 
 
 		 528 aa  50.8  0.00004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.00978905  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01862  hypothetical protein  47.5 
 
 		 89 aa  47  0.0005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6127  putative transposase  32.41 
 
 		 237 aa  46.2  0.0008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.682044  normal  0.765968 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0210  transposase, IS21 family  28.87 
 
 		 417 aa  45.8  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000847159 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5194  integrase catalytic subunit  33.33 
 
 		 525 aa  46.2  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.471073 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3122  hypothetical protein  31.43 
 
 		 316 aa  43.9  0.004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014159  Tpau_4272  Integrase catalytic region  34.04 
 
 		 510 aa  43.5  0.005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1429  integrase catalytic subunit  29.2 
 
 		 524 aa  43.5  0.005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.398273  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1482  integrase catalytic subunit  29.2 
 
 		 524 aa  43.5  0.005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1925  integrase catalytic subunit  29.2 
 
 		 524 aa  43.5  0.005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.683538  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2241  integrase catalytic subunit  29.2 
 
 		 524 aa  43.5  0.005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4290  integrase catalytic subunit  33.65 
 
 		 512 aa  43.5  0.006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.559076  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4396  integrase catalytic subunit  33.65 
 
 		 512 aa  43.5  0.006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.624598  normal  0.336917 
 
 
-
 
NC_008761  Pnap_4788  integrase catalytic subunit  33.65 
 
 		 512 aa  43.5  0.006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5624  integrase catalytic region  35.42 
 
 		 429 aa  43.5  0.006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.205652  normal  0.723097 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1706  integrase catalytic region  35.42 
 
 		 429 aa  43.5  0.006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9835  transposase  30.36 
 
 		 517 aa  43.5  0.006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1847  integrase catalytic region  35.42 
 
 		 429 aa  43.5  0.006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.154194 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0303  integrase catalytic subunit  31.43 
 
 		 519 aa  43.5  0.007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2132  integrase catalytic subunit  31.43 
 
 		 519 aa  43.5  0.007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3016  integrase catalytic subunit  31.43 
 
 		 519 aa  43.5  0.007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2217  integrase catalytic subunit  27.78 
 
 		 302 aa  43.1  0.008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000287605 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>