187 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_3122 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009253  Dred_0303  integrase catalytic subunit  100 
 
 		 519 aa  656    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2132  integrase catalytic subunit  100 
 
 		 519 aa  656    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3016  integrase catalytic subunit  100 
 
 		 519 aa  656    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3122  hypothetical protein  100 
 
 		 316 aa  657    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2217  integrase catalytic subunit  57.04 
 
 		 302 aa  328  6e-89  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000287605 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0735  hypothetical protein  50.87 
 
 		 289 aa  305  5.0000000000000004e-82  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4128  integrase catalytic subunit  41.61 
 
 		 513 aa  258  1e-67  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0988  integrase catalytic subunit  41.61 
 
 		 513 aa  258  1e-67  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1299  integrase catalytic subunit  41.61 
 
 		 513 aa  258  1e-67  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2660  integrase catalytic subunit  41.61 
 
 		 513 aa  258  1e-67  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.549324  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3187  integrase catalytic subunit  41.61 
 
 		 513 aa  258  1e-67  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3708  integrase catalytic subunit  41.61 
 
 		 513 aa  258  1e-67  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0892  integrase catalytic subunit  41.61 
 
 		 513 aa  257  2e-67  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1075  integrase catalytic subunit  41.61 
 
 		 475 aa  257  2e-67  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1224  integrase catalytic subunit  41.61 
 
 		 513 aa  256  4e-67  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3740  putative transposase  40 
 
 		 512 aa  246  4.9999999999999997e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2841  ISPsy14, transposase  40 
 
 		 504 aa  244  9.999999999999999e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0126762  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1938  integrase catalytic subunit  39.68 
 
 		 512 aa  244  9.999999999999999e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.441696  normal  0.123274 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9835  transposase  40.26 
 
 		 517 aa  241  1e-62  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4290  integrase catalytic subunit  38.71 
 
 		 512 aa  236  5.0000000000000005e-61  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.559076  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4396  integrase catalytic subunit  38.71 
 
 		 512 aa  236  5.0000000000000005e-61  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.624598  normal  0.336917 
 
 
-
 
NC_008761  Pnap_4788  integrase catalytic subunit  38.71 
 
 		 512 aa  236  5.0000000000000005e-61  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3716  Integrase catalytic region  41.99 
 
 		 523 aa  234  1.0000000000000001e-60  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  normal  0.124306 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0706  integrase catalytic region  40.13 
 
 		 528 aa  233  4.0000000000000004e-60  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.00978905  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2289  integrase catalytic region  40.43 
 
 		 516 aa  232  5e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4798  integrase catalytic region  40.43 
 
 		 516 aa  232  5e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.288871  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0410  integrase catalytic subunit  40.76 
 
 		 514 aa  230  3e-59  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0752835  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0598  integrase catalytic subunit  40.76 
 
 		 514 aa  230  3e-59  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1852  integrase catalytic subunit  40.76 
 
 		 514 aa  230  3e-59  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.687265  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2396  integrase catalytic subunit  40.76 
 
 		 514 aa  230  3e-59  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.483197  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3180  integrase catalytic subunit  40.76 
 
 		 514 aa  230  3e-59  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.150597  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0193  integrase catalytic subunit  42.05 
 
 		 514 aa  228  1e-58  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1628  integrase catalytic subunit  42.05 
 
 		 514 aa  228  1e-58  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1855  integrase catalytic subunit  36.13 
 
 		 507 aa  228  1e-58  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0997  integrase catalytic subunit  39.81 
 
 		 514 aa  226  4e-58  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2256  integrase catalytic subunit  39.81 
 
 		 514 aa  226  5.0000000000000005e-58  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4229  integrase catalytic subunit  41.7 
 
 		 514 aa  224  1e-57  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1795  putative transposase  39.36 
 
 		 517 aa  223  2e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.765121  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3594  integrase catalytic subunit  35.81 
 
 		 514 aa  223  3e-57  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6260  integrase catalytic subunit  38.3 
 
 		 517 aa  223  4.9999999999999996e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.441371  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2982  integrase catalytic subunit  41.7 
 
 		 514 aa  223  4.9999999999999996e-57  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00424027  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1250  integrase catalytic subunit  37.81 
 
 		 513 aa  222  6e-57  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1328  integrase catalytic subunit  38.28 
 
 		 513 aa  222  7e-57  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1038  integrase catalytic region  35.16 
 
 		 488 aa  220  1.9999999999999999e-56  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1554  integrase catalytic subunit  40.57 
 
 		 519 aa  216  4e-55  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2053  integrase catalytic subunit  40.57 
 
 		 519 aa  216  4e-55  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3414  integrase catalytic subunit  40.57 
 
 		 519 aa  216  4e-55  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.604761  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5628  integrase catalytic region  36.66 
 
 		 518 aa  216  4e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4730  integrase catalytic region  36.66 
 
 		 518 aa  216  4e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6206  integrase catalytic region  36.66 
 
 		 518 aa  216  4e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0134  Integrase catalytic region  37.66 
 
 		 507 aa  214  9.999999999999999e-55  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.53025 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4696  integrase catalytic subunit  35.16 
 
 		 505 aa  214  9.999999999999999e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.569862 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1363  Integrase catalytic region  37.66 
 
 		 507 aa  214  9.999999999999999e-55  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1811  integrase catalytic subunit  39.16 
 
 		 510 aa  214  1.9999999999999998e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.14945  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1463  transposase  39.55 
 
 		 487 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4138  integrase catalytic subunit  37.15 
 
 		 513 aa  212  5.999999999999999e-54  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009471  Acry_3593  integrase catalytic subunit  37.42 
 
 		 513 aa  209  5e-53  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  normal  0.454266 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3788  Integrase catalytic region  38.26 
 
 		 513 aa  203  3e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0608543 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6473  Integrase catalytic region  38.26 
 
 		 513 aa  203  3e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6163  Integrase catalytic region  38.26 
 
 		 513 aa  203  3e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4234  Integrase catalytic region  38.26 
 
 		 513 aa  203  3e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.115769  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5580  Integrase catalytic region  38.26 
 
 		 513 aa  203  3e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2788  Integrase catalytic region  38.26 
 
 		 513 aa  203  3e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.952319  normal  0.0224954 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2963  Integrase catalytic region  38.26 
 
 		 513 aa  203  3e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2154  Integrase catalytic region  38.26 
 
 		 513 aa  203  3e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.944811  normal  0.172855 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6805  Integrase catalytic region  38.26 
 
 		 513 aa  203  3e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2120  Integrase catalytic region  38.26 
 
 		 513 aa  203  3e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0442814  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3694  Integrase catalytic region  38.26 
 
 		 513 aa  203  3e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00066117  hitchhiker  0.00045424 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4851  Integrase catalytic region  38.26 
 
 		 513 aa  203  3e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.242832  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0850  Integrase catalytic region  38.26 
 
 		 513 aa  203  3e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3293  Integrase catalytic region  38.26 
 
 		 513 aa  203  3e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.823799  normal  0.964616 
 
 
-
 
NC_013733  Slin_6980  Integrase catalytic region  38.26 
 
 		 513 aa  203  3e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3092  Integrase catalytic region  38.26 
 
 		 513 aa  203  3e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.30832  normal  0.801547 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4302  Integrase catalytic region  38.26 
 
 		 513 aa  203  3e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00408602 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5321  Integrase catalytic region  38.26 
 
 		 513 aa  203  3e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.354079 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3399  integrase catalytic subunit  37.79 
 
 		 515 aa  202  6e-51  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.976382  n/a   
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3485  integrase catalytic subunit  37.79 
 
 		 515 aa  202  6e-51  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.522877  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0283  integrase catalytic subunit  37.79 
 
 		 515 aa  202  6e-51  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.188339  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2303  integrase catalytic subunit  37.79 
 
 		 515 aa  202  6e-51  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.268136  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5654  Integrase catalytic region  38.54 
 
 		 512 aa  201  9.999999999999999e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5194  integrase catalytic subunit  33.44 
 
 		 525 aa  199  3.9999999999999996e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.471073 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2548  integrase catalytic subunit  36.33 
 
 		 518 aa  195  1e-48  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0559  integrase catalytic subunit  38.31 
 
 		 517 aa  195  1e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00182  transposase  36.3 
 
 		 510 aa  192  6e-48  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01935  hypothetical protein  36.3 
 
 		 510 aa  192  6e-48  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06058  hypothetical protein  36.3 
 
 		 510 aa  192  6e-48  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06964  hypothetical protein  36.3 
 
 		 510 aa  192  6e-48  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5452  integrase catalytic region  43.32 
 
 		 458 aa  178  9e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.681559  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0037  Integrase catalytic region  33.22 
 
 		 515 aa  168  8e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1596  Integrase catalytic region  37.06 
 
 		 512 aa  165  9e-40  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.151594  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1830  transposase subunit  32.41 
 
 		 526 aa  165  1.0000000000000001e-39  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.733482  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1429  integrase catalytic subunit  33.33 
 
 		 524 aa  164  2.0000000000000002e-39  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.398273  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1482  integrase catalytic subunit  33.33 
 
 		 524 aa  164  2.0000000000000002e-39  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1925  integrase catalytic subunit  33.33 
 
 		 524 aa  164  2.0000000000000002e-39  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.683538  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2241  integrase catalytic subunit  33.33 
 
 		 524 aa  164  2.0000000000000002e-39  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5850  Integrase catalytic region  33.44 
 
 		 513 aa  164  2.0000000000000002e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0612  integrase catalytic subunit  43.09 
 
 		 472 aa  161  1e-38  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.352245  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6127  putative transposase  36.17 
 
 		 237 aa  154  1e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.682044  normal  0.765968 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0052  Integrase catalytic region  35.15 
 
 		 521 aa  154  2e-36  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0148  Integrase catalytic region  35.15 
 
 		 520 aa  154  2e-36  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>