181 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_0735 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008346  Swol_0735  hypothetical protein  100 
 
 
289 aa  607  1e-173  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2217  integrase catalytic subunit  56.92 
 
 
302 aa  309  2.9999999999999997e-83  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  unclonable  0.000000000287605 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3122  hypothetical protein  50.87 
 
 
316 aa  308  5e-83  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0303  integrase catalytic subunit  50.87 
 
 
519 aa  306  2.0000000000000002e-82  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2132  integrase catalytic subunit  50.87 
 
 
519 aa  306  2.0000000000000002e-82  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3016  integrase catalytic subunit  50.87 
 
 
519 aa  306  2.0000000000000002e-82  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0988  integrase catalytic subunit  40.43 
 
 
513 aa  226  2e-58  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1224  integrase catalytic subunit  40.78 
 
 
513 aa  227  2e-58  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1299  integrase catalytic subunit  40.43 
 
 
513 aa  226  2e-58  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2660  integrase catalytic subunit  40.43 
 
 
513 aa  226  2e-58  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.549324  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3187  integrase catalytic subunit  40.43 
 
 
513 aa  226  2e-58  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3708  integrase catalytic subunit  40.43 
 
 
513 aa  226  2e-58  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4128  integrase catalytic subunit  40.43 
 
 
513 aa  226  3e-58  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0892  integrase catalytic subunit  40.43 
 
 
513 aa  226  3e-58  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1075  integrase catalytic subunit  40.43 
 
 
475 aa  226  4e-58  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0193  integrase catalytic subunit  41.84 
 
 
514 aa  220  3e-56  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1628  integrase catalytic subunit  41.84 
 
 
514 aa  220  3e-56  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4229  integrase catalytic subunit  41.49 
 
 
514 aa  218  8.999999999999998e-56  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0410  integrase catalytic subunit  41.49 
 
 
514 aa  217  2e-55  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0752835  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0598  integrase catalytic subunit  41.49 
 
 
514 aa  217  2e-55  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1852  integrase catalytic subunit  41.49 
 
 
514 aa  217  2e-55  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.687265  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2396  integrase catalytic subunit  41.49 
 
 
514 aa  217  2e-55  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.483197  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3180  integrase catalytic subunit  41.49 
 
 
514 aa  217  2e-55  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.150597  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0997  integrase catalytic subunit  41.13 
 
 
514 aa  216  4e-55  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2256  integrase catalytic subunit  41.13 
 
 
514 aa  215  7e-55  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2982  integrase catalytic subunit  41.13 
 
 
514 aa  215  7e-55  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00424027  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3716  Integrase catalytic region  42.75 
 
 
523 aa  211  2e-53  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  normal  0.124306 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1038  integrase catalytic region  38.65 
 
 
488 aa  210  2e-53  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3740  putative transposase  40.43 
 
 
512 aa  209  6e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2841  ISPsy14, transposase  40 
 
 
504 aa  206  4e-52  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0126762  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1938  integrase catalytic subunit  38.3 
 
 
512 aa  204  2e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.441696  normal  0.123274 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0134  Integrase catalytic region  37.46 
 
 
507 aa  202  4e-51  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.53025 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1363  Integrase catalytic region  37.46 
 
 
507 aa  202  4e-51  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1795  putative transposase  39.36 
 
 
517 aa  202  7e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.765121  normal 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6260  integrase catalytic subunit  40.36 
 
 
517 aa  198  7e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.441371  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4798  integrase catalytic region  37.19 
 
 
516 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.288871  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2289  integrase catalytic region  37.19 
 
 
516 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4290  integrase catalytic subunit  36.17 
 
 
512 aa  194  1e-48  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.559076  normal 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4396  integrase catalytic subunit  36.17 
 
 
512 aa  194  1e-48  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.624598  normal  0.336917 
 
 
-
 
NC_008761  Pnap_4788  integrase catalytic subunit  36.17 
 
 
512 aa  194  1e-48  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5194  integrase catalytic subunit  37.1 
 
 
525 aa  190  2.9999999999999997e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.471073 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1855  integrase catalytic subunit  36.27 
 
 
507 aa  189  4e-47  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1554  integrase catalytic subunit  35.82 
 
 
519 aa  189  5.999999999999999e-47  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2053  integrase catalytic subunit  35.82 
 
 
519 aa  189  5.999999999999999e-47  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3414  integrase catalytic subunit  35.82 
 
 
519 aa  189  5.999999999999999e-47  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.604761  n/a   
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6206  integrase catalytic region  36.4 
 
 
518 aa  189  5.999999999999999e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5628  integrase catalytic region  36.4 
 
 
518 aa  189  5.999999999999999e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4730  integrase catalytic region  36.4 
 
 
518 aa  189  5.999999999999999e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009471  Acry_3593  integrase catalytic subunit  35.46 
 
 
513 aa  183  3e-45  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  normal  0.454266 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3594  integrase catalytic subunit  35.92 
 
 
514 aa  182  4.0000000000000006e-45  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5654  Integrase catalytic region  35.82 
 
 
512 aa  181  1e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1463  transposase  35.34 
 
 
487 aa  181  1e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1328  integrase catalytic subunit  38.37 
 
 
513 aa  181  2e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9835  transposase  35.82 
 
 
517 aa  180  2e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0706  integrase catalytic region  35.46 
 
 
528 aa  180  2e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.00978905  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2120  Integrase catalytic region  40.14 
 
 
513 aa  180  2.9999999999999997e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0442814  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5321  Integrase catalytic region  40.14 
 
 
513 aa  180  2.9999999999999997e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.354079 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5580  Integrase catalytic region  40.14 
 
 
513 aa  180  2.9999999999999997e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2963  Integrase catalytic region  40.14 
 
 
513 aa  180  2.9999999999999997e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6805  Integrase catalytic region  40.14 
 
 
513 aa  180  2.9999999999999997e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3788  Integrase catalytic region  40.14 
 
 
513 aa  180  2.9999999999999997e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0608543 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0850  Integrase catalytic region  40.14 
 
 
513 aa  180  2.9999999999999997e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3092  Integrase catalytic region  40.14 
 
 
513 aa  180  2.9999999999999997e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.30832  normal  0.801547 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2154  Integrase catalytic region  40.14 
 
 
513 aa  180  2.9999999999999997e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.944811  normal  0.172855 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4696  integrase catalytic subunit  34.75 
 
 
505 aa  180  2.9999999999999997e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.569862 
 
 
-
 
NC_013733  Slin_6980  Integrase catalytic region  40.14 
 
 
513 aa  180  2.9999999999999997e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3293  Integrase catalytic region  40.14 
 
 
513 aa  180  2.9999999999999997e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.823799  normal  0.964616 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3694  Integrase catalytic region  40.14 
 
 
513 aa  180  2.9999999999999997e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00066117  hitchhiker  0.00045424 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4851  Integrase catalytic region  40.14 
 
 
513 aa  180  2.9999999999999997e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.242832  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6163  Integrase catalytic region  40.14 
 
 
513 aa  180  2.9999999999999997e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6473  Integrase catalytic region  40.14 
 
 
513 aa  180  2.9999999999999997e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4302  Integrase catalytic region  40.14 
 
 
513 aa  180  2.9999999999999997e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00408602 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2788  Integrase catalytic region  40.14 
 
 
513 aa  180  2.9999999999999997e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.952319  normal  0.0224954 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4234  Integrase catalytic region  40.14 
 
 
513 aa  180  2.9999999999999997e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.115769  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0559  integrase catalytic subunit  34.04 
 
 
517 aa  178  1e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3399  integrase catalytic subunit  33.57 
 
 
515 aa  177  2e-43  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.976382  n/a   
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3485  integrase catalytic subunit  33.57 
 
 
515 aa  177  2e-43  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.522877  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0283  integrase catalytic subunit  33.57 
 
 
515 aa  177  2e-43  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.188339  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2303  integrase catalytic subunit  33.57 
 
 
515 aa  177  2e-43  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.268136  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00182  transposase  35.25 
 
 
510 aa  177  2e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01935  hypothetical protein  35.25 
 
 
510 aa  177  2e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06058  hypothetical protein  35.25 
 
 
510 aa  177  2e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06964  hypothetical protein  35.25 
 
 
510 aa  177  2e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1925  integrase catalytic subunit  36.67 
 
 
524 aa  176  4e-43  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.683538  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1250  integrase catalytic subunit  34.87 
 
 
513 aa  175  8e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1429  integrase catalytic subunit  36.3 
 
 
524 aa  174  9.999999999999999e-43  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.398273  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1482  integrase catalytic subunit  36.3 
 
 
524 aa  174  9.999999999999999e-43  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2241  integrase catalytic subunit  36.3 
 
 
524 aa  174  9.999999999999999e-43  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4138  integrase catalytic subunit  36.05 
 
 
513 aa  172  7.999999999999999e-42  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1811  integrase catalytic subunit  36.17 
 
 
510 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.14945  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1830  transposase subunit  33.8 
 
 
526 aa  162  6e-39  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.733482  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2548  integrase catalytic subunit  35.56 
 
 
518 aa  157  2e-37  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0037  Integrase catalytic region  34.15 
 
 
515 aa  157  2e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1596  Integrase catalytic region  37.82 
 
 
512 aa  155  7e-37  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.151594  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0052  Integrase catalytic region  32.75 
 
 
521 aa  152  5.9999999999999996e-36  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0148  Integrase catalytic region  32.75 
 
 
520 aa  152  7e-36  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0780  Integrase catalytic region  40.84 
 
 
432 aa  149  5e-35  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5452  integrase catalytic region  38.95 
 
 
458 aa  137  2e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.681559  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6127  putative transposase  33.33 
 
 
237 aa  135  9e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.682044  normal  0.765968 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5850  Integrase catalytic region  30.56 
 
 
513 aa  126  5e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>