83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_03176 on replicon NC_009783
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009783  VIBHAR_03176  hypothetical protein  100 
 
 
391 aa  813    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00115  transposase  96.77 
 
 
459 aa  800    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00293  hypothetical protein  96.52 
 
 
459 aa  795    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00950  hypothetical protein  96.77 
 
 
459 aa  800    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01127  hypothetical protein  96.77 
 
 
459 aa  800    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01865  hypothetical protein  96.21 
 
 
379 aa  732    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02188  hypothetical protein  96.77 
 
 
459 aa  800    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02282  hypothetical protein  96.52 
 
 
459 aa  797    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02340  hypothetical protein  95.71 
 
 
407 aa  683    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02641  hypothetical protein  96.73 
 
 
406 aa  792    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02919  hypothetical protein  97.01 
 
 
459 aa  800    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03113  hypothetical protein  97.01 
 
 
459 aa  801    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03172  hypothetical protein  96.77 
 
 
459 aa  800    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03190  hypothetical protein  100 
 
 
448 aa  811    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06152  hypothetical protein  97.01 
 
 
459 aa  801    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06945  hypothetical protein  97.01 
 
 
459 aa  801    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06773  hypothetical protein  97.01 
 
 
459 aa  801    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06704  hypothetical protein  97.01 
 
 
459 aa  801    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06289  hypothetical protein  97.01 
 
 
459 aa  801    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06260  hypothetical protein  97.01 
 
 
459 aa  801    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03267  hypothetical protein  96.77 
 
 
459 aa  800    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05721  hypothetical protein  96.77 
 
 
459 aa  800    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05657  hypothetical protein  97.01 
 
 
459 aa  801    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05509  hypothetical protein  96.77 
 
 
459 aa  800    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04959  hypothetical protein  96.73 
 
 
403 aa  793    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03586  hypothetical protein  97.01 
 
 
459 aa  801    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00498  hypothetical protein  98.78 
 
 
259 aa  508  1e-143  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00456  hypothetical protein  98.78 
 
 
259 aa  508  1e-143  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03704  hypothetical protein  94.38 
 
 
316 aa  476  1e-133  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05272  hypothetical protein  93.55 
 
 
243 aa  353  4e-96  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00497  hypothetical protein  99.27 
 
 
194 aa  283  3.0000000000000004e-75  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00457  hypothetical protein  99.27 
 
 
194 aa  283  3.0000000000000004e-75  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0184  hypothetical protein  41.93 
 
 
472 aa  276  6e-73  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0195  hypothetical protein  41.93 
 
 
472 aa  276  6e-73  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2032  hypothetical protein  41.69 
 
 
472 aa  274  2.0000000000000002e-72  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1424  hypothetical protein  41.69 
 
 
472 aa  272  7e-72  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1893  hypothetical protein  41.71 
 
 
472 aa  269  5e-71  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0064  hypothetical protein  41.71 
 
 
472 aa  269  5e-71  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03703  hypothetical protein  100 
 
 
120 aa  249  5e-65  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05271  hypothetical protein  99.04 
 
 
110 aa  217  2e-55  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2515  transposase IS4 family protein  28.18 
 
 
467 aa  164  2.0000000000000002e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.99983  normal  0.0630319 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5887  transposase IS4 family protein  29.95 
 
 
481 aa  159  7e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000153597 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2199  transposase Tn5  27.93 
 
 
467 aa  159  9e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.334008  hitchhiker  0.00000000355698 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2627  hypothetical protein  28.07 
 
 
457 aa  141  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02149  hypothetical protein  95.59 
 
 
78 aa  139  1e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3941  hypothetical protein  28.65 
 
 
361 aa  138  2e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4481  hypothetical protein  29.09 
 
 
441 aa  133  5e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.579978  hitchhiker  0.0000396419 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4752  hypothetical protein  28.53 
 
 
441 aa  129  9.000000000000001e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.839178  normal 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4825  hypothetical protein  28.53 
 
 
441 aa  129  1.0000000000000001e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3105  transposase, IS4 family protein  28.46 
 
 
439 aa  125  1e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0428603 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2215  transposase, IS4 family protein  28.19 
 
 
439 aa  124  2e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.501331  normal  0.787142 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2775  transposase, IS4 family protein  28.19 
 
 
439 aa  124  2e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0055865 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3107  transposase, IS4 family protein  28.19 
 
 
419 aa  124  2e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0395714 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3660  transposase, IS4 family protein  28.19 
 
 
439 aa  124  2e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1752  hypothetical protein  28.27 
 
 
445 aa  122  9.999999999999999e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.227885  normal  0.59787 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4842  hypothetical protein  28.27 
 
 
445 aa  122  9.999999999999999e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4729  hypothetical protein  28.27 
 
 
445 aa  122  9.999999999999999e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.199919  normal 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8279  transposase  27.71 
 
 
473 aa  118  9.999999999999999e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3410  transposase Tn5  26.54 
 
 
322 aa  114  3e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0141  putative transposase  32.93 
 
 
371 aa  113  5e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12240  transposase  26.3 
 
 
460 aa  107  4e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33340  transposase  26.3 
 
 
460 aa  107  5e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1413  transposase, IS4 family protein  28.08 
 
 
462 aa  104  2e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.106317  normal 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4025  hypothetical protein  25 
 
 
470 aa  105  2e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4034  hypothetical protein  25 
 
 
470 aa  105  2e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.287551 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3078  putative transposase  26.87 
 
 
482 aa  101  2e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.049818  normal  0.456044 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1301  putative transposase  26.87 
 
 
482 aa  101  2e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31320  transposase  26.05 
 
 
460 aa  102  2e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18340  transposase  26.05 
 
 
460 aa  101  2e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.308708  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18270  transposase  26.05 
 
 
460 aa  101  2e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0704  transposase, IS4 family protein  23.75 
 
 
453 aa  93.2  6e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4941  transposase, IS4 family protein  28.21 
 
 
380 aa  87.4  4e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.491222 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0421  hypothetical protein  29.73 
 
 
187 aa  72.4  0.00000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1573  putative transposase  25.45 
 
 
395 aa  69.7  0.00000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.153836 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01862  hypothetical protein  100 
 
 
89 aa  65.5  0.000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3113  hypothetical protein  27.59 
 
 
293 aa  65.5  0.000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3096  transposase Tn5  31.96 
 
 
126 aa  58.9  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41930  transposase  28.48 
 
 
234 aa  58.5  0.0000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.209589  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0419  IS4 family transposase  29.17 
 
 
164 aa  54.7  0.000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.216929 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06859  hypothetical protein  70.45 
 
 
51 aa  53.9  0.000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0094  transposase, IS4 family protein  23.36 
 
 
427 aa  53.1  0.000009  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1615  transposase, IS4 family protein  23.36 
 
 
427 aa  53.1  0.000009  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.121827  hitchhiker  0.0000000133729 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1482  hypothetical protein  24.34 
 
 
261 aa  48.9  0.0002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>