81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_8279 on replicon NC_011982
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011982  Avi_8279  transposase  100 
 
 		 473 aa  981    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4025  hypothetical protein  54.45 
 
 		 470 aa  494  9.999999999999999e-139  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4034  hypothetical protein  54.45 
 
 		 470 aa  494  9.999999999999999e-139  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.287551 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2515  transposase IS4 family protein  33.48 
 
 		 467 aa  237  3e-61  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.99983  normal  0.0630319 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2199  transposase Tn5  33.12 
 
 		 467 aa  233  4.0000000000000004e-60  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.334008  hitchhiker  0.00000000355698 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2972  hypothetical protein  49.36 
 
 		 283 aa  231  2e-59  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0469532  normal  0.67832 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5887  transposase IS4 family protein  31.61 
 
 		 481 aa  223  7e-57  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000153597 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12240  transposase  30.77 
 
 		 460 aa  211  3e-53  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33340  transposase  30.77 
 
 		 460 aa  210  4e-53  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31320  transposase  30.56 
 
 		 460 aa  207  4e-52  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18340  transposase  30.56 
 
 		 460 aa  205  2e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.308708  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18270  transposase  30.56 
 
 		 460 aa  205  2e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3660  transposase, IS4 family protein  29.3 
 
 		 439 aa  199  1.0000000000000001e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2775  transposase, IS4 family protein  29.3 
 
 		 439 aa  199  1.0000000000000001e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0055865 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2215  transposase, IS4 family protein  29.3 
 
 		 439 aa  199  1.0000000000000001e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.501331  normal  0.787142 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3105  transposase, IS4 family protein  29.3 
 
 		 439 aa  198  2.0000000000000003e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0428603 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4481  hypothetical protein  30.19 
 
 		 441 aa  196  6e-49  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.579978  hitchhiker  0.0000396419 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4729  hypothetical protein  31.26 
 
 		 445 aa  188  2e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.199919  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1752  hypothetical protein  31.26 
 
 		 445 aa  188  2e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.227885  normal  0.59787 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4842  hypothetical protein  31.26 
 
 		 445 aa  188  2e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4752  hypothetical protein  29.81 
 
 		 441 aa  187  3e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.839178  normal  1 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4825  hypothetical protein  29.24 
 
 		 441 aa  187  3e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3107  transposase, IS4 family protein  29.66 
 
 		 419 aa  187  5e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0395714 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2627  hypothetical protein  28.82 
 
 		 457 aa  167  2.9999999999999998e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1413  transposase, IS4 family protein  29.23 
 
 		 462 aa  154  2.9999999999999998e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.106317  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1301  putative transposase  29.07 
 
 		 482 aa  150  6e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3078  putative transposase  29.07 
 
 		 482 aa  150  6e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.049818  normal  0.456044 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3410  transposase Tn5  31.66 
 
 		 322 aa  138  2e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3113  hypothetical protein  30.36 
 
 		 293 aa  127  4.0000000000000003e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03190  hypothetical protein  26.29 
 
 		 448 aa  127  6e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0184  hypothetical protein  27.8 
 
 		 472 aa  126  9e-28  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0195  hypothetical protein  27.8 
 
 		 472 aa  126  9e-28  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4941  transposase, IS4 family protein  28.75 
 
 		 380 aa  126  9e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.491222 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2032  hypothetical protein  27.8 
 
 		 472 aa  126  1e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3941  hypothetical protein  28.81 
 
 		 361 aa  126  1e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02919  hypothetical protein  26.29 
 
 		 459 aa  124  3e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06773  hypothetical protein  26.09 
 
 		 459 aa  124  5e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05657  hypothetical protein  26.19 
 
 		 459 aa  124  5e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06152  hypothetical protein  26.09 
 
 		 459 aa  124  5e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06260  hypothetical protein  26.09 
 
 		 459 aa  124  5e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06289  hypothetical protein  26.09 
 
 		 459 aa  124  5e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06704  hypothetical protein  26.19 
 
 		 459 aa  124  5e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03586  hypothetical protein  26.09 
 
 		 459 aa  124  5e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03113  hypothetical protein  26.09 
 
 		 459 aa  124  5e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06945  hypothetical protein  26.09 
 
 		 459 aa  124  5e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02282  hypothetical protein  26.09 
 
 		 459 aa  124  5e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02188  hypothetical protein  26.09 
 
 		 459 aa  124  5e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00950  hypothetical protein  26.09 
 
 		 459 aa  124  5e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1424  hypothetical protein  27.95 
 
 		 472 aa  123  6e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01127  hypothetical protein  26.09 
 
 		 459 aa  123  7e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03172  hypothetical protein  26.09 
 
 		 459 aa  123  7e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03267  hypothetical protein  26.09 
 
 		 459 aa  123  7e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00115  transposase  26.09 
 
 		 459 aa  123  7e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05721  hypothetical protein  26.09 
 
 		 459 aa  123  7e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05509  hypothetical protein  26.09 
 
 		 459 aa  123  7e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00293  hypothetical protein  26.09 
 
 		 459 aa  123  9e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1893  hypothetical protein  27.92 
 
 		 472 aa  119  9e-26  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0064  hypothetical protein  27.92 
 
 		 472 aa  119  9e-26  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41930  transposase  32.71 
 
 		 234 aa  119  9.999999999999999e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.209589  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03176  hypothetical protein  27.71 
 
 		 391 aa  118  1.9999999999999998e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04959  hypothetical protein  27.46 
 
 		 403 aa  115  1.0000000000000001e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02641  hypothetical protein  27.46 
 
 		 406 aa  115  1.0000000000000001e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01865  hypothetical protein  27.66 
 
 		 379 aa  115  1.0000000000000001e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02340  hypothetical protein  25.76 
 
 		 407 aa  105  2e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0165  IS4 family transposase  32.04 
 
 		 212 aa  100  7e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.0055531  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0704  transposase, IS4 family protein  25.29 
 
 		 453 aa  92.4  2e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03704  hypothetical protein  25.66 
 
 		 316 aa  86.3  0.000000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0419  IS4 family transposase  31.29 
 
 		 164 aa  77.4  0.0000000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.216929 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0421  hypothetical protein  30.94 
 
 		 187 aa  77.4  0.0000000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00498  hypothetical protein  29.46 
 
 		 259 aa  75.1  0.000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00456  hypothetical protein  29.46 
 
 		 259 aa  75.1  0.000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1573  putative transposase  26.9 
 
 		 395 aa  74.3  0.000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.153836 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05272  hypothetical protein  25.24 
 
 		 243 aa  65.5  0.000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3096  transposase Tn5  34.78 
 
 		 126 aa  64.3  0.000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1482  hypothetical protein  33.02 
 
 		 261 aa  61.2  0.00000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00497  hypothetical protein  28.05 
 
 		 194 aa  60.8  0.00000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00457  hypothetical protein  28.05 
 
 		 194 aa  60.8  0.00000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4950  hypothetical protein  50 
 
 		 63 aa  52.4  0.00002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.694438  normal  0.307678 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4406  hypothetical protein  30.53 
 
 		 285 aa  52  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03703  hypothetical protein  28.97 
 
 		 120 aa  45.4  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05271  hypothetical protein  28.97 
 
 		 110 aa  45.4  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>