90 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_4025 on replicon NC_009430
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009430  Rsph17025_4025  hypothetical protein  100 
 
 		 470 aa  967    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4034  hypothetical protein  100 
 
 		 470 aa  967    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.287551 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8279  transposase  54.45 
 
 		 473 aa  494  9.999999999999999e-139  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2972  hypothetical protein  84.31 
 
 		 283 aa  369  1e-101  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0469532  normal  0.67832 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2515  transposase IS4 family protein  35.1 
 
 		 467 aa  260  4e-68  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.99983  normal  0.0630319 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2199  transposase Tn5  34.75 
 
 		 467 aa  255  1.0000000000000001e-66  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.334008  hitchhiker  0.00000000355698 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5887  transposase IS4 family protein  35.55 
 
 		 481 aa  249  9e-65  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000153597 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1752  hypothetical protein  35.24 
 
 		 445 aa  234  2.0000000000000002e-60  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.227885  normal  0.59787 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4842  hypothetical protein  35.24 
 
 		 445 aa  234  2.0000000000000002e-60  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4729  hypothetical protein  35.24 
 
 		 445 aa  234  2.0000000000000002e-60  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.199919  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2775  transposase, IS4 family protein  36.79 
 
 		 439 aa  233  6e-60  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0055865 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2215  transposase, IS4 family protein  36.79 
 
 		 439 aa  233  6e-60  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.501331  normal  0.787142 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3660  transposase, IS4 family protein  36.79 
 
 		 439 aa  233  6e-60  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4825  hypothetical protein  35.59 
 
 		 441 aa  233  6e-60  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3105  transposase, IS4 family protein  36.79 
 
 		 439 aa  232  9e-60  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0428603 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4752  hypothetical protein  35.53 
 
 		 441 aa  230  3e-59  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.839178  normal  1 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4481  hypothetical protein  34.54 
 
 		 441 aa  230  4e-59  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.579978  hitchhiker  0.0000396419 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12240  transposase  34.54 
 
 		 460 aa  224  2e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31320  transposase  34.54 
 
 		 460 aa  225  2e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33340  transposase  34.54 
 
 		 460 aa  224  3e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18340  transposase  34.33 
 
 		 460 aa  219  1e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.308708  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18270  transposase  34.33 
 
 		 460 aa  219  1e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3107  transposase, IS4 family protein  36.48 
 
 		 419 aa  218  2e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0395714 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1413  transposase, IS4 family protein  31.79 
 
 		 462 aa  167  2.9999999999999998e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.106317  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2627  hypothetical protein  26.77 
 
 		 457 aa  164  4.0000000000000004e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3410  transposase Tn5  32.92 
 
 		 322 aa  163  6e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1301  putative transposase  31.55 
 
 		 482 aa  163  7e-39  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3078  putative transposase  31.55 
 
 		 482 aa  163  7e-39  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.049818  normal  0.456044 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3113  hypothetical protein  36.58 
 
 		 293 aa  148  2.0000000000000003e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4941  transposase, IS4 family protein  31.56 
 
 		 380 aa  135  9.999999999999999e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.491222 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41930  transposase  36.73 
 
 		 234 aa  132  1.0000000000000001e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.209589  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3941  hypothetical protein  28.18 
 
 		 361 aa  132  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1893  hypothetical protein  26.93 
 
 		 472 aa  131  2.0000000000000002e-29  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0064  hypothetical protein  26.93 
 
 		 472 aa  131  2.0000000000000002e-29  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0184  hypothetical protein  25.58 
 
 		 472 aa  122  9.999999999999999e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0195  hypothetical protein  25.58 
 
 		 472 aa  122  9.999999999999999e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1424  hypothetical protein  25.58 
 
 		 472 aa  122  9.999999999999999e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2032  hypothetical protein  25.37 
 
 		 472 aa  119  7.999999999999999e-26  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03190  hypothetical protein  24.46 
 
 		 448 aa  119  1.9999999999999998e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02919  hypothetical protein  23.98 
 
 		 459 aa  117  6e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02188  hypothetical protein  23.98 
 
 		 459 aa  117  6e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00950  hypothetical protein  23.98 
 
 		 459 aa  117  6e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06773  hypothetical protein  23.98 
 
 		 459 aa  117  6.9999999999999995e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05509  hypothetical protein  23.98 
 
 		 459 aa  116  6.9999999999999995e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05721  hypothetical protein  23.98 
 
 		 459 aa  116  6.9999999999999995e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06945  hypothetical protein  23.98 
 
 		 459 aa  117  6.9999999999999995e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06152  hypothetical protein  23.98 
 
 		 459 aa  117  6.9999999999999995e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03586  hypothetical protein  23.98 
 
 		 459 aa  117  6.9999999999999995e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03267  hypothetical protein  23.98 
 
 		 459 aa  116  6.9999999999999995e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06260  hypothetical protein  23.98 
 
 		 459 aa  117  6.9999999999999995e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06289  hypothetical protein  23.98 
 
 		 459 aa  117  6.9999999999999995e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03172  hypothetical protein  23.98 
 
 		 459 aa  116  6.9999999999999995e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03113  hypothetical protein  23.98 
 
 		 459 aa  117  6.9999999999999995e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06704  hypothetical protein  23.98 
 
 		 459 aa  117  6.9999999999999995e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01127  hypothetical protein  23.98 
 
 		 459 aa  116  6.9999999999999995e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00293  hypothetical protein  23.98 
 
 		 459 aa  116  6.9999999999999995e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00115  transposase  23.98 
 
 		 459 aa  116  6.9999999999999995e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02282  hypothetical protein  23.98 
 
 		 459 aa  116  8.999999999999998e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05657  hypothetical protein  23.77 
 
 		 459 aa  115  1.0000000000000001e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0704  transposase, IS4 family protein  28.5 
 
 		 453 aa  105  1e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0165  IS4 family transposase  38.99 
 
 		 212 aa  105  1e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.0055531  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03176  hypothetical protein  25 
 
 		 391 aa  105  2e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01865  hypothetical protein  24.74 
 
 		 379 aa  104  4e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02641  hypothetical protein  24.4 
 
 		 406 aa  103  6e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04959  hypothetical protein  24.4 
 
 		 403 aa  103  6e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02340  hypothetical protein  23.93 
 
 		 407 aa  98.6  2e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0421  hypothetical protein  37.57 
 
 		 187 aa  98.2  3e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0419  IS4 family transposase  35.19 
 
 		 164 aa  85.9  0.000000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.216929 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03704  hypothetical protein  24.16 
 
 		 316 aa  79.7  0.00000000000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1573  putative transposase  28.4 
 
 		 395 aa  77.8  0.0000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.153836 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00498  hypothetical protein  25.21 
 
 		 259 aa  71.2  0.00000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00456  hypothetical protein  25.21 
 
 		 259 aa  71.2  0.00000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3096  transposase Tn5  39.36 
 
 		 126 aa  69.7  0.00000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1482  hypothetical protein  34.67 
 
 		 261 aa  68.6  0.0000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05272  hypothetical protein  24.5 
 
 		 243 aa  62  0.00000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00497  hypothetical protein  24.87 
 
 		 194 aa  60.1  0.00000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00457  hypothetical protein  24.87 
 
 		 194 aa  60.1  0.00000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4950  hypothetical protein  52 
 
 		 63 aa  56.6  0.0000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.694438  normal  0.307678 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1615  transposase, IS4 family protein  20.34 
 
 		 427 aa  55.8  0.000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.121827  hitchhiker  0.0000000133729 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0094  transposase, IS4 family protein  20.34 
 
 		 427 aa  55.8  0.000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4406  hypothetical protein  29.47 
 
 		 285 aa  52.8  0.00001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3473  hypothetical protein  33.12 
 
 		 223 aa  48.9  0.0002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.848098  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5820  hypothetical protein  30.61 
 
 		 108 aa  48.5  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1738  hypothetical protein  48.89 
 
 		 66 aa  45.4  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.887108 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4951  hypothetical protein  27.21 
 
 		 132 aa  45.4  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.248425  normal  0.419329 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2981  hypothetical protein  40.91 
 
 		 219 aa  45.1  0.003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3652  hypothetical protein  48.78 
 
 		 60 aa  44.7  0.004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03703  hypothetical protein  26.67 
 
 		 120 aa  44.3  0.005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4242  pili assembly chaperone protein  33.8 
 
 		 243 aa  43.9  0.006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4095  long polar fimbrial operon protein LpfB  33.8 
 
 		 243 aa  43.5  0.008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.124467 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>