83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_04959 on replicon NC_009784
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009783  VIBHAR_03190  hypothetical protein  96.73 
 
 
448 aa  790    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00115  transposase  99.5 
 
 
459 aa  820    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00293  hypothetical protein  99.24 
 
 
459 aa  817    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00950  hypothetical protein  99.5 
 
 
459 aa  821    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01127  hypothetical protein  99.5 
 
 
459 aa  820    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01865  hypothetical protein  99.46 
 
 
379 aa  763    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02188  hypothetical protein  99.5 
 
 
459 aa  821    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02282  hypothetical protein  99.24 
 
 
459 aa  818    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02340  hypothetical protein  98.84 
 
 
407 aa  705    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02641  hypothetical protein  99.5 
 
 
406 aa  824    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02919  hypothetical protein  99.24 
 
 
459 aa  818    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03113  hypothetical protein  99.75 
 
 
459 aa  822    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03172  hypothetical protein  99.5 
 
 
459 aa  820    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03176  hypothetical protein  96.73 
 
 
391 aa  793    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05721  hypothetical protein  99.5 
 
 
459 aa  820    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06945  hypothetical protein  99.75 
 
 
459 aa  822    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06773  hypothetical protein  99.75 
 
 
459 aa  822    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06704  hypothetical protein  99.75 
 
 
459 aa  822    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06289  hypothetical protein  99.75 
 
 
459 aa  822    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06260  hypothetical protein  99.75 
 
 
459 aa  822    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06152  hypothetical protein  99.75 
 
 
459 aa  822    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03267  hypothetical protein  99.5 
 
 
459 aa  820    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05657  hypothetical protein  99.24 
 
 
459 aa  818    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05509  hypothetical protein  99.5 
 
 
459 aa  820    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04959  hypothetical protein  100 
 
 
403 aa  838    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03586  hypothetical protein  99.75 
 
 
459 aa  822    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00498  hypothetical protein  96.9 
 
 
259 aa  518  1e-146  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00456  hypothetical protein  96.9 
 
 
259 aa  518  1e-146  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03704  hypothetical protein  97.95 
 
 
316 aa  496  1e-139  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05272  hypothetical protein  99.45 
 
 
243 aa  375  1e-103  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0184  hypothetical protein  42.22 
 
 
472 aa  284  2.0000000000000002e-75  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0195  hypothetical protein  42.22 
 
 
472 aa  284  2.0000000000000002e-75  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2032  hypothetical protein  41.98 
 
 
472 aa  282  6.000000000000001e-75  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1893  hypothetical protein  42.86 
 
 
472 aa  281  1e-74  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0064  hypothetical protein  42.86 
 
 
472 aa  281  1e-74  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1424  hypothetical protein  41.98 
 
 
472 aa  281  2e-74  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00457  hypothetical protein  97.73 
 
 
194 aa  272  8.000000000000001e-72  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00497  hypothetical protein  97.73 
 
 
194 aa  272  8.000000000000001e-72  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03703  hypothetical protein  100 
 
 
120 aa  249  5e-65  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05271  hypothetical protein  99.04 
 
 
110 aa  217  2.9999999999999998e-55  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2515  transposase IS4 family protein  29.7 
 
 
467 aa  176  6e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.99983  normal  0.0630319 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2199  transposase Tn5  29.19 
 
 
467 aa  171  2e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.334008  hitchhiker  0.00000000355698 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5887  transposase IS4 family protein  30.69 
 
 
481 aa  166  1.0000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000153597 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2627  hypothetical protein  27.47 
 
 
457 aa  149  1.0000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3941  hypothetical protein  28.65 
 
 
361 aa  146  5e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4481  hypothetical protein  29.64 
 
 
441 aa  144  3e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.579978  hitchhiker  0.0000396419 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4752  hypothetical protein  29.09 
 
 
441 aa  141  1.9999999999999998e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.839178  normal 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4825  hypothetical protein  29.09 
 
 
441 aa  140  3.9999999999999997e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02149  hypothetical protein  95.59 
 
 
78 aa  139  1e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1752  hypothetical protein  28.53 
 
 
445 aa  133  5e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.227885  normal  0.59787 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4842  hypothetical protein  28.53 
 
 
445 aa  133  5e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4729  hypothetical protein  28.53 
 
 
445 aa  133  5e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.199919  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3105  transposase, IS4 family protein  29.04 
 
 
439 aa  129  7.000000000000001e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0428603 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2215  transposase, IS4 family protein  28.77 
 
 
439 aa  129  1.0000000000000001e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.501331  normal  0.787142 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2775  transposase, IS4 family protein  28.77 
 
 
439 aa  129  1.0000000000000001e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0055865 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3107  transposase, IS4 family protein  28.77 
 
 
419 aa  129  1.0000000000000001e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0395714 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3660  transposase, IS4 family protein  28.77 
 
 
439 aa  129  1.0000000000000001e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3410  transposase Tn5  27.83 
 
 
322 aa  124  3e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8279  transposase  27.46 
 
 
473 aa  115  8.999999999999998e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12240  transposase  26.25 
 
 
460 aa  115  1.0000000000000001e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33340  transposase  26.25 
 
 
460 aa  115  2.0000000000000002e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31320  transposase  26 
 
 
460 aa  109  7.000000000000001e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18340  transposase  26 
 
 
460 aa  109  7.000000000000001e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.308708  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18270  transposase  26 
 
 
460 aa  109  7.000000000000001e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0141  putative transposase  31.75 
 
 
371 aa  108  1e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1413  transposase, IS4 family protein  27.9 
 
 
462 aa  108  2e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.106317  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0704  transposase, IS4 family protein  24.17 
 
 
453 aa  104  3e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3078  putative transposase  26.87 
 
 
482 aa  103  4e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.049818  normal  0.456044 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1301  putative transposase  26.87 
 
 
482 aa  103  4e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4034  hypothetical protein  24.4 
 
 
470 aa  103  5e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.287551 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4025  hypothetical protein  24.4 
 
 
470 aa  103  5e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4941  transposase, IS4 family protein  28.31 
 
 
380 aa  90.1  6e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.491222 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1573  putative transposase  26.82 
 
 
395 aa  87.8  3e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.153836 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3113  hypothetical protein  28.57 
 
 
293 aa  77.4  0.0000000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0421  hypothetical protein  29.73 
 
 
187 aa  72.8  0.00000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0419  IS4 family transposase  30.36 
 
 
164 aa  66.2  0.0000000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.216929 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41930  transposase  27.44 
 
 
234 aa  60.5  0.00000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.209589  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3096  transposase Tn5  31.96 
 
 
126 aa  58.9  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01862  hypothetical protein  96.3 
 
 
89 aa  55.8  0.000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1482  hypothetical protein  24.34 
 
 
261 aa  54.7  0.000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06859  hypothetical protein  70.45 
 
 
51 aa  53.9  0.000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0094  transposase, IS4 family protein  23.1 
 
 
427 aa  48.5  0.0002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1615  transposase, IS4 family protein  23.1 
 
 
427 aa  48.5  0.0002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.121827  hitchhiker  0.0000000133729 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>