90 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_3107 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008786  Veis_3660  transposase, IS4 family protein  100 
 
 
439 aa  850    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3107  transposase, IS4 family protein  100 
 
 
419 aa  856    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0395714 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3105  transposase, IS4 family protein  99.76 
 
 
439 aa  848    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0428603 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2775  transposase, IS4 family protein  100 
 
 
439 aa  850    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0055865 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2215  transposase, IS4 family protein  100 
 
 
439 aa  850    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.501331  normal  0.787142 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4481  hypothetical protein  61 
 
 
441 aa  511  1e-144  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.579978  hitchhiker  0.0000396419 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4752  hypothetical protein  59.33 
 
 
441 aa  504  9.999999999999999e-143  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.839178  normal 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4825  hypothetical protein  59.57 
 
 
441 aa  506  9.999999999999999e-143  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1752  hypothetical protein  58.61 
 
 
445 aa  495  1e-139  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.227885  normal  0.59787 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4729  hypothetical protein  58.61 
 
 
445 aa  495  1e-139  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.199919  normal 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4842  hypothetical protein  58.61 
 
 
445 aa  495  1e-139  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1413  transposase, IS4 family protein  54.86 
 
 
462 aa  419  1e-116  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.106317  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4941  transposase, IS4 family protein  57.86 
 
 
380 aa  360  3e-98  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.491222 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3113  hypothetical protein  60.74 
 
 
293 aa  324  2e-87  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31320  transposase  43.15 
 
 
460 aa  318  2e-85  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33340  transposase  43.68 
 
 
460 aa  317  3e-85  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12240  transposase  43.45 
 
 
460 aa  314  1.9999999999999998e-84  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18340  transposase  43.45 
 
 
460 aa  312  6.999999999999999e-84  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.308708  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18270  transposase  43.45 
 
 
460 aa  312  6.999999999999999e-84  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2515  transposase IS4 family protein  34.94 
 
 
467 aa  246  4e-64  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.99983  normal  0.0630319 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2199  transposase Tn5  34.71 
 
 
467 aa  243  6e-63  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.334008  hitchhiker  0.00000000355698 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4025  hypothetical protein  36.48 
 
 
470 aa  218  1e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4034  hypothetical protein  36.48 
 
 
470 aa  218  1e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.287551 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5887  transposase IS4 family protein  32.95 
 
 
481 aa  217  2.9999999999999998e-55  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000153597 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0421  hypothetical protein  57.5 
 
 
187 aa  203  5e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0165  IS4 family transposase  59.67 
 
 
212 aa  192  1e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.0055531  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8279  transposase  29.66 
 
 
473 aa  187  4e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0419  IS4 family transposase  51.95 
 
 
164 aa  167  4e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.216929 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41930  transposase  50.63 
 
 
234 aa  164  4.0000000000000004e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.209589  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3410  transposase Tn5  32.9 
 
 
322 aa  153  5.9999999999999996e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4951  hypothetical protein  58.87 
 
 
132 aa  146  6e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.248425  normal  0.419329 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06704  hypothetical protein  27.88 
 
 
459 aa  141  3e-32  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05657  hypothetical protein  27.65 
 
 
459 aa  140  3e-32  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06773  hypothetical protein  27.88 
 
 
459 aa  141  3e-32  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06289  hypothetical protein  27.88 
 
 
459 aa  141  3e-32  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06260  hypothetical protein  27.88 
 
 
459 aa  141  3e-32  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06152  hypothetical protein  27.88 
 
 
459 aa  141  3e-32  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06945  hypothetical protein  27.88 
 
 
459 aa  141  3e-32  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03586  hypothetical protein  27.88 
 
 
459 aa  141  3e-32  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02919  hypothetical protein  27.88 
 
 
459 aa  141  3e-32  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03113  hypothetical protein  27.88 
 
 
459 aa  141  3e-32  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02282  hypothetical protein  27.88 
 
 
459 aa  140  3.9999999999999997e-32  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03267  hypothetical protein  27.88 
 
 
459 aa  140  3.9999999999999997e-32  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05509  hypothetical protein  27.88 
 
 
459 aa  140  3.9999999999999997e-32  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01127  hypothetical protein  27.88 
 
 
459 aa  140  3.9999999999999997e-32  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03172  hypothetical protein  27.88 
 
 
459 aa  140  3.9999999999999997e-32  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05721  hypothetical protein  27.88 
 
 
459 aa  140  3.9999999999999997e-32  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00115  transposase  27.88 
 
 
459 aa  140  3.9999999999999997e-32  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00293  hypothetical protein  27.88 
 
 
459 aa  140  4.999999999999999e-32  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00950  hypothetical protein  27.65 
 
 
459 aa  139  7.999999999999999e-32  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02188  hypothetical protein  27.65 
 
 
459 aa  139  7.999999999999999e-32  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2627  hypothetical protein  24.31 
 
 
457 aa  139  1e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03190  hypothetical protein  27.55 
 
 
448 aa  137  4e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3941  hypothetical protein  26.96 
 
 
361 aa  133  6e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2032  hypothetical protein  26.52 
 
 
472 aa  132  1.0000000000000001e-29  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1893  hypothetical protein  26.17 
 
 
472 aa  131  2.0000000000000002e-29  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0064  hypothetical protein  26.17 
 
 
472 aa  131  2.0000000000000002e-29  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0184  hypothetical protein  26.52 
 
 
472 aa  131  3e-29  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0195  hypothetical protein  26.52 
 
 
472 aa  131  3e-29  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1424  hypothetical protein  26.52 
 
 
472 aa  130  4.0000000000000003e-29  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1301  putative transposase  29.78 
 
 
482 aa  130  5.0000000000000004e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3078  putative transposase  29.78 
 
 
482 aa  130  5.0000000000000004e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.049818  normal  0.456044 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04959  hypothetical protein  28.77 
 
 
403 aa  129  1.0000000000000001e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01865  hypothetical protein  28.61 
 
 
379 aa  129  1.0000000000000001e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02641  hypothetical protein  28.77 
 
 
406 aa  128  2.0000000000000002e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03176  hypothetical protein  28.19 
 
 
391 aa  124  2e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02340  hypothetical protein  27.32 
 
 
407 aa  112  9e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0704  transposase, IS4 family protein  31.82 
 
 
453 aa  103  5e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6437  hypothetical protein  68.12 
 
 
128 aa  97.4  4e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.8669  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00498  hypothetical protein  30.18 
 
 
259 aa  97.1  6e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00456  hypothetical protein  30.18 
 
 
259 aa  97.1  6e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4952  IS4 family transposase  46.3 
 
 
108 aa  90.1  6e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.450455  normal  0.665267 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3096  transposase Tn5  41.3 
 
 
126 aa  82  0.00000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03704  hypothetical protein  25.63 
 
 
316 aa  73.2  0.000000000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05271  hypothetical protein  37.5 
 
 
110 aa  71.6  0.00000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03703  hypothetical protein  38.46 
 
 
120 aa  70.9  0.00000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2972  hypothetical protein  30.95 
 
 
283 aa  70.1  0.00000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0469532  normal  0.67832 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2981  hypothetical protein  53.45 
 
 
219 aa  69.3  0.0000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4950  hypothetical protein  50.85 
 
 
63 aa  65.9  0.000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.694438  normal  0.307678 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1738  hypothetical protein  55.32 
 
 
66 aa  60.8  0.00000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.887108 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00457  hypothetical protein  29.08 
 
 
194 aa  60.1  0.00000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00497  hypothetical protein  29.08 
 
 
194 aa  60.1  0.00000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05272  hypothetical protein  29.08 
 
 
243 aa  58.9  0.0000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1482  hypothetical protein  32.17 
 
 
261 aa  55.1  0.000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1573  putative transposase  25.28 
 
 
395 aa  52.8  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.153836 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4406  hypothetical protein  38.1 
 
 
285 aa  48.9  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5820  hypothetical protein  23.81 
 
 
108 aa  46.6  0.0008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02149  hypothetical protein  37.93 
 
 
78 aa  45.1  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1615  transposase, IS4 family protein  22.37 
 
 
427 aa  45.4  0.002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.121827  hitchhiker  0.0000000133729 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0094  transposase, IS4 family protein  22.37 
 
 
427 aa  45.4  0.002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>