30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_2981 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008786  Veis_2981  hypothetical protein  100 
 
 
219 aa  451  1.0000000000000001e-126  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3660  transposase, IS4 family protein  50.63 
 
 
439 aa  90.1  2e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3105  transposase, IS4 family protein  50.63 
 
 
439 aa  90.1  2e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0428603 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2775  transposase, IS4 family protein  50.63 
 
 
439 aa  90.1  2e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0055865 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2215  transposase, IS4 family protein  50.63 
 
 
439 aa  90.1  2e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.501331  normal  0.787142 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4825  hypothetical protein  45.88 
 
 
441 aa  84  0.000000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4752  hypothetical protein  45.88 
 
 
441 aa  84  0.000000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.839178  normal 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4481  hypothetical protein  45.88 
 
 
441 aa  82  0.000000000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.579978  hitchhiker  0.0000396419 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3113  hypothetical protein  44.71 
 
 
293 aa  81.6  0.000000000000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4729  hypothetical protein  44.83 
 
 
445 aa  80.9  0.00000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.199919  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1752  hypothetical protein  44.83 
 
 
445 aa  80.9  0.00000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.227885  normal  0.59787 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4842  hypothetical protein  44.83 
 
 
445 aa  80.9  0.00000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41930  transposase  40.51 
 
 
234 aa  70.1  0.00000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.209589  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31320  transposase  40.51 
 
 
460 aa  69.7  0.00000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3107  transposase, IS4 family protein  53.45 
 
 
419 aa  69.3  0.00000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0395714 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4643  hypothetical protein  50 
 
 
80 aa  68.6  0.00000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.777081  normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5887  transposase IS4 family protein  48.53 
 
 
481 aa  66.6  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000153597 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2515  transposase IS4 family protein  43.94 
 
 
467 aa  60.1  0.00000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.99983  normal  0.0630319 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2199  transposase Tn5  43.94 
 
 
467 aa  60.1  0.00000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.334008  hitchhiker  0.00000000355698 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0165  IS4 family transposase  40.74 
 
 
212 aa  59.7  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.0055531  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12240  transposase  40.51 
 
 
460 aa  57.8  0.0000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18270  transposase  40.51 
 
 
460 aa  58.2  0.0000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18340  transposase  40.51 
 
 
460 aa  58.2  0.0000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.308708  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33340  transposase  40.51 
 
 
460 aa  57.8  0.0000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4025  hypothetical protein  40.91 
 
 
470 aa  45.1  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4034  hypothetical protein  40.91 
 
 
470 aa  45.1  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.287551 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2032  hypothetical protein  33.8 
 
 
472 aa  43.9  0.002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1424  hypothetical protein  33.8 
 
 
472 aa  43.9  0.002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0195  hypothetical protein  33.8 
 
 
472 aa  43.9  0.002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0184  hypothetical protein  33.8 
 
 
472 aa  43.9  0.002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>