17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_4952 on replicon NC_008759
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008759  Pnap_4952  IS4 family transposase  100 
 
 		 108 aa  224  3e-58  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.450455  normal  0.665267 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3113  hypothetical protein  75.93 
 
 		 293 aa  168  3e-41  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4825  hypothetical protein  75 
 
 		 441 aa  166  1e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4752  hypothetical protein  75 
 
 		 441 aa  165  2e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.839178  normal  1 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4481  hypothetical protein  73.15 
 
 		 441 aa  164  5e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.579978  hitchhiker  0.0000396419 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0419  IS4 family transposase  54.63 
 
 		 164 aa  129  1.0000000000000001e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.216929 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1752  hypothetical protein  52.78 
 
 		 445 aa  121  3e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.227885  normal  0.59787 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4729  hypothetical protein  52.78 
 
 		 445 aa  121  3e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.199919  normal  1 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4842  hypothetical protein  52.78 
 
 		 445 aa  121  3e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1413  transposase, IS4 family protein  43.52 
 
 		 462 aa  99  2e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.106317  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4941  transposase, IS4 family protein  42.59 
 
 		 380 aa  96.3  1e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.491222 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2215  transposase, IS4 family protein  46.3 
 
 		 439 aa  90.5  8e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.501331  normal  0.787142 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2775  transposase, IS4 family protein  46.3 
 
 		 439 aa  90.5  8e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0055865 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3105  transposase, IS4 family protein  46.3 
 
 		 439 aa  90.1  8e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0428603 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3660  transposase, IS4 family protein  46.3 
 
 		 439 aa  90.5  8e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3107  transposase, IS4 family protein  46.3 
 
 		 419 aa  90.1  9e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0395714 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0165  IS4 family transposase  47.89 
 
 		 212 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.0055531  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>